0 nestedRepeats,237 transMapEnsemblV5,672 transMapEstV5,641 transMapRefSeqV5,641 transMapRnaV5,641 transMapV5,747 uniprot,1822 0.01 cpgIslandExt,473 cpgIslandExtUnmasked,476 cpgIslandSuper,473 0.0f cpgIslandExt,449 cpgIslandExtUnmasked,452 cpgIslandSuper,449 0.1 refSeqComposite,1274 0.1f cpgIslandExt,451 cpgIslandExtUnmasked,454 cpgIslandSuper,451 0.2 augustusGene,136 0.5 augustusGene,138 transMapEnsemblV5,226 transMapEnsemblV5,361 transMapEstV5,195 transMapEstV5,330 transMapRefSeqV5,195 transMapRefSeqV5,330 transMapRnaV5,195 transMapRnaV5,330 transMapV5,301 transMapV5,436 xenoRefGene,264 0.6 cpgIslandExt,276 cpgIslandExtUnmasked,279 cpgIslandSuper,276 000 transMapV5,110 1 augustusGene,310 chainGalGal6,391 chainGalGal6,522 chainGalGal6,714 chainGalGal6,1113 chainNetGalGal6,394 chainNetGalGal6,525 chainNetGalGal6,717 chainNetGalGal6,1116 chainNetXenTro7,404 chainNetXenTro7,535 chainNetXenTro7,729 chainNetXenTro7,1128 chainNetXenTro9,401 chainNetXenTro9,532 chainNetXenTro9,726 chainNetXenTro9,1125 chainXenTro7,401 chainXenTro7,532 chainXenTro7,726 chainXenTro7,1125 chainXenTro9,398 chainXenTro9,529 chainXenTro9,723 chainXenTro9,1122 cpgIslandExt,245 cpgIslandExt,429 cpgIslandExt,458 cpgIslandExt,485 cpgIslandExtUnmasked,248 cpgIslandExtUnmasked,432 cpgIslandExtUnmasked,461 cpgIslandExtUnmasked,488 cpgIslandSuper,245 cpgIslandSuper,429 cpgIslandSuper,458 cpgIslandSuper,485 genscan,227 netGalGal6,391 netGalGal6,522 netGalGal6,714 netGalGal6,1113 netXenTro7,401 netXenTro7,532 netXenTro7,726 netXenTro7,1125 netXenTro9,398 netXenTro9,529 netXenTro9,723 netXenTro9,1122 refSeqComposite,1817 transMapEnsemblV5,781 transMapEstV5,750 transMapRefSeqV5,750 transMapRnaV5,750 transMapV5,856 uniprot,1110 uniprot,1314 uniprot,1346 uniprot,1490 uniprot,1927 xenoRefGene,387 1.0 transMapEnsemblV5,369 transMapEstV5,338 transMapRefSeqV5,338 transMapRnaV5,338 transMapV5,444 10 gap,137 uniprot,1928 100 augustusGene,134 chainGalGal6,1081 chainNetGalGal6,1084 chainNetXenTro7,1096 chainNetXenTro9,1093 chainXenTro7,1093 chainXenTro9,1090 microsat,70 nestedRepeats,230 netGalGal6,1081 netXenTro7,1093 netXenTro9,1090 100.0 cpgIslandExt,474 cpgIslandExtUnmasked,477 cpgIslandSuper,474 1000 chainNetXenTro7,703 chainNetXenTro9,700 chainXenTro7,700 chainXenTro9,697 nestedRepeats,238 netXenTro7,700 netXenTro9,697 1000-2000 augustusGene,161 1000000 transMapEnsemblV5,674 transMapEstV5,643 transMapRefSeqV5,643 transMapRnaV5,643 transMapV5,749 uniprot,1824 103-7 chainGalGal6,1114 chainNetGalGal6,1117 chainNetXenTro7,1129 chainNetXenTro9,1126 chainXenTro7,1126 chainXenTro9,1123 netGalGal6,1114 netXenTro7,1126 netXenTro9,1123 10607616 nestedRepeats,394 rmsk,417 10973072 nestedRepeats,361 rmsk,384 11 chainGalGal6,710 chainGalGal6,717 chainNetGalGal6,713 chainNetGalGal6,720 chainNetXenTro7,725 chainNetXenTro7,732 chainNetXenTro9,722 chainNetXenTro9,729 chainXenTro7,722 chainXenTro7,729 chainXenTro9,719 chainXenTro9,726 netGalGal6,710 netGalGal6,717 netXenTro7,722 netXenTro7,729 netXenTro9,719 netXenTro9,726 1100 chainGalGal6,731 chainGalGal6,743 chainNetGalGal6,734 chainNetGalGal6,746 chainNetXenTro7,746 chainNetXenTro7,758 chainNetXenTro9,743 chainNetXenTro9,755 chainXenTro7,743 chainXenTro7,755 chainXenTro9,740 chainXenTro9,752 netGalGal6,731 netGalGal6,743 netXenTro7,743 netXenTro7,755 netXenTro9,740 netXenTro9,752 111 chainGalGal6,712 chainGalGal6,718 chainNetGalGal6,715 chainNetGalGal6,721 chainNetXenTro7,727 chainNetXenTro7,733 chainNetXenTro9,724 chainNetXenTro9,730 chainXenTro7,724 chainXenTro7,730 chainXenTro9,721 chainXenTro9,727 netGalGal6,712 netGalGal6,718 netXenTro7,724 netXenTro7,730 netXenTro9,721 netXenTro9,727 11484-9 chainGalGal6,1083 chainNetGalGal6,1086 chainNetXenTro7,1098 chainNetXenTro9,1095 chainXenTro7,1095 chainXenTro9,1092 netGalGal6,1083 netXenTro7,1095 netXenTro9,1092 115-26 chainGalGal6,1045 chainNetGalGal6,1048 chainNetXenTro7,1060 chainNetXenTro9,1057 chainXenTro7,1057 chainXenTro9,1054 netGalGal6,1045 netXenTro7,1057 netXenTro9,1054 11928468 chainGalGal6,1047 chainNetGalGal6,1050 chainNetXenTro7,1062 chainNetXenTro9,1059 chainXenTro7,1059 chainXenTro9,1056 netGalGal6,1047 netXenTro7,1059 netXenTro9,1056 11932250 refSeqComposite,1747 xenoRefGene,317 12 refSeqComposite,1743 transMapEnsemblV5,751 transMapEnsemblV5,817 transMapEstV5,720 transMapEstV5,786 transMapRefSeqV5,720 transMapRefSeqV5,786 transMapRnaV5,720 transMapRnaV5,786 transMapV5,826 transMapV5,892 xenoRefGene,313 12111 chainGalGal6,720 chainNetGalGal6,723 chainNetXenTro7,735 chainNetXenTro9,732 chainXenTro7,732 chainXenTro9,729 netGalGal6,720 netXenTro7,732 netXenTro9,729 122 gap,133 12529312 chainGalGal6,1116 chainNetGalGal6,1119 chainNetXenTro7,1131 chainNetXenTro9,1128 chainXenTro7,1128 chainXenTro9,1125 netGalGal6,1116 netXenTro7,1128 netXenTro9,1125 127-163 genscan,206 13 chainGalGal6,1112 chainNetGalGal6,1115 chainNetXenTro7,1127 chainNetXenTro9,1124 chainXenTro7,1124 chainXenTro9,1121 netGalGal6,1112 netXenTro7,1124 netXenTro9,1121 134-41 windowmaskerSdust,112 1400 chainGalGal6,755 chainNetGalGal6,758 chainNetXenTro7,770 chainNetXenTro9,767 chainXenTro7,767 chainXenTro9,764 netGalGal6,755 netXenTro7,767 netXenTro9,764 14500911 chainGalGal6,1085 chainNetGalGal6,1088 chainNetXenTro7,1100 chainNetXenTro9,1097 chainXenTro7,1097 chainXenTro9,1094 netGalGal6,1085 netXenTro7,1097 netXenTro9,1094 14534192 augustusGene,340 147 gold,153 15 microsat,30 microsat,79 microsat,130 refSeqComposite,1246 simpleRepeat,90 windowmaskerSdust,109 xenoRefGene,236 15108278 uniprot,2051 152111 chainGalGal6,723 chainNetGalGal6,726 chainNetXenTro7,738 chainNetXenTro9,735 chainXenTro7,735 chainXenTro9,732 netGalGal6,723 netXenTro7,735 netXenTro9,732 15600 chainGalGal6,734 chainGalGal6,746 chainNetGalGal6,737 chainNetGalGal6,749 chainNetXenTro7,749 chainNetXenTro7,761 chainNetXenTro9,746 chainNetXenTro9,758 chainXenTro7,746 chainXenTro7,758 chainXenTro9,743 chainXenTro9,755 netGalGal6,734 netGalGal6,746 netXenTro7,746 netXenTro7,758 netXenTro9,743 netXenTro9,755 15608248 refSeqComposite,1823 xenoRefGene,393 16 nestedRepeats,357 rmsk,380 16000 chainGalGal6,758 chainNetGalGal6,761 chainNetXenTro7,773 chainNetXenTro9,770 chainXenTro7,770 chainXenTro9,767 netGalGal6,758 netXenTro7,770 netXenTro9,767 16287941 windowmaskerSdust,114 17 cpgIslandExt,241 cpgIslandExtUnmasked,244 cpgIslandSuper,241 transMapEnsemblV5,750 transMapEstV5,719 transMapRefSeqV5,719 transMapRnaV5,719 transMapV5,825 1763-73 transMapEnsemblV5,752 transMapEstV5,721 transMapRefSeqV5,721 transMapRnaV5,721 transMapV5,827 17989246 transMapEnsemblV5,754 transMapEstV5,723 transMapRefSeqV5,723 transMapRnaV5,723 transMapV5,829 18085818 transMapEnsemblV5,820 transMapEstV5,789 transMapRefSeqV5,789 transMapRnaV5,789 transMapV5,895 18218656 augustusGene,315 transMapEnsemblV5,786 transMapEstV5,755 transMapRefSeqV5,755 transMapRnaV5,755 transMapV5,861 19 augustusGene,335 196 cpgIslandExt,619 cpgIslandExtUnmasked,622 cpgIslandSuper,619 1987 cpgIslandExt,379 cpgIslandExt,616 cpgIslandExtUnmasked,382 cpgIslandExtUnmasked,619 cpgIslandSuper,379 cpgIslandSuper,616 1996 nestedRepeats,410 rmsk,433 1996-2010 nestedRepeats,334 rmsk,357 1997 genscan,149 genscan,223 1998 genscan,167 genscan,204 1999 microsat,103 microsat,128 nestedRepeats,388 rmsk,411 simpleRepeat,65 simpleRepeat,88 2 augustusGene,142 augustusGene,337 chainGalGal6,425 chainGalGal6,430 chainGalGal6,715 chainNetGalGal6,428 chainNetGalGal6,433 chainNetGalGal6,718 chainNetXenTro7,438 chainNetXenTro7,443 chainNetXenTro7,730 chainNetXenTro9,435 chainNetXenTro9,440 chainNetXenTro9,727 chainXenTro7,435 chainXenTro7,440 chainXenTro7,727 chainXenTro9,432 chainXenTro9,437 chainXenTro9,724 cpgIslandExt,421 cpgIslandExt,426 cpgIslandExt,428 cpgIslandExt,434 cpgIslandExt,460 cpgIslandExt,475 cpgIslandExt,620 cpgIslandExtUnmasked,424 cpgIslandExtUnmasked,429 cpgIslandExtUnmasked,431 cpgIslandExtUnmasked,437 cpgIslandExtUnmasked,463 cpgIslandExtUnmasked,478 cpgIslandExtUnmasked,623 cpgIslandSuper,421 cpgIslandSuper,426 cpgIslandSuper,428 cpgIslandSuper,434 cpgIslandSuper,460 cpgIslandSuper,475 cpgIslandSuper,620 microsat,66 microsat,132 netGalGal6,425 netGalGal6,430 netGalGal6,715 netXenTro7,435 netXenTro7,440 netXenTro7,727 netXenTro9,432 netXenTro9,437 netXenTro9,724 simpleRepeat,92 uniprot,1121 uniprot,1331 windowmaskerSdust,111 2-3 uniprot,1572 20 chainGalGal6,1082 chainNetGalGal6,1085 chainNetXenTro7,1097 chainNetXenTro9,1094 chainXenTro7,1094 chainXenTro9,1091 cpgIslandExt,618 cpgIslandExtUnmasked,621 cpgIslandSuper,618 netGalGal6,1082 netXenTro7,1094 netXenTro9,1091 transMapEnsemblV5,377 transMapEstV5,346 transMapRefSeqV5,346 transMapRnaV5,346 transMapV5,452 200 cpgIslandExt,271 cpgIslandExtUnmasked,274 cpgIslandSuper,271 2000 nestedRepeats,63 nestedRepeats,355 rmsk,99 rmsk,378 2002 chainGalGal6,1044 chainNetGalGal6,1047 chainNetXenTro7,1059 chainNetXenTro9,1056 chainXenTro7,1056 chainXenTro9,1053 netGalGal6,1044 netXenTro7,1056 netXenTro9,1053 refSeqComposite,1741 xenoRefGene,311 2003 augustusGene,333 chainGalGal6,1078 chainGalGal6,1110 chainNetGalGal6,1081 chainNetGalGal6,1113 chainNetXenTro7,1093 chainNetXenTro7,1125 chainNetXenTro9,1090 chainNetXenTro9,1122 chainXenTro7,1090 chainXenTro7,1122 chainXenTro9,1087 chainXenTro9,1119 netGalGal6,1078 netGalGal6,1110 netXenTro7,1090 netXenTro7,1122 netXenTro9,1087 netXenTro9,1119 2004 uniprot,2045 2005 refSeqComposite,1815 xenoRefGene,385 2006 windowmaskerSdust,107 2007 chainGalGal6,1017 chainNetGalGal6,1020 chainNetXenTro7,1032 chainNetXenTro9,1029 chainXenTro7,1029 chainXenTro9,1026 netGalGal6,1017 netXenTro7,1029 netXenTro9,1026 transMapEnsemblV5,748 transMapEnsemblV5,814 transMapEstV5,717 transMapEstV5,783 transMapRefSeqV5,717 transMapRefSeqV5,783 transMapRnaV5,717 transMapRnaV5,783 transMapV5,823 transMapV5,889 2008 augustusGene,308 transMapEnsemblV5,779 transMapEstV5,748 transMapRefSeqV5,748 transMapRnaV5,748 transMapV5,854 2012 chainNetXenTro7,8 chainNetXenTro7,74 chainNetXenTro7,319 chainNetXenTro7Viewchain,5 chainNetXenTro7Viewnet,5 chainXenTro7,7 chainXenTro7,71 chainXenTro7,316 netXenTro7,7 netXenTro7,71 netXenTro7,316 uniprot,2000 2014 refSeqComposite,1782 xenoRefGene,352 2015 gap,16 gold,18 2016 chainNetXenTro9,8 chainNetXenTro9,73 chainNetXenTro9,317 chainNetXenTro9Viewchain,5 chainNetXenTro9Viewnet,5 chainXenTro9,7 chainXenTro9,70 chainXenTro9,314 netXenTro9,7 netXenTro9,70 netXenTro9,314 2018 chainGalGal6,5 chainGalGal6,67 chainGalGal6,307 chainNetGalGal6,6 chainNetGalGal6,70 chainNetGalGal6,310 chainNetGalGal6Viewchain,4 chainNetGalGal6Viewnet,4 netGalGal6,5 netGalGal6,67 netGalGal6,307 2022_03 uniprot,1911 2023 uniprot,1191 2111 chainGalGal6,719 chainNetGalGal6,722 chainNetXenTro7,734 chainNetXenTro9,731 chainXenTro7,731 chainXenTro9,728 netGalGal6,719 netXenTro7,731 netXenTro9,728 22 windowmaskerSdust,110 22102590 uniprot,2007 225 transMapEnsemblV5,719 transMapEstV5,688 transMapRefSeqV5,688 transMapRnaV5,688 transMapV5,794 23 uniprot,2047 24 augustusGene,311 transMapEnsemblV5,782 transMapEstV5,751 transMapRefSeqV5,751 transMapRnaV5,751 transMapV5,857 24259432 refSeqComposite,1789 xenoRefGene,359 25 genscan,225 transMapV5,113 xenoRefGene,271 252111 chainGalGal6,724 chainNetGalGal6,727 chainNetXenTro7,739 chainNetXenTro9,736 chainXenTro7,736 chainXenTro9,733 netGalGal6,724 netXenTro7,736 netXenTro9,733 261-82 cpgIslandExt,621 cpgIslandExtUnmasked,624 cpgIslandSuper,621 268 genscan,226 27 microsat,131 simpleRepeat,91 2n cpgIslandExt,487 cpgIslandExtUnmasked,490 cpgIslandSuper,487 3 augustusGene,140 chainGalGal6,437 chainGalGal6,716 chainNetGalGal6,440 chainNetGalGal6,719 chainNetXenTro7,450 chainNetXenTro7,731 chainNetXenTro9,447 chainNetXenTro9,728 chainXenTro7,447 chainXenTro7,728 chainXenTro9,444 chainXenTro9,725 cpgIslandExt,432 cpgIslandExt,462 cpgIslandExtUnmasked,435 cpgIslandExtUnmasked,465 cpgIslandSuper,432 cpgIslandSuper,462 microsat,68 netGalGal6,437 netGalGal6,716 netXenTro7,447 netXenTro7,728 netXenTro9,444 netXenTro9,725 transMapEnsemblV5,816 transMapEstV5,785 transMapRefSeqV5,785 transMapRnaV5,785 transMapV5,891 uniprot,1123 uniprot,1194 3.1 augustusGene,24 30 chainGalGal6,1080 chainNetGalGal6,1083 chainNetXenTro7,1095 chainNetXenTro9,1092 chainXenTro7,1092 chainXenTro9,1089 gap,138 netGalGal6,1080 netXenTro7,1092 netXenTro9,1089 300 cpgIslandExt,6 cpgIslandExtUnmasked,9 cpgIslandSuper,6 31600 chainGalGal6,735 chainGalGal6,747 chainNetGalGal6,738 chainNetGalGal6,750 chainNetXenTro7,750 chainNetXenTro7,762 chainNetXenTro9,747 chainNetXenTro9,759 chainXenTro7,747 chainXenTro7,759 chainXenTro9,744 chainXenTro9,756 netGalGal6,735 netGalGal6,747 netXenTro7,747 netXenTro7,759 netXenTro9,744 netXenTro9,756 32000 chainGalGal6,759 chainNetGalGal6,762 chainNetXenTro7,774 chainNetXenTro9,771 chainXenTro7,771 chainXenTro9,768 netGalGal6,759 netXenTro7,771 netXenTro9,768 32111 chainGalGal6,721 chainNetGalGal6,724 chainNetXenTro7,736 chainNetXenTro9,733 chainXenTro7,733 chainXenTro9,730 netGalGal6,721 netXenTro7,733 netXenTro9,730 325 chainGalGal6,726 chainGalGal6,738 chainNetGalGal6,729 chainNetGalGal6,741 chainNetXenTro7,741 chainNetXenTro7,753 chainNetXenTro9,738 chainNetXenTro9,750 chainXenTro7,738 chainXenTro7,750 chainXenTro9,735 chainXenTro9,747 gap,134 netGalGal6,726 netGalGal6,738 netXenTro7,738 netXenTro7,750 netXenTro9,735 netXenTro9,747 33 refSeqComposite,1818 xenoRefGene,388 34990190 refSeqComposite,1560 360 chainGalGal6,727 chainGalGal6,739 chainNetGalGal6,730 chainNetGalGal6,742 chainNetXenTro7,742 chainNetXenTro7,754 chainNetXenTro9,739 chainNetXenTro9,751 chainXenTro7,739 chainXenTro7,751 chainXenTro9,736 chainXenTro9,748 netGalGal6,727 netGalGal6,739 netXenTro7,739 netXenTro7,751 netXenTro9,736 netXenTro9,748 3600 chainGalGal6,732 chainGalGal6,744 chainNetGalGal6,735 chainNetGalGal6,747 chainNetXenTro7,747 chainNetXenTro7,759 chainNetXenTro9,744 chainNetXenTro9,756 chainXenTro7,744 chainXenTro7,756 chainXenTro9,741 chainXenTro9,753 netGalGal6,732 netGalGal6,744 netXenTro7,744 netXenTro7,756 netXenTro9,741 netXenTro9,753 3656447 cpgIslandExt,623 cpgIslandExtUnmasked,626 cpgIslandSuper,623 36727467 refSeqComposite,1562 4 refSeqComposite,1744 xenoRefGene,314 40 uniprot,2002 400 chainGalGal6,728 chainGalGal6,740 chainNetGalGal6,731 chainNetGalGal6,743 chainNetXenTro7,743 chainNetXenTro7,755 chainNetXenTro9,740 chainNetXenTro9,752 chainXenTro7,740 chainXenTro7,752 chainXenTro9,737 chainXenTro9,749 netGalGal6,728 netGalGal6,740 netXenTro7,740 netXenTro7,752 netXenTro9,737 netXenTro9,749 transMapV5,109 4000 chainGalGal6,756 chainNetGalGal6,759 chainNetXenTro7,771 chainNetXenTro9,768 chainXenTro7,768 chainXenTro9,765 netGalGal6,756 netXenTro7,768 netXenTro9,765 418-420 nestedRepeats,359 rmsk,382 42 refSeqComposite,1784 xenoRefGene,354 423 gap,139 45 refSeqComposite,945 450 chainGalGal6,729 chainGalGal6,741 chainNetGalGal6,732 chainNetGalGal6,744 chainNetXenTro7,744 chainNetXenTro7,756 chainNetXenTro9,741 chainNetXenTro9,753 chainXenTro7,741 chainXenTro7,753 chainXenTro9,738 chainXenTro9,750 netGalGal6,729 netGalGal6,741 netXenTro7,741 netXenTro7,753 netXenTro9,738 netXenTro9,750 464-70 uniprot,2049 5 augustusGene,312 cpgIslandExt,464 cpgIslandExtUnmasked,467 cpgIslandSuper,464 transMapEnsemblV5,9 transMapEnsemblV5,783 transMapEstV5,7 transMapEstV5,752 transMapRefSeqV5,8 transMapRefSeqV5,752 transMapRnaV5,8 transMapRnaV5,752 transMapV5,6 transMapV5,858 uniprot,2048 5-base gc5BaseBw,6 gc5BaseBw,27 50 cpgIslandExt,265 cpgIslandExtUnmasked,268 cpgIslandSuper,265 nestedRepeats,229 5000 chainGalGal6,688 chainNetGalGal6,691 netGalGal6,688 512 gold,154 56600 chainGalGal6,736 chainGalGal6,748 chainNetGalGal6,739 chainNetGalGal6,751 chainNetXenTro7,751 chainNetXenTro7,763 chainNetXenTro9,748 chainNetXenTro9,760 chainXenTro7,748 chainXenTro7,760 chainXenTro9,745 chainXenTro9,757 netGalGal6,736 netGalGal6,748 netXenTro7,748 netXenTro7,760 netXenTro9,745 netXenTro9,757 57000 chainGalGal6,760 chainNetGalGal6,763 chainNetXenTro7,775 chainNetXenTro9,772 chainXenTro7,772 chainXenTro9,769 netGalGal6,760 netXenTro7,772 netXenTro9,769 573-80 microsat,133 simpleRepeat,93 6 cpgIslandExt,466 cpgIslandExt,469 cpgIslandExt,477 cpgIslandExtUnmasked,469 cpgIslandExtUnmasked,472 cpgIslandExtUnmasked,480 cpgIslandSuper,466 cpgIslandSuper,469 cpgIslandSuper,477 nestedRepeats,391 nestedRepeats,412 nestedRepeats,413 rmsk,414 rmsk,435 rmsk,436 600 chainGalGal6,730 chainGalGal6,742 chainNetGalGal6,733 chainNetGalGal6,745 chainNetXenTro7,745 chainNetXenTro7,757 chainNetXenTro9,742 chainNetXenTro9,754 chainXenTro7,742 chainXenTro7,754 chainXenTro9,739 chainXenTro9,751 netGalGal6,730 netGalGal6,742 netXenTro7,742 netXenTro7,754 netXenTro9,739 netXenTro9,751 625 chainGalGal6,750 chainNetGalGal6,753 chainNetXenTro7,765 chainNetXenTro9,762 chainXenTro7,762 chainXenTro9,759 netGalGal6,750 netXenTro7,762 netXenTro9,759 637-44 augustusGene,313 transMapEnsemblV5,784 transMapEstV5,753 transMapRefSeqV5,753 transMapRnaV5,753 transMapV5,859 656-64 refSeqComposite,1745 xenoRefGene,315 657-63 nestedRepeats,392 rmsk,415 660 chainGalGal6,751 chainNetGalGal6,754 chainNetXenTro7,766 chainNetXenTro9,763 chainXenTro7,763 chainXenTro9,760 netGalGal6,751 netXenTro7,763 netXenTro9,760 7 cpgIslandExt,472 cpgIslandExt,480 cpgIslandExtUnmasked,475 cpgIslandExtUnmasked,483 cpgIslandSuper,472 cpgIslandSuper,480 7.0 chainNetXenTro7,10 chainNetXenTro7,76 chainNetXenTro7,321 chainNetXenTro7Viewchain,7 chainNetXenTro7Viewnet,7 chainXenTro7,9 chainXenTro7,73 chainXenTro7,318 netXenTro7,9 netXenTro7,73 netXenTro7,318 700 chainGalGal6,752 chainNetGalGal6,755 chainNetXenTro7,767 chainNetXenTro9,764 chainXenTro7,764 chainXenTro9,761 netGalGal6,752 netXenTro7,764 netXenTro9,761 72111 chainGalGal6,722 chainNetGalGal6,725 chainNetXenTro7,737 chainNetXenTro9,734 chainXenTro7,734 chainXenTro9,731 netGalGal6,722 netXenTro7,734 netXenTro9,731 743-8 nestedRepeats,414 rmsk,437 750 chainGalGal6,753 chainNetGalGal6,756 chainNetXenTro7,768 chainNetXenTro9,765 chainXenTro7,765 chainXenTro9,762 netGalGal6,753 netXenTro7,765 netXenTro9,762 7600 chainGalGal6,733 chainGalGal6,745 chainNetGalGal6,736 chainNetGalGal6,748 chainNetXenTro7,748 chainNetXenTro7,760 chainNetXenTro9,745 chainNetXenTro9,757 chainXenTro7,745 chainXenTro7,757 chainXenTro9,742 chainXenTro9,754 netGalGal6,733 netGalGal6,745 netXenTro7,745 netXenTro7,757 netXenTro9,742 netXenTro9,754 78-94 genscan,228 8000 chainGalGal6,757 chainNetGalGal6,760 chainNetXenTro7,772 chainNetXenTro9,769 chainXenTro7,769 chainXenTro9,766 netGalGal6,757 netXenTro7,769 netXenTro9,766 8994846 nestedRepeats,416 rmsk,439 9 cpgIslandExt,482 cpgIslandExtUnmasked,485 cpgIslandSuper,482 nestedRepeats,358 nestedRepeats,390 rmsk,381 rmsk,413 900 chainGalGal6,754 chainNetGalGal6,757 chainNetXenTro7,769 chainNetXenTro9,766 chainXenTro7,766 chainXenTro9,763 netGalGal6,754 netXenTro7,766 netXenTro9,763 9149143 genscan,230 93 uniprot,1483 96 refSeqComposite,1281 9862982 microsat,135 simpleRepeat,95 _alt uniprot,1419 _fix uniprot,1421 a augustusGene,116 augustusGene,128 augustusGene,152 augustusGene,215 augustusGene,218 augustusGene,233 augustusGene,323 augustusGene,328 chainGalGal6,76 chainGalGal6,146 chainGalGal6,199 chainGalGal6,457 chainGalGal6,467 chainGalGal6,471 chainGalGal6,538 chainGalGal6,555 chainGalGal6,558 chainGalGal6,625 chainGalGal6,630 chainGalGal6,636 chainGalGal6,640 chainGalGal6,651 chainGalGal6,683 chainGalGal6,802 chainGalGal6,816 chainGalGal6,822 chainGalGal6,828 chainGalGal6,832 chainGalGal6,835 chainGalGal6,863 chainGalGal6,1053 chainGalGal6,1077 chainGalGal6,1093 chainNetGalGal6,79 chainNetGalGal6,149 chainNetGalGal6,202 chainNetGalGal6,460 chainNetGalGal6,470 chainNetGalGal6,474 chainNetGalGal6,541 chainNetGalGal6,558 chainNetGalGal6,561 chainNetGalGal6,628 chainNetGalGal6,633 chainNetGalGal6,639 chainNetGalGal6,643 chainNetGalGal6,654 chainNetGalGal6,686 chainNetGalGal6,805 chainNetGalGal6,819 chainNetGalGal6,825 chainNetGalGal6,831 chainNetGalGal6,835 chainNetGalGal6,838 chainNetGalGal6,866 chainNetGalGal6,1056 chainNetGalGal6,1080 chainNetGalGal6,1096 chainNetXenTro7,84 chainNetXenTro7,155 chainNetXenTro7,209 chainNetXenTro7,470 chainNetXenTro7,480 chainNetXenTro7,484 chainNetXenTro7,551 chainNetXenTro7,568 chainNetXenTro7,571 chainNetXenTro7,639 chainNetXenTro7,645 chainNetXenTro7,651 chainNetXenTro7,655 chainNetXenTro7,666 chainNetXenTro7,698 chainNetXenTro7,817 chainNetXenTro7,831 chainNetXenTro7,837 chainNetXenTro7,843 chainNetXenTro7,847 chainNetXenTro7,850 chainNetXenTro7,878 chainNetXenTro7,1068 chainNetXenTro7,1092 chainNetXenTro7,1108 chainNetXenTro9,82 chainNetXenTro9,153 chainNetXenTro9,207 chainNetXenTro9,467 chainNetXenTro9,477 chainNetXenTro9,481 chainNetXenTro9,548 chainNetXenTro9,565 chainNetXenTro9,568 chainNetXenTro9,636 chainNetXenTro9,642 chainNetXenTro9,648 chainNetXenTro9,652 chainNetXenTro9,663 chainNetXenTro9,695 chainNetXenTro9,814 chainNetXenTro9,828 chainNetXenTro9,834 chainNetXenTro9,840 chainNetXenTro9,844 chainNetXenTro9,847 chainNetXenTro9,875 chainNetXenTro9,1065 chainNetXenTro9,1089 chainNetXenTro9,1105 chainXenTro7,81 chainXenTro7,152 chainXenTro7,206 chainXenTro7,467 chainXenTro7,477 chainXenTro7,481 chainXenTro7,548 chainXenTro7,565 chainXenTro7,568 chainXenTro7,636 chainXenTro7,642 chainXenTro7,648 chainXenTro7,652 chainXenTro7,663 chainXenTro7,695 chainXenTro7,814 chainXenTro7,828 chainXenTro7,834 chainXenTro7,840 chainXenTro7,844 chainXenTro7,847 chainXenTro7,875 chainXenTro7,1065 chainXenTro7,1089 chainXenTro7,1105 chainXenTro9,79 chainXenTro9,150 chainXenTro9,204 chainXenTro9,464 chainXenTro9,474 chainXenTro9,478 chainXenTro9,545 chainXenTro9,562 chainXenTro9,565 chainXenTro9,633 chainXenTro9,639 chainXenTro9,645 chainXenTro9,649 chainXenTro9,660 chainXenTro9,692 chainXenTro9,811 chainXenTro9,825 chainXenTro9,831 chainXenTro9,837 chainXenTro9,841 chainXenTro9,844 chainXenTro9,872 chainXenTro9,1062 chainXenTro9,1086 chainXenTro9,1102 cpgIslandExt,43 cpgIslandExt,50 cpgIslandExt,54 cpgIslandExt,128 cpgIslandExt,166 cpgIslandExt,236 cpgIslandExt,590 cpgIslandExt,593 cpgIslandExtUnmasked,46 cpgIslandExtUnmasked,53 cpgIslandExtUnmasked,57 cpgIslandExtUnmasked,131 cpgIslandExtUnmasked,169 cpgIslandExtUnmasked,239 cpgIslandExtUnmasked,593 cpgIslandExtUnmasked,596 cpgIslandSuper,43 cpgIslandSuper,50 cpgIslandSuper,54 cpgIslandSuper,128 cpgIslandSuper,166 cpgIslandSuper,236 cpgIslandSuper,590 cpgIslandSuper,593 gap,100 gap,104 gc5BaseBw,44 genscan,102 genscan,132 gold,118 gold,124 microsat,53 microsat,119 nestedRepeats,177 nestedRepeats,226 nestedRepeats,344 nestedRepeats,363 netGalGal6,76 netGalGal6,146 netGalGal6,199 netGalGal6,457 netGalGal6,467 netGalGal6,471 netGalGal6,538 netGalGal6,555 netGalGal6,558 netGalGal6,625 netGalGal6,630 netGalGal6,636 netGalGal6,640 netGalGal6,651 netGalGal6,683 netGalGal6,802 netGalGal6,816 netGalGal6,822 netGalGal6,828 netGalGal6,832 netGalGal6,835 netGalGal6,863 netGalGal6,1053 netGalGal6,1077 netGalGal6,1093 netXenTro7,81 netXenTro7,152 netXenTro7,206 netXenTro7,467 netXenTro7,477 netXenTro7,481 netXenTro7,548 netXenTro7,565 netXenTro7,568 netXenTro7,636 netXenTro7,642 netXenTro7,648 netXenTro7,652 netXenTro7,663 netXenTro7,695 netXenTro7,814 netXenTro7,828 netXenTro7,834 netXenTro7,840 netXenTro7,844 netXenTro7,847 netXenTro7,875 netXenTro7,1065 netXenTro7,1089 netXenTro7,1105 netXenTro9,79 netXenTro9,150 netXenTro9,204 netXenTro9,464 netXenTro9,474 netXenTro9,478 netXenTro9,545 netXenTro9,562 netXenTro9,565 netXenTro9,633 netXenTro9,639 netXenTro9,645 netXenTro9,649 netXenTro9,660 netXenTro9,692 netXenTro9,811 netXenTro9,825 netXenTro9,831 netXenTro9,837 netXenTro9,841 netXenTro9,844 netXenTro9,872 netXenTro9,1062 netXenTro9,1086 netXenTro9,1102 refSeqComposite,148 refSeqComposite,159 refSeqComposite,296 refSeqComposite,311 refSeqComposite,533 refSeqComposite,646 refSeqComposite,794 refSeqComposite,1056 refSeqComposite,1250 refSeqComposite,1269 refSeqComposite,1522 refSeqComposite,1541 refSeqComposite,1567 refSeqComposite,1656 refSeqComposite,1759 refSeqComposite,1802 rmsk,36 rmsk,56 rmsk,226 rmsk,240 rmsk,367 rmsk,386 simpleRepeat,79 transMapEnsemblV5,83 transMapEnsemblV5,116 transMapEnsemblV5,207 transMapEnsemblV5,320 transMapEnsemblV5,356 transMapEnsemblV5,400 transMapEnsemblV5,426 transMapEnsemblV5,479 transMapEnsemblV5,549 transMapEnsemblV5,628 transMapEnsemblV5,656 transMapEnsemblV5,715 transMapEstV5,52 transMapEstV5,85 transMapEstV5,176 transMapEstV5,289 transMapEstV5,325 transMapEstV5,369 transMapEstV5,395 transMapEstV5,448 transMapEstV5,518 transMapEstV5,597 transMapEstV5,625 transMapEstV5,684 transMapRefSeqV5,52 transMapRefSeqV5,85 transMapRefSeqV5,176 transMapRefSeqV5,289 transMapRefSeqV5,325 transMapRefSeqV5,369 transMapRefSeqV5,395 transMapRefSeqV5,448 transMapRefSeqV5,518 transMapRefSeqV5,597 transMapRefSeqV5,625 transMapRefSeqV5,684 transMapRnaV5,52 transMapRnaV5,85 transMapRnaV5,176 transMapRnaV5,289 transMapRnaV5,325 transMapRnaV5,369 transMapRnaV5,395 transMapRnaV5,448 transMapRnaV5,518 transMapRnaV5,597 transMapRnaV5,625 transMapRnaV5,684 transMapV5,53 transMapV5,191 transMapV5,282 transMapV5,395 transMapV5,431 transMapV5,475 transMapV5,501 transMapV5,554 transMapV5,624 transMapV5,703 transMapV5,731 transMapV5,790 uniprot,140 uniprot,311 uniprot,418 uniprot,459 uniprot,480 uniprot,490 uniprot,523 uniprot,603 uniprot,622 uniprot,708 uniprot,740 uniprot,759 uniprot,805 uniprot,965 uniprot,976 uniprot,988 uniprot,1001 uniprot,1048 uniprot,1071 uniprot,1152 uniprot,1164 uniprot,1179 uniprot,1217 uniprot,1226 uniprot,1234 uniprot,1239 uniprot,1286 uniprot,1458 uniprot,1599 uniprot,1634 uniprot,1735 uniprot,1779 uniprot,1807 uniprot,1922 uniprot,1949 uniprot,2017 uniprot,2023 uniprot,2032 windowmaskerSdust,91 xenoRefGene,240 xenoRefGene,259 xenoRefGene,329 xenoRefGene,372 a91-114-31-123 chainNetXenTro7,691 chainNetXenTro9,688 chainXenTro7,688 chainXenTro9,685 netXenTro7,688 netXenTro9,685 a91-90-25-100 chainGalGal6,676 chainNetGalGal6,679 netGalGal6,676 aa unipModif,1 windowmaskerSdust,97 ab augustusGene,3 augustusGene,16 abbreviated chainGalGal6,588 chainNetGalGal6,591 chainNetXenTro7,602 chainNetXenTro9,599 chainXenTro7,599 chainXenTro9,596 netGalGal6,588 netXenTro7,599 netXenTro9,596 about chainGalGal6,463 chainGalGal6,476 chainGalGal6,852 chainNetGalGal6,466 chainNetGalGal6,479 chainNetGalGal6,855 chainNetXenTro7,476 chainNetXenTro7,489 chainNetXenTro7,867 chainNetXenTro9,473 chainNetXenTro9,486 chainNetXenTro9,864 chainXenTro7,473 chainXenTro7,486 chainXenTro7,864 chainXenTro9,470 chainXenTro9,483 chainXenTro9,861 gap,36 genscan,127 gold,38 microsat,98 netGalGal6,463 netGalGal6,476 netGalGal6,852 netXenTro7,473 netXenTro7,486 netXenTro7,864 netXenTro9,470 netXenTro9,483 netXenTro9,861 refSeqComposite,96 refSeqComposite,854 refSeqComposite,1189 refSeqComposite,1385 refSeqComposite,1464 simpleRepeat,59 transMapEnsemblV5,133 transMapEstV5,102 transMapRefSeqV5,102 transMapRnaV5,102 transMapV5,208 xenoRefGene,178 above chainGalGal6,535 chainGalGal6,547 chainGalGal6,567 chainNetGalGal6,538 chainNetGalGal6,550 chainNetGalGal6,570 chainNetXenTro7,548 chainNetXenTro7,560 chainNetXenTro7,580 chainNetXenTro9,545 chainNetXenTro9,557 chainNetXenTro9,577 chainXenTro7,545 chainXenTro7,557 chainXenTro7,577 chainXenTro9,542 chainXenTro9,554 chainXenTro9,574 nestedRepeats,218 netGalGal6,535 netGalGal6,547 netGalGal6,567 netXenTro7,545 netXenTro7,557 netXenTro7,577 netXenTro9,542 netXenTro9,554 netXenTro9,574 uniprot,1525 abundance chainGalGal6,181 chainNetGalGal6,184 chainNetXenTro7,191 chainNetXenTro9,189 chainXenTro7,188 chainXenTro9,186 netGalGal6,181 netXenTro7,188 netXenTro9,186 acad chainGalGal6,1073 chainNetGalGal6,1076 chainNetXenTro7,1088 chainNetXenTro9,1085 chainXenTro7,1085 chainXenTro9,1082 netGalGal6,1073 netXenTro7,1085 netXenTro9,1082 acc ucscToRefSeq,2 acceptor genscan,32 access cpgIslandExt,505 cpgIslandExtUnmasked,508 cpgIslandSuper,505 refSeqComposite,1291 refSeqComposite,1355 refSeqComposite,1445 refSeqComposite,1654 transMapEnsemblV5,519 transMapEnsemblV5,578 transMapEstV5,488 transMapEstV5,547 transMapRefSeqV5,488 transMapRefSeqV5,547 transMapRnaV5,488 transMapRnaV5,547 transMapV5,594 transMapV5,653 uniprot,896 uniprot,1706 uniprot,1838 accessed refSeqComposite,1300 refSeqComposite,1323 transMapEnsemblV5,528 transMapEstV5,497 transMapRefSeqV5,497 transMapRnaV5,497 transMapV5,603 accesses refSeqComposite,1628 accessing refSeqComposite,1386 transMapEnsemblV5,571 transMapEstV5,540 transMapRefSeqV5,540 transMapRnaV5,540 transMapV5,646 accession refSeqComposite,781 refSeqComposite,806 ucscToINSDC,2 ucscToINSDC,23 ucscToRefSeq,4 ucscToRefSeq,18 xenoRefGene,118 xenoRefGene,130 accession.version-srcuniq.destuniq transMapEnsemblV5,422 transMapEstV5,391 transMapRefSeqV5,391 transMapRnaV5,391 transMapV5,497 accessions refSeqComposite,222 refSeqComposite,351 refSeqComposite,495 transMapEnsemblV5,394 transMapEstV5,363 transMapRefSeqV5,363 transMapRnaV5,363 transMapV5,469 according augustusGene,114 cpgIslandExt,370 cpgIslandExtUnmasked,373 cpgIslandSuper,370 nestedRepeats,183 acgt chainGalGal6,675 chainNetGalGal6,678 chainNetXenTro7,690 chainNetXenTro9,687 chainXenTro7,687 chainXenTro9,684 netGalGal6,675 netXenTro7,687 netXenTro9,684 acid unipModif,5 unipMut,4 uniprot,339 uniprot,351 acids microsat,126 refSeqComposite,1780 refSeqComposite,1813 simpleRepeat,86 uniprot,620 uniprot,1998 xenoRefGene,350 xenoRefGene,383 acronym uniprot,546 added chainGalGal6,598 chainNetGalGal6,601 chainNetXenTro7,612 chainNetXenTro9,609 chainXenTro7,609 chainXenTro9,606 nestedRepeats,147 netGalGal6,598 netXenTro7,609 netXenTro9,606 transMapEnsemblV5,428 transMapEnsemblV5,438 transMapEstV5,397 transMapEstV5,407 transMapRefSeqV5,397 transMapRefSeqV5,407 transMapRnaV5,397 transMapRnaV5,407 transMapV5,503 transMapV5,513 uniprot,1187 additional nestedRepeats,288 rmsk,295 additions refSeqComposite,119 adjust refSeqComposite,744 admin cpgIslandExt,577 cpgIslandExtUnmasked,580 cpgIslandSuper,577 uniprot,1917 advice chainGalGal6,938 chainGalGal6,970 chainNetGalGal6,941 chainNetGalGal6,973 chainNetXenTro7,953 chainNetXenTro7,985 chainNetXenTro9,950 chainNetXenTro9,982 chainXenTro7,950 chainXenTro7,982 chainXenTro9,947 chainXenTro9,979 netGalGal6,938 netGalGal6,970 netXenTro7,950 netXenTro7,982 netXenTro9,947 netXenTro9,979 advise refSeqComposite,78 af nestedRepeats,372 nestedRepeats,396 rmsk,395 rmsk,419 afa nestedRepeats,325 rmsk,348 affine chainGalGal6,86 chainNetGalGal6,89 chainNetXenTro7,94 chainNetXenTro9,92 chainXenTro7,91 chainXenTro9,89 netGalGal6,86 netXenTro7,91 netXenTro9,89 after chainGalGal6,910 chainNetGalGal6,913 chainNetXenTro7,925 chainNetXenTro9,922 chainXenTro7,922 chainXenTro9,919 cpgIslandExt,94 cpgIslandExt,326 cpgIslandExtUnmasked,97 cpgIslandExtUnmasked,329 cpgIslandSuper,94 cpgIslandSuper,326 netGalGal6,910 netXenTro7,922 netXenTro9,919 uniprot,294 uniprot,1329 again transMapEnsemblV5,410 transMapEstV5,379 transMapRefSeqV5,379 transMapRnaV5,379 transMapV5,485 uniprot,629 uniprot,1500 against refSeqComposite,1232 transMapEnsemblV5,126 transMapEstV5,95 transMapRefSeqV5,95 transMapRnaV5,95 transMapV5,201 xenoRefGene,222 agarwala windowmaskerSdust,98 agp gap,50 gap,59 gap,66 gold,49 gold,58 gold,65 aids cpgIslandExt,86 cpgIslandExtUnmasked,89 cpgIslandSuper,86 al cpgIslandExt,378 cpgIslandExtUnmasked,381 cpgIslandSuper,378 refSeqComposite,1771 transMapEnsemblV5,736 transMapEstV5,705 transMapRefSeqV5,705 transMapRnaV5,705 transMapV5,811 xenoRefGene,341 alejo uniprot,1966 algorithm augustusGene,130 transMapEnsemblV5,28 transMapEstV5,26 transMapRefSeqV5,26 transMapRnaV5,26 transMapV5,25 algorithms uniprot,52 align chainGalGal6,197 chainNetGalGal6,200 chainNetXenTro7,207 chainNetXenTro9,205 chainXenTro7,204 chainXenTro9,202 netGalGal6,197 netXenTro7,204 netXenTro9,202 uniprot,1216 alignable chainGalGal6,22 chainGalGal6,38 chainNetGalGal6,25 chainNetGalGal6,41 chainNetXenTro7,28 chainNetXenTro7,44 chainNetXenTro9,27 chainNetXenTro9,43 chainXenTro7,25 chainXenTro7,41 chainXenTro9,24 chainXenTro9,40 netGalGal6,22 netGalGal6,38 netXenTro7,25 netXenTro7,41 netXenTro9,24 netXenTro9,40 aligned chainGalGal6,591 chainNetGalGal6,594 chainNetXenTro7,605 chainNetXenTro9,602 chainXenTro7,602 chainXenTro9,599 netGalGal6,591 netXenTro7,602 netXenTro9,599 refSeqComposite,81 refSeqComposite,190 refSeqComposite,305 refSeqComposite,898 refSeqComposite,1061 refSeqComposite,1231 refSeqComposite,1253 transMapV5,117 uniprot,783 uniprot,973 uniprot,1007 uniprot,1246 uniprot,1335 uniprot,1472 xenoRefGene,221 xenoRefGene,243 aligning chainGalGal6,135 chainGalGal6,335 chainGalGal6,365 chainNetGalGal6,138 chainNetGalGal6,338 chainNetGalGal6,368 chainNetXenTro7,144 chainNetXenTro7,348 chainNetXenTro7,378 chainNetXenTro9,142 chainNetXenTro9,345 chainNetXenTro9,375 chainXenTro7,141 chainXenTro7,345 chainXenTro7,375 chainXenTro9,139 chainXenTro9,342 chainXenTro9,372 netGalGal6,135 netGalGal6,335 netGalGal6,365 netXenTro7,141 netXenTro7,345 netXenTro7,375 netXenTro9,139 netXenTro9,342 netXenTro9,372 uniprot,952 alignment chainGalGal6,261 chainGalGal6,1020 chainNetGalGal6,264 chainNetGalGal6,1023 chainNetXenTro7,271 chainNetXenTro7,1035 chainNetXenTro9,269 chainNetXenTro9,1032 chainXenTro7,268 chainXenTro7,1032 chainXenTro9,266 chainXenTro9,1029 netGalGal6,8 netGalGal6,261 netGalGal6,1020 netXenTro7,11 netXenTro7,268 netXenTro7,1032 netXenTro9,10 netXenTro9,266 netXenTro9,1029 refSeqComposite,194 refSeqComposite,328 refSeqComposite,460 refSeqComposite,1150 refSeqComposite,1242 refSeqComposite,1258 refSeqComposite,1737 transMapEnsemblV5,27 transMapEnsemblV5,79 transMapEnsemblV5,104 transMapEnsemblV5,141 transMapEnsemblV5,197 transMapEnsemblV5,211 transMapEnsemblV5,390 transMapEnsemblV5,433 transMapEstV5,25 transMapEstV5,48 transMapEstV5,73 transMapEstV5,110 transMapEstV5,166 transMapEstV5,180 transMapEstV5,359 transMapEstV5,402 transMapRefSeqV5,25 transMapRefSeqV5,48 transMapRefSeqV5,73 transMapRefSeqV5,110 transMapRefSeqV5,166 transMapRefSeqV5,180 transMapRefSeqV5,359 transMapRefSeqV5,402 transMapRnaV5,25 transMapRnaV5,48 transMapRnaV5,73 transMapRnaV5,110 transMapRnaV5,166 transMapRnaV5,180 transMapRnaV5,359 transMapRnaV5,402 transMapV5,24 transMapV5,49 transMapV5,179 transMapV5,216 transMapV5,272 transMapV5,286 transMapV5,465 transMapV5,508 unipAliSwissprot,4 unipAliTrembl,4 uniprot,108 uniprot,135 uniprot,191 uniprot,807 uniprot,914 uniprot,1175 uniprot,1429 uniprot,1523 uniprot,1620 uniprot,1629 uniprot,1636 uniprot,1642 uniprot,1704 uniprot,1862 xenoRefGene,232 xenoRefGene,248 xenoRefGene,307 alignments augustusGene,300 chainGalGal6,9 chainGalGal6,63 chainGalGal6,450 chainGalGal6,603 chainGalGal6,615 chainGalGal6,623 chainGalGal6,650 chainGalGal6,768 chainGalGal6,1040 chainGalGal6,1105 chainNetGalGal6,12 chainNetGalGal6,66 chainNetGalGal6,453 chainNetGalGal6,606 chainNetGalGal6,618 chainNetGalGal6,626 chainNetGalGal6,653 chainNetGalGal6,771 chainNetGalGal6,1043 chainNetGalGal6,1108 chainNetGalGal6Viewchain,10 chainNetGalGal6Viewnet,10 chainNetXenTro7,15 chainNetXenTro7,69 chainNetXenTro7,463 chainNetXenTro7,617 chainNetXenTro7,629 chainNetXenTro7,637 chainNetXenTro7,665 chainNetXenTro7,783 chainNetXenTro7,1055 chainNetXenTro7,1120 chainNetXenTro7Viewchain,12 chainNetXenTro7Viewnet,12 chainNetXenTro9,14 chainNetXenTro9,68 chainNetXenTro9,460 chainNetXenTro9,614 chainNetXenTro9,626 chainNetXenTro9,634 chainNetXenTro9,662 chainNetXenTro9,780 chainNetXenTro9,1052 chainNetXenTro9,1117 chainNetXenTro9Viewchain,11 chainNetXenTro9Viewnet,11 chainXenTro7,12 chainXenTro7,66 chainXenTro7,460 chainXenTro7,614 chainXenTro7,626 chainXenTro7,634 chainXenTro7,662 chainXenTro7,780 chainXenTro7,1052 chainXenTro7,1117 chainXenTro9,11 chainXenTro9,65 chainXenTro9,457 chainXenTro9,611 chainXenTro9,623 chainXenTro9,631 chainXenTro9,659 chainXenTro9,777 chainXenTro9,1049 chainXenTro9,1114 ncbiRefSeqPsl,2 ncbiRefSeqPsl,4 netGalGal6,63 netGalGal6,450 netGalGal6,603 netGalGal6,615 netGalGal6,623 netGalGal6,650 netGalGal6,768 netGalGal6,1040 netGalGal6,1105 netXenTro7,66 netXenTro7,460 netXenTro7,614 netXenTro7,626 netXenTro7,634 netXenTro7,662 netXenTro7,780 netXenTro7,1052 netXenTro7,1117 netXenTro9,65 netXenTro9,457 netXenTro9,611 netXenTro9,623 netXenTro9,631 netXenTro9,659 netXenTro9,777 netXenTro9,1049 netXenTro9,1114 refSeqComposite,268 refSeqComposite,367 refSeqComposite,434 refSeqComposite,436 refSeqComposite,1211 refSeqComposite,1267 refSeqComposite,1424 rmsk,306 transMapEnsemblV5,21 transMapEnsemblV5,72 transMapEnsemblV5,155 transMapEnsemblV5,168 transMapEnsemblV5,327 transMapEnsemblV5,340 transMapEnsemblV5,350 transMapEnsemblV5,373 transMapEnsemblV5,444 transMapEnsemblV5,456 transMapEnsemblV5,771 transMapEstV5,19 transMapEstV5,41 transMapEstV5,124 transMapEstV5,137 transMapEstV5,296 transMapEstV5,309 transMapEstV5,319 transMapEstV5,342 transMapEstV5,413 transMapEstV5,425 transMapEstV5,740 transMapRefSeqV5,19 transMapRefSeqV5,41 transMapRefSeqV5,124 transMapRefSeqV5,137 transMapRefSeqV5,296 transMapRefSeqV5,309 transMapRefSeqV5,319 transMapRefSeqV5,342 transMapRefSeqV5,413 transMapRefSeqV5,425 transMapRefSeqV5,740 transMapRnaV5,19 transMapRnaV5,41 transMapRnaV5,124 transMapRnaV5,137 transMapRnaV5,296 transMapRnaV5,309 transMapRnaV5,319 transMapRnaV5,342 transMapRnaV5,413 transMapRnaV5,425 transMapRnaV5,740 transMapV5,4 transMapV5,18 transMapV5,40 transMapV5,68 transMapV5,86 transMapV5,128 transMapV5,141 transMapV5,230 transMapV5,243 transMapV5,402 transMapV5,415 transMapV5,425 transMapV5,448 transMapV5,519 transMapV5,531 transMapV5,846 uniprot,82 uniprot,100 uniprot,637 uniprot,793 uniprot,814 uniprot,876 uniprot,1138 uniprot,1148 uniprot,1161 uniprot,1309 uniprot,1410 uniprot,1487 xenoRefGene,257 aligns transMapV5,163 all augustusGene,207 chainGalGal6,622 chainNetGalGal6,625 chainNetXenTro7,636 chainNetXenTro9,633 chainXenTro7,633 chainXenTro9,630 cpgIslandExt,327 cpgIslandExt,527 cpgIslandExtUnmasked,6 cpgIslandExtUnmasked,330 cpgIslandExtUnmasked,530 cpgIslandSuper,327 cpgIslandSuper,527 ncbiRefSeq,2 nestedRepeats,138 nestedRepeats,170 netGalGal6,622 netXenTro7,633 netXenTro9,630 refSeqComposite,34 refSeqComposite,85 refSeqComposite,178 refSeqComposite,183 refSeqComposite,199 refSeqComposite,201 refSeqComposite,215 refSeqComposite,345 refSeqComposite,381 refSeqComposite,589 refSeqComposite,792 refSeqComposite,1410 refSeqComposite,1574 refSeqComposite,1666 refSeqComposite,1671 rmsk,65 transMapEnsemblV5,191 transMapEstV5,160 transMapRefSeqV5,160 transMapRnaV5,160 transMapV5,266 uniprot,89 uniprot,121 uniprot,204 uniprot,395 uniprot,956 uniprot,1107 uniprot,1167 uniprot,1311 uniprot,1337 uniprot,1343 uniprot,1418 uniprot,1542 uniprot,1685 uniprot,1979 allows augustusGene,168 chainGalGal6,81 chainNetGalGal6,84 chainNetXenTro7,89 chainNetXenTro9,87 chainXenTro7,86 chainXenTro9,84 netGalGal6,81 netXenTro7,86 netXenTro9,84 refSeqComposite,825 transMapEnsemblV5,119 transMapEnsemblV5,289 transMapEstV5,88 transMapEstV5,258 transMapRefSeqV5,88 transMapRefSeqV5,258 transMapRnaV5,88 transMapRnaV5,258 transMapV5,194 transMapV5,364 xenoRefGene,149 aln unipAliSwissprot,2 unipAliTrembl,2 alone augustusGene,33 along transMapEnsemblV5,182 transMapEstV5,151 transMapRefSeqV5,151 transMapRnaV5,151 transMapV5,257 alpha refSeqComposite,418 already chainGalGal6,813 chainNetGalGal6,816 chainNetXenTro7,828 chainNetXenTro9,825 chainXenTro7,825 chainXenTro9,822 netGalGal6,813 netXenTro7,825 netXenTro9,822 also chainGalGal6,92 chainNetGalGal6,95 chainNetXenTro7,100 chainNetXenTro9,98 chainXenTro7,97 chainXenTro9,95 cpgIslandExt,531 cpgIslandExtUnmasked,534 cpgIslandSuper,531 gap,32 gold,34 netGalGal6,92 netXenTro7,97 netXenTro9,95 refSeqComposite,1129 refSeqComposite,1321 refSeqComposite,1354 refSeqComposite,1586 transMapEnsemblV5,109 transMapEnsemblV5,144 transMapEnsemblV5,648 transMapEstV5,78 transMapEstV5,113 transMapEstV5,617 transMapRefSeqV5,78 transMapRefSeqV5,113 transMapRefSeqV5,617 transMapRnaV5,78 transMapRnaV5,113 transMapRnaV5,617 transMapV5,184 transMapV5,219 transMapV5,723 uniprot,666 uniprot,706 uniprot,1799 alt uniprot,850 alternating gold,90 alternative augustusGene,122 unipAliSwissprot,16 uniprot,163 uniprot,670 alternatives-from-sampling augustusGene,131 alus rmsk,160 always gold,121 uniprot,503 uniprot,960 uniprot,1411 uniprot,1579 ambiguous refSeqComposite,990 amino unipModif,4 unipMut,3 uniprot,338 uniprot,350 uniprot,619 amount rmsk,215 amsterdam genscan,201 an chainGalGal6,153 chainGalGal6,180 chainGalGal6,186 chainNetGalGal6,156 chainNetGalGal6,183 chainNetGalGal6,189 chainNetXenTro7,163 chainNetXenTro7,190 chainNetXenTro7,196 chainNetXenTro9,161 chainNetXenTro9,188 chainNetXenTro9,194 chainXenTro7,160 chainXenTro7,187 chainXenTro7,193 chainXenTro9,158 chainXenTro9,185 chainXenTro9,191 cpgIslandExt,66 cpgIslandExtUnmasked,69 cpgIslandSuper,66 gc5BaseBw,65 nestedRepeats,196 nestedRepeats,347 netGalGal6,153 netGalGal6,180 netGalGal6,186 netXenTro7,160 netXenTro7,187 netXenTro7,193 netXenTro9,158 netXenTro9,185 netXenTro9,191 refSeqComposite,748 refSeqComposite,819 refSeqComposite,1241 refSeqComposite,1773 rmsk,370 uniprot,765 uniprot,899 uniprot,1203 uniprot,1467 uniprot,1568 xenoRefGene,143 xenoRefGene,231 xenoRefGene,343 analysis refSeqComposite,76 refSeqComposite,1459 transMapEnsemblV5,540 transMapEstV5,509 transMapRefSeqV5,509 transMapRnaV5,509 transMapV5,615 uniprot,1648 uniprot,1728 analyze microsat,122 simpleRepeat,82 and augustusGene,9 augustusGene,60 augustusGene,74 augustusGene,87 augustusGene,206 augustusGene,271 augustusGene,277 augustusGene,296 augustusGene,327 chainGalGal6,98 chainGalGal6,113 chainGalGal6,229 chainGalGal6,237 chainGalGal6,251 chainGalGal6,291 chainGalGal6,313 chainGalGal6,439 chainGalGal6,594 chainGalGal6,629 chainGalGal6,638 chainGalGal6,779 chainGalGal6,857 chainGalGal6,889 chainGalGal6,900 chainGalGal6,909 chainGalGal6,934 chainGalGal6,949 chainGalGal6,974 chainGalGal6,980 chainGalGal6,986 chainGalGal6,993 chainGalGal6,999 chainGalGal6,1063 chainGalGal6,1068 chainNetGalGal6,10 chainNetGalGal6,101 chainNetGalGal6,116 chainNetGalGal6,232 chainNetGalGal6,240 chainNetGalGal6,254 chainNetGalGal6,294 chainNetGalGal6,316 chainNetGalGal6,442 chainNetGalGal6,597 chainNetGalGal6,632 chainNetGalGal6,641 chainNetGalGal6,782 chainNetGalGal6,860 chainNetGalGal6,892 chainNetGalGal6,903 chainNetGalGal6,912 chainNetGalGal6,937 chainNetGalGal6,952 chainNetGalGal6,977 chainNetGalGal6,983 chainNetGalGal6,989 chainNetGalGal6,996 chainNetGalGal6,1002 chainNetGalGal6,1066 chainNetGalGal6,1071 chainNetGalGal6Viewchain,8 chainNetGalGal6Viewnet,8 chainNetXenTro7,13 chainNetXenTro7,107 chainNetXenTro7,122 chainNetXenTro7,239 chainNetXenTro7,247 chainNetXenTro7,261 chainNetXenTro7,302 chainNetXenTro7,326 chainNetXenTro7,452 chainNetXenTro7,608 chainNetXenTro7,644 chainNetXenTro7,653 chainNetXenTro7,794 chainNetXenTro7,872 chainNetXenTro7,904 chainNetXenTro7,915 chainNetXenTro7,924 chainNetXenTro7,949 chainNetXenTro7,964 chainNetXenTro7,989 chainNetXenTro7,995 chainNetXenTro7,1001 chainNetXenTro7,1008 chainNetXenTro7,1014 chainNetXenTro7,1078 chainNetXenTro7,1083 chainNetXenTro7Viewchain,10 chainNetXenTro7Viewnet,10 chainNetXenTro9,12 chainNetXenTro9,105 chainNetXenTro9,120 chainNetXenTro9,237 chainNetXenTro9,245 chainNetXenTro9,259 chainNetXenTro9,300 chainNetXenTro9,323 chainNetXenTro9,449 chainNetXenTro9,605 chainNetXenTro9,641 chainNetXenTro9,650 chainNetXenTro9,791 chainNetXenTro9,869 chainNetXenTro9,901 chainNetXenTro9,912 chainNetXenTro9,921 chainNetXenTro9,946 chainNetXenTro9,961 chainNetXenTro9,986 chainNetXenTro9,992 chainNetXenTro9,998 chainNetXenTro9,1005 chainNetXenTro9,1011 chainNetXenTro9,1075 chainNetXenTro9,1080 chainNetXenTro9Viewchain,9 chainNetXenTro9Viewnet,9 chainXenTro7,104 chainXenTro7,119 chainXenTro7,236 chainXenTro7,244 chainXenTro7,258 chainXenTro7,299 chainXenTro7,323 chainXenTro7,449 chainXenTro7,605 chainXenTro7,641 chainXenTro7,650 chainXenTro7,791 chainXenTro7,869 chainXenTro7,901 chainXenTro7,912 chainXenTro7,921 chainXenTro7,946 chainXenTro7,961 chainXenTro7,986 chainXenTro7,992 chainXenTro7,998 chainXenTro7,1005 chainXenTro7,1011 chainXenTro7,1075 chainXenTro7,1080 chainXenTro9,102 chainXenTro9,117 chainXenTro9,234 chainXenTro9,242 chainXenTro9,256 chainXenTro9,297 chainXenTro9,320 chainXenTro9,446 chainXenTro9,602 chainXenTro9,638 chainXenTro9,647 chainXenTro9,788 chainXenTro9,866 chainXenTro9,898 chainXenTro9,909 chainXenTro9,918 chainXenTro9,943 chainXenTro9,958 chainXenTro9,983 chainXenTro9,989 chainXenTro9,995 chainXenTro9,1002 chainXenTro9,1008 chainXenTro9,1072 chainXenTro9,1077 cpgIslandExt,12 cpgIslandExt,35 cpgIslandExt,183 cpgIslandExt,244 cpgIslandExt,248 cpgIslandExt,295 cpgIslandExt,508 cpgIslandExt,599 cpgIslandExtUnmasked,15 cpgIslandExtUnmasked,38 cpgIslandExtUnmasked,186 cpgIslandExtUnmasked,247 cpgIslandExtUnmasked,251 cpgIslandExtUnmasked,298 cpgIslandExtUnmasked,511 cpgIslandExtUnmasked,602 cpgIslandSuper,12 cpgIslandSuper,35 cpgIslandSuper,183 cpgIslandSuper,244 cpgIslandSuper,248 cpgIslandSuper,295 cpgIslandSuper,508 cpgIslandSuper,599 cytoBandIdeo,8 gap,5 gap,81 gap,103 gc5BaseBw,9 gc5BaseBw,22 gc5BaseBw,74 genscan,7 genscan,30 genscan,40 genscan,46 genscan,63 genscan,83 genscan,97 genscan,108 genscan,119 genscan,138 genscan,147 gold,6 gold,92 gold,106 gold,112 microsat,4 microsat,8 microsat,33 microsat,36 microsat,67 microsat,72 microsat,75 ncbiRefSeq,7 ncbiRefSeq,16 ncbiRefSeqGenomicDiff,8 ncbiRefSeqGenomicDiff,13 ncbiRefSeqOther,16 ncbiRefSeqPredicted,12 ncbiRefSeqPsl,8 nestedRepeats,12 nestedRepeats,38 nestedRepeats,113 nestedRepeats,162 nestedRepeats,166 nestedRepeats,231 nestedRepeats,256 nestedRepeats,309 nestedRepeats,315 nestedRepeats,346 nestedRepeats,375 netGalGal6,98 netGalGal6,113 netGalGal6,229 netGalGal6,237 netGalGal6,251 netGalGal6,291 netGalGal6,313 netGalGal6,439 netGalGal6,594 netGalGal6,629 netGalGal6,638 netGalGal6,779 netGalGal6,857 netGalGal6,889 netGalGal6,900 netGalGal6,909 netGalGal6,934 netGalGal6,949 netGalGal6,974 netGalGal6,980 netGalGal6,986 netGalGal6,993 netGalGal6,999 netGalGal6,1063 netGalGal6,1068 netXenTro7,104 netXenTro7,119 netXenTro7,236 netXenTro7,244 netXenTro7,258 netXenTro7,299 netXenTro7,323 netXenTro7,449 netXenTro7,605 netXenTro7,641 netXenTro7,650 netXenTro7,791 netXenTro7,869 netXenTro7,901 netXenTro7,912 netXenTro7,921 netXenTro7,946 netXenTro7,961 netXenTro7,986 netXenTro7,992 netXenTro7,998 netXenTro7,1005 netXenTro7,1011 netXenTro7,1075 netXenTro7,1080 netXenTro9,102 netXenTro9,117 netXenTro9,234 netXenTro9,242 netXenTro9,256 netXenTro9,297 netXenTro9,320 netXenTro9,446 netXenTro9,602 netXenTro9,638 netXenTro9,647 netXenTro9,788 netXenTro9,866 netXenTro9,898 netXenTro9,909 netXenTro9,918 netXenTro9,943 netXenTro9,958 netXenTro9,983 netXenTro9,989 netXenTro9,995 netXenTro9,1002 netXenTro9,1008 netXenTro9,1072 netXenTro9,1077 refSeqComposite,8 refSeqComposite,22 refSeqComposite,72 refSeqComposite,110 refSeqComposite,120 refSeqComposite,143 refSeqComposite,192 refSeqComposite,203 refSeqComposite,231 refSeqComposite,257 refSeqComposite,265 refSeqComposite,273 refSeqComposite,301 refSeqComposite,365 refSeqComposite,469 refSeqComposite,493 refSeqComposite,575 refSeqComposite,594 refSeqComposite,657 refSeqComposite,667 refSeqComposite,707 refSeqComposite,719 refSeqComposite,805 refSeqComposite,830 refSeqComposite,863 refSeqComposite,883 refSeqComposite,915 refSeqComposite,957 refSeqComposite,973 refSeqComposite,996 refSeqComposite,1011 refSeqComposite,1128 refSeqComposite,1147 refSeqComposite,1173 refSeqComposite,1178 refSeqComposite,1278 refSeqComposite,1373 refSeqComposite,1475 refSeqComposite,1493 refSeqComposite,1633 refSeqComposite,1674 refSeqComposite,1724 refSeqComposite,1810 rmsk,7 rmsk,28 rmsk,137 rmsk,221 rmsk,332 rmsk,338 rmsk,369 rmsk,398 simpleRepeat,9 simpleRepeat,42 transMapEnsemblV5,5 transMapEnsemblV5,11 transMapEnsemblV5,43 transMapEnsemblV5,94 transMapEnsemblV5,174 transMapEnsemblV5,199 transMapEnsemblV5,366 transMapEnsemblV5,368 transMapEnsemblV5,392 transMapEnsemblV5,409 transMapEnsemblV5,435 transMapEnsemblV5,466 transMapEnsemblV5,482 transMapEnsemblV5,497 transMapEnsemblV5,554 transMapEnsemblV5,639 transMapEnsemblV5,688 transMapEnsemblV5,702 transMapEnsemblV5,709 transMapEnsemblV5,767 transMapEstV5,9 transMapEstV5,63 transMapEstV5,143 transMapEstV5,168 transMapEstV5,335 transMapEstV5,337 transMapEstV5,361 transMapEstV5,378 transMapEstV5,404 transMapEstV5,435 transMapEstV5,451 transMapEstV5,466 transMapEstV5,523 transMapEstV5,608 transMapEstV5,657 transMapEstV5,671 transMapEstV5,678 transMapEstV5,736 transMapRefSeqV5,10 transMapRefSeqV5,63 transMapRefSeqV5,143 transMapRefSeqV5,168 transMapRefSeqV5,335 transMapRefSeqV5,337 transMapRefSeqV5,361 transMapRefSeqV5,378 transMapRefSeqV5,404 transMapRefSeqV5,435 transMapRefSeqV5,451 transMapRefSeqV5,466 transMapRefSeqV5,523 transMapRefSeqV5,608 transMapRefSeqV5,657 transMapRefSeqV5,671 transMapRefSeqV5,678 transMapRefSeqV5,736 transMapRnaV5,10 transMapRnaV5,63 transMapRnaV5,143 transMapRnaV5,168 transMapRnaV5,335 transMapRnaV5,337 transMapRnaV5,361 transMapRnaV5,378 transMapRnaV5,404 transMapRnaV5,435 transMapRnaV5,451 transMapRnaV5,466 transMapRnaV5,523 transMapRnaV5,608 transMapRnaV5,657 transMapRnaV5,671 transMapRnaV5,678 transMapRnaV5,736 transMapV5,8 transMapV5,16 transMapV5,74 transMapV5,88 transMapV5,139 transMapV5,162 transMapV5,169 transMapV5,249 transMapV5,274 transMapV5,441 transMapV5,443 transMapV5,467 transMapV5,484 transMapV5,510 transMapV5,541 transMapV5,557 transMapV5,572 transMapV5,629 transMapV5,714 transMapV5,763 transMapV5,777 transMapV5,784 transMapV5,842 ucscToINSDC,11 ucscToRefSeq,6 unipAliSwissprot,19 unipAliTrembl,11 unipChain,9 unipConflict,7 unipDisulfBond,7 unipDomain,5 unipInterest,7 unipLocCytopl,6 unipLocExtra,6 unipLocSignal,7 unipLocTransMemb,6 unipModif,8 unipMut,7 unipOther,7 unipRepeat,5 unipStruct,9 uniprot,8 uniprot,17 uniprot,174 uniprot,329 uniprot,345 uniprot,355 uniprot,369 uniprot,378 uniprot,403 uniprot,433 uniprot,439 uniprot,448 uniprot,488 uniprot,517 uniprot,568 uniprot,589 uniprot,611 uniprot,617 uniprot,702 uniprot,761 uniprot,796 uniprot,866 uniprot,926 uniprot,939 uniprot,1122 uniprot,1214 uniprot,1310 uniprot,1342 uniprot,1375 uniprot,1420 uniprot,1465 uniprot,1498 uniprot,1598 uniprot,1617 uniprot,1650 uniprot,1691 uniprot,1790 uniprot,1898 uniprot,1958 uniprot,1970 uniprot,2028 uniprot,2036 windowmaskerSdust,10 xenoRefGene,8 xenoRefGene,17 xenoRefGene,45 xenoRefGene,79 xenoRefGene,129 xenoRefGene,154 xenoRefGene,187 xenoRefGene,200 xenoRefGene,268 xenoRefGene,295 xenoRefGene,380 annot unipOther,2 annotated refSeqComposite,558 rmsk,67 uniprot,736 uniprot,994 uniprot,1014 uniprot,1027 uniprot,1034 uniprot,1040 uniprot,1053 uniprot,1082 uniprot,1233 uniprot,1265 annotation chainGalGal6,302 chainNetGalGal6,305 chainNetXenTro7,314 chainNetXenTro9,312 chainXenTro7,311 chainXenTro9,309 netGalGal6,302 netXenTro7,311 netXenTro9,309 refSeqComposite,67 refSeqComposite,668 refSeqComposite,1117 refSeqComposite,1146 refSeqComposite,1192 rmsk,38 transMapEnsemblV5,609 transMapEstV5,578 transMapRefSeqV5,578 transMapRnaV5,578 transMapV5,684 uniprot,143 uniprot,466 uniprot,487 uniprot,530 uniprot,605 uniprot,624 uniprot,1731 annotationonprotein uniprot,1929 annotations genscan,120 ncbiRefSeqOther,6 nestedRepeats,71 refSeqComposite,191 refSeqComposite,197 refSeqComposite,205 refSeqComposite,220 refSeqComposite,349 refSeqComposite,383 refSeqComposite,483 refSeqComposite,864 refSeqComposite,1471 refSeqComposite,1503 refSeqComposite,1539 transMapEnsemblV5,60 transMapEnsemblV5,542 transMapEnsemblV5,703 transMapEnsemblV5,711 transMapEstV5,511 transMapEstV5,672 transMapEstV5,680 transMapRefSeqV5,511 transMapRefSeqV5,672 transMapRefSeqV5,680 transMapRnaV5,511 transMapRnaV5,672 transMapRnaV5,680 transMapV5,76 transMapV5,617 transMapV5,778 transMapV5,786 unipOther,5 unipStruct,7 uniprot,6 uniprot,18 uniprot,54 uniprot,96 uniprot,128 uniprot,171 uniprot,212 uniprot,363 uniprot,394 uniprot,397 uniprot,455 uniprot,501 uniprot,595 uniprot,631 uniprot,662 uniprot,704 uniprot,718 uniprot,763 uniprot,1438 uniprot,1504 uniprot,1514 uniprot,1757 xenoRefGene,188 another refSeqComposite,327 transMapV5,81 any refSeqComposite,274 refSeqComposite,1356 uniprot,660 uniprot,1146 uniprot,1250 api cpgIslandExt,519 cpgIslandExtUnmasked,522 cpgIslandSuper,519 refSeqComposite,1312 refSeqComposite,1366 transMapEnsemblV5,566 transMapEstV5,535 transMapRefSeqV5,535 transMapRnaV5,535 transMapV5,641 appending transMapEnsemblV5,399 transMapEstV5,368 transMapRefSeqV5,368 transMapRnaV5,368 transMapV5,474 approach uniprot,1531 appropriate refSeqComposite,775 xenoRefGene,112 apr genscan,224 refSeqComposite,1742 xenoRefGene,312 apsects gc5BaseBw,51 arbitrary refSeqComposite,941 archive refSeqComposite,1708 uniprot,893 uniprot,1670 uniprot,1908 archives refSeqComposite,1347 refSeqComposite,1692 uniprot,1832 are augustusGene,27 chainGalGal6,21 chainGalGal6,40 chainGalGal6,53 chainGalGal6,142 chainGalGal6,212 chainGalGal6,223 chainGalGal6,324 chainGalGal6,393 chainGalGal6,414 chainGalGal6,421 chainGalGal6,504 chainGalGal6,695 chainNetGalGal6,24 chainNetGalGal6,43 chainNetGalGal6,56 chainNetGalGal6,145 chainNetGalGal6,215 chainNetGalGal6,226 chainNetGalGal6,327 chainNetGalGal6,396 chainNetGalGal6,417 chainNetGalGal6,424 chainNetGalGal6,507 chainNetGalGal6,698 chainNetXenTro7,27 chainNetXenTro7,46 chainNetXenTro7,59 chainNetXenTro7,151 chainNetXenTro7,222 chainNetXenTro7,233 chainNetXenTro7,337 chainNetXenTro7,406 chainNetXenTro7,427 chainNetXenTro7,434 chainNetXenTro7,517 chainNetXenTro7,710 chainNetXenTro9,26 chainNetXenTro9,45 chainNetXenTro9,58 chainNetXenTro9,149 chainNetXenTro9,220 chainNetXenTro9,231 chainNetXenTro9,334 chainNetXenTro9,403 chainNetXenTro9,424 chainNetXenTro9,431 chainNetXenTro9,514 chainNetXenTro9,707 chainXenTro7,24 chainXenTro7,43 chainXenTro7,56 chainXenTro7,148 chainXenTro7,219 chainXenTro7,230 chainXenTro7,334 chainXenTro7,403 chainXenTro7,424 chainXenTro7,431 chainXenTro7,514 chainXenTro7,707 chainXenTro9,23 chainXenTro9,42 chainXenTro9,55 chainXenTro9,146 chainXenTro9,217 chainXenTro9,228 chainXenTro9,331 chainXenTro9,400 chainXenTro9,421 chainXenTro9,428 chainXenTro9,511 chainXenTro9,704 cpgIslandExt,8 cpgIslandExt,17 cpgIslandExt,28 cpgIslandExt,116 cpgIslandExt,149 cpgIslandExt,153 cpgIslandExtUnmasked,11 cpgIslandExtUnmasked,20 cpgIslandExtUnmasked,31 cpgIslandExtUnmasked,119 cpgIslandExtUnmasked,152 cpgIslandExtUnmasked,156 cpgIslandSuper,8 cpgIslandSuper,17 cpgIslandSuper,28 cpgIslandSuper,116 cpgIslandSuper,149 cpgIslandSuper,153 gap,24 gap,69 genscan,25 genscan,160 gold,26 gold,84 gold,101 microsat,16 microsat,25 microsat,52 nestedRepeats,74 nestedRepeats,102 nestedRepeats,140 nestedRepeats,146 nestedRepeats,164 nestedRepeats,172 nestedRepeats,181 nestedRepeats,209 nestedRepeats,274 nestedRepeats,281 netGalGal6,21 netGalGal6,40 netGalGal6,53 netGalGal6,142 netGalGal6,212 netGalGal6,223 netGalGal6,324 netGalGal6,393 netGalGal6,414 netGalGal6,421 netGalGal6,504 netGalGal6,695 netXenTro7,24 netXenTro7,43 netXenTro7,56 netXenTro7,148 netXenTro7,219 netXenTro7,230 netXenTro7,334 netXenTro7,403 netXenTro7,424 netXenTro7,431 netXenTro7,514 netXenTro7,707 netXenTro9,23 netXenTro9,42 netXenTro9,55 netXenTro9,146 netXenTro9,217 netXenTro9,228 netXenTro9,331 netXenTro9,400 netXenTro9,421 netXenTro9,428 netXenTro9,511 netXenTro9,704 refSeqComposite,180 refSeqComposite,233 refSeqComposite,407 refSeqComposite,428 refSeqComposite,768 refSeqComposite,893 refSeqComposite,935 refSeqComposite,999 refSeqComposite,1026 refSeqComposite,1343 refSeqComposite,1377 refSeqComposite,1400 refSeqComposite,1478 rmsk,43 rmsk,288 rmsk,304 rmsk,312 simpleRepeat,49 transMapEnsemblV5,55 transMapEnsemblV5,73 transMapEnsemblV5,454 transMapEnsemblV5,461 transMapEnsemblV5,470 transMapEnsemblV5,504 transMapEnsemblV5,514 transMapEnsemblV5,543 transMapEnsemblV5,582 transMapEstV5,42 transMapEstV5,423 transMapEstV5,430 transMapEstV5,439 transMapEstV5,473 transMapEstV5,483 transMapEstV5,512 transMapEstV5,551 transMapRefSeqV5,42 transMapRefSeqV5,423 transMapRefSeqV5,430 transMapRefSeqV5,439 transMapRefSeqV5,473 transMapRefSeqV5,483 transMapRefSeqV5,512 transMapRefSeqV5,551 transMapRnaV5,42 transMapRnaV5,423 transMapRnaV5,430 transMapRnaV5,439 transMapRnaV5,473 transMapRnaV5,483 transMapRnaV5,512 transMapRnaV5,551 transMapV5,41 transMapV5,69 transMapV5,529 transMapV5,536 transMapV5,545 transMapV5,579 transMapV5,589 transMapV5,618 transMapV5,657 uniprot,55 uniprot,93 uniprot,124 uniprot,146 uniprot,165 uniprot,175 uniprot,208 uniprot,456 uniprot,502 uniprot,555 uniprot,579 uniprot,596 uniprot,644 uniprot,679 uniprot,735 uniprot,868 uniprot,880 uniprot,1006 uniprot,1013 uniprot,1033 uniprot,1061 uniprot,1086 uniprot,1117 uniprot,1149 uniprot,1318 uniprot,1350 uniprot,1425 uniprot,1433 uniprot,1454 uniprot,1659 uniprot,1867 uniprot,1895 xenoRefGene,40 xenoRefGene,105 xenoRefGene,203 areas cpgIslandExt,305 cpgIslandExtUnmasked,308 cpgIslandSuper,305 gc5BaseBw,37 arian chainGalGal6,947 chainNetGalGal6,950 chainNetXenTro7,962 chainNetXenTro9,959 chainXenTro7,959 chainXenTro9,956 nestedRepeats,305 netGalGal6,947 netXenTro7,959 netXenTro9,956 rmsk,16 rmsk,328 arrangement cpgIslandExt,67 cpgIslandExtUnmasked,70 cpgIslandSuper,67 arrows nestedRepeats,145 nestedRepeats,163 articles refSeqComposite,1105 as augustusGene,77 augustusGene,79 chainGalGal6,466 chainGalGal6,506 chainGalGal6,529 chainGalGal6,544 chainGalGal6,806 chainGalGal6,861 chainGalGal6,919 chainNetGalGal6,469 chainNetGalGal6,509 chainNetGalGal6,532 chainNetGalGal6,547 chainNetGalGal6,809 chainNetGalGal6,864 chainNetGalGal6,922 chainNetXenTro7,479 chainNetXenTro7,519 chainNetXenTro7,542 chainNetXenTro7,557 chainNetXenTro7,821 chainNetXenTro7,876 chainNetXenTro7,934 chainNetXenTro9,476 chainNetXenTro9,516 chainNetXenTro9,539 chainNetXenTro9,554 chainNetXenTro9,818 chainNetXenTro9,873 chainNetXenTro9,931 chainXenTro7,476 chainXenTro7,516 chainXenTro7,539 chainXenTro7,554 chainXenTro7,818 chainXenTro7,873 chainXenTro7,931 chainXenTro9,473 chainXenTro9,513 chainXenTro9,536 chainXenTro9,551 chainXenTro9,815 chainXenTro9,870 chainXenTro9,928 cpgIslandExt,165 cpgIslandExt,548 cpgIslandExt,550 cpgIslandExtUnmasked,168 cpgIslandExtUnmasked,551 cpgIslandExtUnmasked,553 cpgIslandSuper,165 cpgIslandSuper,548 cpgIslandSuper,550 gap,71 genscan,35 genscan,37 microsat,21 nestedRepeats,125 netGalGal6,466 netGalGal6,506 netGalGal6,529 netGalGal6,544 netGalGal6,806 netGalGal6,861 netGalGal6,919 netXenTro7,476 netXenTro7,516 netXenTro7,539 netXenTro7,554 netXenTro7,818 netXenTro7,873 netXenTro7,931 netXenTro9,473 netXenTro9,513 netXenTro9,536 netXenTro9,551 netXenTro9,815 netXenTro9,870 netXenTro9,928 refSeqComposite,414 refSeqComposite,506 refSeqComposite,526 refSeqComposite,539 refSeqComposite,626 refSeqComposite,894 refSeqComposite,1223 refSeqComposite,1405 refSeqComposite,1521 refSeqComposite,1641 rmsk,53 rmsk,55 transMapEnsemblV5,65 transMapEnsemblV5,188 transMapEnsemblV5,215 transMapEnsemblV5,227 transMapEnsemblV5,516 transMapEnsemblV5,627 transMapEstV5,157 transMapEstV5,184 transMapEstV5,196 transMapEstV5,485 transMapEstV5,596 transMapRefSeqV5,157 transMapRefSeqV5,184 transMapRefSeqV5,196 transMapRefSeqV5,485 transMapRefSeqV5,596 transMapRnaV5,157 transMapRnaV5,184 transMapRnaV5,196 transMapRnaV5,485 transMapRnaV5,596 transMapV5,263 transMapV5,290 transMapV5,302 transMapV5,591 transMapV5,702 uniprot,307 uniprot,598 uniprot,600 uniprot,621 uniprot,1100 uniprot,1778 windowmaskerSdust,18 ascii uniprot,1762 ask refSeqComposite,123 aspect refSeqComposite,709 assemblies augustusGene,196 augustusGene,237 chainGalGal6,323 chainGalGal6,586 chainNetGalGal6,326 chainNetGalGal6,589 chainNetXenTro7,336 chainNetXenTro7,600 chainNetXenTro9,333 chainNetXenTro9,597 chainXenTro7,333 chainXenTro7,597 chainXenTro9,330 chainXenTro9,594 gap,131 netGalGal6,323 netGalGal6,586 netXenTro7,333 netXenTro7,597 netXenTro9,330 netXenTro9,594 refSeqComposite,184 rmsk,107 transMapEnsemblV5,193 transMapEstV5,162 transMapRefSeqV5,162 transMapRnaV5,162 transMapV5,268 assembly augustusGene,197 chainGalGal6,151 chainGalGal6,159 chainGalGal6,310 chainNetGalGal6,154 chainNetGalGal6,162 chainNetGalGal6,313 chainNetXenTro7,161 chainNetXenTro7,169 chainNetXenTro7,323 chainNetXenTro9,159 chainNetXenTro9,167 chainNetXenTro9,320 chainXenTro7,158 chainXenTro7,166 chainXenTro7,320 chainXenTro9,156 chainXenTro9,164 chainXenTro9,317 gap,20 gap,22 gap,29 gap,38 gap,46 gap,117 gold,1 gold,2 gold,22 gold,24 gold,31 gold,40 gold,45 netGalGal6,151 netGalGal6,159 netGalGal6,310 netXenTro7,158 netXenTro7,166 netXenTro7,320 netXenTro9,156 netXenTro9,164 netXenTro9,317 refSeqComposite,371 refSeqComposite,479 transMapV5,106 transMapV5,124 transMapV5,135 ucscToINSDC,40 ucscToRefSeq,34 uniprot,445 uniprot,701 assembly.2bit cpgIslandExt,412 cpgIslandExtUnmasked,415 cpgIslandSuper,412 assessing refSeqComposite,653 assigned transMapEnsemblV5,462 transMapEstV5,431 transMapRefSeqV5,431 transMapRnaV5,431 transMapV5,537 associated cpgIslandExt,18 cpgIslandExt,38 cpgIslandExt,510 cpgIslandExtUnmasked,21 cpgIslandExtUnmasked,41 cpgIslandExtUnmasked,513 cpgIslandSuper,18 cpgIslandSuper,38 cpgIslandSuper,510 gc5BaseBw,34 refSeqComposite,1401 rmsk,224 simpleRepeat,51 transMapEnsemblV5,583 transMapEstV5,552 transMapRefSeqV5,552 transMapRnaV5,552 transMapV5,658 uniprot,787 associates ucscToINSDC,16 ucscToRefSeq,11 association refSeqComposite,685 astashyn refSeqComposite,1758 xenoRefGene,328 at chainGalGal6,423 chainGalGal6,801 chainGalGal6,923 chainGalGal6,958 chainGalGal6,963 chainGalGal6,1004 chainNetGalGal6,426 chainNetGalGal6,804 chainNetGalGal6,926 chainNetGalGal6,961 chainNetGalGal6,966 chainNetGalGal6,1007 chainNetXenTro7,436 chainNetXenTro7,816 chainNetXenTro7,938 chainNetXenTro7,973 chainNetXenTro7,978 chainNetXenTro7,1019 chainNetXenTro9,433 chainNetXenTro9,813 chainNetXenTro9,935 chainNetXenTro9,970 chainNetXenTro9,975 chainNetXenTro9,1016 chainXenTro7,433 chainXenTro7,813 chainXenTro7,935 chainXenTro7,970 chainXenTro7,975 chainXenTro7,1016 chainXenTro9,430 chainXenTro9,810 chainXenTro9,932 chainXenTro9,967 chainXenTro9,972 chainXenTro9,1013 cpgIslandExt,155 cpgIslandExt,218 cpgIslandExt,235 cpgIslandExtUnmasked,158 cpgIslandExtUnmasked,221 cpgIslandExtUnmasked,238 cpgIslandSuper,155 cpgIslandSuper,218 cpgIslandSuper,235 microsat,28 microsat,77 netGalGal6,423 netGalGal6,801 netGalGal6,923 netGalGal6,958 netGalGal6,963 netGalGal6,1004 netXenTro7,433 netXenTro7,813 netXenTro7,935 netXenTro7,970 netXenTro7,975 netXenTro7,1016 netXenTro9,430 netXenTro9,810 netXenTro9,932 netXenTro9,967 netXenTro9,972 netXenTro9,1013 refSeqComposite,735 refSeqComposite,1050 refSeqComposite,1154 refSeqComposite,1279 refSeqComposite,1716 rmsk,243 rmsk,267 transMapEnsemblV5,295 transMapEnsemblV5,684 transMapEstV5,264 transMapEstV5,653 transMapRefSeqV5,264 transMapRefSeqV5,653 transMapRnaV5,264 transMapRnaV5,653 transMapV5,118 transMapV5,370 transMapV5,759 ucscToINSDC,3 uniprot,825 uniprot,1946 uniprot,1991 xenoRefGene,93 xenoRefGene,269 xenoRefGene,285 augustus augustusGene,1 augustusGene,2 augustusGene,22 augustusGene,148 augustusGene,256 uniprot,835 uniprot,867 auml windowmaskerSdust,95 automated transMapEnsemblV5,539 transMapEstV5,508 transMapRefSeqV5,508 transMapRnaV5,508 transMapV5,614 uniprot,1468 uniprot,1727 automatically uniprot,1565 av uniprot,2015 available augustusGene,239 cpgIslandExt,543 cpgIslandExtUnmasked,546 cpgIslandSuper,543 nestedRepeats,259 nestedRepeats,276 refSeqComposite,181 refSeqComposite,277 refSeqComposite,476 refSeqComposite,569 refSeqComposite,654 refSeqComposite,1344 refSeqComposite,1596 rmsk,73 transMapEnsemblV5,189 transMapEnsemblV5,247 transMapEstV5,158 transMapEstV5,216 transMapRefSeqV5,158 transMapRefSeqV5,216 transMapRnaV5,158 transMapRnaV5,216 transMapV5,264 transMapV5,322 uniprot,881 uniprot,1660 uniprot,1981 windowmaskerSdust,40 average nestedRepeats,186 nestedRepeats,221 aware uniprot,1456 awk cpgIslandExt,424 cpgIslandExtUnmasked,427 cpgIslandSuper,424 axt chainGalGal6,607 chainGalGal6,614 chainNetGalGal6,610 chainNetGalGal6,617 chainNetXenTro7,621 chainNetXenTro7,628 chainNetXenTro9,618 chainNetXenTro9,625 chainXenTro7,618 chainXenTro7,625 chainXenTro9,615 chainXenTro9,622 netGalGal6,607 netGalGal6,614 netXenTro7,618 netXenTro7,625 netXenTro9,615 netXenTro9,622 axtchain chainGalGal6,619 chainGalGal6,706 chainGalGal6,954 chainNetGalGal6,622 chainNetGalGal6,709 chainNetGalGal6,957 chainNetXenTro7,633 chainNetXenTro7,721 chainNetXenTro7,969 chainNetXenTro9,630 chainNetXenTro9,718 chainNetXenTro9,966 chainXenTro7,630 chainXenTro7,718 chainXenTro7,966 chainXenTro9,627 chainXenTro9,715 chainXenTro9,963 netGalGal6,619 netGalGal6,706 netGalGal6,954 netXenTro7,630 netXenTro7,718 netXenTro7,966 netXenTro9,627 netXenTro9,715 netXenTro9,963 b transMapEnsemblV5,720 transMapEnsemblV5,730 transMapEstV5,689 transMapEstV5,699 transMapRefSeqV5,689 transMapRefSeqV5,699 transMapRnaV5,689 transMapRnaV5,699 transMapV5,795 transMapV5,805 back chainGalGal6,599 chainNetGalGal6,602 chainNetXenTro7,613 chainNetXenTro9,610 chainXenTro7,610 chainXenTro9,607 netGalGal6,599 netXenTro7,610 netXenTro9,607 baertsch augustusGene,290 chainGalGal6,992 chainGalGal6,1050 chainGalGal6,1096 chainNetGalGal6,995 chainNetGalGal6,1053 chainNetGalGal6,1099 chainNetXenTro7,1007 chainNetXenTro7,1065 chainNetXenTro7,1111 chainNetXenTro9,1004 chainNetXenTro9,1062 chainNetXenTro9,1108 chainXenTro7,1004 chainXenTro7,1062 chainXenTro7,1108 chainXenTro9,1001 chainXenTro9,1059 chainXenTro9,1105 netGalGal6,992 netGalGal6,1050 netGalGal6,1096 netXenTro7,1004 netXenTro7,1062 netXenTro7,1108 netXenTro9,1001 netXenTro9,1059 netXenTro9,1105 transMapEnsemblV5,761 transMapEstV5,730 transMapRefSeqV5,730 transMapRnaV5,730 transMapV5,836 bairoch uniprot,2022 band cytoBandIdeo,2 base cpgIslandExt,46 cpgIslandExt,53 cpgIslandExt,234 cpgIslandExtUnmasked,49 cpgIslandExtUnmasked,56 cpgIslandExtUnmasked,237 cpgIslandSuper,46 cpgIslandSuper,53 cpgIslandSuper,234 refSeqComposite,1262 refSeqComposite,1270 refSeqComposite,1282 rmsk,217 rmsk,219 rmsk,222 xenoRefGene,252 xenoRefGene,260 xenoRefGene,272 base-level transMapEnsemblV5,321 transMapEstV5,290 transMapRefSeqV5,290 transMapRnaV5,290 transMapV5,396 based augustusGene,28 chainGalGal6,326 chainGalGal6,352 chainNetGalGal6,329 chainNetGalGal6,355 chainNetXenTro7,339 chainNetXenTro7,365 chainNetXenTro9,336 chainNetXenTro9,362 chainXenTro7,336 chainXenTro7,362 chainXenTro9,333 chainXenTro9,359 genscan,26 netGalGal6,326 netGalGal6,352 netXenTro7,336 netXenTro7,362 netXenTro9,333 netXenTro9,359 refSeqComposite,252 refSeqComposite,360 uniprot,60 uniprot,727 uniprot,1604 bases cpgIslandExt,7 cpgIslandExt,353 cpgIslandExtUnmasked,10 cpgIslandExtUnmasked,356 cpgIslandSuper,7 cpgIslandSuper,353 gap,140 gc5BaseBw,25 refSeqComposite,901 transMapV5,166 basis cpgIslandExt,289 cpgIslandExtUnmasked,292 cpgIslandSuper,289 uniprot,1570 bc149621.1 transMapEnsemblV5,459 transMapEstV5,428 transMapRefSeqV5,428 transMapRnaV5,428 transMapV5,534 bc149621.1-1 transMapEnsemblV5,465 transMapEnsemblV5,476 transMapEstV5,434 transMapEstV5,445 transMapRefSeqV5,434 transMapRefSeqV5,445 transMapRnaV5,434 transMapRnaV5,445 transMapV5,540 transMapV5,551 bc149621.1-1.1 transMapEnsemblV5,487 transMapEstV5,456 transMapRefSeqV5,456 transMapRnaV5,456 transMapV5,562 bc149621.1-2 transMapEnsemblV5,467 transMapEnsemblV5,489 transMapEstV5,436 transMapEstV5,458 transMapRefSeqV5,436 transMapRefSeqV5,458 transMapRnaV5,436 transMapRnaV5,458 transMapV5,542 transMapV5,564 bc149621.1-2.1 transMapEnsemblV5,496 transMapEstV5,465 transMapRefSeqV5,465 transMapRnaV5,465 transMapV5,571 bc149621.1-2.2 transMapEnsemblV5,498 transMapEstV5,467 transMapRefSeqV5,467 transMapRnaV5,467 transMapV5,573 be augustusGene,99 chainGalGal6,108 chainGalGal6,433 chainNetGalGal6,111 chainNetGalGal6,436 chainNetXenTro7,117 chainNetXenTro7,446 chainNetXenTro9,115 chainNetXenTro9,443 chainXenTro7,114 chainXenTro7,443 chainXenTro9,112 chainXenTro9,440 cpgIslandExt,37 cpgIslandExt,70 cpgIslandExt,187 cpgIslandExt,513 cpgIslandExt,532 cpgIslandExt,561 cpgIslandExt,572 cpgIslandExtUnmasked,40 cpgIslandExtUnmasked,73 cpgIslandExtUnmasked,190 cpgIslandExtUnmasked,516 cpgIslandExtUnmasked,535 cpgIslandExtUnmasked,564 cpgIslandExtUnmasked,575 cpgIslandSuper,37 cpgIslandSuper,70 cpgIslandSuper,187 cpgIslandSuper,513 cpgIslandSuper,532 cpgIslandSuper,561 cpgIslandSuper,572 gc5BaseBw,41 microsat,19 microsat,39 nestedRepeats,269 nestedRepeats,291 netGalGal6,108 netGalGal6,433 netXenTro7,114 netXenTro7,443 netXenTro9,112 netXenTro9,440 refSeqComposite,304 refSeqComposite,729 refSeqComposite,939 refSeqComposite,970 refSeqComposite,1030 refSeqComposite,1107 refSeqComposite,1195 refSeqComposite,1299 refSeqComposite,1306 refSeqComposite,1322 refSeqComposite,1394 refSeqComposite,1454 refSeqComposite,1485 refSeqComposite,1505 refSeqComposite,1513 refSeqComposite,1587 refSeqComposite,1609 refSeqComposite,1679 refSeqComposite,1704 rmsk,278 rmsk,284 rmsk,298 simpleRepeat,44 transMapEnsemblV5,63 transMapEnsemblV5,110 transMapEnsemblV5,145 transMapEnsemblV5,527 transMapEnsemblV5,556 transMapEnsemblV5,611 transMapEnsemblV5,619 transMapEnsemblV5,642 transMapEnsemblV5,649 transMapEstV5,79 transMapEstV5,114 transMapEstV5,496 transMapEstV5,525 transMapEstV5,580 transMapEstV5,588 transMapEstV5,611 transMapEstV5,618 transMapRefSeqV5,79 transMapRefSeqV5,114 transMapRefSeqV5,496 transMapRefSeqV5,525 transMapRefSeqV5,580 transMapRefSeqV5,588 transMapRefSeqV5,611 transMapRefSeqV5,618 transMapRnaV5,79 transMapRnaV5,114 transMapRnaV5,496 transMapRnaV5,525 transMapRnaV5,580 transMapRnaV5,588 transMapRnaV5,611 transMapRnaV5,618 transMapV5,185 transMapV5,220 transMapV5,602 transMapV5,631 transMapV5,686 transMapV5,694 transMapV5,717 transMapV5,724 uniprot,181 uniprot,246 uniprot,1094 uniprot,1105 uniprot,1143 uniprot,1197 uniprot,1270 uniprot,1327 uniprot,1556 uniprot,1694 uniprot,1715 uniprot,1740 uniprot,1750 uniprot,1759 uniprot,1770 uniprot,1793 uniprot,1800 uniprot,1882 xenoRefGene,88 because cpgIslandExt,61 cpgIslandExt,107 cpgIslandExtUnmasked,64 cpgIslandExtUnmasked,110 cpgIslandSuper,61 cpgIslandSuper,107 uniprot,674 bed3 windowmaskerSdust,76 been chainGalGal6,574 chainNetGalGal6,577 chainNetXenTro7,587 chainNetXenTro9,584 chainXenTro7,584 chainXenTro9,581 nestedRepeats,89 netGalGal6,574 netXenTro7,584 netXenTro9,581 refSeqComposite,639 refSeqComposite,677 refSeqComposite,687 refSeqComposite,702 rmsk,70 rmsk,109 uniprot,34 uniprot,47 uniprot,303 uniprot,1043 before chainGalGal6,908 chainNetGalGal6,911 chainNetXenTro7,923 chainNetXenTro9,920 chainXenTro7,920 chainXenTro9,917 netGalGal6,908 netXenTro7,920 netXenTro9,917 uniprot,934 begin refSeqComposite,223 refSeqComposite,352 beginning refSeqComposite,1052 refSeqComposite,1650 beloow refSeqComposite,338 below chainGalGal6,682 chainNetGalGal6,685 chainNetXenTro7,697 chainNetXenTro9,694 chainXenTro7,694 chainXenTro9,691 genscan,154 genscan,168 nestedRepeats,68 netGalGal6,682 netXenTro7,694 netXenTro9,691 refSeqComposite,1396 refSeqComposite,1533 rmsk,104 uniprot,73 uniprot,92 uniprot,189 uniprot,207 uniprot,769 uniprot,898 benson microsat,102 microsat,112 microsat,114 simpleRepeat,64 simpleRepeat,72 simpleRepeat,74 best chainGalGal6,269 chainGalGal6,516 chainNetGalGal6,272 chainNetGalGal6,519 chainNetXenTro7,279 chainNetXenTro7,529 chainNetXenTro9,277 chainNetXenTro9,526 chainXenTro7,276 chainXenTro7,526 chainXenTro9,274 chainXenTro9,523 netGalGal6,269 netGalGal6,516 netXenTro7,276 netXenTro7,526 netXenTro9,274 netXenTro9,523 refSeqComposite,1277 transMapEnsemblV5,242 transMapEstV5,211 transMapRefSeqV5,211 transMapRnaV5,211 transMapV5,67 transMapV5,317 uniprot,1074 uniprot,1415 xenoRefGene,267 beta uniprot,364 between chainGalGal6,51 chainGalGal6,624 chainGalGal6,855 chainNetGalGal6,54 chainNetGalGal6,627 chainNetGalGal6,858 chainNetXenTro7,57 chainNetXenTro7,638 chainNetXenTro7,870 chainNetXenTro9,56 chainNetXenTro9,635 chainNetXenTro9,867 chainXenTro7,54 chainXenTro7,635 chainXenTro7,867 chainXenTro9,53 chainXenTro9,632 chainXenTro9,864 gap,127 gold,98 gold,103 ncbiRefSeqGenomicDiff,4 netGalGal6,51 netGalGal6,624 netGalGal6,855 netXenTro7,54 netXenTro7,635 netXenTro7,867 netXenTro9,53 netXenTro9,632 netXenTro9,864 refSeqComposite,65 refSeqComposite,462 refSeqComposite,878 uniprot,375 uniprot,922 uniprot,1371 uniprot,1615 bias uniprot,400 bigbed refSeqComposite,1380 refSeqComposite,1391 refSeqComposite,1481 uniprot,1736 bigbedtobed refSeqComposite,1510 refSeqComposite,1550 transMapEnsemblV5,616 transMapEnsemblV5,661 transMapEstV5,585 transMapEstV5,630 transMapRefSeqV5,585 transMapRefSeqV5,630 transMapRnaV5,585 transMapRnaV5,630 transMapV5,691 transMapV5,736 uniprot,1767 uniprot,1812 bigpsl transMapEnsemblV5,546 transMapEstV5,515 transMapRefSeqV5,515 transMapRnaV5,515 transMapV5,621 bin refSeqComposite,1436 refSeqComposite,1466 binaries transMapEnsemblV5,640 transMapEstV5,609 transMapRefSeqV5,609 transMapRnaV5,609 transMapV5,715 uniprot,1791 binary cpgIslandExt,570 cpgIslandExtUnmasked,573 cpgIslandSuper,570 refSeqComposite,1524 transMapEnsemblV5,630 transMapEstV5,599 transMapRefSeqV5,599 transMapRnaV5,599 transMapV5,705 uniprot,1781 biocomput chainGalGal6,1043 chainNetGalGal6,1046 chainNetXenTro7,1058 chainNetXenTro9,1055 chainXenTro7,1055 chainXenTro9,1052 netGalGal6,1043 netXenTro7,1055 netXenTro9,1052 bioinformatics augustusGene,307 augustusGene,332 transMapEnsemblV5,778 transMapEstV5,747 transMapRefSeqV5,747 transMapRnaV5,747 transMapV5,853 windowmaskerSdust,106 biol cpgIslandExt,615 cpgIslandExtUnmasked,618 cpgIslandSuper,615 genscan,222 transMapEnsemblV5,813 transMapEstV5,782 transMapRefSeqV5,782 transMapRnaV5,782 transMapV5,888 biological uniprot,320 biology genscan,200 birds augustusGene,203 black gap,72 gap,111 blast uniprot,949 uniprot,1084 uniprot,1115 blast-like refSeqComposite,1736 xenoRefGene,306 blastz chainGalGal6,920 chainGalGal6,1107 chainNetGalGal6,923 chainNetGalGal6,1110 chainNetXenTro7,935 chainNetXenTro7,1122 chainNetXenTro9,932 chainNetXenTro9,1119 chainXenTro7,932 chainXenTro7,1119 chainXenTro9,929 chainXenTro9,1116 netGalGal6,920 netGalGal6,1107 netXenTro7,932 netXenTro7,1119 netXenTro9,929 netXenTro9,1116 transMapEnsemblV5,78 transMapEnsemblV5,196 transMapEstV5,47 transMapEstV5,165 transMapRefSeqV5,47 transMapRefSeqV5,165 transMapRnaV5,47 transMapRnaV5,165 transMapV5,48 transMapV5,144 transMapV5,271 blat refSeqComposite,1238 refSeqComposite,1734 transMapEnsemblV5,167 transMapEstV5,136 transMapRefSeqV5,136 transMapRnaV5,136 transMapV5,126 transMapV5,150 transMapV5,157 transMapV5,242 xenoRefGene,228 blat--the xenoRefGene,305 blocks chainGalGal6,44 chainGalGal6,647 chainGalGal6,668 chainNetGalGal6,47 chainNetGalGal6,650 chainNetGalGal6,671 chainNetXenTro7,50 chainNetXenTro7,662 chainNetXenTro7,683 chainNetXenTro9,49 chainNetXenTro9,659 chainNetXenTro9,680 chainXenTro7,47 chainXenTro7,659 chainXenTro7,680 chainXenTro9,46 chainXenTro9,656 chainXenTro9,677 gold,108 gold,135 netGalGal6,44 netGalGal6,647 netGalGal6,668 netXenTro7,47 netXenTro7,659 netXenTro7,680 netXenTro9,46 netXenTro9,656 netXenTro9,677 blog cpgIslandExt,553 cpgIslandExtUnmasked,556 cpgIslandSuper,553 blue unipAliSwissprot,11 unipAliSwissprot,15 uniprot,507 uniprot,583 bond uniprot,473 bonds unipDisulfBond,2 unipDisulfBond,5 uniprot,334 uniprot,336 both chainGalGal6,96 chainGalGal6,117 chainGalGal6,171 chainGalGal6,898 chainNetGalGal6,99 chainNetGalGal6,120 chainNetGalGal6,174 chainNetGalGal6,901 chainNetXenTro7,104 chainNetXenTro7,126 chainNetXenTro7,181 chainNetXenTro7,913 chainNetXenTro9,102 chainNetXenTro9,124 chainNetXenTro9,179 chainNetXenTro9,910 chainXenTro7,101 chainXenTro7,123 chainXenTro7,178 chainXenTro7,910 chainXenTro9,99 chainXenTro9,121 chainXenTro9,176 chainXenTro9,907 netGalGal6,96 netGalGal6,117 netGalGal6,171 netGalGal6,898 netXenTro7,101 netXenTro7,123 netXenTro7,178 netXenTro7,910 netXenTro9,99 netXenTro9,121 netXenTro9,176 netXenTro9,907 transMapEnsemblV5,512 transMapEstV5,481 transMapRefSeqV5,481 transMapRnaV5,481 transMapV5,587 uniprot,675 uniprot,1616 xenoRefGene,126 xenoRefGene,197 bothgap chainGalGal6,749 chainNetGalGal6,752 chainNetXenTro7,764 chainNetXenTro9,761 chainXenTro7,761 chainXenTro9,758 netGalGal6,749 netXenTro7,761 netXenTro9,758 boundaries gold,83 box chainGalGal6,376 chainGalGal6,458 chainNetGalGal6,379 chainNetGalGal6,461 chainNetXenTro7,389 chainNetXenTro7,471 chainNetXenTro9,386 chainNetXenTro9,468 chainXenTro7,386 chainXenTro7,468 chainXenTro9,383 chainXenTro9,465 gap,112 netGalGal6,376 netGalGal6,458 netXenTro7,386 netXenTro7,468 netXenTro9,383 netXenTro9,465 xenoRefGene,216 boxes chainGalGal6,123 chainGalGal6,133 chainGalGal6,447 chainNetGalGal6,126 chainNetGalGal6,136 chainNetGalGal6,450 chainNetXenTro7,132 chainNetXenTro7,142 chainNetXenTro7,460 chainNetXenTro9,130 chainNetXenTro9,140 chainNetXenTro9,457 chainXenTro7,129 chainXenTro7,139 chainXenTro7,457 chainXenTro9,127 chainXenTro9,137 chainXenTro9,454 gap,73 nestedRepeats,126 netGalGal6,123 netGalGal6,133 netGalGal6,447 netXenTro7,129 netXenTro7,139 netXenTro7,457 netXenTro9,127 netXenTro9,137 netXenTro9,454 refSeqComposite,166 bp cpgIslandExt,272 cpgIslandExtUnmasked,275 cpgIslandSuper,272 refSeqComposite,946 branch transMapEnsemblV5,220 transMapEstV5,189 transMapRefSeqV5,189 transMapRnaV5,189 transMapV5,295 branch-point augustusGene,55 brejov transMapEnsemblV5,718 transMapEstV5,687 transMapRefSeqV5,687 transMapRnaV5,687 transMapV5,793 brian uniprot,1959 bridge gold,133 bridged gap,101 briefly uniprot,778 brown gold,93 gold,107 refSeqComposite,1752 xenoRefGene,322 browser chainGalGal6,978 chainNetGalGal6,981 chainNetXenTro7,993 chainNetXenTro9,990 chainXenTro7,990 chainXenTro9,987 cpgIslandExt,522 cpgIslandExtUnmasked,525 cpgIslandSuper,522 nestedRepeats,243 netGalGal6,978 netXenTro7,990 netXenTro9,987 refSeqComposite,1125 refSeqComposite,1187 refSeqComposite,1314 refSeqComposite,1451 transMapEnsemblV5,37 transMapEnsemblV5,165 transMapEnsemblV5,533 transMapEstV5,35 transMapEstV5,134 transMapEstV5,502 transMapRefSeqV5,35 transMapRefSeqV5,134 transMapRefSeqV5,502 transMapRnaV5,35 transMapRnaV5,134 transMapRnaV5,502 transMapV5,34 transMapV5,240 transMapV5,608 ucscToINSDC,19 ucscToRefSeq,14 uniprot,1544 uniprot,1721 browsing uniprot,1662 build refSeqComposite,300 uniprot,1552 builds transMapEnsemblV5,54 built augustusGene,51 augustusGene,67 burge genscan,22 genscan,146 genscan,166 genscan,173 genscan,180 genscan,207 but chainGalGal6,549 chainNetGalGal6,552 chainNetXenTro7,562 chainNetXenTro9,559 chainXenTro7,559 chainXenTro9,556 netGalGal6,549 netXenTro7,559 netXenTro9,556 refSeqComposite,427 refSeqComposite,899 refSeqComposite,1032 refSeqComposite,1452 rmsk,311 uniprot,638 uniprot,1047 button chainGalGal6,347 chainNetGalGal6,350 chainNetXenTro7,360 chainNetXenTro9,357 chainXenTro7,357 chainXenTro9,354 netGalGal6,347 netXenTro7,357 netXenTro9,354 by augustusGene,147 augustusGene,266 augustusGene,282 chainGalGal6,110 chainGalGal6,126 chainGalGal6,317 chainGalGal6,380 chainGalGal6,417 chainGalGal6,435 chainGalGal6,815 chainGalGal6,927 chainGalGal6,946 chainGalGal6,966 chainGalGal6,990 chainGalGal6,1011 chainNetGalGal6,113 chainNetGalGal6,129 chainNetGalGal6,320 chainNetGalGal6,383 chainNetGalGal6,420 chainNetGalGal6,438 chainNetGalGal6,818 chainNetGalGal6,930 chainNetGalGal6,949 chainNetGalGal6,969 chainNetGalGal6,993 chainNetGalGal6,1014 chainNetXenTro7,119 chainNetXenTro7,135 chainNetXenTro7,330 chainNetXenTro7,393 chainNetXenTro7,430 chainNetXenTro7,448 chainNetXenTro7,830 chainNetXenTro7,942 chainNetXenTro7,961 chainNetXenTro7,981 chainNetXenTro7,1005 chainNetXenTro7,1026 chainNetXenTro9,117 chainNetXenTro9,133 chainNetXenTro9,327 chainNetXenTro9,390 chainNetXenTro9,427 chainNetXenTro9,445 chainNetXenTro9,827 chainNetXenTro9,939 chainNetXenTro9,958 chainNetXenTro9,978 chainNetXenTro9,1002 chainNetXenTro9,1023 chainXenTro7,116 chainXenTro7,132 chainXenTro7,327 chainXenTro7,390 chainXenTro7,427 chainXenTro7,445 chainXenTro7,827 chainXenTro7,939 chainXenTro7,958 chainXenTro7,978 chainXenTro7,1002 chainXenTro7,1023 chainXenTro9,114 chainXenTro9,130 chainXenTro9,324 chainXenTro9,387 chainXenTro9,424 chainXenTro9,442 chainXenTro9,824 chainXenTro9,936 chainXenTro9,955 chainXenTro9,975 chainXenTro9,999 chainXenTro9,1020 cpgIslandExt,49 cpgIslandExt,194 cpgIslandExt,229 cpgIslandExt,406 cpgIslandExt,596 cpgIslandExtUnmasked,52 cpgIslandExtUnmasked,197 cpgIslandExtUnmasked,232 cpgIslandExtUnmasked,409 cpgIslandExtUnmasked,599 cpgIslandSuper,49 cpgIslandSuper,194 cpgIslandSuper,229 cpgIslandSuper,406 cpgIslandSuper,596 gap,94 gc5BaseBw,81 genscan,20 genscan,88 genscan,121 gold,86 microsat,110 nestedRepeats,8 nestedRepeats,91 nestedRepeats,129 netGalGal6,110 netGalGal6,126 netGalGal6,317 netGalGal6,380 netGalGal6,417 netGalGal6,435 netGalGal6,815 netGalGal6,927 netGalGal6,946 netGalGal6,966 netGalGal6,990 netGalGal6,1011 netXenTro7,116 netXenTro7,132 netXenTro7,327 netXenTro7,390 netXenTro7,427 netXenTro7,445 netXenTro7,827 netXenTro7,939 netXenTro7,958 netXenTro7,978 netXenTro7,1002 netXenTro7,1023 netXenTro9,114 netXenTro9,130 netXenTro9,324 netXenTro9,387 netXenTro9,424 netXenTro9,442 netXenTro9,824 netXenTro9,936 netXenTro9,955 netXenTro9,975 netXenTro9,999 netXenTro9,1020 refSeqComposite,39 refSeqComposite,50 refSeqComposite,70 refSeqComposite,207 refSeqComposite,372 refSeqComposite,385 refSeqComposite,446 refSeqComposite,559 refSeqComposite,628 refSeqComposite,641 refSeqComposite,645 refSeqComposite,689 refSeqComposite,765 refSeqComposite,770 refSeqComposite,847 refSeqComposite,865 refSeqComposite,1204 refSeqComposite,1721 refSeqComposite,1726 rmsk,4 rmsk,14 rmsk,50 simpleRepeat,6 simpleRepeat,22 simpleRepeat,70 transMapEnsemblV5,23 transMapEnsemblV5,229 transMapEnsemblV5,398 transMapEnsemblV5,681 transMapEnsemblV5,699 transMapEnsemblV5,705 transMapEnsemblV5,743 transMapEstV5,21 transMapEstV5,198 transMapEstV5,367 transMapEstV5,650 transMapEstV5,668 transMapEstV5,674 transMapEstV5,712 transMapRefSeqV5,21 transMapRefSeqV5,198 transMapRefSeqV5,367 transMapRefSeqV5,650 transMapRefSeqV5,668 transMapRefSeqV5,674 transMapRefSeqV5,712 transMapRnaV5,21 transMapRnaV5,198 transMapRnaV5,367 transMapRnaV5,650 transMapRnaV5,668 transMapRnaV5,674 transMapRnaV5,712 transMapV5,20 transMapV5,304 transMapV5,473 transMapV5,756 transMapV5,774 transMapV5,780 transMapV5,818 ucscToINSDC,50 ucscToRefSeq,44 uniprot,39 uniprot,49 uniprot,224 uniprot,713 uniprot,720 uniprot,818 uniprot,987 uniprot,995 uniprot,1015 uniprot,1028 uniprot,1045 uniprot,1538 uniprot,1764 uniprot,1943 windowmaskerSdust,6 windowmaskerSdust,20 xenoRefGene,102 xenoRefGene,107 xenoRefGene,171 xenoRefGene,189 xenoRefGene,195 xenoRefGene,292 xenoRefGene,297 c cpgIslandExt,44 cpgIslandExt,389 cpgIslandExtUnmasked,47 cpgIslandExtUnmasked,392 cpgIslandSuper,44 cpgIslandSuper,389 gc5BaseBw,23 genscan,181 genscan,208 refSeqComposite,917 refSeqComposite,958 refSeqComposite,985 refSeqComposite,1044 refSeqComposite,1071 refSeqComposite,1083 transMapEnsemblV5,728 transMapEnsemblV5,734 transMapEstV5,697 transMapEstV5,703 transMapRefSeqV5,697 transMapRefSeqV5,703 transMapRnaV5,697 transMapRnaV5,703 transMapV5,803 transMapV5,809 windowmaskerSdust,30 c-114100-125-31 chainNetXenTro7,692 chainNetXenTro9,689 chainXenTro7,689 chainXenTro9,686 netXenTro7,689 netXenTro9,686 c-90100-100-25 chainGalGal6,677 chainNetGalGal6,680 netGalGal6,677 caenorhabditis augustusGene,212 calculated cpgIslandExt,369 cpgIslandExtUnmasked,372 cpgIslandSuper,369 calculation cpgIslandExt,399 cpgIslandExtUnmasked,402 cpgIslandSuper,399 california chainGalGal6,962 chainGalGal6,1008 chainNetGalGal6,965 chainNetGalGal6,1011 chainNetXenTro7,977 chainNetXenTro7,1023 chainNetXenTro9,974 chainNetXenTro9,1020 chainXenTro7,974 chainXenTro7,1020 chainXenTro9,971 chainXenTro9,1017 netGalGal6,962 netGalGal6,1008 netXenTro7,974 netXenTro7,1020 netXenTro9,971 netXenTro9,1017 can augustusGene,98 chainGalGal6,91 chainGalGal6,107 chainNetGalGal6,94 chainNetGalGal6,110 chainNetXenTro7,99 chainNetXenTro7,116 chainNetXenTro9,97 chainNetXenTro9,114 chainXenTro7,96 chainXenTro7,113 chainXenTro9,94 chainXenTro9,111 cpgIslandExt,512 cpgIslandExt,530 cpgIslandExt,560 cpgIslandExt,571 cpgIslandExtUnmasked,515 cpgIslandExtUnmasked,533 cpgIslandExtUnmasked,563 cpgIslandExtUnmasked,574 cpgIslandSuper,512 cpgIslandSuper,530 cpgIslandSuper,560 cpgIslandSuper,571 netGalGal6,91 netGalGal6,107 netXenTro7,96 netXenTro7,113 netXenTro9,94 netXenTro9,111 refSeqComposite,287 refSeqComposite,728 refSeqComposite,1106 refSeqComposite,1194 refSeqComposite,1298 refSeqComposite,1305 refSeqComposite,1320 refSeqComposite,1353 refSeqComposite,1393 refSeqComposite,1453 refSeqComposite,1461 refSeqComposite,1484 refSeqComposite,1504 refSeqComposite,1512 refSeqComposite,1565 refSeqComposite,1585 refSeqComposite,1608 refSeqComposite,1678 refSeqComposite,1703 rmsk,116 simpleRepeat,35 transMapEnsemblV5,526 transMapEnsemblV5,555 transMapEnsemblV5,610 transMapEnsemblV5,618 transMapEnsemblV5,641 transMapEnsemblV5,647 transMapEstV5,495 transMapEstV5,524 transMapEstV5,579 transMapEstV5,587 transMapEstV5,610 transMapEstV5,616 transMapRefSeqV5,495 transMapRefSeqV5,524 transMapRefSeqV5,579 transMapRefSeqV5,587 transMapRefSeqV5,610 transMapRefSeqV5,616 transMapRnaV5,495 transMapRnaV5,524 transMapRnaV5,579 transMapRnaV5,587 transMapRnaV5,610 transMapRnaV5,616 transMapV5,601 transMapV5,630 transMapV5,685 transMapV5,693 transMapV5,716 transMapV5,722 uniprot,180 uniprot,656 uniprot,1064 uniprot,1093 uniprot,1104 uniprot,1326 uniprot,1555 uniprot,1693 uniprot,1714 uniprot,1739 uniprot,1749 uniprot,1758 uniprot,1769 uniprot,1792 uniprot,1798 uniprot,1881 xenoRefGene,87 cannot uniprot,1269 cases chainGalGal6,193 chainGalGal6,404 chainNetGalGal6,196 chainNetGalGal6,407 chainNetXenTro7,203 chainNetXenTro7,417 chainNetXenTro9,201 chainNetXenTro9,414 chainXenTro7,200 chainXenTro7,414 chainXenTro9,198 chainXenTro9,411 netGalGal6,193 netGalGal6,404 netXenTro7,200 netXenTro7,414 netXenTro9,198 netXenTro9,411 uniprot,757 uniprot,1183 uniprot,1452 cat uniprot,1936 categorized chainGalGal6,505 chainNetGalGal6,508 chainNetXenTro7,518 chainNetXenTro9,515 chainXenTro7,515 chainXenTro9,512 netGalGal6,505 netXenTro7,515 netXenTro9,512 cauldron chainGalGal6,1060 chainNetGalGal6,1063 chainNetXenTro7,1075 chainNetXenTro9,1072 chainXenTro7,1072 chainXenTro9,1069 netGalGal6,1060 netXenTro7,1072 netXenTro9,1069 cause chainGalGal6,487 chainNetGalGal6,490 chainNetXenTro7,500 chainNetXenTro9,497 chainXenTro7,497 chainXenTro9,494 netGalGal6,487 netXenTro7,497 netXenTro9,494 caused chainGalGal6,109 chainNetGalGal6,112 chainNetXenTro7,118 chainNetXenTro9,116 chainXenTro7,115 chainXenTro9,113 netGalGal6,109 netXenTro7,115 netXenTro9,113 cb transMapEnsemblV5,794 transMapEstV5,763 transMapRefSeqV5,763 transMapRnaV5,763 transMapV5,869 cdna augustusGene,299 refSeqComposite,267 refSeqComposite,363 transMapEnsemblV5,391 transMapEnsemblV5,687 transMapEnsemblV5,770 transMapEstV5,360 transMapEstV5,656 transMapEstV5,739 transMapRefSeqV5,360 transMapRefSeqV5,656 transMapRefSeqV5,739 transMapRnaV5,360 transMapRnaV5,656 transMapRnaV5,739 transMapV5,15 transMapV5,466 transMapV5,762 transMapV5,845 cdnas transMapEnsemblV5,125 transMapEstV5,94 transMapRefSeqV5,94 transMapRnaV5,94 transMapV5,200 cell uniprot,563 cerevisiae augustusGene,222 certain nestedRepeats,294 rmsk,301 cg cpgIslandExt,243 cpgIslandExt,281 cpgIslandExt,339 cpgIslandExtUnmasked,246 cpgIslandExtUnmasked,284 cpgIslandExtUnmasked,342 cpgIslandSuper,243 cpgIslandSuper,281 cpgIslandSuper,339 chain chainGalGal6,2 chainGalGal6,27 chainGalGal6,57 chainGalGal6,60 chainGalGal6,120 chainGalGal6,273 chainGalGal6,315 chainGalGal6,410 chainGalGal6,465 chainGalGal6,569 chainGalGal6,775 chainGalGal6,818 chainGalGal6,829 chainGalGal6,837 chainGalGal6,842 chainGalGal6,865 chainGalGal6,874 chainNetGalGal6,2 chainNetGalGal6,9 chainNetGalGal6,30 chainNetGalGal6,60 chainNetGalGal6,63 chainNetGalGal6,123 chainNetGalGal6,276 chainNetGalGal6,318 chainNetGalGal6,413 chainNetGalGal6,468 chainNetGalGal6,572 chainNetGalGal6,778 chainNetGalGal6,821 chainNetGalGal6,832 chainNetGalGal6,840 chainNetGalGal6,845 chainNetGalGal6,868 chainNetGalGal6,877 chainNetGalGal6Viewchain,1 chainNetGalGal6Viewchain,7 chainNetGalGal6Viewnet,7 chainNetXenTro7,3 chainNetXenTro7,12 chainNetXenTro7,33 chainNetXenTro7,63 chainNetXenTro7,66 chainNetXenTro7,129 chainNetXenTro7,284 chainNetXenTro7,328 chainNetXenTro7,423 chainNetXenTro7,478 chainNetXenTro7,582 chainNetXenTro7,790 chainNetXenTro7,833 chainNetXenTro7,844 chainNetXenTro7,852 chainNetXenTro7,857 chainNetXenTro7,880 chainNetXenTro7,889 chainNetXenTro7Viewchain,1 chainNetXenTro7Viewchain,9 chainNetXenTro7Viewnet,9 chainNetXenTro9,3 chainNetXenTro9,11 chainNetXenTro9,32 chainNetXenTro9,62 chainNetXenTro9,65 chainNetXenTro9,127 chainNetXenTro9,282 chainNetXenTro9,325 chainNetXenTro9,420 chainNetXenTro9,475 chainNetXenTro9,579 chainNetXenTro9,787 chainNetXenTro9,830 chainNetXenTro9,841 chainNetXenTro9,849 chainNetXenTro9,854 chainNetXenTro9,877 chainNetXenTro9,886 chainNetXenTro9Viewchain,1 chainNetXenTro9Viewchain,8 chainNetXenTro9Viewnet,8 chainXenTro7,3 chainXenTro7,30 chainXenTro7,60 chainXenTro7,63 chainXenTro7,126 chainXenTro7,281 chainXenTro7,325 chainXenTro7,420 chainXenTro7,475 chainXenTro7,579 chainXenTro7,787 chainXenTro7,830 chainXenTro7,841 chainXenTro7,849 chainXenTro7,854 chainXenTro7,877 chainXenTro7,886 chainXenTro9,3 chainXenTro9,29 chainXenTro9,59 chainXenTro9,62 chainXenTro9,124 chainXenTro9,279 chainXenTro9,322 chainXenTro9,417 chainXenTro9,472 chainXenTro9,576 chainXenTro9,784 chainXenTro9,827 chainXenTro9,838 chainXenTro9,846 chainXenTro9,851 chainXenTro9,874 chainXenTro9,883 netGalGal6,27 netGalGal6,57 netGalGal6,60 netGalGal6,120 netGalGal6,273 netGalGal6,315 netGalGal6,410 netGalGal6,465 netGalGal6,569 netGalGal6,775 netGalGal6,818 netGalGal6,829 netGalGal6,837 netGalGal6,842 netGalGal6,865 netGalGal6,874 netXenTro7,30 netXenTro7,60 netXenTro7,63 netXenTro7,126 netXenTro7,281 netXenTro7,325 netXenTro7,420 netXenTro7,475 netXenTro7,579 netXenTro7,787 netXenTro7,830 netXenTro7,841 netXenTro7,849 netXenTro7,854 netXenTro7,877 netXenTro7,886 netXenTro9,29 netXenTro9,59 netXenTro9,62 netXenTro9,124 netXenTro9,279 netXenTro9,322 netXenTro9,417 netXenTro9,472 netXenTro9,576 netXenTro9,784 netXenTro9,827 netXenTro9,838 netXenTro9,846 netXenTro9,851 netXenTro9,874 netXenTro9,883 transMapV5,138 uniprot,290 chained chainGalGal6,8 chainXenTro7,11 chainXenTro9,10 chainnet chainGalGal6,792 chainGalGal6,997 chainNetGalGal6,795 chainNetGalGal6,1000 chainNetXenTro7,807 chainNetXenTro7,1012 chainNetXenTro9,804 chainNetXenTro9,1009 chainXenTro7,804 chainXenTro7,1009 chainXenTro9,801 chainXenTro9,1006 netGalGal6,792 netGalGal6,997 netXenTro7,804 netXenTro7,1009 netXenTro9,801 netXenTro9,1006 chains chainGalGal6,196 chainGalGal6,208 chainGalGal6,219 chainGalGal6,320 chainGalGal6,359 chainGalGal6,392 chainGalGal6,397 chainGalGal6,419 chainGalGal6,431 chainGalGal6,438 chainGalGal6,495 chainGalGal6,665 chainGalGal6,680 chainGalGal6,694 chainGalGal6,763 chainGalGal6,784 chainGalGal6,799 chainGalGal6,859 chainGalGal6,890 chainGalGal6,985 chainNetGalGal6,199 chainNetGalGal6,211 chainNetGalGal6,222 chainNetGalGal6,323 chainNetGalGal6,362 chainNetGalGal6,395 chainNetGalGal6,400 chainNetGalGal6,422 chainNetGalGal6,434 chainNetGalGal6,441 chainNetGalGal6,498 chainNetGalGal6,668 chainNetGalGal6,683 chainNetGalGal6,697 chainNetGalGal6,766 chainNetGalGal6,787 chainNetGalGal6,802 chainNetGalGal6,862 chainNetGalGal6,893 chainNetGalGal6,988 chainNetXenTro7,206 chainNetXenTro7,218 chainNetXenTro7,229 chainNetXenTro7,333 chainNetXenTro7,372 chainNetXenTro7,405 chainNetXenTro7,410 chainNetXenTro7,432 chainNetXenTro7,444 chainNetXenTro7,451 chainNetXenTro7,508 chainNetXenTro7,680 chainNetXenTro7,695 chainNetXenTro7,709 chainNetXenTro7,778 chainNetXenTro7,799 chainNetXenTro7,814 chainNetXenTro7,874 chainNetXenTro7,905 chainNetXenTro7,1000 chainNetXenTro9,204 chainNetXenTro9,216 chainNetXenTro9,227 chainNetXenTro9,330 chainNetXenTro9,369 chainNetXenTro9,402 chainNetXenTro9,407 chainNetXenTro9,429 chainNetXenTro9,441 chainNetXenTro9,448 chainNetXenTro9,505 chainNetXenTro9,677 chainNetXenTro9,692 chainNetXenTro9,706 chainNetXenTro9,775 chainNetXenTro9,796 chainNetXenTro9,811 chainNetXenTro9,871 chainNetXenTro9,902 chainNetXenTro9,997 chainXenTro7,203 chainXenTro7,215 chainXenTro7,226 chainXenTro7,330 chainXenTro7,369 chainXenTro7,402 chainXenTro7,407 chainXenTro7,429 chainXenTro7,441 chainXenTro7,448 chainXenTro7,505 chainXenTro7,677 chainXenTro7,692 chainXenTro7,706 chainXenTro7,775 chainXenTro7,796 chainXenTro7,811 chainXenTro7,871 chainXenTro7,902 chainXenTro7,997 chainXenTro9,201 chainXenTro9,213 chainXenTro9,224 chainXenTro9,327 chainXenTro9,366 chainXenTro9,399 chainXenTro9,404 chainXenTro9,426 chainXenTro9,438 chainXenTro9,445 chainXenTro9,502 chainXenTro9,674 chainXenTro9,689 chainXenTro9,703 chainXenTro9,772 chainXenTro9,793 chainXenTro9,808 chainXenTro9,868 chainXenTro9,899 chainXenTro9,994 netGalGal6,196 netGalGal6,208 netGalGal6,219 netGalGal6,320 netGalGal6,359 netGalGal6,392 netGalGal6,397 netGalGal6,419 netGalGal6,431 netGalGal6,438 netGalGal6,495 netGalGal6,665 netGalGal6,680 netGalGal6,694 netGalGal6,763 netGalGal6,784 netGalGal6,799 netGalGal6,859 netGalGal6,890 netGalGal6,985 netXenTro7,203 netXenTro7,215 netXenTro7,226 netXenTro7,330 netXenTro7,369 netXenTro7,402 netXenTro7,407 netXenTro7,429 netXenTro7,441 netXenTro7,448 netXenTro7,505 netXenTro7,677 netXenTro7,692 netXenTro7,706 netXenTro7,775 netXenTro7,796 netXenTro7,811 netXenTro7,871 netXenTro7,902 netXenTro7,997 netXenTro9,201 netXenTro9,213 netXenTro9,224 netXenTro9,327 netXenTro9,366 netXenTro9,399 netXenTro9,404 netXenTro9,426 netXenTro9,438 netXenTro9,445 netXenTro9,502 netXenTro9,674 netXenTro9,689 netXenTro9,703 netXenTro9,772 netXenTro9,793 netXenTro9,808 netXenTro9,868 netXenTro9,899 netXenTro9,994 transMapEnsemblV5,80 transMapEnsemblV5,198 transMapEnsemblV5,212 transMapEnsemblV5,258 transMapEnsemblV5,283 transMapEnsemblV5,331 transMapEnsemblV5,513 transMapEstV5,49 transMapEstV5,167 transMapEstV5,181 transMapEstV5,227 transMapEstV5,252 transMapEstV5,300 transMapEstV5,482 transMapRefSeqV5,49 transMapRefSeqV5,167 transMapRefSeqV5,181 transMapRefSeqV5,227 transMapRefSeqV5,252 transMapRefSeqV5,300 transMapRefSeqV5,482 transMapRnaV5,49 transMapRnaV5,167 transMapRnaV5,181 transMapRnaV5,227 transMapRnaV5,252 transMapRnaV5,300 transMapRnaV5,482 transMapV5,50 transMapV5,87 transMapV5,273 transMapV5,287 transMapV5,333 transMapV5,358 transMapV5,406 transMapV5,588 unipChain,1 unipChain,7 uniprot,288 change cpgIslandExt,210 cpgIslandExtUnmasked,213 cpgIslandSuper,210 refSeqComposite,909 refSeqComposite,923 changed rmsk,285 uniprot,1382 check chainGalGal6,342 chainNetGalGal6,345 chainNetXenTro7,355 chainNetXenTro9,352 chainXenTro7,352 chainXenTro9,349 netGalGal6,342 netXenTro7,352 netXenTro9,349 check-box refSeqComposite,733 checkbox uniprot,231 chiaromonte chainGalGal6,1030 chainNetGalGal6,1033 chainNetXenTro7,1045 chainNetXenTro9,1042 chainXenTro7,1042 chainXenTro9,1039 netGalGal6,1030 netXenTro7,1042 netXenTro9,1039 chicken augustusGene,204 augustusGene,262 chainGalGal6,1 chainGalGal6,3 chainGalGal6,65 chainGalGal6,97 chainGalGal6,150 chainGalGal6,270 chainGalGal6,297 chainGalGal6,578 chainGalGal6,627 chainNetGalGal6,1 chainNetGalGal6,4 chainNetGalGal6,68 chainNetGalGal6,100 chainNetGalGal6,153 chainNetGalGal6,273 chainNetGalGal6,300 chainNetGalGal6,581 chainNetGalGal6,630 chainNetGalGal6Viewchain,2 chainNetGalGal6Viewnet,2 netGalGal6,1 netGalGal6,3 netGalGal6,65 netGalGal6,97 netGalGal6,150 netGalGal6,270 netGalGal6,297 netGalGal6,578 netGalGal6,627 chmod uniprot,1921 choose augustusGene,171 cpgIslandExt,581 cpgIslandExtUnmasked,584 cpgIslandSuper,581 uniprot,657 chosen refSeqComposite,538 chr16 refSeqComposite,1558 chr4 chainGalGal6,374 chainNetGalGal6,377 chainNetXenTro7,387 chainNetXenTro9,384 chainXenTro7,384 chainXenTro9,381 netGalGal6,374 netXenTro7,384 netXenTro9,381 chr6 transMapEnsemblV5,670 transMapEstV5,639 transMapRefSeqV5,639 transMapRnaV5,639 transMapV5,745 uniprot,1820 chris genscan,21 genscan,172 uniprot,1954 chrom refSeqComposite,1557 transMapEnsemblV5,669 transMapEstV5,638 transMapRefSeqV5,638 transMapRnaV5,638 transMapV5,744 uniprot,1819 chromosome chainGalGal6,249 chainGalGal6,329 chainGalGal6,354 chainGalGal6,362 chainGalGal6,372 chainGalGal6,381 chainGalGal6,528 chainGalGal6,543 chainGalGal6,559 chainGalGal6,628 chainGalGal6,634 chainNetGalGal6,252 chainNetGalGal6,332 chainNetGalGal6,357 chainNetGalGal6,365 chainNetGalGal6,375 chainNetGalGal6,384 chainNetGalGal6,531 chainNetGalGal6,546 chainNetGalGal6,562 chainNetGalGal6,631 chainNetGalGal6,637 chainNetXenTro7,259 chainNetXenTro7,342 chainNetXenTro7,367 chainNetXenTro7,375 chainNetXenTro7,385 chainNetXenTro7,394 chainNetXenTro7,541 chainNetXenTro7,556 chainNetXenTro7,572 chainNetXenTro7,643 chainNetXenTro7,649 chainNetXenTro9,257 chainNetXenTro9,339 chainNetXenTro9,364 chainNetXenTro9,372 chainNetXenTro9,382 chainNetXenTro9,391 chainNetXenTro9,538 chainNetXenTro9,553 chainNetXenTro9,569 chainNetXenTro9,640 chainNetXenTro9,646 chainXenTro7,256 chainXenTro7,339 chainXenTro7,364 chainXenTro7,372 chainXenTro7,382 chainXenTro7,391 chainXenTro7,538 chainXenTro7,553 chainXenTro7,569 chainXenTro7,640 chainXenTro7,646 chainXenTro9,254 chainXenTro9,336 chainXenTro9,361 chainXenTro9,369 chainXenTro9,379 chainXenTro9,388 chainXenTro9,535 chainXenTro9,550 chainXenTro9,566 chainXenTro9,637 chainXenTro9,643 cytoBandIdeo,1 gap,130 netGalGal6,249 netGalGal6,329 netGalGal6,354 netGalGal6,362 netGalGal6,372 netGalGal6,381 netGalGal6,528 netGalGal6,543 netGalGal6,559 netGalGal6,628 netGalGal6,634 netXenTro7,256 netXenTro7,339 netXenTro7,364 netXenTro7,372 netXenTro7,382 netXenTro7,391 netXenTro7,538 netXenTro7,553 netXenTro7,569 netXenTro7,640 netXenTro7,646 netXenTro9,254 netXenTro9,336 netXenTro9,361 netXenTro9,369 netXenTro9,379 netXenTro9,388 netXenTro9,535 netXenTro9,550 netXenTro9,566 netXenTro9,637 netXenTro9,643 ucscToINSDC,20 ucscToRefSeq,15 uniprot,1416 chromosome-based chainGalGal6,322 chainNetGalGal6,325 chainNetXenTro7,335 chainNetXenTro9,332 chainXenTro7,332 chainXenTro9,329 netGalGal6,322 netXenTro7,332 netXenTro9,329 circle rmsk,202 cited cpgIslandExt,374 cpgIslandExtUnmasked,377 cpgIslandSuper,374 cl transMapEnsemblV5,726 transMapEstV5,695 transMapRefSeqV5,695 transMapRnaV5,695 transMapV5,801 class rmsk,199 rmsk,253 classes rmsk,150 classification rmsk,266 rmsk,282 clawson gc5BaseBw,83 ucscToINSDC,52 ucscToRefSeq,46 cleaved uniprot,249 click chainGalGal6,455 chainGalGal6,469 chainNetGalGal6,458 chainNetGalGal6,472 chainNetXenTro7,468 chainNetXenTro7,482 chainNetXenTro9,465 chainNetXenTro9,479 chainXenTro7,465 chainXenTro7,479 chainXenTro9,462 chainXenTro9,476 gc5BaseBw,56 netGalGal6,455 netGalGal6,469 netXenTro7,465 netXenTro7,479 netXenTro9,462 netXenTro9,476 refSeqComposite,751 refSeqComposite,773 transMapEnsemblV5,136 transMapEnsemblV5,150 transMapEstV5,105 transMapEstV5,119 transMapRefSeqV5,105 transMapRefSeqV5,119 transMapRnaV5,105 transMapRnaV5,119 transMapV5,211 transMapV5,225 uniprot,229 uniprot,481 uniprot,1673 xenoRefGene,110 xenoRefGene,214 clicking uniprot,1633 clinical refSeqComposite,585 clipped nestedRepeats,224 closer transMapEnsemblV5,68 transMapEstV5,37 transMapRefSeqV5,37 transMapRnaV5,37 transMapV5,36 closest augustusGene,241 clusters refSeqComposite,412 cm refSeqComposite,1763 xenoRefGene,333 code refSeqComposite,1518 transMapEnsemblV5,624 transMapEnsemblV5,638 transMapEstV5,593 transMapEstV5,607 transMapRefSeqV5,593 transMapRefSeqV5,607 transMapRnaV5,593 transMapRnaV5,607 transMapV5,699 transMapV5,713 uniprot,1546 uniprot,1775 uniprot,1789 windowmaskerSdust,34 coding refSeqComposite,1084 simpleRepeat,38 uniprot,1102 uniprot,1133 xenoRefGene,212 codon genscan,100 genscan,122 refSeqComposite,720 refSeqComposite,814 refSeqComposite,821 refSeqComposite,836 refSeqComposite,866 transMapEnsemblV5,114 transMapEstV5,83 transMapRefSeqV5,83 transMapRnaV5,83 transMapV5,189 xenoRefGene,138 xenoRefGene,145 xenoRefGene,160 xenoRefGene,190 codons genscan,89 genscan,93 refSeqComposite,841 refSeqComposite,848 xenoRefGene,165 xenoRefGene,172 cognate transMapEnsemblV5,180 transMapEstV5,149 transMapRefSeqV5,149 transMapRnaV5,149 transMapV5,255 coiled-coil uniprot,367 collaboration ucscToINSDC,9 ucscToINSDC,31 collaborator refSeqComposite,647 collaborators refSeqComposite,691 collapsed nestedRepeats,173 collection refSeqComposite,32 xenoRefGene,33 color chainGalGal6,350 chainNetGalGal6,353 chainNetXenTro7,363 chainNetXenTro9,360 chainXenTro7,360 chainXenTro9,357 genscan,86 genscan,96 netGalGal6,350 netXenTro7,360 netXenTro9,357 refSeqComposite,607 refSeqComposite,630 refSeqComposite,845 rmsk,207 xenoRefGene,58 xenoRefGene,169 coloration gold,94 colored chainGalGal6,325 chainNetGalGal6,328 chainNetXenTro7,338 chainNetXenTro9,335 chainXenTro7,335 chainXenTro9,332 netGalGal6,325 netXenTro7,335 netXenTro9,332 transMapEnsemblV5,146 transMapEstV5,115 transMapRefSeqV5,115 transMapRnaV5,115 transMapV5,221 uniprot,160 uniprot,176 coloring chainGalGal6,341 chainNetGalGal6,344 chainNetXenTro7,354 chainNetXenTro9,351 chainXenTro7,351 chainXenTro9,348 genscan,116 netGalGal6,341 netXenTro7,351 netXenTro9,348 refSeqComposite,815 refSeqComposite,822 refSeqComposite,860 transMapEnsemblV5,115 transMapEstV5,84 transMapRefSeqV5,84 transMapRnaV5,84 transMapV5,190 xenoRefGene,139 xenoRefGene,146 xenoRefGene,184 colors refSeqComposite,837 xenoRefGene,81 xenoRefGene,161 column nestedRepeats,107 refSeqComposite,1428 refSeqComposite,1439 columns transMapEnsemblV5,553 transMapEstV5,522 transMapRefSeqV5,522 transMapRnaV5,522 transMapV5,628 combined rmsk,232 command cpgIslandExt,409 cpgIslandExt,503 cpgIslandExtUnmasked,412 cpgIslandExtUnmasked,506 cpgIslandSuper,409 cpgIslandSuper,503 refSeqComposite,1549 refSeqComposite,1613 transMapEnsemblV5,256 transMapEstV5,225 transMapRefSeqV5,225 transMapRnaV5,225 transMapV5,331 uniprot,1871 uniprot,1875 commands uniprot,1902 comment uniprot,260 uniprot,282 uniprot,531 uniprot,615 common cpgIslandExt,30 cpgIslandExtUnmasked,33 cpgIslandSuper,30 comparative chainGalGal6,10 chainNetGalGal6,13 chainNetGalGal6Viewchain,11 chainNetGalGal6Viewnet,11 chainNetXenTro7,16 chainNetXenTro7Viewchain,13 chainNetXenTro7Viewnet,13 chainNetXenTro9,15 chainNetXenTro9Viewchain,12 chainNetXenTro9Viewnet,12 chainXenTro7,13 chainXenTro9,12 netGalGal6,10 netXenTro7,13 netXenTro9,12 transMapEnsemblV5,744 transMapEnsemblV5,799 transMapEstV5,713 transMapEstV5,768 transMapRefSeqV5,713 transMapRefSeqV5,768 transMapRnaV5,713 transMapRnaV5,768 transMapV5,819 transMapV5,874 compare refSeqComposite,831 transMapEnsemblV5,124 transMapEstV5,93 transMapRefSeqV5,93 transMapRnaV5,93 transMapV5,199 xenoRefGene,155 compared transMapV5,154 comparison genscan,109 uniprot,1260 compiled refSeqComposite,1514 transMapEnsemblV5,620 transMapEstV5,589 transMapRefSeqV5,589 transMapRnaV5,589 transMapV5,695 uniprot,1771 complete genscan,213 completely refSeqComposite,813 uniprot,1464 xenoRefGene,137 complex chainGalGal6,164 chainNetGalGal6,167 chainNetXenTro7,174 chainNetXenTro9,172 chainXenTro7,171 chainXenTro9,169 netGalGal6,164 netXenTro7,171 netXenTro9,169 complexity nestedRepeats,40 rmsk,30 rmsk,182 component gold,136 composed uniprot,1396 composite refSeqComposite,16 refSeqComposite,149 compositional genscan,41 uniprot,399 comput transMapEnsemblV5,812 transMapEstV5,781 transMapRefSeqV5,781 transMapRnaV5,781 transMapV5,887 computational genscan,196 uniprot,51 computed transMapEnsemblV5,228 transMapEstV5,197 transMapRefSeqV5,197 transMapRnaV5,197 transMapV5,303 comstock transMapEnsemblV5,725 transMapEstV5,694 transMapRefSeqV5,694 transMapRnaV5,694 transMapV5,800 concerning refSeqComposite,126 conditional augustusGene,118 configuration chainGalGal6,314 chainNetGalGal6,317 chainNetXenTro7,327 chainNetXenTro9,324 chainXenTro7,324 chainXenTro9,321 gc5BaseBw,60 gc5BaseBw,69 genscan,64 genscan,84 nestedRepeats,114 netGalGal6,314 netXenTro7,324 netXenTro9,321 refSeqComposite,144 rmsk,138 transMapEnsemblV5,95 transMapEstV5,64 transMapRefSeqV5,64 transMapRnaV5,64 transMapV5,170 uniprot,235 uniprot,449 uniprot,650 uniprot,1755 xenoRefGene,46 configured gc5BaseBw,42 refSeqComposite,730 transMapEnsemblV5,111 transMapEstV5,80 transMapRefSeqV5,80 transMapRnaV5,80 transMapV5,186 xenoRefGene,89 conflicts unipConflict,2 unipConflict,5 uniprot,373 connect uniprot,1677 conservation transMapEnsemblV5,232 transMapEstV5,201 transMapRefSeqV5,201 transMapRnaV5,201 transMapV5,307 consistency uniprot,402 consortium uniprot,1986 constructed cpgIslandExt,322 cpgIslandExt,495 cpgIslandExtUnmasked,325 cpgIslandExtUnmasked,498 cpgIslandSuper,322 cpgIslandSuper,495 refSeqComposite,1218 construction cpgIslandExt,311 cpgIslandExtUnmasked,314 cpgIslandSuper,311 contact uniprot,686 uniprot,1440 contain transMapV5,14 uniprot,1163 contained chainGalGal6,891 chainNetGalGal6,894 chainNetXenTro7,906 chainNetXenTro9,903 chainXenTro7,903 chainXenTro9,900 netGalGal6,891 netXenTro7,903 netXenTro9,900 refSeqComposite,1142 containing refSeqComposite,1658 transMapEnsemblV5,548 transMapEstV5,517 transMapRefSeqV5,517 transMapRnaV5,517 transMapV5,623 contains gap,118 refSeqComposite,152 refSeqComposite,872 transMapEnsemblV5,17 transMapEstV5,15 transMapRefSeqV5,16 transMapRnaV5,16 xenoRefGene,142 content augustusGene,71 cpgIslandExt,263 cpgIslandExtUnmasked,266 cpgIslandSuper,263 gc5BaseBw,31 contig gold,82 contigs gap,85 gold,74 gold,99 gold,116 controls cpgIslandExt,217 cpgIslandExtUnmasked,220 cpgIslandSuper,217 refSeqComposite,734 xenoRefGene,92 convenience uniprot,404 conventions chainGalGal6,312 chainNetGalGal6,315 chainNetXenTro7,325 chainNetXenTro9,322 chainXenTro7,322 chainXenTro9,319 genscan,62 genscan,70 nestedRepeats,112 netGalGal6,312 netXenTro7,322 netXenTro9,319 refSeqComposite,142 refSeqComposite,453 refSeqComposite,601 rmsk,136 transMapEnsemblV5,93 transMapEnsemblV5,101 transMapEstV5,62 transMapEstV5,70 transMapRefSeqV5,62 transMapRefSeqV5,70 transMapRnaV5,62 transMapRnaV5,70 transMapV5,168 transMapV5,176 uniprot,447 xenoRefGene,44 xenoRefGene,52 converted chainGalGal6,605 chainNetGalGal6,608 chainNetXenTro7,619 chainNetXenTro9,616 chainXenTro7,616 chainXenTro9,613 netGalGal6,605 netXenTro7,616 netXenTro9,613 refSeqComposite,1174 refSeqComposite,1588 uniprot,1477 uniprot,1760 coordinates refSeqComposite,37 refSeqComposite,68 uniprot,29 uniprot,643 uniprot,1848 uniprot,1855 uniprot,1886 uniprot,1892 copies microsat,80 copy uniprot,419 correct uniprot,962 uniprot,1222 corrections refSeqComposite,121 corresponding transMapEnsemblV5,259 transMapEstV5,228 transMapRefSeqV5,228 transMapRnaV5,228 transMapV5,334 could refSeqComposite,969 refSeqComposite,1545 count cpgIslandExt,334 cpgIslandExt,357 cpgIslandExtUnmasked,337 cpgIslandExtUnmasked,360 cpgIslandSuper,334 cpgIslandSuper,357 gap,132 counts gold,143 coverage uniprot,1485 covered chainGalGal6,814 chainNetGalGal6,817 chainNetXenTro7,829 chainNetXenTro9,826 chainXenTro7,826 chainXenTro9,823 gap,25 gold,27 netGalGal6,814 netXenTro7,826 netXenTro9,823 cow transMapEnsemblV5,451 transMapEstV5,420 transMapRefSeqV5,420 transMapRnaV5,420 transMapV5,526 cpg cpgIslandExt,1 cpgIslandExt,3 cpgIslandExt,15 cpgIslandExt,26 cpgIslandExt,55 cpgIslandExt,147 cpgIslandExt,176 cpgIslandExt,225 cpgIslandExt,316 cpgIslandExt,319 cpgIslandExt,333 cpgIslandExt,346 cpgIslandExt,351 cpgIslandExt,356 cpgIslandExt,367 cpgIslandExt,382 cpgIslandExt,385 cpgIslandExt,506 cpgIslandExt,608 cpgIslandExtUnmasked,2 cpgIslandExtUnmasked,3 cpgIslandExtUnmasked,18 cpgIslandExtUnmasked,29 cpgIslandExtUnmasked,58 cpgIslandExtUnmasked,150 cpgIslandExtUnmasked,179 cpgIslandExtUnmasked,228 cpgIslandExtUnmasked,319 cpgIslandExtUnmasked,322 cpgIslandExtUnmasked,336 cpgIslandExtUnmasked,349 cpgIslandExtUnmasked,354 cpgIslandExtUnmasked,359 cpgIslandExtUnmasked,370 cpgIslandExtUnmasked,385 cpgIslandExtUnmasked,388 cpgIslandExtUnmasked,509 cpgIslandExtUnmasked,611 cpgIslandSuper,1 cpgIslandSuper,3 cpgIslandSuper,15 cpgIslandSuper,26 cpgIslandSuper,55 cpgIslandSuper,147 cpgIslandSuper,176 cpgIslandSuper,225 cpgIslandSuper,316 cpgIslandSuper,319 cpgIslandSuper,333 cpgIslandSuper,346 cpgIslandSuper,351 cpgIslandSuper,356 cpgIslandSuper,367 cpgIslandSuper,382 cpgIslandSuper,385 cpgIslandSuper,506 cpgIslandSuper,608 cpg_lh cpgIslandExt,418 cpgIslandExt,558 cpgIslandExt,568 cpgIslandExt,580 cpgIslandExtUnmasked,421 cpgIslandExtUnmasked,561 cpgIslandExtUnmasked,571 cpgIslandExtUnmasked,583 cpgIslandSuper,418 cpgIslandSuper,558 cpgIslandSuper,568 cpgIslandSuper,580 cpg_lh.err cpgIslandExt,423 cpgIslandExtUnmasked,426 cpgIslandSuper,423 cpgisland.bed cpgIslandExt,489 cpgIslandExtUnmasked,492 cpgIslandSuper,489 cpgislandext cpgIslandExt,566 cpgIslandExtUnmasked,569 cpgIslandSuper,566 cpgs cpgIslandExt,115 cpgIslandExt,152 cpgIslandExtUnmasked,118 cpgIslandExtUnmasked,155 cpgIslandSuper,115 cpgIslandSuper,152 create refSeqComposite,310 windowmaskerSdust,48 created chainGalGal6,989 chainNetGalGal6,992 chainNetXenTro7,1004 chainNetXenTro9,1001 chainXenTro7,1001 chainXenTro9,998 microsat,89 netGalGal6,989 netXenTro7,1001 netXenTro9,998 refSeqComposite,102 refSeqComposite,1153 rmsk,13 transMapEnsemblV5,74 transMapEstV5,43 transMapRefSeqV5,43 transMapRnaV5,43 transMapV5,42 uniprot,824 uniprot,1942 creates chainGalGal6,639 chainNetGalGal6,642 chainNetXenTro7,654 chainNetXenTro9,651 chainXenTro7,651 chainXenTro9,648 netGalGal6,639 netXenTro7,651 netXenTro9,648 credits augustusGene,247 chainGalGal6,915 chainNetGalGal6,918 chainNetXenTro7,930 chainNetXenTro9,927 chainXenTro7,927 chainXenTro9,924 cpgIslandExt,584 cpgIslandExtUnmasked,587 cpgIslandSuper,584 gc5BaseBw,71 genscan,169 microsat,104 nestedRepeats,302 netGalGal6,915 netXenTro7,927 netXenTro9,924 refSeqComposite,1711 rmsk,325 simpleRepeat,66 transMapEnsemblV5,676 transMapEstV5,645 transMapRefSeqV5,645 transMapRnaV5,645 transMapV5,751 ucscToINSDC,42 ucscToRefSeq,36 uniprot,1938 xenoRefGene,280 criteria cpgIslandExt,261 cpgIslandExtUnmasked,264 cpgIslandSuper,261 transMapEnsemblV5,359 transMapEstV5,328 transMapRefSeqV5,328 transMapRnaV5,328 transMapV5,434 cross-species transMapEnsemblV5,26 transMapEstV5,24 transMapRefSeqV5,24 transMapRnaV5,24 transMapV5,23 cruz chainGalGal6,965 chainGalGal6,1010 chainNetGalGal6,968 chainNetGalGal6,1013 chainNetXenTro7,980 chainNetXenTro7,1025 chainNetXenTro9,977 chainNetXenTro9,1022 chainXenTro7,977 chainXenTro7,1022 chainXenTro9,974 chainXenTro9,1019 netGalGal6,965 netGalGal6,1010 netXenTro7,977 netXenTro7,1022 netXenTro9,974 netXenTro9,1019 cs cpgIslandExt,63 cpgIslandExt,101 cpgIslandExt,296 cpgIslandExtUnmasked,66 cpgIslandExtUnmasked,104 cpgIslandExtUnmasked,299 cpgIslandSuper,63 cpgIslandSuper,101 cpgIslandSuper,296 culex augustusGene,220 curated ncbiRefSeq,6 refSeqComposite,88 refSeqComposite,202 refSeqComposite,210 refSeqComposite,251 refSeqComposite,315 refSeqComposite,400 refSeqComposite,422 refSeqComposite,471 refSeqComposite,523 refSeqComposite,556 refSeqComposite,591 refSeqComposite,1413 refSeqComposite,1673 refSeqComposite,1725 refSeqComposite,1803 uniprot,35 uniprot,110 uniprot,142 xenoRefGene,296 xenoRefGene,373 curator rmsk,261 curr nestedRepeats,384 nestedRepeats,406 rmsk,407 rmsk,429 current nestedRepeats,250 uniprot,1296 uniprot,1575 uniprot,1692 uniprot,1712 currently gold,79 refSeqComposite,475 cutoff refSeqComposite,942 cytoplamsic uniprot,518 cytoplasmic unipLocCytopl,1 unipLocCytopl,3 uniprot,276 uniprot,284 uniprot,569 cytosine cpgIslandExt,45 cpgIslandExtUnmasked,48 cpgIslandSuper,45 gc5BaseBw,24 d augustusGene,293 chainGalGal6,1057 chainGalGal6,1101 chainNetGalGal6,1060 chainNetGalGal6,1104 chainNetXenTro7,1072 chainNetXenTro7,1116 chainNetXenTro9,1069 chainNetXenTro9,1113 chainXenTro7,1069 chainXenTro7,1113 chainXenTro9,1066 chainXenTro9,1110 cpgIslandExt,438 cpgIslandExtUnmasked,441 cpgIslandSuper,438 genscan,192 netGalGal6,1057 netGalGal6,1101 netXenTro7,1069 netXenTro7,1113 netXenTro9,1066 netXenTro9,1110 transMapEnsemblV5,764 transMapEnsemblV5,798 transMapEstV5,733 transMapEstV5,767 transMapRefSeqV5,733 transMapRefSeqV5,767 transMapRnaV5,733 transMapRnaV5,767 transMapV5,839 transMapV5,873 d501-4 refSeqComposite,1821 xenoRefGene,391 d71-5 uniprot,2005 d756-63 refSeqComposite,1787 xenoRefGene,357 dark refSeqComposite,625 unipAliSwissprot,10 uniprot,162 uniprot,582 uniprot,587 xenoRefGene,75 data cpgIslandExt,403 cpgIslandExt,493 cpgIslandExt,504 cpgIslandExt,525 cpgIslandExtUnmasked,406 cpgIslandExtUnmasked,496 cpgIslandExtUnmasked,507 cpgIslandExtUnmasked,528 cpgIslandSuper,403 cpgIslandSuper,493 cpgIslandSuper,504 cpgIslandSuper,525 gap,97 gc5BaseBw,73 microsat,47 nestedRepeats,263 nestedRepeats,280 refSeqComposite,154 refSeqComposite,656 refSeqComposite,1157 refSeqComposite,1163 refSeqComposite,1290 refSeqComposite,1294 refSeqComposite,1316 refSeqComposite,1368 refSeqComposite,1653 refSeqComposite,1719 rmsk,126 rmsk,287 transMapEnsemblV5,518 transMapEnsemblV5,522 transMapEnsemblV5,536 transMapEnsemblV5,573 transMapEnsemblV5,577 transMapEnsemblV5,691 transMapEstV5,487 transMapEstV5,491 transMapEstV5,505 transMapEstV5,542 transMapEstV5,546 transMapEstV5,660 transMapRefSeqV5,487 transMapRefSeqV5,491 transMapRefSeqV5,505 transMapRefSeqV5,542 transMapRefSeqV5,546 transMapRefSeqV5,660 transMapRnaV5,487 transMapRnaV5,491 transMapRnaV5,505 transMapRnaV5,542 transMapRnaV5,546 transMapRnaV5,660 transMapV5,593 transMapV5,597 transMapV5,611 transMapV5,648 transMapV5,652 transMapV5,766 ucscToINSDC,34 ucscToINSDC,44 ucscToRefSeq,28 ucscToRefSeq,38 uniprot,32 uniprot,45 uniprot,892 uniprot,895 uniprot,1683 uniprot,1705 uniprot,1709 uniprot,1724 uniprot,1837 uniprot,1980 xenoRefGene,36 xenoRefGene,290 database chainGalGal6,981 chainNetGalGal6,984 chainNetXenTro7,996 chainNetXenTro9,993 chainXenTro7,993 chainXenTro9,990 nestedRepeats,345 netGalGal6,981 netXenTro7,993 netXenTro9,990 refSeqComposite,564 refSeqComposite,1403 refSeqComposite,1785 refSeqComposite,1806 refSeqComposite,1819 rmsk,125 rmsk,368 transMapEnsemblV5,166 transMapEstV5,135 transMapRefSeqV5,135 transMapRnaV5,135 transMapV5,241 ucscToINSDC,8 ucscToINSDC,30 ucscToINSDC,41 ucscToRefSeq,25 ucscToRefSeq,35 uniprot,25 uniprot,821 uniprot,2003 uniprot,2031 xenoRefGene,355 xenoRefGene,376 xenoRefGene,389 databases refSeqComposite,279 refSeqComposite,426 transMapEnsemblV5,698 transMapEstV5,667 transMapRefSeqV5,667 transMapRnaV5,667 transMapV5,773 dataset refSeqComposite,532 david chainGalGal6,975 chainNetGalGal6,978 chainNetXenTro7,990 chainNetXenTro9,987 chainXenTro7,987 chainXenTro9,984 netGalGal6,975 netXenTro7,987 netXenTro9,984 davis transMapEnsemblV5,727 transMapEstV5,696 transMapRefSeqV5,696 transMapRnaV5,696 transMapV5,802 de augustusGene,303 transMapEnsemblV5,774 transMapEstV5,743 transMapRefSeqV5,743 transMapRnaV5,743 transMapV5,849 deamination cpgIslandExt,110 cpgIslandExtUnmasked,113 cpgIslandSuper,110 dec nestedRepeats,389 nestedRepeats,411 rmsk,412 rmsk,434 transMapEnsemblV5,749 transMapEnsemblV5,815 transMapEstV5,718 transMapEstV5,784 transMapRefSeqV5,718 transMapRefSeqV5,784 transMapRnaV5,718 transMapRnaV5,784 transMapV5,824 transMapV5,890 default chainGalGal6,318 chainNetGalGal6,321 chainNetXenTro7,331 chainNetXenTro9,328 chainXenTro7,328 chainXenTro9,325 cpgIslandExt,195 cpgIslandExtUnmasked,198 cpgIslandSuper,195 netGalGal6,318 netXenTro7,328 netXenTro9,325 refSeqComposite,766 refSeqComposite,1040 refSeqComposite,1067 uniprot,225 xenoRefGene,103 xenoRefGene,196 defined refSeqComposite,627 uniprot,305 uniprot,1387 definition gap,40 gold,42 deletion chainGalGal6,147 chainGalGal6,1062 chainNetGalGal6,150 chainNetGalGal6,1065 chainNetXenTro7,156 chainNetXenTro7,1077 chainNetXenTro9,154 chainNetXenTro9,1074 chainXenTro7,153 chainXenTro7,1074 chainXenTro9,151 chainXenTro9,1071 netGalGal6,147 netGalGal6,1062 netXenTro7,153 netXenTro7,1074 netXenTro9,151 netXenTro9,1071 refSeqComposite,950 refSeqComposite,1046 refSeqComposite,1073 rmsk,220 deletions chainGalGal6,115 chainGalGal6,179 chainNetGalGal6,118 chainNetGalGal6,182 chainNetXenTro7,124 chainNetXenTro7,189 chainNetXenTro9,122 chainNetXenTro9,187 chainXenTro7,121 chainXenTro7,186 chainXenTro9,119 chainXenTro9,184 netGalGal6,115 netGalGal6,179 netXenTro7,121 netXenTro7,186 netXenTro9,119 netXenTro9,184 delivered gap,52 gold,51 dense gold,68 nestedRepeats,157 nestedRepeats,168 dependencies genscan,183 depending uniprot,442 uniprot,808 depicts gold,72 windowmaskerSdust,15 deprecated uniprot,1044 derived chainGalGal6,765 chainNetGalGal6,768 chainNetXenTro7,780 chainNetXenTro9,777 chainXenTro7,777 chainXenTro9,774 netGalGal6,765 netXenTro7,777 netXenTro9,774 uniprot,830 described chainGalGal6,772 chainNetGalGal6,775 chainNetXenTro7,787 chainNetXenTro9,784 chainXenTro7,784 chainXenTro9,781 genscan,161 nestedRepeats,60 nestedRepeats,338 netGalGal6,772 netXenTro7,784 netXenTro9,781 refSeqComposite,1642 rmsk,96 rmsk,361 uniprot,1524 describes augustusGene,226 gap,61 gold,60 describing refSeqComposite,255 description augustusGene,12 chainGalGal6,12 chainGalGal6,777 chainNetGalGal6,15 chainNetGalGal6,780 chainNetXenTro7,18 chainNetXenTro7,792 chainNetXenTro9,17 chainNetXenTro9,789 chainXenTro7,15 chainXenTro7,789 chainXenTro9,14 chainXenTro9,786 cpgIslandExt,14 cpgIslandExtUnmasked,17 cpgIslandSuper,14 gap,7 gc5BaseBw,11 genscan,10 genscan,77 genscan,133 gold,8 microsat,10 nestedRepeats,14 netGalGal6,12 netGalGal6,777 netXenTro7,15 netXenTro7,789 netXenTro9,14 netXenTro9,786 refSeqComposite,11 refSeqComposite,741 rmsk,9 simpleRepeat,11 transMapEnsemblV5,14 transMapEnsemblV5,234 transMapEstV5,12 transMapEstV5,203 transMapRefSeqV5,13 transMapRefSeqV5,203 transMapRnaV5,13 transMapRnaV5,203 transMapV5,11 transMapV5,309 ucscToINSDC,13 ucscToRefSeq,8 uniprot,11 uniprot,106 windowmaskerSdust,12 xenoRefGene,11 xenoRefGene,99 descriptions augustusGene,91 designed refSeqComposite,1441 uniprot,1355 destination transMapEnsemblV5,417 transMapEstV5,386 transMapRefSeqV5,386 transMapRnaV5,386 transMapV5,492 destined uniprot,244 destuniq transMapEnsemblV5,436 transMapEstV5,405 transMapRefSeqV5,405 transMapRnaV5,405 transMapV5,511 detail genscan,164 detailed augustusGene,90 chainGalGal6,461 chainGalGal6,480 chainNetGalGal6,464 chainNetGalGal6,483 chainNetXenTro7,474 chainNetXenTro7,493 chainNetXenTro9,471 chainNetXenTro9,490 chainXenTro7,471 chainXenTro7,490 chainXenTro9,468 chainXenTro9,487 nestedRepeats,70 netGalGal6,461 netGalGal6,480 netXenTro7,471 netXenTro7,490 netXenTro9,468 netXenTro9,487 rmsk,37 uniprot,692 details refSeqComposite,95 refSeqComposite,1126 rmsk,119 transMapEnsemblV5,236 transMapEstV5,205 transMapRefSeqV5,205 transMapRnaV5,205 transMapV5,311 uniprot,499 uniprot,771 uniprot,1157 uniprot,1584 determination transMapEnsemblV5,274 transMapEstV5,243 transMapRefSeqV5,243 transMapRnaV5,243 transMapV5,349 determine transMapV5,91 determined windowmaskerSdust,19 determining chainGalGal6,485 chainNetGalGal6,488 chainNetXenTro7,498 chainNetXenTro9,495 chainXenTro7,495 chainXenTro9,492 netGalGal6,485 netXenTro7,495 netXenTro9,492 dev cpgIslandExt,419 cpgIslandExtUnmasked,422 cpgIslandSuper,419 nestedRepeats,387 nestedRepeats,409 rmsk,410 rmsk,432 developed chainGalGal6,922 chainGalGal6,957 chainGalGal6,1003 chainNetGalGal6,925 chainNetGalGal6,960 chainNetGalGal6,1006 chainNetXenTro7,937 chainNetXenTro7,972 chainNetXenTro7,1018 chainNetXenTro9,934 chainNetXenTro9,969 chainNetXenTro9,1015 chainXenTro7,934 chainXenTro7,969 chainXenTro7,1015 chainXenTro9,931 chainXenTro9,966 chainXenTro9,1012 cpgIslandExt,595 cpgIslandExtUnmasked,598 cpgIslandSuper,595 netGalGal6,922 netGalGal6,957 netGalGal6,1003 netXenTro7,934 netXenTro7,969 netXenTro7,1015 netXenTro9,931 netXenTro9,966 netXenTro9,1012 dfam rmsk,112 di-nucleotide microsat,3 microsat,32 diagnostics refSeqComposite,586 diekhans augustusGene,288 transMapEnsemblV5,683 transMapEnsemblV5,716 transMapEnsemblV5,759 transMapEnsemblV5,791 transMapEstV5,652 transMapEstV5,685 transMapEstV5,728 transMapEstV5,760 transMapRefSeqV5,652 transMapRefSeqV5,685 transMapRefSeqV5,728 transMapRefSeqV5,760 transMapRnaV5,652 transMapRnaV5,685 transMapRnaV5,728 transMapRnaV5,760 transMapV5,758 transMapV5,791 transMapV5,834 transMapV5,866 uniprot,1540 uniprot,1957 diemand uniprot,2014 differ refSeqComposite,288 uniprot,746 uniprot,1131 difference uniprot,1251 differences ncbiRefSeqGenomicDiff,3 refSeqComposite,64 refSeqComposite,461 refSeqComposite,892 refSeqComposite,961 uniprot,374 uniprot,921 uniprot,1370 different augustusGene,39 augustusGene,85 augustusGene,96 augustusGene,144 augustusGene,155 augustusGene,179 augustusGene,193 chainGalGal6,560 chainNetGalGal6,563 chainNetXenTro7,573 chainNetXenTro9,570 chainXenTro7,570 chainXenTro9,567 gc5BaseBw,50 genscan,54 netGalGal6,560 netXenTro7,570 netXenTro9,567 refSeqComposite,99 refSeqComposite,134 refSeqComposite,874 rmsk,149 uniprot,634 differing refSeqComposite,153 difficult transMapEnsemblV5,278 transMapEstV5,247 transMapRefSeqV5,247 transMapRnaV5,247 transMapV5,353 diffs ncbiRefSeqGenomicDiff,2 refSeqComposite,458 refSeqComposite,870 refSeqComposite,1200 refSeqComposite,1375 dinucleotide cpgIslandExt,240 cpgIslandExtUnmasked,243 cpgIslandSuper,240 dinucleotides cpgIslandExt,282 cpgIslandExt,340 cpgIslandExtUnmasked,285 cpgIslandExtUnmasked,343 cpgIslandSuper,282 cpgIslandSuper,340 directly cpgIslandExt,534 cpgIslandExtUnmasked,537 cpgIslandSuper,534 uniprot,993 directory refSeqComposite,1531 refSeqComposite,1580 refSeqComposite,1600 rmsk,134 discarded chainGalGal6,691 chainNetGalGal6,694 chainNetXenTro7,706 chainNetXenTro9,703 chainXenTro7,703 chainXenTro9,700 netGalGal6,691 netXenTro7,703 netXenTro9,700 refSeqComposite,1248 transMapEnsemblV5,383 transMapEstV5,352 transMapRefSeqV5,352 transMapRnaV5,352 transMapV5,458 xenoRefGene,238 discovery transMapEnsemblV5,738 transMapEstV5,707 transMapRefSeqV5,707 transMapRnaV5,707 transMapV5,813 discussion nestedRepeats,364 rmsk,387 disease uniprot,545 uniprot,616 diseases simpleRepeat,54 display chainGalGal6,241 chainGalGal6,311 chainGalGal6,356 chainGalGal6,386 chainGalGal6,445 chainGalGal6,474 chainGalGal6,503 chainGalGal6,979 chainNetGalGal6,244 chainNetGalGal6,314 chainNetGalGal6,359 chainNetGalGal6,389 chainNetGalGal6,448 chainNetGalGal6,477 chainNetGalGal6,506 chainNetGalGal6,982 chainNetXenTro7,251 chainNetXenTro7,324 chainNetXenTro7,369 chainNetXenTro7,399 chainNetXenTro7,458 chainNetXenTro7,487 chainNetXenTro7,516 chainNetXenTro7,994 chainNetXenTro9,249 chainNetXenTro9,321 chainNetXenTro9,366 chainNetXenTro9,396 chainNetXenTro9,455 chainNetXenTro9,484 chainNetXenTro9,513 chainNetXenTro9,991 chainXenTro7,248 chainXenTro7,321 chainXenTro7,366 chainXenTro7,396 chainXenTro7,455 chainXenTro7,484 chainXenTro7,513 chainXenTro7,991 chainXenTro9,246 chainXenTro9,318 chainXenTro9,363 chainXenTro9,393 chainXenTro9,452 chainXenTro9,481 chainXenTro9,510 chainXenTro9,988 genscan,61 genscan,69 genscan,104 gold,131 nestedRepeats,111 netGalGal6,241 netGalGal6,311 netGalGal6,356 netGalGal6,386 netGalGal6,445 netGalGal6,474 netGalGal6,503 netGalGal6,979 netXenTro7,248 netXenTro7,321 netXenTro7,366 netXenTro7,396 netXenTro7,455 netXenTro7,484 netXenTro7,513 netXenTro7,991 netXenTro9,246 netXenTro9,318 netXenTro9,363 netXenTro9,393 netXenTro9,452 netXenTro9,481 netXenTro9,510 netXenTro9,988 refSeqComposite,141 refSeqComposite,452 refSeqComposite,600 refSeqComposite,721 refSeqComposite,779 refSeqComposite,835 refSeqComposite,1183 refSeqComposite,1447 rmsk,135 rmsk,141 rmsk,212 transMapEnsemblV5,92 transMapEnsemblV5,100 transMapEnsemblV5,113 transMapEstV5,61 transMapEstV5,69 transMapEstV5,82 transMapRefSeqV5,61 transMapRefSeqV5,69 transMapRefSeqV5,82 transMapRnaV5,61 transMapRnaV5,69 transMapRnaV5,82 transMapV5,167 transMapV5,175 transMapV5,188 uniprot,446 xenoRefGene,43 xenoRefGene,51 xenoRefGene,80 xenoRefGene,116 xenoRefGene,159 displayed chainGalGal6,422 chainGalGal6,519 chainGalGal6,696 chainNetGalGal6,425 chainNetGalGal6,522 chainNetGalGal6,699 chainNetXenTro7,435 chainNetXenTro7,532 chainNetXenTro7,711 chainNetXenTro9,432 chainNetXenTro9,529 chainNetXenTro9,708 chainXenTro7,432 chainXenTro7,529 chainXenTro7,708 chainXenTro9,429 chainXenTro9,526 chainXenTro9,705 cpgIslandExt,204 cpgIslandExtUnmasked,207 cpgIslandSuper,204 gc5BaseBw,54 nestedRepeats,124 nestedRepeats,217 netGalGal6,422 netGalGal6,519 netGalGal6,696 netXenTro7,432 netXenTro7,529 netXenTro7,708 netXenTro9,429 netXenTro9,526 netXenTro9,705 refSeqComposite,1119 xenoRefGene,204 displays chainGalGal6,122 chainNetGalGal6,125 chainNetXenTro7,131 chainNetXenTro9,129 chainXenTro7,128 chainXenTro9,126 cpgIslandExt,174 cpgIslandExtUnmasked,177 cpgIslandSuper,174 microsat,13 netGalGal6,122 netXenTro7,128 netXenTro9,126 rmsk,145 simpleRepeat,14 dissertation augustusGene,105 distance transMapEnsemblV5,221 transMapEstV5,190 transMapRefSeqV5,190 transMapRnaV5,190 transMapV5,296 distances transMapEnsemblV5,70 transMapEstV5,39 transMapRefSeqV5,39 transMapRnaV5,39 transMapV5,38 distant transMapEnsemblV5,270 transMapEstV5,239 transMapRefSeqV5,239 transMapRnaV5,239 transMapV5,64 transMapV5,345 distinguish cpgIslandExt,75 cpgIslandExtUnmasked,78 cpgIslandSuper,75 distinguished gold,85 distributions augustusGene,83 genscan,42 disulf unipDisulfBond,1 uniprot,472 disulfide unipDisulfBond,4 uniprot,333 uniprot,335 diverged chainGalGal6,914 chainNetGalGal6,917 chainNetXenTro7,929 chainNetXenTro9,926 chainXenTro7,926 chainXenTro9,923 nestedRepeats,212 netGalGal6,914 netXenTro7,926 netXenTro9,923 transMapV5,152 divided uniprot,56 dna chainGalGal6,1023 chainNetGalGal6,1026 chainNetXenTro7,1038 chainNetXenTro9,1035 chainXenTro7,1035 chainXenTro9,1032 cpgIslandExt,60 cpgIslandExt,79 cpgIslandExt,92 cpgIslandExtUnmasked,63 cpgIslandExtUnmasked,82 cpgIslandExtUnmasked,95 cpgIslandSuper,60 cpgIslandSuper,79 cpgIslandSuper,92 genscan,219 microsat,123 nestedRepeats,33 nestedRepeats,41 netGalGal6,1023 netXenTro7,1035 netXenTro9,1032 refSeqComposite,1085 rmsk,23 rmsk,31 rmsk,174 rmsk,177 rmsk,257 simpleRepeat,83 do cpgIslandExt,140 cpgIslandExtUnmasked,143 cpgIslandSuper,140 refSeqComposite,390 transMapEnsemblV5,319 transMapEstV5,288 transMapRefSeqV5,288 transMapRnaV5,288 transMapV5,394 uniprot,168 uniprot,1129 doc rmsk,132 document gap,58 gold,57 documentation gap,30 gold,32 dollar cpgIslandExt,425 cpgIslandExt,427 cpgIslandExt,431 cpgIslandExt,433 cpgIslandExt,457 cpgIslandExt,459 cpgIslandExt,461 cpgIslandExt,463 cpgIslandExt,465 cpgIslandExt,468 cpgIslandExt,471 cpgIslandExt,476 cpgIslandExt,479 cpgIslandExt,481 cpgIslandExtUnmasked,428 cpgIslandExtUnmasked,430 cpgIslandExtUnmasked,434 cpgIslandExtUnmasked,436 cpgIslandExtUnmasked,460 cpgIslandExtUnmasked,462 cpgIslandExtUnmasked,464 cpgIslandExtUnmasked,466 cpgIslandExtUnmasked,468 cpgIslandExtUnmasked,471 cpgIslandExtUnmasked,474 cpgIslandExtUnmasked,479 cpgIslandExtUnmasked,482 cpgIslandExtUnmasked,484 cpgIslandSuper,425 cpgIslandSuper,427 cpgIslandSuper,431 cpgIslandSuper,433 cpgIslandSuper,457 cpgIslandSuper,459 cpgIslandSuper,461 cpgIslandSuper,463 cpgIslandSuper,465 cpgIslandSuper,468 cpgIslandSuper,471 cpgIslandSuper,476 cpgIslandSuper,479 cpgIslandSuper,481 domain unipLocExtra,4 domains unipDomain,1 unipDomain,3 unipLocCytopl,4 unipLocTransMemb,4 uniprot,255 uniprot,257 uniprot,266 uniprot,268 uniprot,277 uniprot,279 uniprot,323 uniprot,325 uniprot,331 uniprot,391 uniprot,514 uniprot,516 uniprot,519 uniprot,550 done augustusGene,265 augustusGene,281 donor genscan,31 double chainGalGal6,130 chainGalGal6,160 chainNetGalGal6,133 chainNetGalGal6,163 chainNetXenTro7,139 chainNetXenTro7,170 chainNetXenTro9,137 chainNetXenTro9,168 chainXenTro7,136 chainXenTro7,167 chainXenTro9,134 chainXenTro9,165 netGalGal6,130 netGalGal6,160 netXenTro7,136 netXenTro7,167 netXenTro9,134 netXenTro9,165 refSeqComposite,1020 double-lined chainGalGal6,221 chainNetGalGal6,224 chainNetXenTro7,231 chainNetXenTro9,229 chainXenTro7,228 chainXenTro9,226 netGalGal6,221 netXenTro7,228 netXenTro9,226 double-sided chainGalGal6,104 chainNetGalGal6,107 chainNetXenTro7,113 chainNetXenTro9,111 chainXenTro7,110 chainXenTro9,108 netGalGal6,104 netXenTro7,110 netXenTro9,108 download refSeqComposite,1566 refSeqComposite,1709 transMapEnsemblV5,560 transMapEstV5,529 transMapRefSeqV5,529 transMapRnaV5,529 transMapV5,635 uniprot,1744 uniprot,1983 downloaded refSeqComposite,1166 refSeqComposite,1331 refSeqComposite,1520 transMapEnsemblV5,557 transMapEnsemblV5,626 transMapEstV5,526 transMapEstV5,595 transMapRefSeqV5,526 transMapRefSeqV5,595 transMapRnaV5,526 transMapRnaV5,595 transMapV5,632 transMapV5,701 ucscToINSDC,36 ucscToRefSeq,30 uniprot,1741 uniprot,1777 downloading transMapEnsemblV5,636 transMapEstV5,605 transMapRefSeqV5,605 transMapRnaV5,605 transMapV5,711 uniprot,1787 downloads refSeqComposite,1334 refSeqComposite,1350 refSeqComposite,1489 refSeqComposite,1579 refSeqComposite,1604 refSeqComposite,1683 rmsk,76 uniprot,1698 downstream refSeqComposite,1458 dr refSeqComposite,1797 xenoRefGene,367 drawn gap,108 gold,127 draws uniprot,1532 drosophila augustusGene,213 due chainGalGal6,144 chainGalGal6,214 chainGalGal6,226 chainNetGalGal6,147 chainNetGalGal6,217 chainNetGalGal6,229 chainNetXenTro7,153 chainNetXenTro7,224 chainNetXenTro7,236 chainNetXenTro9,151 chainNetXenTro9,222 chainNetXenTro9,234 chainXenTro7,150 chainXenTro7,221 chainXenTro7,233 chainXenTro9,148 chainXenTro9,219 chainXenTro9,231 netGalGal6,144 netGalGal6,214 netGalGal6,226 netXenTro7,150 netXenTro7,221 netXenTro7,233 netXenTro9,148 netXenTro9,219 netXenTro9,231 refSeqComposite,979 uniprot,848 uniprot,919 uniprot,1368 duplicate uniprot,594 duplication chainGalGal6,1061 chainNetGalGal6,1064 chainNetXenTro7,1076 chainNetXenTro9,1073 chainXenTro7,1073 chainXenTro9,1070 cpgIslandExt,95 cpgIslandExtUnmasked,98 cpgIslandSuper,95 netGalGal6,1061 netXenTro7,1073 netXenTro9,1070 duplications transMapEnsemblV5,312 transMapEnsemblV5,510 transMapEstV5,281 transMapEstV5,479 transMapRefSeqV5,281 transMapRefSeqV5,479 transMapRnaV5,281 transMapRnaV5,479 transMapV5,387 transMapV5,585 during chainGalGal6,819 chainNetGalGal6,822 chainNetXenTro7,834 chainNetXenTro9,831 chainXenTro7,831 chainXenTro9,828 netGalGal6,819 netXenTro7,831 netXenTro9,828 dynamic chainGalGal6,652 chainNetGalGal6,655 chainNetXenTro7,667 chainNetXenTro9,664 chainXenTro7,664 chainXenTro9,661 netGalGal6,652 netXenTro7,664 netXenTro9,661 e uniprot,2021 e.g chainGalGal6,373 chainNetGalGal6,376 chainNetXenTro7,386 chainNetXenTro9,383 chainXenTro7,383 chainXenTro9,380 netGalGal6,373 netXenTro7,383 netXenTro9,380 refSeqComposite,1136 uniprot,398 uniprot,467 e247 transMapEnsemblV5,818 transMapEstV5,787 transMapRefSeqV5,787 transMapRnaV5,787 transMapV5,893 each chainGalGal6,259 chainNetGalGal6,262 chainNetXenTro7,269 chainNetXenTro9,267 chainXenTro7,266 chainXenTro9,264 cpgIslandExt,239 cpgIslandExt,253 cpgIslandExtUnmasked,242 cpgIslandExtUnmasked,256 cpgIslandSuper,239 cpgIslandSuper,253 genscan,99 nestedRepeats,120 netGalGal6,259 netXenTro7,266 netXenTro9,264 refSeqComposite,542 refSeqComposite,1430 transMapEnsemblV5,389 transMapEnsemblV5,403 transMapEnsemblV5,412 transMapEnsemblV5,431 transMapEstV5,358 transMapEstV5,372 transMapEstV5,381 transMapEstV5,400 transMapRefSeqV5,358 transMapRefSeqV5,372 transMapRefSeqV5,381 transMapRefSeqV5,400 transMapRnaV5,358 transMapRnaV5,372 transMapRnaV5,381 transMapRnaV5,400 transMapV5,464 transMapV5,478 transMapV5,487 transMapV5,506 uniprot,151 echo uniprot,1925 edge uniprot,1182 uniprot,1451 editors genscan,195 either chainGalGal6,127 chainNetGalGal6,130 chainNetXenTro7,136 chainNetXenTro9,134 chainXenTro7,133 chainXenTro9,131 gap,87 netGalGal6,127 netXenTro7,133 netXenTro9,131 rmsk,273 uniprot,816 uniprot,1398 electronic nestedRepeats,348 rmsk,371 element rmsk,228 elements nestedRepeats,352 nestedRepeats,380 rmsk,3 rmsk,156 rmsk,164 rmsk,169 rmsk,176 rmsk,375 rmsk,403 elsevier genscan,202 em windowmaskerSdust,93 emerged chainGalGal6,825 chainNetGalGal6,828 chainNetXenTro7,840 chainNetXenTro9,837 chainXenTro7,837 chainXenTro9,834 netGalGal6,825 netXenTro7,837 netXenTro9,834 end refSeqComposite,1054 refSeqComposite,1561 rmsk,245 transMapEnsemblV5,673 transMapEstV5,642 transMapRefSeqV5,642 transMapRnaV5,642 transMapV5,748 uniprot,126 uniprot,210 uniprot,1823 enough refSeqComposite,1028 ensembl transMapEnsemblV5,2 transMapEnsemblV5,4 transMapEnsemblV5,20 transMapEnsemblV5,40 transMapEnsemblV5,47 transMapEnsemblV5,58 transMapEnsemblV5,592 transMapEnsemblV5,708 transMapEstV5,561 transMapEstV5,677 transMapRefSeqV5,561 transMapRefSeqV5,677 transMapRnaV5,561 transMapRnaV5,677 transMapV5,667 transMapV5,783 uniprot,731 uniprot,834 uniprot,865 ensure transMapEnsemblV5,385 transMapEstV5,354 transMapRefSeqV5,354 transMapRnaV5,354 transMapV5,460 enter chainGalGal6,367 chainNetGalGal6,370 chainNetXenTro7,380 chainNetXenTro9,377 chainXenTro7,377 chainXenTro9,374 netGalGal6,367 netXenTro7,377 netXenTro9,374 entire cpgIslandExt,301 cpgIslandExtUnmasked,304 cpgIslandSuper,301 windowmaskerSdust,37 entirely uniprot,1434 entries refSeqComposite,1359 ermolaeva refSeqComposite,1760 xenoRefGene,330 errors refSeqComposite,953 est refSeqComposite,264 refSeqComposite,364 transMapEnsemblV5,689 transMapEstV5,4 transMapEstV5,18 transMapEstV5,658 transMapRefSeqV5,658 transMapRnaV5,658 transMapV5,764 established refSeqComposite,688 ests transMapEnsemblV5,177 transMapEnsemblV5,601 transMapEstV5,2 transMapEstV5,146 transMapEstV5,570 transMapRefSeqV5,146 transMapRefSeqV5,570 transMapRnaV5,146 transMapRnaV5,570 transMapV5,252 transMapV5,676 et cpgIslandExt,377 cpgIslandExtUnmasked,380 cpgIslandSuper,377 refSeqComposite,1770 transMapEnsemblV5,735 transMapEstV5,704 transMapRefSeqV5,704 transMapRnaV5,704 transMapV5,810 xenoRefGene,340 etc uniprot,479 evaluate uniprot,1461 evaluated cpgIslandExt,257 cpgIslandExtUnmasked,260 cpgIslandSuper,257 even uniprot,136 every chainGalGal6,275 chainNetGalGal6,278 chainNetXenTro7,286 chainNetXenTro9,284 chainXenTro7,283 chainXenTro9,281 netGalGal6,275 netXenTro7,283 netXenTro9,281 refSeqComposite,478 uniprot,1571 evidence refSeqComposite,261 refSeqComposite,276 evolution chainGalGal6,1058 chainNetGalGal6,1061 chainNetXenTro7,1073 chainNetXenTro9,1070 chainXenTro7,1070 chainXenTro9,1067 netGalGal6,1058 netXenTro7,1070 netXenTro9,1067 evolutionary cpgIslandExt,98 cpgIslandExtUnmasked,101 cpgIslandSuper,98 transMapEnsemblV5,69 transMapEstV5,38 transMapRefSeqV5,38 transMapRnaV5,38 transMapV5,37 ewing transMapEnsemblV5,729 transMapEstV5,698 transMapRefSeqV5,698 transMapRnaV5,698 transMapV5,804 exact uniprot,1622 uniprot,1747 example refSeqComposite,1535 rmsk,256 transMapEnsemblV5,448 transMapEnsemblV5,660 transMapEstV5,417 transMapEstV5,629 transMapRefSeqV5,417 transMapRefSeqV5,629 transMapRnaV5,417 transMapRnaV5,629 transMapV5,97 transMapV5,523 transMapV5,735 uniprot,1450 uniprot,1811 uniprot,1901 examples refSeqComposite,406 except refSeqComposite,41 uniprot,508 exe cpgIslandExt,578 cpgIslandExtUnmasked,581 cpgIslandSuper,578 uniprot,1918 exist chainGalGal6,406 chainNetGalGal6,409 chainNetXenTro7,419 chainNetXenTro9,416 chainXenTro7,416 chainXenTro9,413 cpgIslandExt,179 cpgIslandExtUnmasked,182 cpgIslandSuper,179 gold,97 netGalGal6,406 netXenTro7,416 netXenTro9,413 refSeqComposite,293 exists refSeqComposite,330 exon augustusGene,86 exons chainGalGal6,48 chainNetGalGal6,51 chainNetXenTro7,54 chainNetXenTro9,53 chainXenTro7,51 chainXenTro9,50 genscan,44 netGalGal6,48 netXenTro7,51 netXenTro9,50 transMapEnsemblV5,742 transMapEstV5,711 transMapRefSeqV5,711 transMapRnaV5,711 transMapV5,817 exp cpgIslandExt,381 cpgIslandExtUnmasked,384 cpgIslandSuper,381 expanded refSeqComposite,665 expansions simpleRepeat,48 expected cpgIslandExt,285 cpgIslandExt,366 cpgIslandExtUnmasked,288 cpgIslandExtUnmasked,369 cpgIslandSuper,285 cpgIslandSuper,366 expense transMapEnsemblV5,297 transMapEstV5,266 transMapRefSeqV5,266 transMapRnaV5,266 transMapV5,372 experimentally uniprot,304 explanation gc5BaseBw,66 explored cpgIslandExt,514 cpgIslandExtUnmasked,517 cpgIslandSuper,514 refSeqComposite,1307 uniprot,1716 expression cpgIslandExt,11 cpgIslandExt,146 cpgIslandExtUnmasked,14 cpgIslandExtUnmasked,149 cpgIslandSuper,11 cpgIslandSuper,146 extend rmsk,308 extra transMapEnsemblV5,552 transMapEstV5,521 transMapRefSeqV5,521 transMapRnaV5,521 transMapV5,627 extracellular unipLocExtra,1 unipLocExtra,3 uniprot,254 uniprot,262 uniprot,513 uniprot,566 extract refSeqComposite,1537 extracted nestedRepeats,23 f chainGalGal6,1031 chainNetGalGal6,1034 chainNetXenTro7,1046 chainNetXenTro9,1043 chainXenTro7,1043 chainXenTro9,1040 netGalGal6,1031 netXenTro7,1043 netXenTro9,1040 refSeqComposite,1757 xenoRefGene,327 facilitate genscan,106 uniprot,1852 famiglietti uniprot,2018 families uniprot,1395 family rmsk,249 faq augustusGene,45 genscan,60 nestedRepeats,298 refSeqComposite,140 rmsk,321 transMapEnsemblV5,579 transMapEstV5,548 transMapRefSeqV5,548 transMapRnaV5,548 transMapV5,654 uniprot,1839 far uniprot,599 farrell refSeqComposite,1762 xenoRefGene,332 fasta refSeqComposite,1663 feature chainGalGal6,245 chainNetGalGal6,248 chainNetXenTro7,255 chainNetXenTro9,253 chainXenTro7,252 chainXenTro9,250 genscan,129 netGalGal6,245 netXenTro7,252 netXenTro9,250 refSeqComposite,823 refSeqComposite,856 transMapEnsemblV5,117 transMapEstV5,86 transMapRefSeqV5,86 transMapRnaV5,86 transMapV5,192 uniprot,64 uniprot,524 uniprot,613 xenoRefGene,147 xenoRefGene,180 features refSeqComposite,724 transMapEnsemblV5,654 transMapEstV5,623 transMapRefSeqV5,623 transMapRnaV5,623 transMapV5,729 uniprot,694 uniprot,1805 xenoRefGene,83 fed chainGalGal6,617 chainNetGalGal6,620 chainNetXenTro7,631 chainNetXenTro9,628 chainXenTro7,628 chainXenTro9,625 netGalGal6,617 netXenTro7,628 netXenTro9,625 feedback refSeqComposite,107 uniprot,1445 uniprot,1961 fewer transMapV5,160 ffer windowmaskerSdust,96 field augustusGene,120 file cpgIslandExt,583 cpgIslandExtUnmasked,586 cpgIslandSuper,583 gap,51 gap,67 gold,50 gold,66 refSeqComposite,1171 refSeqComposite,1381 refSeqComposite,1392 refSeqComposite,1657 uniprot,884 uniprot,1511 uniprot,1614 uniprot,1737 uniprot,1756 windowmaskerSdust,77 filenames uniprot,1748 uniprot,1894 files refSeqComposite,1164 refSeqComposite,1482 transMapEnsemblV5,547 transMapEnsemblV5,581 transMapEstV5,516 transMapEstV5,550 transMapRefSeqV5,516 transMapRefSeqV5,550 transMapRnaV5,516 transMapRnaV5,550 transMapV5,622 transMapV5,656 uniprot,1863 fill chainGalGal6,849 chainGalGal6,882 chainNetGalGal6,852 chainNetGalGal6,885 chainNetXenTro7,864 chainNetXenTro7,897 chainNetXenTro9,861 chainNetXenTro9,894 chainXenTro7,861 chainXenTro7,894 chainXenTro9,858 chainXenTro9,891 netGalGal6,849 netGalGal6,882 netXenTro7,861 netXenTro7,894 netXenTro9,858 netXenTro9,891 filled chainGalGal6,415 chainGalGal6,434 chainGalGal6,831 chainGalGal6,904 chainNetGalGal6,418 chainNetGalGal6,437 chainNetGalGal6,834 chainNetGalGal6,907 chainNetXenTro7,428 chainNetXenTro7,447 chainNetXenTro7,846 chainNetXenTro7,919 chainNetXenTro9,425 chainNetXenTro9,444 chainNetXenTro9,843 chainNetXenTro9,916 chainXenTro7,425 chainXenTro7,444 chainXenTro7,843 chainXenTro7,916 chainXenTro9,422 chainXenTro9,441 chainXenTro9,840 chainXenTro9,913 netGalGal6,415 netGalGal6,434 netGalGal6,831 netGalGal6,904 netXenTro7,425 netXenTro7,444 netXenTro7,843 netXenTro7,916 netXenTro9,422 netXenTro9,441 netXenTro9,840 netXenTro9,913 filter chainGalGal6,379 chainNetGalGal6,382 chainNetXenTro7,392 chainNetXenTro9,389 chainXenTro7,389 chainXenTro9,386 genscan,82 netGalGal6,379 netXenTro7,389 netXenTro9,386 uniprot,187 uniprot,664 filtered transMapEnsemblV5,77 transMapEnsemblV5,352 transMapEstV5,46 transMapEstV5,321 transMapRefSeqV5,46 transMapRefSeqV5,321 transMapRnaV5,46 transMapRnaV5,321 transMapV5,45 transMapV5,427 uniprot,1480 uniprot,1499 filtering transMapEnsemblV5,238 transMapEnsemblV5,306 transMapEstV5,207 transMapEstV5,275 transMapRefSeqV5,207 transMapRefSeqV5,275 transMapRnaV5,207 transMapRnaV5,275 transMapV5,313 transMapV5,381 uniprot,693 uniprot,912 uniprot,1154 final cpgIslandExt,89 cpgIslandExtUnmasked,92 cpgIslandSuper,89 uniprot,1153 find chainGalGal6,661 chainNetGalGal6,664 chainNetXenTro7,676 chainNetXenTro9,673 chainXenTro7,673 chainXenTro9,670 netGalGal6,661 netXenTro7,673 netXenTro9,670 rmsk,117 finder microsat,94 microsat,107 microsat,118 simpleRepeat,25 simpleRepeat,78 finding augustusGene,306 chainGalGal6,286 chainNetGalGal6,289 chainNetXenTro7,297 chainNetXenTro9,295 chainXenTro7,294 chainXenTro9,292 netGalGal6,286 netXenTro7,294 netXenTro9,292 transMapEnsemblV5,777 transMapEstV5,746 transMapRefSeqV5,746 transMapRnaV5,746 transMapV5,852 finds transMapV5,159 finger uniprot,327 finished transMapEnsemblV5,363 transMapEstV5,332 transMapRefSeqV5,332 transMapRnaV5,332 transMapV5,438 first chainGalGal6,789 chainNetGalGal6,792 chainNetXenTro7,804 chainNetXenTro9,801 chainXenTro7,801 chainXenTro9,798 netGalGal6,789 netXenTro7,801 netXenTro9,798 refSeqComposite,1427 uniprot,70 fish augustusGene,201 fit chainGalGal6,809 chainNetGalGal6,812 chainNetXenTro7,824 chainNetXenTro9,821 chainXenTro7,821 chainXenTro9,818 nestedRepeats,175 netGalGal6,809 netXenTro7,821 netXenTro9,818 refSeqComposite,392 five refSeqComposite,873 refSeqComposite,889 fix uniprot,851 flag nestedRepeats,287 rmsk,294 flags nestedRepeats,289 rmsk,296 fly augustusGene,214 follow refSeqComposite,598 followed cpgIslandExt,47 cpgIslandExtUnmasked,50 cpgIslandSuper,47 following chainGalGal6,670 chainNetGalGal6,673 chainNetXenTro7,685 chainNetXenTro9,682 chainXenTro7,682 chainXenTro9,679 cpgIslandExt,260 cpgIslandExt,408 cpgIslandExtUnmasked,263 cpgIslandExtUnmasked,411 cpgIslandSuper,260 cpgIslandSuper,408 gap,120 genscan,81 netGalGal6,670 netXenTro7,682 netXenTro9,679 refSeqComposite,450 refSeqComposite,1548 transMapEnsemblV5,589 transMapEstV5,558 transMapRefSeqV5,558 transMapRnaV5,558 transMapV5,664 windowmaskerSdust,56 follows genscan,67 refSeqComposite,895 refSeqComposite,1406 transMapEnsemblV5,98 transMapEnsemblV5,216 transMapEstV5,67 transMapEstV5,185 transMapRefSeqV5,67 transMapRefSeqV5,185 transMapRnaV5,67 transMapRnaV5,185 transMapV5,173 transMapV5,291 xenoRefGene,49 for augustusGene,34 augustusGene,52 augustusGene,68 augustusGene,80 augustusGene,175 augustusGene,184 augustusGene,192 augustusGene,232 augustusGene,253 augustusGene,260 augustusGene,274 chainGalGal6,258 chainGalGal6,274 chainGalGal6,285 chainGalGal6,292 chainGalGal6,492 chainNetGalGal6,261 chainNetGalGal6,277 chainNetGalGal6,288 chainNetGalGal6,295 chainNetGalGal6,495 chainNetXenTro7,268 chainNetXenTro7,285 chainNetXenTro7,296 chainNetXenTro7,303 chainNetXenTro7,505 chainNetXenTro9,266 chainNetXenTro9,283 chainNetXenTro9,294 chainNetXenTro9,301 chainNetXenTro9,502 chainXenTro7,265 chainXenTro7,282 chainXenTro7,293 chainXenTro7,300 chainXenTro7,502 chainXenTro9,263 chainXenTro9,280 chainXenTro9,291 chainXenTro9,298 chainXenTro9,499 cpgIslandExt,133 cpgIslandExt,162 cpgIslandExt,242 cpgIslandExt,246 cpgIslandExt,258 cpgIslandExt,309 cpgIslandExt,500 cpgIslandExt,556 cpgIslandExtUnmasked,136 cpgIslandExtUnmasked,165 cpgIslandExtUnmasked,245 cpgIslandExtUnmasked,249 cpgIslandExtUnmasked,261 cpgIslandExtUnmasked,312 cpgIslandExtUnmasked,503 cpgIslandExtUnmasked,559 cpgIslandSuper,133 cpgIslandSuper,162 cpgIslandSuper,242 cpgIslandSuper,246 cpgIslandSuper,258 cpgIslandSuper,309 cpgIslandSuper,500 cpgIslandSuper,556 cytoBandIdeo,5 gc5BaseBw,64 genscan,49 genscan,71 genscan,124 genscan,131 genscan,174 microsat,95 nestedRepeats,35 nestedRepeats,239 nestedRepeats,293 nestedRepeats,299 nestedRepeats,311 nestedRepeats,362 netGalGal6,258 netGalGal6,274 netGalGal6,285 netGalGal6,292 netGalGal6,492 netXenTro7,265 netXenTro7,282 netXenTro7,293 netXenTro7,300 netXenTro7,502 netXenTro9,263 netXenTro9,280 netXenTro9,291 netXenTro9,298 netXenTro9,499 refSeqComposite,42 refSeqComposite,74 refSeqComposite,93 refSeqComposite,108 refSeqComposite,124 refSeqComposite,129 refSeqComposite,236 refSeqComposite,245 refSeqComposite,331 refSeqComposite,395 refSeqComposite,454 refSeqComposite,477 refSeqComposite,541 refSeqComposite,602 refSeqComposite,723 refSeqComposite,747 refSeqComposite,851 refSeqComposite,1182 refSeqComposite,1295 refSeqComposite,1336 refSeqComposite,1446 refSeqComposite,1525 refSeqComposite,1534 refSeqComposite,1665 refSeqComposite,1693 rmsk,25 rmsk,120 rmsk,255 rmsk,300 rmsk,322 rmsk,334 rmsk,385 simpleRepeat,30 simpleRepeat,56 transMapEnsemblV5,41 transMapEnsemblV5,45 transMapEnsemblV5,67 transMapEnsemblV5,102 transMapEnsemblV5,130 transMapEnsemblV5,147 transMapEnsemblV5,190 transMapEnsemblV5,217 transMapEnsemblV5,235 transMapEnsemblV5,266 transMapEnsemblV5,268 transMapEnsemblV5,286 transMapEnsemblV5,290 transMapEnsemblV5,388 transMapEnsemblV5,402 transMapEnsemblV5,411 transMapEnsemblV5,447 transMapEnsemblV5,523 transMapEnsemblV5,538 transMapEnsemblV5,567 transMapEnsemblV5,631 transMapEnsemblV5,635 transMapEnsemblV5,659 transMapEnsemblV5,802 transMapEstV5,36 transMapEstV5,71 transMapEstV5,99 transMapEstV5,116 transMapEstV5,159 transMapEstV5,186 transMapEstV5,204 transMapEstV5,235 transMapEstV5,237 transMapEstV5,255 transMapEstV5,259 transMapEstV5,357 transMapEstV5,371 transMapEstV5,380 transMapEstV5,416 transMapEstV5,492 transMapEstV5,507 transMapEstV5,536 transMapEstV5,600 transMapEstV5,604 transMapEstV5,628 transMapEstV5,771 transMapRefSeqV5,36 transMapRefSeqV5,71 transMapRefSeqV5,99 transMapRefSeqV5,116 transMapRefSeqV5,159 transMapRefSeqV5,186 transMapRefSeqV5,204 transMapRefSeqV5,235 transMapRefSeqV5,237 transMapRefSeqV5,255 transMapRefSeqV5,259 transMapRefSeqV5,357 transMapRefSeqV5,371 transMapRefSeqV5,380 transMapRefSeqV5,416 transMapRefSeqV5,492 transMapRefSeqV5,507 transMapRefSeqV5,536 transMapRefSeqV5,600 transMapRefSeqV5,604 transMapRefSeqV5,628 transMapRefSeqV5,771 transMapRnaV5,36 transMapRnaV5,71 transMapRnaV5,99 transMapRnaV5,116 transMapRnaV5,159 transMapRnaV5,186 transMapRnaV5,204 transMapRnaV5,235 transMapRnaV5,237 transMapRnaV5,255 transMapRnaV5,259 transMapRnaV5,357 transMapRnaV5,371 transMapRnaV5,380 transMapRnaV5,416 transMapRnaV5,492 transMapRnaV5,507 transMapRnaV5,536 transMapRnaV5,600 transMapRnaV5,604 transMapRnaV5,628 transMapRnaV5,771 transMapV5,35 transMapV5,62 transMapV5,96 transMapV5,98 transMapV5,151 transMapV5,177 transMapV5,205 transMapV5,222 transMapV5,265 transMapV5,292 transMapV5,310 transMapV5,341 transMapV5,343 transMapV5,361 transMapV5,365 transMapV5,463 transMapV5,477 transMapV5,486 transMapV5,522 transMapV5,598 transMapV5,613 transMapV5,642 transMapV5,706 transMapV5,710 transMapV5,734 transMapV5,877 ucscToINSDC,45 ucscToRefSeq,39 uniprot,75 uniprot,78 uniprot,401 uniprot,405 uniprot,462 uniprot,497 uniprot,532 uniprot,549 uniprot,697 uniprot,739 uniprot,743 uniprot,770 uniprot,842 uniprot,846 uniprot,861 uniprot,886 uniprot,964 uniprot,997 uniprot,1017 uniprot,1023 uniprot,1057 uniprot,1070 uniprot,1097 uniprot,1119 uniprot,1211 uniprot,1238 uniprot,1320 uniprot,1393 uniprot,1427 uniprot,1627 uniprot,1644 uniprot,1651 uniprot,1661 uniprot,1726 uniprot,1782 uniprot,1786 uniprot,1810 uniprot,1833 uniprot,1840 uniprot,1869 uniprot,1977 uniprot,1982 uniprot,2034 windowmaskerSdust,35 windowmaskerSdust,86 windowmaskerSdust,103 xenoRefGene,20 xenoRefGene,53 xenoRefGene,175 form uniprot,1665 format chainGalGal6,608 chainNetGalGal6,611 chainNetXenTro7,622 chainNetXenTro9,619 chainXenTro7,619 chainXenTro9,616 gap,63 gold,62 netGalGal6,608 netXenTro7,619 netXenTro9,616 refSeqComposite,1172 refSeqComposite,1362 refSeqComposite,1382 refSeqComposite,1408 refSeqComposite,1422 refSeqComposite,1569 refSeqComposite,1583 refSeqComposite,1591 refSeqComposite,1664 transMapEnsemblV5,420 transMapEstV5,389 transMapRefSeqV5,389 transMapRnaV5,389 transMapV5,495 formats refSeqComposite,1181 uniprot,885 uniprot,1865 formula cpgIslandExt,373 cpgIslandExtUnmasked,376 cpgIslandSuper,373 forth chainGalGal6,441 chainNetGalGal6,444 chainNetXenTro7,454 chainNetXenTro9,451 chainXenTro7,451 chainXenTro9,448 netGalGal6,441 netXenTro7,451 netXenTro9,448 found augustusGene,100 gold,138 refSeqComposite,1196 refSeqComposite,1395 refSeqComposite,1680 refSeqComposite,1705 transMapEnsemblV5,643 transMapEstV5,612 transMapRefSeqV5,612 transMapRnaV5,612 transMapV5,718 uniprot,241 uniprot,1128 uniprot,1271 uniprot,1328 uniprot,1557 uniprot,1751 uniprot,1794 four chainGalGal6,509 chainNetGalGal6,512 chainNetXenTro7,522 chainNetXenTro9,519 chainXenTro7,519 chainXenTro9,516 netGalGal6,509 netXenTro7,519 netXenTro9,516 fragments gold,4 nestedRepeats,3 nestedRepeats,19 nestedRepeats,82 nestedRepeats,101 nestedRepeats,127 nestedRepeats,139 nestedRepeats,191 nestedRepeats,205 nestedRepeats,208 free uniprot,1435 frog chainGalGal6,73 chainGalGal6,100 chainGalGal6,158 chainGalGal6,205 chainGalGal6,272 chainGalGal6,280 chainGalGal6,580 chainGalGal6,633 chainNetGalGal6,76 chainNetGalGal6,103 chainNetGalGal6,161 chainNetGalGal6,208 chainNetGalGal6,275 chainNetGalGal6,283 chainNetGalGal6,583 chainNetGalGal6,636 chainNetXenTro7,81 chainNetXenTro7,109 chainNetXenTro7,168 chainNetXenTro7,215 chainNetXenTro7,283 chainNetXenTro7,291 chainNetXenTro7,594 chainNetXenTro7,648 chainNetXenTro9,79 chainNetXenTro9,107 chainNetXenTro9,166 chainNetXenTro9,213 chainNetXenTro9,281 chainNetXenTro9,289 chainNetXenTro9,591 chainNetXenTro9,645 chainXenTro7,78 chainXenTro7,106 chainXenTro7,165 chainXenTro7,212 chainXenTro7,280 chainXenTro7,288 chainXenTro7,591 chainXenTro7,645 chainXenTro9,76 chainXenTro9,104 chainXenTro9,163 chainXenTro9,210 chainXenTro9,278 chainXenTro9,286 chainXenTro9,588 chainXenTro9,642 gap,18 gold,20 netGalGal6,73 netGalGal6,100 netGalGal6,158 netGalGal6,205 netGalGal6,272 netGalGal6,280 netGalGal6,580 netGalGal6,633 netXenTro7,78 netXenTro7,106 netXenTro7,165 netXenTro7,212 netXenTro7,280 netXenTro7,288 netXenTro7,591 netXenTro7,645 netXenTro9,76 netXenTro9,104 netXenTro9,163 netXenTro9,210 netXenTro9,278 netXenTro9,286 netXenTro9,588 netXenTro9,642 refSeqComposite,20 refSeqComposite,443 refSeqComposite,465 refSeqComposite,499 refSeqComposite,1235 transMapEnsemblV5,91 transMapEnsemblV5,204 transMapEnsemblV5,335 transMapEstV5,60 transMapEstV5,173 transMapEstV5,304 transMapRefSeqV5,60 transMapRefSeqV5,173 transMapRefSeqV5,304 transMapRnaV5,60 transMapRnaV5,173 transMapRnaV5,304 transMapV5,61 transMapV5,279 transMapV5,410 xenoRefGene,4 xenoRefGene,25 xenoRefGene,225 from augustusGene,19 chainGalGal6,176 chainGalGal6,304 chainGalGal6,561 chainGalGal6,584 chainGalGal6,766 chainGalGal6,939 chainGalGal6,971 chainNetGalGal6,179 chainNetGalGal6,307 chainNetGalGal6,564 chainNetGalGal6,587 chainNetGalGal6,769 chainNetGalGal6,942 chainNetGalGal6,974 chainNetXenTro7,186 chainNetXenTro7,316 chainNetXenTro7,574 chainNetXenTro7,598 chainNetXenTro7,781 chainNetXenTro7,954 chainNetXenTro7,986 chainNetXenTro9,184 chainNetXenTro9,314 chainNetXenTro9,571 chainNetXenTro9,595 chainNetXenTro9,778 chainNetXenTro9,951 chainNetXenTro9,983 chainXenTro7,183 chainXenTro7,313 chainXenTro7,571 chainXenTro7,595 chainXenTro7,778 chainXenTro7,951 chainXenTro7,983 chainXenTro9,181 chainXenTro9,311 chainXenTro9,568 chainXenTro9,592 chainXenTro9,775 chainXenTro9,948 chainXenTro9,980 cpgIslandExt,81 cpgIslandExt,496 cpgIslandExt,535 cpgIslandExt,563 cpgIslandExt,574 cpgIslandExtUnmasked,84 cpgIslandExtUnmasked,499 cpgIslandExtUnmasked,538 cpgIslandExtUnmasked,566 cpgIslandExtUnmasked,577 cpgIslandSuper,81 cpgIslandSuper,496 cpgIslandSuper,535 cpgIslandSuper,563 cpgIslandSuper,574 gap,48 genscan,15 gold,3 gold,47 nestedRepeats,24 nestedRepeats,50 nestedRepeats,72 netGalGal6,176 netGalGal6,304 netGalGal6,561 netGalGal6,584 netGalGal6,766 netGalGal6,939 netGalGal6,971 netXenTro7,183 netXenTro7,313 netXenTro7,571 netXenTro7,595 netXenTro7,778 netXenTro7,951 netXenTro7,983 netXenTro9,181 netXenTro9,311 netXenTro9,568 netXenTro9,592 netXenTro9,775 netXenTro9,948 netXenTro9,980 refSeqComposite,5 refSeqComposite,26 refSeqComposite,289 refSeqComposite,295 refSeqComposite,423 refSeqComposite,485 refSeqComposite,843 refSeqComposite,1103 refSeqComposite,1158 refSeqComposite,1167 refSeqComposite,1332 refSeqComposite,1487 refSeqComposite,1515 refSeqComposite,1528 refSeqComposite,1576 refSeqComposite,1597 refSeqComposite,1611 refSeqComposite,1718 rmsk,86 transMapEnsemblV5,29 transMapEnsemblV5,158 transMapEnsemblV5,558 transMapEnsemblV5,621 transMapEnsemblV5,686 transMapEstV5,27 transMapEstV5,127 transMapEstV5,527 transMapEstV5,590 transMapEstV5,655 transMapRefSeqV5,27 transMapRefSeqV5,127 transMapRefSeqV5,527 transMapRefSeqV5,590 transMapRefSeqV5,655 transMapRnaV5,27 transMapRnaV5,127 transMapRnaV5,527 transMapRnaV5,590 transMapRnaV5,655 transMapV5,26 transMapV5,112 transMapV5,233 transMapV5,633 transMapV5,696 transMapV5,761 ucscToINSDC,25 ucscToINSDC,37 ucscToRefSeq,20 ucscToRefSeq,31 uniprot,21 uniprot,36 uniprot,115 uniprot,198 uniprot,250 uniprot,557 uniprot,747 uniprot,831 uniprot,890 uniprot,915 uniprot,1507 uniprot,1696 uniprot,1742 uniprot,1772 uniprot,1844 uniprot,1953 uniprot,1962 windowmaskerSdust,41 xenoRefGene,27 xenoRefGene,167 xenoRefGene,287 frommer cpgIslandExt,606 cpgIslandExtUnmasked,609 cpgIslandSuper,606 ftp windowmaskerSdust,44 full chainGalGal6,239 chainGalGal6,385 chainNetGalGal6,242 chainNetGalGal6,388 chainNetXenTro7,249 chainNetXenTro7,398 chainNetXenTro9,247 chainNetXenTro9,395 chainXenTro7,246 chainXenTro7,395 chainXenTro9,244 chainXenTro9,392 nestedRepeats,118 netGalGal6,239 netGalGal6,385 netXenTro7,246 netXenTro7,395 netXenTro9,244 netXenTro9,392 rmsk,140 transMapEnsemblV5,52 transMapEnsemblV5,280 transMapEstV5,249 transMapRefSeqV5,249 transMapRnaV5,249 transMapV5,355 uniprot,486 uniprot,528 uniprot,540 full-length refSeqComposite,266 furthermore augustusGene,64 future rmsk,272 g cpgIslandExt,51 cpgIslandExt,392 cpgIslandExt,597 cpgIslandExtUnmasked,54 cpgIslandExtUnmasked,395 cpgIslandExtUnmasked,600 cpgIslandSuper,51 cpgIslandSuper,392 cpgIslandSuper,597 gc5BaseBw,20 microsat,115 refSeqComposite,904 refSeqComposite,956 refSeqComposite,1080 simpleRepeat,75 g-25-100100-90 chainGalGal6,678 chainNetGalGal6,681 netGalGal6,678 g-31-125100-114 chainNetXenTro7,693 chainNetXenTro9,690 chainXenTro7,690 chainXenTro9,687 netXenTro7,690 netXenTro9,687 galgal6 chainGalGal6,7 chainGalGal6,69 chainGalGal6,309 chainNetGalGal6,8 chainNetGalGal6,72 chainNetGalGal6,312 chainNetGalGal6Viewchain,6 chainNetGalGal6Viewnet,6 netGalGal6,7 netGalGal6,69 netGalGal6,309 gambiae augustusGene,219 gap chainGalGal6,77 chainGalGal6,87 chainGalGal6,188 chainGalGal6,478 chainGalGal6,490 chainGalGal6,513 chainGalGal6,531 chainGalGal6,546 chainGalGal6,563 chainGalGal6,702 chainGalGal6,833 chainNetGalGal6,80 chainNetGalGal6,90 chainNetGalGal6,191 chainNetGalGal6,481 chainNetGalGal6,493 chainNetGalGal6,516 chainNetGalGal6,534 chainNetGalGal6,549 chainNetGalGal6,566 chainNetGalGal6,705 chainNetGalGal6,836 chainNetXenTro7,85 chainNetXenTro7,95 chainNetXenTro7,198 chainNetXenTro7,491 chainNetXenTro7,503 chainNetXenTro7,526 chainNetXenTro7,544 chainNetXenTro7,559 chainNetXenTro7,576 chainNetXenTro7,717 chainNetXenTro7,848 chainNetXenTro9,83 chainNetXenTro9,93 chainNetXenTro9,196 chainNetXenTro9,488 chainNetXenTro9,500 chainNetXenTro9,523 chainNetXenTro9,541 chainNetXenTro9,556 chainNetXenTro9,573 chainNetXenTro9,714 chainNetXenTro9,845 chainXenTro7,82 chainXenTro7,92 chainXenTro7,195 chainXenTro7,488 chainXenTro7,500 chainXenTro7,523 chainXenTro7,541 chainXenTro7,556 chainXenTro7,573 chainXenTro7,714 chainXenTro7,845 chainXenTro9,80 chainXenTro9,90 chainXenTro9,193 chainXenTro9,485 chainXenTro9,497 chainXenTro9,520 chainXenTro9,538 chainXenTro9,553 chainXenTro9,570 chainXenTro9,711 chainXenTro9,842 gap,1 gap,2 gap,91 gap,102 gap,115 netGalGal6,77 netGalGal6,87 netGalGal6,188 netGalGal6,478 netGalGal6,490 netGalGal6,513 netGalGal6,531 netGalGal6,546 netGalGal6,563 netGalGal6,702 netGalGal6,833 netXenTro7,82 netXenTro7,92 netXenTro7,195 netXenTro7,488 netXenTro7,500 netXenTro7,523 netXenTro7,541 netXenTro7,556 netXenTro7,573 netXenTro7,714 netXenTro7,845 netXenTro9,80 netXenTro9,90 netXenTro9,193 netXenTro9,485 netXenTro9,497 netXenTro9,520 netXenTro9,538 netXenTro9,553 netXenTro9,570 netXenTro9,711 netXenTro9,842 refSeqComposite,930 refSeqComposite,963 refSeqComposite,1019 refSeqComposite,1021 transMapEnsemblV5,142 transMapEstV5,111 transMapRefSeqV5,111 transMapRnaV5,111 transMapV5,217 gapless chainGalGal6,645 chainNetGalGal6,648 chainNetXenTro7,660 chainNetXenTro9,657 chainXenTro7,657 chainXenTro9,654 netGalGal6,645 netXenTro7,657 netXenTro9,654 gaps chainGalGal6,83 chainGalGal6,94 chainGalGal6,106 chainGalGal6,140 chainGalGal6,165 chainGalGal6,211 chainGalGal6,222 chainGalGal6,405 chainGalGal6,427 chainGalGal6,454 chainGalGal6,888 chainGalGal6,894 chainNetGalGal6,86 chainNetGalGal6,97 chainNetGalGal6,109 chainNetGalGal6,143 chainNetGalGal6,168 chainNetGalGal6,214 chainNetGalGal6,225 chainNetGalGal6,408 chainNetGalGal6,430 chainNetGalGal6,457 chainNetGalGal6,891 chainNetGalGal6,897 chainNetXenTro7,91 chainNetXenTro7,102 chainNetXenTro7,115 chainNetXenTro7,149 chainNetXenTro7,175 chainNetXenTro7,221 chainNetXenTro7,232 chainNetXenTro7,418 chainNetXenTro7,440 chainNetXenTro7,467 chainNetXenTro7,903 chainNetXenTro7,909 chainNetXenTro9,89 chainNetXenTro9,100 chainNetXenTro9,113 chainNetXenTro9,147 chainNetXenTro9,173 chainNetXenTro9,219 chainNetXenTro9,230 chainNetXenTro9,415 chainNetXenTro9,437 chainNetXenTro9,464 chainNetXenTro9,900 chainNetXenTro9,906 chainXenTro7,88 chainXenTro7,99 chainXenTro7,112 chainXenTro7,146 chainXenTro7,172 chainXenTro7,218 chainXenTro7,229 chainXenTro7,415 chainXenTro7,437 chainXenTro7,464 chainXenTro7,900 chainXenTro7,906 chainXenTro9,86 chainXenTro9,97 chainXenTro9,110 chainXenTro9,144 chainXenTro9,170 chainXenTro9,216 chainXenTro9,227 chainXenTro9,412 chainXenTro9,434 chainXenTro9,461 chainXenTro9,897 chainXenTro9,903 gap,12 gap,43 gap,68 gap,124 gap,126 gold,96 netGalGal6,83 netGalGal6,94 netGalGal6,106 netGalGal6,140 netGalGal6,165 netGalGal6,211 netGalGal6,222 netGalGal6,405 netGalGal6,427 netGalGal6,454 netGalGal6,888 netGalGal6,894 netXenTro7,88 netXenTro7,99 netXenTro7,112 netXenTro7,146 netXenTro7,172 netXenTro7,218 netXenTro7,229 netXenTro7,415 netXenTro7,437 netXenTro7,464 netXenTro7,900 netXenTro7,906 netXenTro9,86 netXenTro9,97 netXenTro9,110 netXenTro9,144 netXenTro9,170 netXenTro9,216 netXenTro9,227 netXenTro9,412 netXenTro9,434 netXenTro9,461 netXenTro9,897 netXenTro9,903 refSeqComposite,933 refSeqComposite,1024 gardiner-garden cpgIslandExt,376 cpgIslandExt,604 cpgIslandExtUnmasked,379 cpgIslandExtUnmasked,607 cpgIslandSuper,376 cpgIslandSuper,604 gary microsat,111 simpleRepeat,71 gasteiger uniprot,2020 gattiker uniprot,2016 gbdb refSeqComposite,1553 transMapEnsemblV5,664 transMapEstV5,633 transMapRefSeqV5,633 transMapRnaV5,633 transMapV5,739 uniprot,1815 gc cpgIslandExt,262 cpgIslandExtUnmasked,265 cpgIslandSuper,262 gc5BaseBw,1 gc5BaseBw,3 gc5BaseBw,13 gc5BaseBw,30 genbank transMapEnsemblV5,172 transMapEnsemblV5,175 transMapEstV5,16 transMapEstV5,141 transMapEstV5,144 transMapRefSeqV5,141 transMapRefSeqV5,144 transMapRnaV5,4 transMapRnaV5,17 transMapRnaV5,141 transMapRnaV5,144 transMapV5,247 transMapV5,250 uniprot,376 gencode transMapEnsemblV5,6 transMapEnsemblV5,18 transMapEnsemblV5,38 transMapEnsemblV5,710 transMapEstV5,679 transMapRefSeqV5,679 transMapRnaV5,679 transMapV5,785 uniprot,730 gene augustusGene,5 augustusGene,10 augustusGene,40 augustusGene,112 augustusGene,157 augustusGene,163 augustusGene,305 augustusGene,320 cpgIslandExt,145 cpgIslandExtUnmasked,148 cpgIslandSuper,145 genscan,4 genscan,8 genscan,55 genscan,72 genscan,111 genscan,117 genscan,214 ncbiRefSeq,17 ncbiRefSeqGenomicDiff,14 ncbiRefSeqOther,17 ncbiRefSeqPredicted,13 ncbiRefSeqPsl,9 refSeqComposite,9 refSeqComposite,109 refSeqComposite,135 refSeqComposite,411 refSeqComposite,544 refSeqComposite,562 refSeqComposite,603 refSeqComposite,771 refSeqComposite,789 refSeqComposite,801 refSeqComposite,832 refSeqComposite,861 transMapEnsemblV5,12 transMapEnsemblV5,53 transMapEnsemblV5,59 transMapEnsemblV5,393 transMapEnsemblV5,776 transMapEstV5,10 transMapEstV5,362 transMapEstV5,745 transMapRefSeqV5,5 transMapRefSeqV5,11 transMapRefSeqV5,18 transMapRefSeqV5,362 transMapRefSeqV5,745 transMapRnaV5,11 transMapRnaV5,362 transMapRnaV5,745 transMapV5,9 transMapV5,17 transMapV5,468 transMapV5,851 unipAliSwissprot,20 unipAliTrembl,12 unipChain,10 unipConflict,8 unipDisulfBond,8 unipDomain,6 unipInterest,8 unipLocCytopl,7 unipLocExtra,7 unipLocSignal,8 unipLocTransMemb,7 unipModif,9 unipMut,8 unipOther,8 unipRepeat,6 unipStruct,10 uniprot,9 uniprot,732 uniprot,1025 uniprot,1050 uniprot,1059 uniprot,1080 uniprot,1281 uniprot,1394 xenoRefGene,9 xenoRefGene,54 xenoRefGene,108 xenoRefGene,123 xenoRefGene,128 xenoRefGene,156 xenoRefGene,185 gene-rich gc5BaseBw,36 genedx uniprot,1973 genepred refSeqComposite,1177 refSeqComposite,1407 refSeqComposite,1582 genepredtogtf refSeqComposite,1594 refSeqComposite,1617 refSeqComposite,1624 generally rmsk,72 uniprot,248 generate nestedRepeats,261 nestedRepeats,320 rmsk,343 generated cpgIslandExt,588 cpgIslandExtUnmasked,591 cpgIslandSuper,588 nestedRepeats,282 refSeqComposite,484 refSeqComposite,1203 refSeqComposite,1720 rmsk,289 xenoRefGene,291 generating augustusGene,189 genes augustusGene,8 augustusGene,44 cpgIslandExt,20 cpgIslandExt,23 cpgIslandExtUnmasked,23 cpgIslandExtUnmasked,26 cpgIslandSuper,20 cpgIslandSuper,23 genscan,2 genscan,6 genscan,59 ncbiRefSeq,5 ncbiRefSeq,15 ncbiRefSeqGenomicDiff,12 ncbiRefSeqOther,15 ncbiRefSeqPredicted,5 ncbiRefSeqPredicted,11 ncbiRefSeqPsl,7 refSeqComposite,4 refSeqComposite,7 refSeqComposite,15 refSeqComposite,24 refSeqComposite,139 refSeqComposite,238 refSeqComposite,432 refSeqComposite,510 refSeqComposite,1215 refSeqComposite,1226 simpleRepeat,41 transMapEnsemblV5,10 transMapEnsemblV5,88 transMapEnsemblV5,171 transMapEnsemblV5,185 transMapEnsemblV5,292 transMapEnsemblV5,806 transMapEstV5,8 transMapEstV5,57 transMapEstV5,140 transMapEstV5,154 transMapEstV5,261 transMapEstV5,775 transMapRefSeqV5,9 transMapRefSeqV5,57 transMapRefSeqV5,140 transMapRefSeqV5,154 transMapRefSeqV5,261 transMapRefSeqV5,775 transMapRnaV5,9 transMapRnaV5,57 transMapRnaV5,140 transMapRnaV5,154 transMapRnaV5,261 transMapRnaV5,775 transMapV5,7 transMapV5,58 transMapV5,73 transMapV5,246 transMapV5,260 transMapV5,367 transMapV5,881 unipAliSwissprot,18 unipAliTrembl,10 unipChain,8 unipConflict,6 unipDisulfBond,6 unipDomain,4 unipInterest,6 unipLocCytopl,5 unipLocExtra,5 unipLocSignal,6 unipLocTransMemb,5 unipModif,7 unipMut,6 unipOther,6 unipRepeat,4 unipStruct,8 uniprot,7 uniprot,1300 xenoRefGene,6 xenoRefGene,7 xenoRefGene,19 xenoRefGene,194 xenoRefGene,202 xenoRefGene,213 genet nestedRepeats,354 nestedRepeats,386 nestedRepeats,408 rmsk,377 rmsk,409 rmsk,431 genetic nestedRepeats,52 rmsk,88 genome augustusGene,31 chainGalGal6,19 chainGalGal6,74 chainGalGal6,206 chainGalGal6,281 chainGalGal6,294 chainGalGal6,787 chainGalGal6,1108 chainNetGalGal6,22 chainNetGalGal6,77 chainNetGalGal6,209 chainNetGalGal6,284 chainNetGalGal6,297 chainNetGalGal6,790 chainNetGalGal6,1111 chainNetXenTro7,25 chainNetXenTro7,82 chainNetXenTro7,216 chainNetXenTro7,292 chainNetXenTro7,305 chainNetXenTro7,802 chainNetXenTro7,1123 chainNetXenTro9,24 chainNetXenTro9,80 chainNetXenTro9,214 chainNetXenTro9,290 chainNetXenTro9,303 chainNetXenTro9,799 chainNetXenTro9,1120 chainXenTro7,22 chainXenTro7,79 chainXenTro7,213 chainXenTro7,289 chainXenTro7,302 chainXenTro7,799 chainXenTro7,1120 chainXenTro9,21 chainXenTro9,77 chainXenTro9,211 chainXenTro9,287 chainXenTro9,300 chainXenTro9,796 chainXenTro9,1117 cpgIslandExt,164 cpgIslandExt,302 cpgIslandExtUnmasked,167 cpgIslandExtUnmasked,305 cpgIslandSuper,164 cpgIslandSuper,302 gap,19 gap,21 gold,21 gold,23 gold,151 ncbiRefSeqGenomicDiff,11 nestedRepeats,405 netGalGal6,19 netGalGal6,74 netGalGal6,206 netGalGal6,281 netGalGal6,294 netGalGal6,787 netGalGal6,1108 netXenTro7,22 netXenTro7,79 netXenTro7,213 netXenTro7,289 netXenTro7,302 netXenTro7,799 netXenTro7,1120 netXenTro9,21 netXenTro9,77 netXenTro9,211 netXenTro9,287 netXenTro9,300 netXenTro9,796 netXenTro9,1117 refSeqComposite,57 refSeqComposite,291 refSeqComposite,299 refSeqComposite,308 refSeqComposite,326 refSeqComposite,370 refSeqComposite,444 refSeqComposite,467 refSeqComposite,500 refSeqComposite,881 refSeqComposite,928 refSeqComposite,978 refSeqComposite,1064 refSeqComposite,1077 refSeqComposite,1111 refSeqComposite,1124 refSeqComposite,1186 refSeqComposite,1236 refSeqComposite,1450 refSeqComposite,1739 rmsk,428 transMapEnsemblV5,36 transMapEnsemblV5,164 transMapEnsemblV5,181 transMapEnsemblV5,206 transMapEnsemblV5,336 transMapEnsemblV5,347 transMapEnsemblV5,408 transMapEnsemblV5,418 transMapEnsemblV5,452 transMapEnsemblV5,475 transMapEnsemblV5,608 transMapEnsemblV5,746 transMapEstV5,34 transMapEstV5,133 transMapEstV5,150 transMapEstV5,175 transMapEstV5,305 transMapEstV5,316 transMapEstV5,377 transMapEstV5,387 transMapEstV5,421 transMapEstV5,444 transMapEstV5,577 transMapEstV5,715 transMapRefSeqV5,34 transMapRefSeqV5,133 transMapRefSeqV5,150 transMapRefSeqV5,175 transMapRefSeqV5,305 transMapRefSeqV5,316 transMapRefSeqV5,377 transMapRefSeqV5,387 transMapRefSeqV5,421 transMapRefSeqV5,444 transMapRefSeqV5,577 transMapRefSeqV5,715 transMapRnaV5,34 transMapRnaV5,133 transMapRnaV5,150 transMapRnaV5,175 transMapRnaV5,305 transMapRnaV5,316 transMapRnaV5,377 transMapRnaV5,387 transMapRnaV5,421 transMapRnaV5,444 transMapRnaV5,577 transMapRnaV5,715 transMapV5,33 transMapV5,85 transMapV5,239 transMapV5,256 transMapV5,281 transMapV5,411 transMapV5,422 transMapV5,483 transMapV5,493 transMapV5,527 transMapV5,550 transMapV5,683 transMapV5,821 ucscToINSDC,18 ucscToRefSeq,13 unipAliSwissprot,9 unipAliTrembl,9 uniprot,88 uniprot,103 uniprot,120 uniprot,203 uniprot,216 uniprot,609 uniprot,642 uniprot,717 uniprot,749 uniprot,803 uniprot,811 uniprot,910 uniprot,1141 uniprot,1377 uniprot,1494 uniprot,1520 uniprot,1543 uniprot,1730 uniprot,1847 uniprot,1858 uniprot,1891 xenoRefGene,226 xenoRefGene,309 genome-wide refSeqComposite,1502 genome.bed uniprot,1935 uniprot,1937 genomes chainGalGal6,25 chainGalGal6,589 chainGalGal6,1070 chainNetGalGal6,28 chainNetGalGal6,592 chainNetGalGal6,1073 chainNetXenTro7,31 chainNetXenTro7,603 chainNetXenTro7,1085 chainNetXenTro9,30 chainNetXenTro9,600 chainNetXenTro9,1082 chainXenTro7,28 chainXenTro7,600 chainXenTro7,1082 chainXenTro9,27 chainXenTro9,597 chainXenTro9,1079 cpgIslandExt,612 cpgIslandExtUnmasked,615 cpgIslandSuper,612 nestedRepeats,369 nestedRepeats,383 netGalGal6,25 netGalGal6,589 netGalGal6,1070 netXenTro7,28 netXenTro7,600 netXenTro7,1082 netXenTro9,27 netXenTro9,597 netXenTro9,1079 refSeqComposite,573 refSeqComposite,1808 rmsk,392 rmsk,406 transMapEnsemblV5,364 transMapEnsemblV5,372 transMapEstV5,333 transMapEstV5,341 transMapRefSeqV5,333 transMapRefSeqV5,341 transMapRnaV5,333 transMapRnaV5,341 transMapV5,439 transMapV5,447 uniprot,863 uniprot,941 windowmaskerSdust,105 xenoRefGene,378 genomic chainGalGal6,497 chainGalGal6,1022 chainGalGal6,1038 chainNetGalGal6,500 chainNetGalGal6,1025 chainNetGalGal6,1041 chainNetXenTro7,510 chainNetXenTro7,1037 chainNetXenTro7,1053 chainNetXenTro9,507 chainNetXenTro9,1034 chainNetXenTro9,1050 chainXenTro7,507 chainXenTro7,1034 chainXenTro7,1050 chainXenTro9,504 chainXenTro9,1031 chainXenTro9,1047 genscan,92 genscan,218 netGalGal6,497 netGalGal6,1022 netGalGal6,1038 netXenTro7,507 netXenTro7,1034 netXenTro7,1050 netXenTro9,504 netXenTro9,1031 netXenTro9,1047 refSeqComposite,840 refSeqComposite,908 refSeqComposite,932 refSeqComposite,1023 refSeqComposite,1081 refSeqComposite,1286 transMapEnsemblV5,128 transMapEstV5,97 transMapRefSeqV5,97 transMapRnaV5,97 transMapV5,203 uniprot,28 uniprot,450 windowmaskerSdust,3 xenoRefGene,164 xenoRefGene,276 genomics chainGalGal6,11 chainNetGalGal6,14 chainNetGalGal6Viewchain,12 chainNetGalGal6Viewnet,12 chainNetXenTro7,17 chainNetXenTro7Viewchain,14 chainNetXenTro7Viewnet,14 chainNetXenTro9,16 chainNetXenTro9Viewchain,13 chainNetXenTro9Viewnet,13 chainXenTro7,14 chainXenTro9,13 netGalGal6,11 netXenTro7,14 netXenTro9,13 transMapEnsemblV5,745 transMapEnsemblV5,800 transMapEstV5,714 transMapEstV5,769 transMapRefSeqV5,714 transMapRefSeqV5,769 transMapRnaV5,714 transMapRnaV5,769 transMapV5,820 transMapV5,875 genscan genscan,1 genscan,3 genscan,17 genscan,136 genscan,177 gertz windowmaskerSdust,92 gff refSeqComposite,1170 giri nestedRepeats,56 nestedRepeats,310 rmsk,92 rmsk,333 github uniprot,1559 give transMapEnsemblV5,440 transMapEstV5,409 transMapRefSeqV5,409 transMapRnaV5,409 transMapV5,515 given refSeqComposite,1542 transMapEnsemblV5,484 transMapEnsemblV5,657 transMapEstV5,453 transMapEstV5,626 transMapRefSeqV5,453 transMapRefSeqV5,626 transMapRnaV5,453 transMapRnaV5,626 transMapV5,559 transMapV5,732 uniprot,741 uniprot,1235 uniprot,1240 uniprot,1808 global transMapEnsemblV5,357 transMapEstV5,326 transMapRefSeqV5,326 transMapRnaV5,326 transMapV5,432 glyco uniprot,469 glycosylation uniprot,341 uniprot,584 gnomon refSeqComposite,375 go genscan,113 refSeqComposite,857 uniprot,1412 xenoRefGene,181 gold gold,91 gold,105 goldenpath uniprot,1907 gr refSeqComposite,1753 xenoRefGene,323 graph gc5BaseBw,59 gc5BaseBw,78 graphical chainGalGal6,444 chainNetGalGal6,447 chainNetXenTro7,457 chainNetXenTro9,454 chainXenTro7,454 chainXenTro9,451 gold,130 netGalGal6,444 netXenTro7,454 netXenTro9,451 rmsk,211 grcg6a chainGalGal6,6 chainGalGal6,68 chainGalGal6,308 chainNetGalGal6,7 chainNetGalGal6,71 chainNetGalGal6,311 chainNetGalGal6Viewchain,5 chainNetGalGal6Viewnet,5 netGalGal6,6 netGalGal6,68 netGalGal6,308 greater cpgIslandExt,267 cpgIslandExt,269 cpgIslandExt,274 cpgIslandExtUnmasked,270 cpgIslandExtUnmasked,272 cpgIslandExtUnmasked,277 cpgIslandSuper,267 cpgIslandSuper,269 cpgIslandSuper,274 green cpgIslandExt,10 cpgIslandExtUnmasked,13 cpgIslandSuper,10 nestedRepeats,328 rmsk,351 uniprot,588 uniprot,593 group augustusGene,198 augustusGene,235 chainGalGal6,637 chainNetGalGal6,640 chainNetXenTro7,652 chainNetXenTro9,649 chainXenTro7,649 chainXenTro9,646 netGalGal6,637 netXenTro7,649 netXenTro9,646 refSeqComposite,388 refSeqComposite,449 uniprot,430 groups augustusGene,194 gs cpgIslandExt,294 cpgIslandExtUnmasked,297 cpgIslandSuper,294 gt cpgIslandExt,422 cpgIslandExt,488 cpgIslandExtUnmasked,425 cpgIslandExtUnmasked,491 cpgIslandSuper,422 cpgIslandSuper,488 uniprot,907 uniprot,909 uniprot,1930 gtf refSeqComposite,1568 refSeqComposite,1578 refSeqComposite,1590 guanine cpgIslandExt,52 cpgIslandExtUnmasked,55 cpgIslandSuper,52 gc5BaseBw,21 h uniprot,2013 had transMapEnsemblV5,195 transMapEstV5,164 transMapRefSeqV5,164 transMapRnaV5,164 transMapV5,270 haeussler uniprot,1945 handful uniprot,1180 haplotype uniprot,852 hard cpgIslandExt,416 cpgIslandExtUnmasked,419 cpgIslandSuper,416 hardison chainGalGal6,941 chainGalGal6,1098 chainNetGalGal6,944 chainNetGalGal6,1101 chainNetXenTro7,956 chainNetXenTro7,1113 chainNetXenTro9,953 chainNetXenTro9,1110 chainXenTro7,953 chainXenTro7,1110 chainXenTro9,950 chainXenTro9,1107 netGalGal6,941 netGalGal6,1098 netXenTro7,953 netXenTro7,1110 netXenTro9,950 netXenTro9,1107 harris chainGalGal6,1015 chainNetGalGal6,1018 chainNetXenTro7,1030 chainNetXenTro9,1027 chainXenTro7,1027 chainXenTro9,1024 netGalGal6,1015 netXenTro7,1027 netXenTro9,1024 hart refSeqComposite,1764 xenoRefGene,334 has nestedRepeats,246 refSeqComposite,617 refSeqComposite,638 refSeqComposite,674 refSeqComposite,686 refSeqComposite,699 refSeqComposite,818 transMapV5,146 uniprot,33 uniprot,46 uniprot,154 uniprot,606 uniprot,1195 uniprot,1232 uniprot,1381 xenoRefGene,68 haussler augustusGene,292 chainGalGal6,976 chainGalGal6,1056 chainGalGal6,1100 chainNetGalGal6,979 chainNetGalGal6,1059 chainNetGalGal6,1103 chainNetXenTro7,991 chainNetXenTro7,1071 chainNetXenTro7,1115 chainNetXenTro9,988 chainNetXenTro9,1068 chainNetXenTro9,1112 chainXenTro7,988 chainXenTro7,1068 chainXenTro7,1112 chainXenTro9,985 chainXenTro9,1065 chainXenTro9,1109 netGalGal6,976 netGalGal6,1056 netGalGal6,1100 netXenTro7,988 netXenTro7,1068 netXenTro7,1112 netXenTro9,985 netXenTro9,1065 netXenTro9,1109 transMapEnsemblV5,763 transMapEnsemblV5,797 transMapEstV5,732 transMapEstV5,766 transMapRefSeqV5,732 transMapRefSeqV5,766 transMapRnaV5,732 transMapRnaV5,766 transMapV5,838 transMapV5,872 have chainGalGal6,573 chainNetGalGal6,576 chainNetXenTro7,586 chainNetXenTro9,583 chainXenTro7,583 chainXenTro9,580 nestedRepeats,88 netGalGal6,573 netXenTro7,583 netXenTro9,580 rmsk,69 rmsk,108 uniprot,170 uniprot,302 uniprot,942 uniprot,1000 uniprot,1042 uniprot,1444 having cpgIslandExt,138 cpgIslandExtUnmasked,141 cpgIslandSuper,138 refSeqComposite,1259 refSeqComposite,1268 xenoRefGene,249 xenoRefGene,258 heavily uniprot,1533 helices uniprot,366 help cpgIslandExt,546 cpgIslandExtUnmasked,549 cpgIslandSuper,546 gc5BaseBw,61 refSeqComposite,125 helps cpgIslandExt,74 cpgIslandExtUnmasked,77 cpgIslandSuper,74 here refSeqComposite,994 refSeqComposite,1197 refSeqComposite,1469 refSeqComposite,1491 refSeqComposite,1685 rmsk,127 transMapEnsemblV5,137 transMapEnsemblV5,151 transMapEnsemblV5,644 transMapEstV5,106 transMapEstV5,120 transMapEstV5,613 transMapRefSeqV5,106 transMapRefSeqV5,120 transMapRefSeqV5,613 transMapRnaV5,106 transMapRnaV5,120 transMapRnaV5,613 transMapV5,212 transMapV5,226 transMapV5,719 uniprot,1795 hg.conf refSeqComposite,1640 hg19 refSeqComposite,574 uniprot,847 uniprot,860 hg38 refSeqComposite,518 refSeqComposite,576 uniprot,700 uniprot,843 uniprot,1177 uniprot,1367 uniprot,1909 hgdownload.soe.ucsc.edu cpgIslandExt,576 cpgIslandExtUnmasked,579 cpgIslandSuper,576 refSeqComposite,1552 transMapEnsemblV5,663 transMapEstV5,632 transMapRefSeqV5,632 transMapRnaV5,632 transMapV5,738 uniprot,1814 uniprot,1906 uniprot,1916 hgmd refSeqComposite,550 hgvs refSeqComposite,903 refSeqComposite,916 refSeqComposite,955 refSeqComposite,984 refSeqComposite,1043 refSeqComposite,1070 refSeqComposite,1074 refSeqComposite,1094 hiatt refSeqComposite,1754 xenoRefGene,324 hidden augustusGene,324 uniprot,182 uniprot,223 hide refSeqComposite,175 uniprot,659 uniprot,667 xenoRefGene,192 hierarchy chainGalGal6,824 chainNetGalGal6,827 chainNetXenTro7,839 chainNetXenTro9,836 chainXenTro7,836 chainXenTro9,833 netGalGal6,824 netXenTro7,836 netXenTro9,833 high gc5BaseBw,29 transMapV5,119 higher chainGalGal6,856 chainNetGalGal6,859 chainNetXenTro7,871 chainNetXenTro9,868 chainXenTro7,868 chainXenTro9,865 cpgIslandExt,157 cpgIslandExtUnmasked,160 cpgIslandSuper,157 netGalGal6,856 netXenTro7,868 netXenTro9,865 rmsk,230 transMapV5,147 higher-level chainGalGal6,873 chainNetGalGal6,876 chainNetXenTro7,888 chainNetXenTro9,885 chainXenTro7,885 chainXenTro9,882 netGalGal6,873 netXenTro7,885 netXenTro9,882 higher-scoring chainGalGal6,817 chainGalGal6,836 chainNetGalGal6,820 chainNetGalGal6,839 chainNetXenTro7,832 chainNetXenTro7,851 chainNetXenTro9,829 chainNetXenTro9,848 chainXenTro7,829 chainXenTro7,848 chainXenTro9,826 chainXenTro9,845 netGalGal6,817 netGalGal6,836 netXenTro7,829 netXenTro7,848 netXenTro9,826 netXenTro9,845 highest refSeqComposite,1261 uniprot,948 uniprot,1113 xenoRefGene,251 highest-scoring chainGalGal6,396 chainGalGal6,783 chainNetGalGal6,399 chainNetGalGal6,786 chainNetXenTro7,409 chainNetXenTro7,798 chainNetXenTro9,406 chainNetXenTro9,795 chainXenTro7,406 chainXenTro7,795 chainXenTro9,403 chainXenTro9,792 netGalGal6,396 netGalGal6,783 netXenTro7,406 netXenTro7,795 netXenTro9,403 netXenTro9,792 highlight gc5BaseBw,49 highlighted uniprot,580 highly microsat,40 hillier cpgIslandExt,601 cpgIslandExtUnmasked,604 cpgIslandSuper,601 hinrichs chainGalGal6,1052 chainNetGalGal6,1055 chainNetXenTro7,1067 chainNetXenTro9,1064 chainXenTro7,1064 chainXenTro9,1061 netGalGal6,1052 netXenTro7,1064 netXenTro9,1061 hiram gc5BaseBw,82 ucscToINSDC,51 ucscToRefSeq,45 his chainGalGal6,950 chainNetGalGal6,953 chainNetXenTro7,965 chainNetXenTro9,962 chainXenTro7,962 chainXenTro9,959 netGalGal6,950 netXenTro7,962 netXenTro9,959 honeybee1 augustusGene,217 horizontal nestedRepeats,130 nestedRepeats,150 hou chainGalGal6,929 chainNetGalGal6,932 chainNetXenTro7,944 chainNetXenTro9,941 chainXenTro7,941 chainXenTro9,938 netGalGal6,929 netXenTro7,941 netXenTro9,938 housekeeping cpgIslandExt,22 cpgIslandExtUnmasked,25 cpgIslandSuper,22 how chainGalGal6,884 chainGalGal6,901 chainNetGalGal6,887 chainNetGalGal6,904 chainNetXenTro7,899 chainNetXenTro7,916 chainNetXenTro9,896 chainNetXenTro9,913 chainXenTro7,896 chainXenTro7,913 chainXenTro9,893 chainXenTro9,910 netGalGal6,884 netGalGal6,901 netXenTro7,896 netXenTro7,913 netXenTro9,893 netXenTro9,910 refSeqComposite,97 rmsk,121 however cpgIslandExt,96 cpgIslandExtUnmasked,99 cpgIslandSuper,96 transMapEnsemblV5,488 transMapEstV5,457 transMapRefSeqV5,457 transMapRnaV5,457 transMapV5,563 hox refSeqComposite,415 http cpgIslandExt,575 cpgIslandExtUnmasked,578 cpgIslandSuper,575 nestedRepeats,332 refSeqComposite,1551 rmsk,355 transMapEnsemblV5,662 transMapEstV5,631 transMapRefSeqV5,631 transMapRnaV5,631 transMapV5,737 uniprot,1813 https uniprot,1905 uniprot,1915 hub uniprot,711 uniprot,1672 uniprot,1679 hubley nestedRepeats,308 nestedRepeats,326 rmsk,331 rmsk,349 hum uniprot,2043 human augustusGene,205 augustusGene,210 augustusGene,276 chainGalGal6,1069 chainNetGalGal6,1072 chainNetXenTro7,1084 chainNetXenTro9,1081 chainXenTro7,1081 chainXenTro9,1078 genscan,217 nestedRepeats,404 netGalGal6,1069 netXenTro7,1081 netXenTro9,1078 refSeqComposite,246 refSeqComposite,298 refSeqComposite,561 refSeqComposite,572 refSeqComposite,1076 rmsk,427 transMapEnsemblV5,42 transMapEnsemblV5,365 transMapEnsemblV5,474 transMapEnsemblV5,741 transMapEnsemblV5,809 transMapEstV5,334 transMapEstV5,443 transMapEstV5,710 transMapEstV5,778 transMapRefSeqV5,334 transMapRefSeqV5,443 transMapRefSeqV5,710 transMapRefSeqV5,778 transMapRnaV5,334 transMapRnaV5,443 transMapRnaV5,710 transMapRnaV5,778 transMapV5,105 transMapV5,134 transMapV5,440 transMapV5,549 transMapV5,816 transMapV5,884 uniprot,699 uniprot,940 uniprot,2040 human-mouse chainGalGal6,1104 chainNetGalGal6,1107 chainNetXenTro7,1119 chainNetXenTro9,1116 chainXenTro7,1116 chainXenTro9,1113 netGalGal6,1104 netXenTro7,1116 netXenTro9,1113 icon refSeqComposite,754 id nestedRepeats,10 nestedRepeats,106 refSeqComposite,1133 uniprot,1026 uniprot,1051 uniprot,1060 uniprot,1282 identical uniprot,1106 uniprot,1144 uniprot,1147 identified chainGalGal6,945 chainNetGalGal6,948 chainNetXenTro7,960 chainNetXenTro9,957 chainXenTro7,957 chainXenTro9,954 netGalGal6,945 netXenTro7,957 netXenTro9,954 refSeqComposite,1265 transMapEnsemblV5,515 transMapEstV5,484 transMapRefSeqV5,484 transMapRnaV5,484 transMapV5,590 xenoRefGene,255 identifier refSeqComposite,785 refSeqComposite,804 transMapEnsemblV5,486 transMapEstV5,455 transMapRefSeqV5,455 transMapRnaV5,455 transMapV5,561 identifiers transMapEnsemblV5,387 transMapEnsemblV5,446 transMapEnsemblV5,464 transMapEstV5,356 transMapEstV5,415 transMapEstV5,433 transMapRefSeqV5,356 transMapRefSeqV5,415 transMapRefSeqV5,433 transMapRnaV5,356 transMapRnaV5,415 transMapRnaV5,433 transMapV5,462 transMapV5,521 transMapV5,539 ucscToRefSeq,19 identifying cpgIslandExt,249 cpgIslandExtUnmasked,252 cpgIslandSuper,249 identity microsat,71 nestedRepeats,187 nestedRepeats,222 refSeqComposite,1263 refSeqComposite,1271 refSeqComposite,1283 xenoRefGene,253 xenoRefGene,261 xenoRefGene,273 ideogram cytoBandIdeo,3 cytoBandIdeo,4 ids uniprot,1292 if gap,77 nestedRepeats,137 transMapEnsemblV5,246 transMapEstV5,215 transMapRefSeqV5,215 transMapRnaV5,215 transMapV5,321 uniprot,602 uniprot,688 uniprot,1030 uniprot,1077 uniprot,1230 uniprot,1261 uniprot,1323 uniprot,1442 xenoRefGene,205 ignored refSeqComposite,1456 uniprot,1426 ii215-25 augustusGene,338 immediately cpgIslandExt,48 cpgIslandExtUnmasked,51 cpgIslandSuper,48 imperfect simpleRepeat,19 important uniprot,900 improve augustusGene,302 transMapEnsemblV5,773 transMapEstV5,742 transMapRefSeqV5,742 transMapRnaV5,742 transMapV5,848 improved chainGalGal6,1018 chainNetGalGal6,1021 chainNetXenTro7,1033 chainNetXenTro9,1030 chainXenTro7,1030 chainXenTro9,1027 netGalGal6,1018 netXenTro7,1030 netXenTro9,1027 in augustusGene,101 chainGalGal6,31 chainGalGal6,95 chainGalGal6,116 chainGalGal6,148 chainGalGal6,155 chainGalGal6,170 chainGalGal6,189 chainGalGal6,192 chainGalGal6,232 chainGalGal6,253 chainGalGal6,300 chainGalGal6,333 chainGalGal6,363 chainGalGal6,375 chainGalGal6,384 chainGalGal6,402 chainGalGal6,407 chainGalGal6,416 chainGalGal6,428 chainGalGal6,442 chainGalGal6,484 chainGalGal6,501 chainGalGal6,532 chainGalGal6,550 chainGalGal6,564 chainGalGal6,600 chainGalGal6,697 chainGalGal6,785 chainGalGal6,826 chainGalGal6,834 chainGalGal6,850 chainGalGal6,883 chainGalGal6,895 chainGalGal6,1065 chainNetGalGal6,34 chainNetGalGal6,98 chainNetGalGal6,119 chainNetGalGal6,151 chainNetGalGal6,158 chainNetGalGal6,173 chainNetGalGal6,192 chainNetGalGal6,195 chainNetGalGal6,235 chainNetGalGal6,256 chainNetGalGal6,303 chainNetGalGal6,336 chainNetGalGal6,366 chainNetGalGal6,378 chainNetGalGal6,387 chainNetGalGal6,405 chainNetGalGal6,410 chainNetGalGal6,419 chainNetGalGal6,431 chainNetGalGal6,445 chainNetGalGal6,487 chainNetGalGal6,504 chainNetGalGal6,535 chainNetGalGal6,553 chainNetGalGal6,567 chainNetGalGal6,603 chainNetGalGal6,700 chainNetGalGal6,788 chainNetGalGal6,829 chainNetGalGal6,837 chainNetGalGal6,853 chainNetGalGal6,886 chainNetGalGal6,898 chainNetGalGal6,1068 chainNetXenTro7,37 chainNetXenTro7,103 chainNetXenTro7,125 chainNetXenTro7,157 chainNetXenTro7,165 chainNetXenTro7,180 chainNetXenTro7,199 chainNetXenTro7,202 chainNetXenTro7,242 chainNetXenTro7,263 chainNetXenTro7,312 chainNetXenTro7,346 chainNetXenTro7,376 chainNetXenTro7,388 chainNetXenTro7,397 chainNetXenTro7,415 chainNetXenTro7,420 chainNetXenTro7,429 chainNetXenTro7,441 chainNetXenTro7,455 chainNetXenTro7,497 chainNetXenTro7,514 chainNetXenTro7,545 chainNetXenTro7,563 chainNetXenTro7,577 chainNetXenTro7,614 chainNetXenTro7,712 chainNetXenTro7,800 chainNetXenTro7,841 chainNetXenTro7,849 chainNetXenTro7,865 chainNetXenTro7,898 chainNetXenTro7,910 chainNetXenTro7,1080 chainNetXenTro9,36 chainNetXenTro9,101 chainNetXenTro9,123 chainNetXenTro9,155 chainNetXenTro9,163 chainNetXenTro9,178 chainNetXenTro9,197 chainNetXenTro9,200 chainNetXenTro9,240 chainNetXenTro9,261 chainNetXenTro9,310 chainNetXenTro9,343 chainNetXenTro9,373 chainNetXenTro9,385 chainNetXenTro9,394 chainNetXenTro9,412 chainNetXenTro9,417 chainNetXenTro9,426 chainNetXenTro9,438 chainNetXenTro9,452 chainNetXenTro9,494 chainNetXenTro9,511 chainNetXenTro9,542 chainNetXenTro9,560 chainNetXenTro9,574 chainNetXenTro9,611 chainNetXenTro9,709 chainNetXenTro9,797 chainNetXenTro9,838 chainNetXenTro9,846 chainNetXenTro9,862 chainNetXenTro9,895 chainNetXenTro9,907 chainNetXenTro9,1077 chainXenTro7,34 chainXenTro7,100 chainXenTro7,122 chainXenTro7,154 chainXenTro7,162 chainXenTro7,177 chainXenTro7,196 chainXenTro7,199 chainXenTro7,239 chainXenTro7,260 chainXenTro7,309 chainXenTro7,343 chainXenTro7,373 chainXenTro7,385 chainXenTro7,394 chainXenTro7,412 chainXenTro7,417 chainXenTro7,426 chainXenTro7,438 chainXenTro7,452 chainXenTro7,494 chainXenTro7,511 chainXenTro7,542 chainXenTro7,560 chainXenTro7,574 chainXenTro7,611 chainXenTro7,709 chainXenTro7,797 chainXenTro7,838 chainXenTro7,846 chainXenTro7,862 chainXenTro7,895 chainXenTro7,907 chainXenTro7,1077 chainXenTro9,33 chainXenTro9,98 chainXenTro9,120 chainXenTro9,152 chainXenTro9,160 chainXenTro9,175 chainXenTro9,194 chainXenTro9,197 chainXenTro9,237 chainXenTro9,258 chainXenTro9,307 chainXenTro9,340 chainXenTro9,370 chainXenTro9,382 chainXenTro9,391 chainXenTro9,409 chainXenTro9,414 chainXenTro9,423 chainXenTro9,435 chainXenTro9,449 chainXenTro9,491 chainXenTro9,508 chainXenTro9,539 chainXenTro9,557 chainXenTro9,571 chainXenTro9,608 chainXenTro9,706 chainXenTro9,794 chainXenTro9,835 chainXenTro9,843 chainXenTro9,859 chainXenTro9,892 chainXenTro9,904 chainXenTro9,1074 cpgIslandExt,24 cpgIslandExt,58 cpgIslandExt,64 cpgIslandExt,87 cpgIslandExt,180 cpgIslandExt,189 cpgIslandExt,214 cpgIslandExt,297 cpgIslandExt,341 cpgIslandExt,375 cpgIslandExt,610 cpgIslandExtUnmasked,27 cpgIslandExtUnmasked,61 cpgIslandExtUnmasked,67 cpgIslandExtUnmasked,90 cpgIslandExtUnmasked,183 cpgIslandExtUnmasked,192 cpgIslandExtUnmasked,217 cpgIslandExtUnmasked,300 cpgIslandExtUnmasked,344 cpgIslandExtUnmasked,378 cpgIslandExtUnmasked,613 cpgIslandSuper,24 cpgIslandSuper,58 cpgIslandSuper,64 cpgIslandSuper,87 cpgIslandSuper,180 cpgIslandSuper,189 cpgIslandSuper,214 cpgIslandSuper,297 cpgIslandSuper,341 cpgIslandSuper,375 cpgIslandSuper,610 gap,13 gap,26 gap,44 gap,74 gap,129 gc5BaseBw,5 gc5BaseBw,26 gc5BaseBw,43 genscan,101 genscan,150 genscan,162 genscan,165 genscan,184 genscan,188 genscan,198 genscan,216 gold,15 gold,28 gold,67 gold,128 gold,139 gold,147 microsat,42 microsat,49 nestedRepeats,61 nestedRepeats,64 nestedRepeats,75 nestedRepeats,115 nestedRepeats,156 nestedRepeats,167 nestedRepeats,241 nestedRepeats,339 nestedRepeats,367 nestedRepeats,381 nestedRepeats,402 netGalGal6,31 netGalGal6,95 netGalGal6,116 netGalGal6,148 netGalGal6,155 netGalGal6,170 netGalGal6,189 netGalGal6,192 netGalGal6,232 netGalGal6,253 netGalGal6,300 netGalGal6,333 netGalGal6,363 netGalGal6,375 netGalGal6,384 netGalGal6,402 netGalGal6,407 netGalGal6,416 netGalGal6,428 netGalGal6,442 netGalGal6,484 netGalGal6,501 netGalGal6,532 netGalGal6,550 netGalGal6,564 netGalGal6,600 netGalGal6,697 netGalGal6,785 netGalGal6,826 netGalGal6,834 netGalGal6,850 netGalGal6,883 netGalGal6,895 netGalGal6,1065 netXenTro7,34 netXenTro7,100 netXenTro7,122 netXenTro7,154 netXenTro7,162 netXenTro7,177 netXenTro7,196 netXenTro7,199 netXenTro7,239 netXenTro7,260 netXenTro7,309 netXenTro7,343 netXenTro7,373 netXenTro7,385 netXenTro7,394 netXenTro7,412 netXenTro7,417 netXenTro7,426 netXenTro7,438 netXenTro7,452 netXenTro7,494 netXenTro7,511 netXenTro7,542 netXenTro7,560 netXenTro7,574 netXenTro7,611 netXenTro7,709 netXenTro7,797 netXenTro7,838 netXenTro7,846 netXenTro7,862 netXenTro7,895 netXenTro7,907 netXenTro7,1077 netXenTro9,33 netXenTro9,98 netXenTro9,120 netXenTro9,152 netXenTro9,160 netXenTro9,175 netXenTro9,194 netXenTro9,197 netXenTro9,237 netXenTro9,258 netXenTro9,307 netXenTro9,340 netXenTro9,370 netXenTro9,382 netXenTro9,391 netXenTro9,409 netXenTro9,414 netXenTro9,423 netXenTro9,435 netXenTro9,449 netXenTro9,491 netXenTro9,508 netXenTro9,539 netXenTro9,557 netXenTro9,571 netXenTro9,608 netXenTro9,706 netXenTro9,794 netXenTro9,835 netXenTro9,843 netXenTro9,859 netXenTro9,892 netXenTro9,904 netXenTro9,1074 refSeqComposite,62 refSeqComposite,278 refSeqComposite,397 refSeqComposite,760 refSeqComposite,992 refSeqComposite,1039 refSeqComposite,1066 refSeqComposite,1143 refSeqComposite,1169 refSeqComposite,1184 refSeqComposite,1254 refSeqComposite,1301 refSeqComposite,1345 refSeqComposite,1360 refSeqComposite,1369 refSeqComposite,1379 refSeqComposite,1389 refSeqComposite,1448 refSeqComposite,1457 refSeqComposite,1472 refSeqComposite,1480 refSeqComposite,1540 refSeqComposite,1625 refSeqComposite,1662 refSeqComposite,1668 rmsk,45 rmsk,63 rmsk,97 rmsk,100 rmsk,128 rmsk,139 rmsk,209 rmsk,270 rmsk,317 rmsk,362 rmsk,390 rmsk,404 rmsk,425 transMapEnsemblV5,33 transMapEnsemblV5,82 transMapEnsemblV5,89 transMapEnsemblV5,161 transMapEnsemblV5,338 transMapEnsemblV5,362 transMapEnsemblV5,370 transMapEnsemblV5,405 transMapEnsemblV5,415 transMapEnsemblV5,449 transMapEnsemblV5,495 transMapEnsemblV5,545 transMapEnsemblV5,587 transMapEstV5,31 transMapEstV5,51 transMapEstV5,58 transMapEstV5,130 transMapEstV5,307 transMapEstV5,331 transMapEstV5,339 transMapEstV5,374 transMapEstV5,384 transMapEstV5,418 transMapEstV5,464 transMapEstV5,514 transMapEstV5,556 transMapRefSeqV5,31 transMapRefSeqV5,51 transMapRefSeqV5,58 transMapRefSeqV5,130 transMapRefSeqV5,307 transMapRefSeqV5,331 transMapRefSeqV5,339 transMapRefSeqV5,374 transMapRefSeqV5,384 transMapRefSeqV5,418 transMapRefSeqV5,464 transMapRefSeqV5,514 transMapRefSeqV5,556 transMapRnaV5,31 transMapRnaV5,51 transMapRnaV5,58 transMapRnaV5,130 transMapRnaV5,307 transMapRnaV5,331 transMapRnaV5,339 transMapRnaV5,374 transMapRnaV5,384 transMapRnaV5,418 transMapRnaV5,464 transMapRnaV5,514 transMapRnaV5,556 transMapV5,30 transMapV5,52 transMapV5,59 transMapV5,77 transMapV5,236 transMapV5,413 transMapV5,437 transMapV5,445 transMapV5,480 transMapV5,490 transMapV5,524 transMapV5,570 transMapV5,620 transMapV5,662 uniprot,67 uniprot,148 uniprot,161 uniprot,177 uniprot,242 uniprot,291 uniprot,313 uniprot,427 uniprot,505 uniprot,509 uniprot,570 uniprot,581 uniprot,586 uniprot,591 uniprot,737 uniprot,755 uniprot,854 uniprot,870 uniprot,882 uniprot,1066 uniprot,1132 uniprot,1151 uniprot,1171 uniprot,1190 uniprot,1199 uniprot,1252 uniprot,1258 uniprot,1272 uniprot,1466 uniprot,1637 uniprot,1663 uniprot,1734 uniprot,1752 uniprot,1849 uniprot,1864 windowmaskerSdust,27 xenoRefGene,244 include refSeqComposite,188 rmsk,159 rmsk,172 included augustusGene,160 cpgIslandExt,306 cpgIslandExtUnmasked,309 cpgIslandSuper,306 windowmaskerSdust,26 includes refSeqComposite,217 refSeqComposite,263 refSeqComposite,347 refSeqComposite,652 rmsk,198 uniprot,1587 including refSeqComposite,799 rmsk,188 uniprot,1700 inclusion refSeqComposite,396 inconsistency refSeqComposite,877 incorporate refSeqComposite,664 incorrect uniprot,1361 indels microsat,74 independently refSeqComposite,294 indexing refSeqComposite,1467 indicate chainGalGal6,139 chainGalGal6,247 chainNetGalGal6,142 chainNetGalGal6,250 chainNetXenTro7,148 chainNetXenTro7,257 chainNetXenTro9,146 chainNetXenTro9,255 chainXenTro7,145 chainXenTro7,254 chainXenTro9,143 chainXenTro9,252 nestedRepeats,153 netGalGal6,139 netGalGal6,247 netXenTro7,145 netXenTro7,254 netXenTro9,143 netXenTro9,252 indicates refSeqComposite,609 xenoRefGene,60 individual chainGalGal6,244 chainGalGal6,499 chainNetGalGal6,247 chainNetGalGal6,502 chainNetXenTro7,254 chainNetXenTro7,512 chainNetXenTro9,252 chainNetXenTro9,509 chainXenTro7,251 chainXenTro7,509 chainXenTro9,249 chainXenTro9,506 netGalGal6,244 netGalGal6,499 netXenTro7,251 netXenTro7,509 netXenTro9,249 netXenTro9,506 refSeqComposite,680 refSeqComposite,705 refSeqComposite,749 refSeqComposite,1495 transMapEnsemblV5,603 transMapEstV5,572 transMapRefSeqV5,572 transMapRnaV5,572 transMapV5,678 information augustusGene,36 chainGalGal6,462 chainGalGal6,475 chainGalGal6,481 chainGalGal6,851 chainNetGalGal6,465 chainNetGalGal6,478 chainNetGalGal6,484 chainNetGalGal6,854 chainNetXenTro7,475 chainNetXenTro7,488 chainNetXenTro7,494 chainNetXenTro7,866 chainNetXenTro9,472 chainNetXenTro9,485 chainNetXenTro9,491 chainNetXenTro9,863 chainXenTro7,472 chainXenTro7,485 chainXenTro7,491 chainXenTro7,863 chainXenTro9,469 chainXenTro9,482 chainXenTro9,488 chainXenTro9,860 cpgIslandExt,542 cpgIslandExtUnmasked,545 cpgIslandSuper,542 gap,35 gc5BaseBw,55 genscan,51 genscan,126 gold,37 microsat,97 nestedRepeats,53 nestedRepeats,301 netGalGal6,462 netGalGal6,475 netGalGal6,481 netGalGal6,851 netXenTro7,472 netXenTro7,485 netXenTro7,491 netXenTro7,863 netXenTro9,469 netXenTro9,482 netXenTro9,488 netXenTro9,860 refSeqComposite,131 refSeqComposite,669 refSeqComposite,853 refSeqComposite,1188 refSeqComposite,1384 refSeqComposite,1388 rmsk,89 rmsk,324 simpleRepeat,58 transMapEnsemblV5,132 transMapEnsemblV5,149 transMapEnsemblV5,569 transMapEstV5,101 transMapEstV5,118 transMapEstV5,538 transMapRefSeqV5,101 transMapRefSeqV5,118 transMapRefSeqV5,538 transMapRnaV5,101 transMapRnaV5,118 transMapRnaV5,538 transMapV5,207 transMapV5,224 transMapV5,644 uniprot,678 uniprot,1842 uniprot,2038 xenoRefGene,177 initial refSeqComposite,683 initiate rmsk,316 initio augustusGene,4 augustusGene,17 input uniprot,1952 windowmaskerSdust,61 windowmaskerSdust,70 insdc ucscToINSDC,1 ucscToINSDC,4 ucscToINSDC,32 inserted chainGalGal6,575 chainGalGal6,907 chainNetGalGal6,578 chainNetGalGal6,910 chainNetXenTro7,588 chainNetXenTro7,922 chainNetXenTro9,585 chainNetXenTro9,919 chainXenTro7,585 chainXenTro7,919 chainXenTro9,582 chainXenTro9,916 netGalGal6,575 netGalGal6,907 netXenTro7,585 netXenTro7,919 netXenTro9,582 netXenTro9,916 insertion chainGalGal6,154 chainNetGalGal6,157 chainNetXenTro7,164 chainNetXenTro9,162 chainXenTro7,161 chainXenTro9,159 netGalGal6,154 netXenTro7,161 netXenTro9,159 rmsk,223 insertions nestedRepeats,86 nestedRepeats,92 refSeqComposite,949 inside uniprot,560 inspection uniprot,1653 instead refSeqComposite,786 xenoRefGene,120 institute nestedRepeats,55 rmsk,91 instructions transMapEnsemblV5,634 transMapEstV5,603 transMapRefSeqV5,603 transMapRnaV5,603 transMapV5,709 uniprot,1785 integrator cpgIslandExt,526 cpgIslandExtUnmasked,529 cpgIslandSuper,526 refSeqComposite,1317 transMapEnsemblV5,537 transMapEstV5,506 transMapRefSeqV5,506 transMapRnaV5,506 transMapV5,612 uniprot,1725 interactions uniprot,316 interactively cpgIslandExt,515 cpgIslandExtUnmasked,518 cpgIslandSuper,515 refSeqComposite,1308 transMapEnsemblV5,529 transMapEstV5,498 transMapRefSeqV5,498 transMapRnaV5,498 transMapV5,604 uniprot,1717 interest unipInterest,1 unipInterest,5 uniprot,299 intergenic genscan,47 international transMapEnsemblV5,695 transMapEstV5,664 transMapRefSeqV5,664 transMapRnaV5,664 transMapV5,770 ucscToINSDC,5 ucscToINSDC,27 internet nestedRepeats,279 interrupted nestedRepeats,1 nestedRepeats,5 nestedRepeats,21 nestedRepeats,90 nestedRepeats,121 interspersed nestedRepeats,36 nestedRepeats,373 nestedRepeats,400 rmsk,26 rmsk,154 rmsk,162 rmsk,396 rmsk,423 intervals windowmaskerSdust,4 into chainGalGal6,606 chainGalGal6,618 chainGalGal6,635 chainGalGal6,810 chainNetGalGal6,609 chainNetGalGal6,621 chainNetGalGal6,638 chainNetGalGal6,813 chainNetXenTro7,620 chainNetXenTro7,632 chainNetXenTro7,650 chainNetXenTro7,825 chainNetXenTro9,617 chainNetXenTro9,629 chainNetXenTro9,647 chainNetXenTro9,822 chainXenTro7,617 chainXenTro7,629 chainXenTro7,647 chainXenTro7,822 chainXenTro9,614 chainXenTro9,626 chainXenTro9,644 chainXenTro9,819 cpgIslandExt,105 cpgIslandExtUnmasked,108 cpgIslandSuper,105 netGalGal6,606 netGalGal6,618 netGalGal6,635 netGalGal6,810 netXenTro7,617 netXenTro7,629 netXenTro7,647 netXenTro7,822 netXenTro9,614 netXenTro9,626 netXenTro9,644 netXenTro9,819 uniprot,57 windowmaskerSdust,80 intron augustusGene,88 augustusGene,330 introns chainGalGal6,56 chainNetGalGal6,59 chainNetXenTro7,62 chainNetXenTro9,61 chainXenTro7,59 chainXenTro9,58 genscan,45 netGalGal6,56 netXenTro7,59 netXenTro9,58 refSeqComposite,940 refSeqComposite,1031 inv chainGalGal6,537 chainNetGalGal6,540 chainNetXenTro7,550 chainNetXenTro9,547 chainXenTro7,547 chainXenTro9,544 netGalGal6,537 netXenTro7,547 netXenTro9,544 inversions chainGalGal6,112 chainGalGal6,177 chainNetGalGal6,115 chainNetGalGal6,180 chainNetXenTro7,121 chainNetXenTro7,187 chainNetXenTro9,119 chainNetXenTro9,185 chainXenTro7,118 chainXenTro7,184 chainXenTro9,116 chainXenTro9,182 netGalGal6,112 netGalGal6,177 netXenTro7,118 netXenTro7,184 netXenTro9,116 netXenTro9,182 inverted chainGalGal6,869 chainNetGalGal6,872 chainNetXenTro7,884 chainNetXenTro9,881 chainXenTro7,881 chainXenTro9,878 netGalGal6,869 netXenTro7,881 netXenTro9,878 invisible refSeqComposite,1038 refSeqComposite,1065 involve chainGalGal6,167 chainNetGalGal6,170 chainNetXenTro7,177 chainNetXenTro9,175 chainXenTro7,174 chainXenTro9,172 netGalGal6,167 netXenTro7,174 netXenTro9,172 is chainGalGal6,283 chainGalGal6,303 chainGalGal6,482 chainNetGalGal6,286 chainNetGalGal6,306 chainNetGalGal6,485 chainNetXenTro7,294 chainNetXenTro7,315 chainNetXenTro7,495 chainNetXenTro9,292 chainNetXenTro9,313 chainNetXenTro9,492 chainXenTro7,291 chainXenTro7,312 chainXenTro7,492 chainXenTro9,289 chainXenTro9,310 chainXenTro9,489 cpgIslandExt,56 cpgIslandExt,113 cpgIslandExt,121 cpgIslandExt,130 cpgIslandExt,160 cpgIslandExt,203 cpgIslandExt,321 cpgIslandExt,330 cpgIslandExt,335 cpgIslandExt,347 cpgIslandExt,368 cpgIslandExt,404 cpgIslandExt,494 cpgIslandExtUnmasked,59 cpgIslandExtUnmasked,116 cpgIslandExtUnmasked,124 cpgIslandExtUnmasked,133 cpgIslandExtUnmasked,163 cpgIslandExtUnmasked,206 cpgIslandExtUnmasked,324 cpgIslandExtUnmasked,333 cpgIslandExtUnmasked,338 cpgIslandExtUnmasked,350 cpgIslandExtUnmasked,371 cpgIslandExtUnmasked,407 cpgIslandExtUnmasked,497 cpgIslandSuper,56 cpgIslandSuper,113 cpgIslandSuper,121 cpgIslandSuper,130 cpgIslandSuper,160 cpgIslandSuper,203 cpgIslandSuper,321 cpgIslandSuper,330 cpgIslandSuper,335 cpgIslandSuper,347 cpgIslandSuper,368 cpgIslandSuper,404 cpgIslandSuper,494 gap,47 gap,92 gap,99 gap,107 gc5BaseBw,32 gold,46 gold,120 gold,126 microsat,88 nestedRepeats,59 nestedRepeats,123 nestedRepeats,198 nestedRepeats,219 nestedRepeats,337 netGalGal6,283 netGalGal6,303 netGalGal6,482 netXenTro7,291 netXenTro7,312 netXenTro7,492 netXenTro9,289 netXenTro9,310 netXenTro9,489 refSeqComposite,147 refSeqComposite,243 refSeqComposite,317 refSeqComposite,537 refSeqComposite,567 refSeqComposite,578 refSeqComposite,714 refSeqComposite,1059 refSeqComposite,1202 refSeqComposite,1217 refSeqComposite,1434 refSeqComposite,1440 rmsk,95 rmsk,360 simpleRepeat,28 transMapEnsemblV5,39 transMapEnsemblV5,277 transMapEnsemblV5,421 transMapEnsemblV5,425 transMapEnsemblV5,437 transMapEnsemblV5,483 transMapEstV5,246 transMapEstV5,390 transMapEstV5,394 transMapEstV5,406 transMapEstV5,452 transMapRefSeqV5,246 transMapRefSeqV5,390 transMapRefSeqV5,394 transMapRefSeqV5,406 transMapRefSeqV5,452 transMapRnaV5,246 transMapRnaV5,390 transMapRnaV5,394 transMapRnaV5,406 transMapRnaV5,452 transMapV5,352 transMapV5,496 transMapV5,500 transMapV5,512 transMapV5,558 uniprot,159 uniprot,222 uniprot,417 uniprot,626 uniprot,707 uniprot,839 uniprot,911 uniprot,958 uniprot,972 uniprot,1052 uniprot,1081 uniprot,1209 uniprot,1245 uniprot,1256 uniprot,1264 uniprot,1283 uniprot,1334 uniprot,1390 uniprot,1564 uniprot,1578 uniprot,1603 uniprot,1630 uniprot,1732 windowmaskerSdust,25 windowmaskerSdust,39 island cpgIslandExt,343 cpgIslandExtUnmasked,346 cpgIslandSuper,343 islands cpgIslandExt,2 cpgIslandExt,4 cpgIslandExt,5 cpgIslandExt,16 cpgIslandExt,27 cpgIslandExt,148 cpgIslandExt,177 cpgIslandExt,226 cpgIslandExt,320 cpgIslandExt,507 cpgIslandExt,609 cpgIslandExtUnmasked,4 cpgIslandExtUnmasked,8 cpgIslandExtUnmasked,19 cpgIslandExtUnmasked,30 cpgIslandExtUnmasked,151 cpgIslandExtUnmasked,180 cpgIslandExtUnmasked,229 cpgIslandExtUnmasked,323 cpgIslandExtUnmasked,510 cpgIslandExtUnmasked,612 cpgIslandSuper,2 cpgIslandSuper,4 cpgIslandSuper,5 cpgIslandSuper,16 cpgIslandSuper,27 cpgIslandSuper,148 cpgIslandSuper,177 cpgIslandSuper,226 cpgIslandSuper,320 cpgIslandSuper,507 cpgIslandSuper,609 isoform unipAliSwissprot,13 uniprot,157 uniprot,186 uniprot,671 isoforms unipAliSwissprot,17 uniprot,145 uniprot,164 issue refSeqComposite,1786 refSeqComposite,1820 uniprot,2004 xenoRefGene,356 xenoRefGene,390 it chainGalGal6,90 chainGalGal6,282 chainGalGal6,536 chainGalGal6,548 chainNetGalGal6,93 chainNetGalGal6,285 chainNetGalGal6,539 chainNetGalGal6,551 chainNetXenTro7,98 chainNetXenTro7,293 chainNetXenTro7,549 chainNetXenTro7,561 chainNetXenTro9,96 chainNetXenTro9,291 chainNetXenTro9,546 chainNetXenTro9,558 chainXenTro7,95 chainXenTro7,290 chainXenTro7,546 chainXenTro7,558 chainXenTro9,93 chainXenTro9,288 chainXenTro9,543 chainXenTro9,555 gap,98 genscan,143 netGalGal6,90 netGalGal6,282 netGalGal6,536 netGalGal6,548 netXenTro7,95 netXenTro7,290 netXenTro7,546 netXenTro7,558 netXenTro9,93 netXenTro9,288 netXenTro9,543 netXenTro9,555 refSeqComposite,577 refSeqComposite,1304 uniprot,228 uniprot,625 uniprot,1586 item nestedRepeats,197 refSeqComposite,717 xenoRefGene,77 items chainGalGal6,500 chainNetGalGal6,503 chainNetXenTro7,513 chainNetXenTro9,510 chainXenTro7,510 chainXenTro9,507 nestedRepeats,171 nestedRepeats,180 netGalGal6,500 netXenTro7,510 netXenTro9,507 refSeqComposite,767 refSeqComposite,966 refSeqComposite,1667 xenoRefGene,104 its cpgIslandExt,509 cpgIslandExtUnmasked,512 cpgIslandSuper,509 nestedRepeats,204 uniprot,230 uniprot,762 uniprot,1316 uniprot,1348 itself uniprot,715 j cpgIslandExt,613 cpgIslandExtUnmasked,616 cpgIslandSuper,613 genscan,220 nestedRepeats,341 refSeqComposite,1765 rmsk,364 transMapEnsemblV5,788 transMapEstV5,757 transMapRefSeqV5,757 transMapRnaV5,757 transMapV5,863 xenoRefGene,335 jan chainGalGal6,1111 chainNetGalGal6,1114 chainNetXenTro7,1126 chainNetXenTro9,1123 chainXenTro7,1123 chainXenTro9,1120 microsat,129 netGalGal6,1111 netXenTro7,1123 netXenTro9,1120 refSeqComposite,1783 refSeqComposite,1816 simpleRepeat,89 uniprot,2001 windowmaskerSdust,108 xenoRefGene,353 xenoRefGene,386 jgi chainNetXenTro7,9 chainNetXenTro7,75 chainNetXenTro7,320 chainNetXenTro7Viewchain,6 chainNetXenTro7Viewnet,6 chainXenTro7,8 chainXenTro7,72 chainXenTro7,317 netXenTro7,8 netXenTro7,72 netXenTro7,317 jim chainGalGal6,967 chainGalGal6,994 chainGalGal6,1012 chainNetGalGal6,970 chainNetGalGal6,997 chainNetGalGal6,1015 chainNetXenTro7,982 chainNetXenTro7,1009 chainNetXenTro7,1027 chainNetXenTro9,979 chainNetXenTro9,1006 chainNetXenTro9,1024 chainXenTro7,979 chainXenTro7,1006 chainXenTro7,1024 chainXenTro9,976 chainXenTro9,1003 chainXenTro9,1021 netGalGal6,967 netGalGal6,994 netGalGal6,1012 netXenTro7,979 netXenTro7,1006 netXenTro7,1024 netXenTro9,976 netXenTro9,1003 netXenTro9,1021 joined chainGalGal6,124 chainNetGalGal6,127 chainNetXenTro7,133 chainNetXenTro9,131 chainXenTro7,130 chainXenTro9,128 nestedRepeats,7 nestedRepeats,18 nestedRepeats,103 nestedRepeats,128 netGalGal6,124 netXenTro7,130 netXenTro9,128 journal nestedRepeats,349 rmsk,372 json refSeqComposite,1361 refSeqComposite,1365 jul chainNetXenTro9,7 chainNetXenTro9,72 chainNetXenTro9,316 chainNetXenTro9Viewchain,4 chainNetXenTro9Viewnet,4 chainXenTro9,6 chainXenTro9,69 chainXenTro9,313 cpgIslandExt,617 cpgIslandExtUnmasked,620 cpgIslandSuper,617 netXenTro9,6 netXenTro9,69 netXenTro9,313 jurka nestedRepeats,62 nestedRepeats,340 rmsk,98 rmsk,363 jz transMapEnsemblV5,790 transMapEstV5,759 transMapRefSeqV5,759 transMapRnaV5,759 transMapV5,865 k augustusGene,268 k1 cpgIslandExt,484 cpgIslandExtUnmasked,487 cpgIslandSuper,484 k2 cpgIslandExt,486 cpgIslandExtUnmasked,489 cpgIslandSuper,486 karlin genscan,148 genscan,209 kasif genscan,193 kd refSeqComposite,1751 refSeqComposite,1793 xenoRefGene,321 xenoRefGene,363 kd-tree chainGalGal6,641 chainNetGalGal6,644 chainNetXenTro7,656 chainNetXenTro9,653 chainXenTro7,653 chainXenTro9,650 netGalGal6,641 netXenTro7,653 netXenTro9,650 kd-trees chainGalGal6,659 chainNetGalGal6,662 chainNetXenTro7,674 chainNetXenTro9,671 chainXenTro7,671 chainXenTro9,668 netGalGal6,659 netXenTro7,671 netXenTro9,668 keep cpgIslandExt,125 cpgIslandExtUnmasked,128 cpgIslandSuper,125 uniprot,1486 kent chainGalGal6,968 chainGalGal6,995 chainGalGal6,1013 chainGalGal6,1048 chainGalGal6,1090 chainNetGalGal6,971 chainNetGalGal6,998 chainNetGalGal6,1016 chainNetGalGal6,1051 chainNetGalGal6,1093 chainNetXenTro7,983 chainNetXenTro7,1010 chainNetXenTro7,1028 chainNetXenTro7,1063 chainNetXenTro7,1105 chainNetXenTro9,980 chainNetXenTro9,1007 chainNetXenTro9,1025 chainNetXenTro9,1060 chainNetXenTro9,1102 chainXenTro7,980 chainXenTro7,1007 chainXenTro7,1025 chainXenTro7,1060 chainXenTro7,1102 chainXenTro9,977 chainXenTro9,1004 chainXenTro9,1022 chainXenTro9,1057 chainXenTro9,1099 netGalGal6,968 netGalGal6,995 netGalGal6,1013 netGalGal6,1048 netGalGal6,1090 netXenTro7,980 netXenTro7,1007 netXenTro7,1025 netXenTro7,1060 netXenTro7,1102 netXenTro9,977 netXenTro9,1004 netXenTro9,1022 netXenTro9,1057 netXenTro9,1099 refSeqComposite,1732 xenoRefGene,303 kept refSeqComposite,1289 xenoRefGene,279 km refSeqComposite,1769 xenoRefGene,339 known chainGalGal6,918 chainNetGalGal6,921 chainNetXenTro7,933 chainNetXenTro9,930 chainXenTro7,930 chainXenTro9,927 gold,122 netGalGal6,918 netXenTro7,930 netXenTro9,927 refSeqComposite,505 xenoRefGene,15 l cpgIslandExt,600 cpgIslandExtUnmasked,603 cpgIslandSuper,600 transMapEnsemblV5,722 transMapEstV5,691 transMapRefSeqV5,691 transMapRnaV5,691 transMapV5,797 lab augustusGene,252 label genscan,98 refSeqComposite,764 refSeqComposite,776 refSeqComposite,812 xenoRefGene,101 xenoRefGene,113 xenoRefGene,136 labeled nestedRepeats,132 refSeqComposite,769 uniprot,457 xenoRefGene,106 labels nestedRepeats,161 refSeqComposite,718 refSeqComposite,798 xenoRefGene,78 landrum refSeqComposite,1766 xenoRefGene,336 langton transMapEnsemblV5,721 transMapEstV5,690 transMapRefSeqV5,690 transMapRnaV5,690 transMapV5,796 largely chainGalGal6,143 chainNetGalGal6,146 chainNetXenTro7,152 chainNetXenTro9,150 chainXenTro7,149 chainXenTro9,147 netGalGal6,143 netXenTro7,149 netXenTro9,147 largest chainGalGal6,395 chainNetGalGal6,398 chainNetXenTro7,408 chainNetXenTro9,405 chainXenTro7,405 chainXenTro9,402 netGalGal6,395 netXenTro7,405 netXenTro9,402 lastz chainGalGal6,593 chainGalGal6,767 chainGalGal6,916 chainNetGalGal6,596 chainNetGalGal6,770 chainNetGalGal6,919 chainNetXenTro7,607 chainNetXenTro7,782 chainNetXenTro7,931 chainNetXenTro9,604 chainNetXenTro9,779 chainNetXenTro9,928 chainXenTro7,604 chainXenTro7,779 chainXenTro7,928 chainXenTro9,601 chainXenTro9,776 chainXenTro9,925 netGalGal6,593 netGalGal6,767 netGalGal6,916 netXenTro7,604 netXenTro7,779 netXenTro7,928 netXenTro9,601 netXenTro9,776 netXenTro9,925 transMapV5,46 lau transMapEnsemblV5,733 transMapEstV5,702 transMapRefSeqV5,702 transMapRnaV5,702 transMapV5,808 lavtoaxt chainGalGal6,611 chainNetGalGal6,614 chainNetXenTro7,625 chainNetXenTro9,622 chainXenTro7,622 chainXenTro9,619 netGalGal6,611 netXenTro7,622 netXenTro9,619 least microsat,29 microsat,78 refSeqComposite,1280 xenoRefGene,270 lee uniprot,1955 left refSeqComposite,972 length augustusGene,82 cpgIslandExt,268 cpgIslandExt,360 cpgIslandExt,395 cpgIslandExtUnmasked,271 cpgIslandExtUnmasked,363 cpgIslandExtUnmasked,398 cpgIslandSuper,268 cpgIslandSuper,360 cpgIslandSuper,395 genscan,39 less refSeqComposite,1244 transMapEnsemblV5,375 transMapEstV5,344 transMapRefSeqV5,344 transMapRnaV5,344 transMapV5,450 uniprot,680 xenoRefGene,234 level chainGalGal6,390 chainGalGal6,424 chainGalGal6,429 chainGalGal6,436 chainGalGal6,494 chainGalGal6,521 chainGalGal6,534 chainGalGal6,566 chainNetGalGal6,393 chainNetGalGal6,427 chainNetGalGal6,432 chainNetGalGal6,439 chainNetGalGal6,497 chainNetGalGal6,524 chainNetGalGal6,537 chainNetGalGal6,569 chainNetXenTro7,403 chainNetXenTro7,437 chainNetXenTro7,442 chainNetXenTro7,449 chainNetXenTro7,507 chainNetXenTro7,534 chainNetXenTro7,547 chainNetXenTro7,579 chainNetXenTro9,400 chainNetXenTro9,434 chainNetXenTro9,439 chainNetXenTro9,446 chainNetXenTro9,504 chainNetXenTro9,531 chainNetXenTro9,544 chainNetXenTro9,576 chainXenTro7,400 chainXenTro7,434 chainXenTro7,439 chainXenTro7,446 chainXenTro7,504 chainXenTro7,531 chainXenTro7,544 chainXenTro7,576 chainXenTro9,397 chainXenTro9,431 chainXenTro9,436 chainXenTro9,443 chainXenTro9,501 chainXenTro9,528 chainXenTro9,541 chainXenTro9,573 netGalGal6,390 netGalGal6,424 netGalGal6,429 netGalGal6,436 netGalGal6,494 netGalGal6,521 netGalGal6,534 netGalGal6,566 netXenTro7,400 netXenTro7,434 netXenTro7,439 netXenTro7,446 netXenTro7,504 netXenTro7,531 netXenTro7,544 netXenTro7,576 netXenTro9,397 netXenTro9,431 netXenTro9,436 netXenTro9,443 netXenTro9,501 netXenTro9,528 netXenTro9,541 netXenTro9,573 refSeqComposite,611 refSeqComposite,631 refSeqComposite,1272 rmsk,205 xenoRefGene,62 xenoRefGene,262 levels cpgIslandExt,158 cpgIslandExtUnmasked,161 cpgIslandSuper,158 libraries nestedRepeats,258 nestedRepeats,317 rmsk,340 library nestedRepeats,47 rmsk,83 lifted uniprot,1492 lifting uniprot,1843 liftover uniprot,887 uniprot,1878 uniprot,1897 uniprot,1920 uniprot,1924 uniprot,1932 light cpgIslandExt,9 cpgIslandExtUnmasked,12 cpgIslandSuper,9 refSeqComposite,620 unipAliSwissprot,14 uniprot,506 uniprot,592 xenoRefGene,71 light-blue uniprot,178 lighter rmsk,237 like chainGalGal6,47 chainGalGal6,55 chainNetGalGal6,50 chainNetGalGal6,58 chainNetXenTro7,53 chainNetXenTro7,61 chainNetXenTro9,52 chainNetXenTro9,60 chainXenTro7,50 chainXenTro7,58 chainXenTro9,49 chainXenTro9,57 netGalGal6,47 netGalGal6,55 netXenTro7,50 netXenTro7,58 netXenTro9,49 netXenTro9,57 refSeqComposite,83 refSeqComposite,1615 uniprot,1541 likely augustusGene,111 microsat,17 refSeqComposite,948 transMapV5,94 line chainGalGal6,472 chainNetGalGal6,475 chainNetXenTro7,485 chainNetXenTro9,482 chainXenTro7,482 chainXenTro9,479 gap,106 gold,125 nestedRepeats,151 netGalGal6,472 netXenTro7,482 netXenTro9,479 refSeqComposite,1003 refSeqComposite,1014 refSeqComposite,1614 rmsk,165 uniprot,1872 uniprot,1876 line-up chainGalGal6,539 chainNetGalGal6,542 chainNetXenTro7,552 chainNetXenTro9,549 chainXenTro7,549 chainXenTro9,546 netGalGal6,539 netXenTro7,549 netXenTro9,546 line-ups chainGalGal6,524 chainNetGalGal6,527 chainNetXenTro7,537 chainNetXenTro9,534 chainXenTro7,534 chainXenTro9,531 netGalGal6,524 netXenTro7,534 netXenTro9,531 lineage transMapEnsemblV5,810 transMapEstV5,779 transMapRefSeqV5,779 transMapRnaV5,779 transMapV5,885 lineage-specific chainGalGal6,942 chainNetGalGal6,945 chainNetXenTro7,957 chainNetXenTro9,954 chainXenTro7,954 chainXenTro9,951 netGalGal6,942 netXenTro7,954 netXenTro9,951 linear chainGalGal6,701 chainNetGalGal6,704 chainNetXenTro7,716 chainNetXenTro9,713 chainXenTro7,713 chainXenTro9,710 netGalGal6,701 netXenTro7,713 netXenTro9,710 lineargap chainGalGal6,707 chainNetGalGal6,710 chainNetXenTro7,722 chainNetXenTro9,719 chainXenTro7,719 chainXenTro9,716 netGalGal6,707 netXenTro7,719 netXenTro9,716 lines chainGalGal6,131 chainGalGal6,138 chainGalGal6,161 chainGalGal6,452 chainNetGalGal6,134 chainNetGalGal6,141 chainNetGalGal6,164 chainNetGalGal6,455 chainNetXenTro7,140 chainNetXenTro7,147 chainNetXenTro7,171 chainNetXenTro7,465 chainNetXenTro9,138 chainNetXenTro9,145 chainNetXenTro9,169 chainNetXenTro9,462 chainXenTro7,137 chainXenTro7,144 chainXenTro7,168 chainXenTro7,462 chainXenTro9,135 chainXenTro9,142 chainXenTro9,166 chainXenTro9,459 nestedRepeats,131 netGalGal6,131 netGalGal6,138 netGalGal6,161 netGalGal6,452 netXenTro7,137 netXenTro7,144 netXenTro7,168 netXenTro7,462 netXenTro9,135 netXenTro9,142 netXenTro9,166 netXenTro9,459 refSeqComposite,998 link gc5BaseBw,63 uniprot,491 uniprot,1675 linked refSeqComposite,1532 refSeqComposite,1647 linux.x86_64 cpgIslandExt,579 cpgIslandExtUnmasked,582 cpgIslandSuper,579 uniprot,1919 lipid uniprot,346 lipoification uniprot,577 list refSeqComposite,763 refSeqComposite,1691 uniprot,979 uniprot,1165 uniprot,1831 literature refSeqComposite,283 refSeqComposite,659 uniprot,434 lm uniprot,2019 loaded windowmaskerSdust,79 local chainGalGal6,111 chainGalGal6,183 chainNetGalGal6,114 chainNetGalGal6,186 chainNetXenTro7,120 chainNetXenTro7,193 chainNetXenTro9,118 chainNetXenTro9,191 chainXenTro7,117 chainXenTro7,190 chainXenTro9,115 chainXenTro9,188 nestedRepeats,98 netGalGal6,111 netGalGal6,183 netXenTro7,117 netXenTro7,190 netXenTro9,115 netXenTro9,188 refSeqComposite,1337 located simpleRepeat,21 location chainGalGal6,252 chainNetGalGal6,255 chainNetXenTro7,262 chainNetXenTro9,260 chainXenTro7,259 chainXenTro9,257 netGalGal6,252 netXenTro7,259 netXenTro9,257 transMapEnsemblV5,404 transMapEnsemblV5,414 transMapEnsemblV5,481 transMapEstV5,373 transMapEstV5,383 transMapEstV5,450 transMapRefSeqV5,373 transMapRefSeqV5,383 transMapRefSeqV5,450 transMapRnaV5,373 transMapRnaV5,383 transMapRnaV5,450 transMapV5,479 transMapV5,489 transMapV5,556 uniprot,554 uniprot,767 uniprot,1417 locations gap,3 transMapEnsemblV5,493 transMapEstV5,462 transMapRefSeqV5,462 transMapRnaV5,462 transMapV5,568 uniprot,451 long refSeqComposite,1027 rmsk,161 rmsk,166 long-established transMapEnsemblV5,805 transMapEstV5,774 transMapRefSeqV5,774 transMapRnaV5,774 transMapV5,880 longer chainGalGal6,82 chainNetGalGal6,85 chainNetXenTro7,90 chainNetXenTro9,88 chainXenTro7,87 chainXenTro9,85 netGalGal6,82 netXenTro7,87 netXenTro9,85 longest chainGalGal6,517 chainNetGalGal6,520 chainNetXenTro7,530 chainNetXenTro9,527 chainXenTro7,527 chainXenTro9,524 netGalGal6,517 netXenTro7,527 netXenTro9,524 look chainGalGal6,46 chainNetGalGal6,49 chainNetXenTro7,52 chainNetXenTro9,51 chainXenTro7,49 chainXenTro9,48 netGalGal6,46 netXenTro7,49 netXenTro9,48 loose chainGalGal6,708 chainNetGalGal6,711 chainNetXenTro7,723 chainNetXenTro9,720 chainXenTro7,720 chainXenTro9,717 netGalGal6,708 netXenTro7,720 netXenTro9,717 losses transMapEnsemblV5,803 transMapEstV5,772 transMapRefSeqV5,772 transMapRnaV5,772 transMapV5,878 lot uniprot,1950 low nestedRepeats,39 rmsk,29 rmsk,181 lowe transMapEnsemblV5,793 transMapEstV5,762 transMapRefSeqV5,762 transMapRnaV5,762 transMapV5,868 lower chainGalGal6,493 chainNetGalGal6,496 chainNetXenTro7,506 chainNetXenTro9,503 chainXenTro7,503 chainXenTro9,500 netGalGal6,493 netXenTro7,503 netXenTro9,500 lower-level chainGalGal6,858 chainGalGal6,864 chainNetGalGal6,861 chainNetGalGal6,867 chainNetXenTro7,873 chainNetXenTro7,879 chainNetXenTro9,870 chainNetXenTro9,876 chainXenTro7,870 chainXenTro7,876 chainXenTro9,867 chainXenTro9,873 netGalGal6,858 netGalGal6,864 netXenTro7,870 netXenTro7,876 netXenTro9,867 netXenTro9,873 ls-snp uniprot,1536 lt refSeqComposite,944 ltr rmsk,170 m augustusGene,287 augustusGene,289 augustusGene,317 cpgIslandExt,605 cpgIslandExt,607 cpgIslandExtUnmasked,608 cpgIslandExtUnmasked,610 cpgIslandSuper,605 cpgIslandSuper,607 transMapEnsemblV5,717 transMapEnsemblV5,724 transMapEnsemblV5,758 transMapEnsemblV5,760 transMapEnsemblV5,792 transMapEstV5,686 transMapEstV5,693 transMapEstV5,727 transMapEstV5,729 transMapEstV5,761 transMapRefSeqV5,686 transMapRefSeqV5,693 transMapRefSeqV5,727 transMapRefSeqV5,729 transMapRefSeqV5,761 transMapRnaV5,686 transMapRnaV5,693 transMapRnaV5,727 transMapRnaV5,729 transMapRnaV5,761 transMapV5,792 transMapV5,799 transMapV5,833 transMapV5,835 transMapV5,867 made rmsk,110 transMapEnsemblV5,396 transMapEstV5,365 transMapRefSeqV5,365 transMapRnaV5,365 transMapV5,471 uniprot,931 uniprot,938 maglott refSeqComposite,1796 xenoRefGene,366 mailing refSeqComposite,1690 uniprot,1830 main unipAliSwissprot,12 uniprot,156 uniprot,1548 maintained uniprot,719 make gold,76 refSeqComposite,116 refSeqComposite,1099 rmsk,123 transMapEnsemblV5,430 transMapEstV5,399 transMapRefSeqV5,399 transMapRnaV5,399 transMapV5,505 uniprot,1406 makedb rmsk,131 making uniprot,1978 mammalian nestedRepeats,368 nestedRepeats,382 refSeqComposite,1776 rmsk,391 rmsk,405 xenoRefGene,346 manner refSeqComposite,1627 uniprot,1469 manual refSeqComposite,258 uniprot,1652 manually refSeqComposite,250 refSeqComposite,421 many chainGalGal6,403 chainNetGalGal6,406 chainNetXenTro7,416 chainNetXenTro9,413 chainXenTro7,413 chainXenTro9,410 netGalGal6,403 netXenTro7,413 netXenTro9,410 uniprot,932 uniprot,1124 map chainGalGal6,331 chainNetGalGal6,334 chainNetXenTro7,344 chainNetXenTro9,341 chainXenTro7,341 chainXenTro9,338 netGalGal6,331 netXenTro7,341 netXenTro9,338 transMapEnsemblV5,294 transMapEstV5,263 transMapRefSeqV5,263 transMapRnaV5,263 transMapV5,369 uniprot,758 uniprot,1885 mapped augustusGene,298 nestedRepeats,233 refSeqComposite,1108 transMapEnsemblV5,381 transMapEnsemblV5,413 transMapEnsemblV5,471 transMapEnsemblV5,769 transMapEstV5,350 transMapEstV5,382 transMapEstV5,440 transMapEstV5,738 transMapRefSeqV5,350 transMapRefSeqV5,382 transMapRefSeqV5,440 transMapRefSeqV5,738 transMapRnaV5,350 transMapRnaV5,382 transMapRnaV5,440 transMapRnaV5,738 transMapV5,131 transMapV5,456 transMapV5,488 transMapV5,546 transMapV5,844 uniprot,26 uniprot,97 uniprot,117 uniprot,132 uniprot,200 uniprot,213 uniprot,632 uniprot,1517 mapping cytoBandIdeo,7 gap,4 gc5BaseBw,8 gold,5 refSeqComposite,320 transMapEnsemblV5,267 transMapEnsemblV5,287 transMapEnsemblV5,300 transMapEstV5,236 transMapEstV5,256 transMapEstV5,269 transMapRefSeqV5,236 transMapRefSeqV5,256 transMapRefSeqV5,269 transMapRnaV5,236 transMapRnaV5,256 transMapRnaV5,269 transMapV5,342 transMapV5,362 transMapV5,375 ucscToINSDC,10 ucscToRefSeq,5 uniprot,725 uniprot,752 uniprot,775 uniprot,904 uniprot,1213 uniprot,1322 uniprot,1613 uniprot,1853 mappings transMapEnsemblV5,7 transMapEnsemblV5,503 transMapEstV5,5 transMapEstV5,472 transMapRefSeqV5,6 transMapRefSeqV5,472 transMapRnaV5,6 transMapRnaV5,472 transMapV5,578 uniprot,1362 maps transMapEnsemblV5,477 transMapEnsemblV5,490 transMapEstV5,446 transMapEstV5,459 transMapRefSeqV5,446 transMapRefSeqV5,459 transMapRnaV5,446 transMapRnaV5,459 transMapV5,72 transMapV5,552 transMapV5,565 mar augustusGene,309 chainGalGal6,4 chainGalGal6,66 chainGalGal6,306 chainNetGalGal6,5 chainNetGalGal6,69 chainNetGalGal6,309 chainNetGalGal6Viewchain,3 chainNetGalGal6Viewnet,3 gap,15 gold,17 netGalGal6,4 netGalGal6,66 netGalGal6,306 transMapEnsemblV5,780 transMapEstV5,749 transMapRefSeqV5,749 transMapRnaV5,749 transMapV5,855 mario augustusGene,102 augustusGene,283 mark transMapEnsemblV5,682 transMapEstV5,651 transMapRefSeqV5,651 transMapRnaV5,651 transMapV5,757 uniprot,1539 uniprot,1956 marked refSeqComposite,525 markers microsat,23 markov augustusGene,325 masked cpgIslandExt,192 cpgIslandExt,198 cpgIslandExt,328 cpgIslandExtUnmasked,195 cpgIslandExtUnmasked,201 cpgIslandExtUnmasked,331 cpgIslandSuper,192 cpgIslandSuper,198 cpgIslandSuper,328 rmsk,71 windowmaskerSdust,5 windowmaskerSdust,16 masker windowmaskerSdust,102 masking cpgIslandExt,304 cpgIslandExtUnmasked,307 cpgIslandSuper,304 maskoutfa cpgIslandExt,414 cpgIslandExtUnmasked,417 cpgIslandSuper,414 match chainGalGal6,257 chainGalGal6,518 chainGalGal6,556 chainNetGalGal6,260 chainNetGalGal6,521 chainNetGalGal6,559 chainNetXenTro7,267 chainNetXenTro7,531 chainNetXenTro7,569 chainNetXenTro9,265 chainNetXenTro9,528 chainNetXenTro9,566 chainXenTro7,264 chainXenTro7,528 chainXenTro7,566 chainXenTro9,262 chainXenTro9,525 chainXenTro9,563 netGalGal6,257 netGalGal6,518 netGalGal6,556 netXenTro7,264 netXenTro7,528 netXenTro7,566 netXenTro9,262 netXenTro9,525 netXenTro9,563 refSeqComposite,912 refSeqComposite,926 uniprot,1305 uniprot,1341 matching chainGalGal6,260 chainNetGalGal6,263 chainNetXenTro7,270 chainNetXenTro9,268 chainXenTro7,267 chainXenTro9,265 netGalGal6,260 netXenTro7,267 netXenTro9,265 uniprot,1068 uniprot,1075 matrix chainGalGal6,671 chainGalGal6,703 chainNetGalGal6,674 chainNetGalGal6,706 chainNetXenTro7,686 chainNetXenTro7,718 chainNetXenTro9,683 chainNetXenTro9,715 chainXenTro7,683 chainXenTro7,715 chainXenTro9,680 chainXenTro9,712 netGalGal6,671 netGalGal6,703 netXenTro7,683 netXenTro7,715 netXenTro9,680 netXenTro9,712 mature unipChain,3 uniprot,251 uniprot,292 maximally chainGalGal6,663 chainNetGalGal6,666 chainNetXenTro7,678 chainNetXenTro9,675 chainXenTro7,675 chainXenTro9,672 cpgIslandExt,250 cpgIslandExtUnmasked,253 cpgIslandSuper,250 netGalGal6,663 netXenTro7,675 netXenTro9,672 maximilian uniprot,1944 maxtracks augustusGene,139 may chainGalGal6,174 chainGalGal6,432 chainNetGalGal6,177 chainNetGalGal6,435 chainNetXenTro7,184 chainNetXenTro7,445 chainNetXenTro9,182 chainNetXenTro9,442 chainXenTro7,181 chainXenTro7,442 chainXenTro9,179 chainXenTro9,439 cpgIslandExt,36 cpgIslandExtUnmasked,39 cpgIslandSuper,36 gc5BaseBw,40 nestedRepeats,268 nestedRepeats,290 netGalGal6,174 netGalGal6,432 netXenTro7,181 netXenTro7,442 netXenTro9,179 netXenTro9,439 refSeqComposite,60 refSeqComposite,663 rmsk,297 rmsk,307 simpleRepeat,43 transMapEnsemblV5,108 transMapEnsemblV5,143 transMapEstV5,77 transMapEstV5,112 transMapRefSeqV5,77 transMapRefSeqV5,112 transMapRnaV5,77 transMapRnaV5,112 transMapV5,183 transMapV5,218 uniprot,2046 mcgarvey refSeqComposite,1768 xenoRefGene,338 md5 uniprot,1601 mediating uniprot,314 medium refSeqComposite,622 xenoRefGene,73 mellifera augustusGene,216 mementos nestedRepeats,377 rmsk,400 menu refSeqComposite,850 xenoRefGene,174 method uniprot,726 uniprot,753 uniprot,776 methods augustusGene,46 chainGalGal6,568 chainGalGal6,771 chainNetGalGal6,571 chainNetGalGal6,774 chainNetXenTro7,581 chainNetXenTro7,786 chainNetXenTro9,578 chainNetXenTro9,783 chainXenTro7,578 chainXenTro7,783 chainXenTro9,575 chainXenTro9,780 cpgIslandExt,224 cpgIslandExtUnmasked,227 cpgIslandSuper,224 genscan,130 genscan,197 microsat,45 nestedRepeats,244 netGalGal6,568 netGalGal6,771 netXenTro7,578 netXenTro7,783 netXenTro9,575 netXenTro9,780 refSeqComposite,91 refSeqComposite,1140 refSeqComposite,1222 rmsk,286 simpleRepeat,55 transMapEnsemblV5,152 transMapEstV5,121 transMapRefSeqV5,121 transMapRnaV5,121 transMapV5,227 uniprot,777 windowmaskerSdust,46 xenoRefGene,217 methylated cpgIslandExt,71 cpgIslandExt,100 cpgIslandExt,132 cpgIslandExtUnmasked,74 cpgIslandExtUnmasked,103 cpgIslandExtUnmasked,135 cpgIslandSuper,71 cpgIslandSuper,100 cpgIslandSuper,132 methylation cpgIslandExt,73 cpgIslandExtUnmasked,76 cpgIslandSuper,73 micro-satellites rmsk,180 microsatellite microsat,1 microsat,22 microsatellites microsat,2 miklem cpgIslandExt,598 cpgIslandExtUnmasked,601 cpgIslandSuper,598 miller chainGalGal6,936 chainGalGal6,973 chainGalGal6,1034 chainGalGal6,1054 chainGalGal6,1102 chainNetGalGal6,939 chainNetGalGal6,976 chainNetGalGal6,1037 chainNetGalGal6,1057 chainNetGalGal6,1105 chainNetXenTro7,951 chainNetXenTro7,988 chainNetXenTro7,1049 chainNetXenTro7,1069 chainNetXenTro7,1117 chainNetXenTro9,948 chainNetXenTro9,985 chainNetXenTro9,1046 chainNetXenTro9,1066 chainNetXenTro9,1114 chainXenTro7,948 chainXenTro7,985 chainXenTro7,1046 chainXenTro7,1066 chainXenTro7,1114 chainXenTro9,945 chainXenTro9,982 chainXenTro9,1043 chainXenTro9,1063 chainXenTro9,1111 netGalGal6,936 netGalGal6,973 netGalGal6,1034 netGalGal6,1054 netGalGal6,1102 netXenTro7,948 netXenTro7,985 netXenTro7,1046 netXenTro7,1066 netXenTro7,1114 netXenTro9,945 netXenTro9,982 netXenTro9,1043 netXenTro9,1063 netXenTro9,1111 minexonintronprob augustusGene,135 minimum chainGalGal6,684 chainNetGalGal6,687 chainNetXenTro7,699 chainNetXenTro9,696 chainXenTro7,696 chainXenTro9,693 netGalGal6,684 netXenTro7,696 netXenTro9,693 minmeanexonintronprob augustusGene,137 minmei chainGalGal6,928 chainNetGalGal6,931 chainNetXenTro7,943 chainNetXenTro9,940 chainXenTro7,940 chainXenTro9,937 netGalGal6,928 netXenTro7,940 netXenTro9,937 mismatch refSeqComposite,896 rmsk,218 mismatching refSeqComposite,900 misplacements uniprot,853 mitochondrion refSeqComposite,241 mj refSeqComposite,1767 xenoRefGene,337 mk_counts windowmaskerSdust,59 mode chainGalGal6,387 chainNetGalGal6,390 chainNetXenTro7,400 chainNetXenTro9,397 chainXenTro7,397 chainXenTro9,394 gold,69 nestedRepeats,119 nestedRepeats,160 nestedRepeats,169 netGalGal6,387 netXenTro7,397 netXenTro9,394 rmsk,142 model augustusGene,121 augustusGene,326 genscan,140 modeling genscan,182 models augustusGene,49 augustusGene,65 augustusGene,97 augustusGene,145 augustusGene,178 genscan,158 uniprot,733 modes chainGalGal6,242 chainNetGalGal6,245 chainNetXenTro7,252 chainNetXenTro9,250 chainXenTro7,249 chainXenTro9,247 netGalGal6,242 netXenTro7,249 netXenTro9,247 modification cpgIslandExt,591 cpgIslandExtUnmasked,594 cpgIslandSuper,591 modifications unipModif,2 unipModif,6 uniprot,340 uniprot,574 modified rmsk,57 uniprot,343 modsnp uniprot,2030 moiety-binding uniprot,347 mol cpgIslandExt,614 cpgIslandExtUnmasked,617 cpgIslandSuper,614 genscan,221 molecular genscan,199 months uniprot,1573 more augustusGene,35 chainGalGal6,163 chainGalGal6,224 chainNetGalGal6,166 chainNetGalGal6,227 chainNetXenTro7,173 chainNetXenTro7,234 chainNetXenTro9,171 chainNetXenTro9,232 chainXenTro7,170 chainXenTro7,231 chainXenTro9,168 chainXenTro9,229 cpgIslandExt,541 cpgIslandExtUnmasked,544 cpgIslandSuper,541 genscan,50 genscan,125 genscan,163 microsat,96 nestedRepeats,211 nestedRepeats,300 netGalGal6,163 netGalGal6,224 netXenTro7,170 netXenTro7,231 netXenTro9,168 netXenTro9,229 refSeqComposite,94 refSeqComposite,130 refSeqComposite,852 refSeqComposite,1383 refSeqComposite,1463 rmsk,323 simpleRepeat,57 transMapEnsemblV5,131 transMapEnsemblV5,148 transMapEnsemblV5,224 transMapEnsemblV5,269 transMapEnsemblV5,291 transMapEnsemblV5,568 transMapEstV5,100 transMapEstV5,117 transMapEstV5,193 transMapEstV5,238 transMapEstV5,260 transMapEstV5,537 transMapRefSeqV5,100 transMapRefSeqV5,117 transMapRefSeqV5,193 transMapRefSeqV5,238 transMapRefSeqV5,260 transMapRefSeqV5,537 transMapRnaV5,100 transMapRnaV5,117 transMapRnaV5,193 transMapRnaV5,238 transMapRnaV5,260 transMapRnaV5,537 transMapV5,63 transMapV5,107 transMapV5,164 transMapV5,206 transMapV5,223 transMapV5,299 transMapV5,344 transMapV5,366 transMapV5,643 uniprot,498 uniprot,691 uniprot,984 uniprot,1841 xenoRefGene,176 morgulis windowmaskerSdust,90 most augustusGene,93 augustusGene,110 nestedRepeats,249 refSeqComposite,580 refSeqComposite,947 transMapV5,93 uniprot,683 uniprot,756 uniprot,1295 uniprot,1391 mostly uniprot,1365 motifs uniprot,388 mouse chainGalGal6,1067 chainNetGalGal6,1070 chainNetXenTro7,1082 chainNetXenTro9,1079 chainXenTro7,1079 chainXenTro9,1076 netGalGal6,1067 netXenTro7,1079 netXenTro9,1076 transMapEnsemblV5,44 transMapEnsemblV5,367 transMapEstV5,336 transMapRefSeqV5,336 transMapRnaV5,336 transMapV5,442 uniprot,521 uniprot,535 mrna transMapEnsemblV5,458 transMapEstV5,427 transMapRefSeqV5,427 transMapRnaV5,18 transMapRnaV5,427 transMapV5,100 transMapV5,533 mrnas transMapEnsemblV5,173 transMapEstV5,142 transMapRefSeqV5,142 transMapRnaV5,142 transMapV5,111 transMapV5,248 much chainGalGal6,885 chainGalGal6,902 chainNetGalGal6,888 chainNetGalGal6,905 chainNetXenTro7,900 chainNetXenTro7,917 chainNetXenTro9,897 chainNetXenTro9,914 chainXenTro7,897 chainXenTro7,914 chainXenTro9,894 chainXenTro9,911 nestedRepeats,210 netGalGal6,885 netGalGal6,902 netXenTro7,897 netXenTro7,914 netXenTro9,894 netXenTro9,911 mujica uniprot,1967 multiple chainGalGal6,195 chainNetGalGal6,198 chainNetXenTro7,205 chainNetXenTro9,203 chainXenTro7,202 chainXenTro9,200 netGalGal6,195 netXenTro7,202 netXenTro9,200 refSeqComposite,1255 refSeqComposite,1302 transMapEnsemblV5,501 transMapEstV5,470 transMapRefSeqV5,470 transMapRnaV5,470 transMapV5,576 uniprot,58 uniprot,1067 uniprot,1095 xenoRefGene,245 must refSeqComposite,303 refSeqComposite,1636 mutagenesis uniprot,353 mutat uniprot,2044 mutated uniprot,618 mutation chainGalGal6,184 chainNetGalGal6,187 chainNetXenTro7,194 chainNetXenTro9,192 chainXenTro7,191 chainXenTro9,189 netGalGal6,184 netXenTro7,191 netXenTro9,189 refSeqComposite,563 mutation-related uniprot,408 mutations unipMut,1 unipMut,5 uniprot,352 mysql cpgIslandExt,538 cpgIslandExtUnmasked,541 cpgIslandSuper,538 refSeqComposite,1328 refSeqComposite,1631 refSeqComposite,1645 n cpgIslandExt,386 cpgIslandExt,394 cpgIslandExt,456 cpgIslandExtUnmasked,389 cpgIslandExtUnmasked,397 cpgIslandExtUnmasked,459 cpgIslandSuper,386 cpgIslandSuper,394 cpgIslandSuper,456 refSeqComposite,918 refSeqComposite,959 refSeqComposite,986 refSeqComposite,1045 refSeqComposite,1072 refSeqComposite,1087 name chainGalGal6,369 chainNetGalGal6,372 chainNetXenTro7,382 chainNetXenTro9,379 chainXenTro7,379 chainXenTro9,376 nestedRepeats,136 netGalGal6,369 netXenTro7,379 netXenTro9,376 refSeqComposite,759 refSeqComposite,772 refSeqComposite,782 refSeqComposite,790 refSeqComposite,802 uniprot,105 uniprot,461 uniprot,541 uniprot,1577 xenoRefGene,109 xenoRefGene,119 xenoRefGene,124 names chainGalGal6,246 chainNetGalGal6,249 chainNetXenTro7,256 chainNetXenTro9,254 chainXenTro7,253 chainXenTro9,251 netGalGal6,246 netXenTro7,253 netXenTro9,251 refSeqComposite,807 ucscToINSDC,21 ucscToINSDC,24 ucscToRefSeq,16 xenoRefGene,131 nanpar1 refSeqComposite,1554 refSeqComposite,1618 transMapEnsemblV5,205 transMapEnsemblV5,665 transMapEstV5,174 transMapEstV5,634 transMapRefSeqV5,174 transMapRefSeqV5,634 transMapRnaV5,174 transMapRnaV5,634 transMapV5,280 transMapV5,740 uniprot,1816 nanpar1.ensembl.transmapv4.bigpsl transMapEnsemblV5,593 transMapEstV5,562 transMapRefSeqV5,562 transMapRnaV5,562 nanpar1.ensembl.transmapv5.bigpsl transMapV5,668 nanpar1.est.transmapv4.bigpsl transMapEnsemblV5,602 transMapEstV5,571 transMapRefSeqV5,571 transMapRnaV5,571 nanpar1.est.transmapv5.bigpsl transMapV5,677 nanpar1.fa windowmaskerSdust,62 windowmaskerSdust,71 nanpar1.refseq.transmapv4.bigpsl transMapEnsemblV5,596 transMapEnsemblV5,668 transMapEstV5,565 transMapEstV5,637 transMapRefSeqV5,565 transMapRefSeqV5,637 transMapRnaV5,565 transMapRnaV5,637 nanpar1.refseq.transmapv5.bigpsl transMapV5,671 transMapV5,743 nanpar1.rna.transmapv4.bigpsl transMapEnsemblV5,599 transMapEstV5,568 transMapRefSeqV5,568 transMapRnaV5,568 nanpar1.rna.transmapv5.bigpsl transMapV5,674 native augustusGene,295 transMapEnsemblV5,766 transMapEstV5,735 transMapRefSeqV5,735 transMapRnaV5,735 transMapV5,123 transMapV5,841 natl chainGalGal6,1072 chainNetGalGal6,1075 chainNetXenTro7,1087 chainNetXenTro9,1084 chainXenTro7,1084 chainXenTro9,1081 netGalGal6,1072 netXenTro7,1084 netXenTro9,1081 natural chainGalGal6,823 chainNetGalGal6,826 chainNetXenTro7,838 chainNetXenTro9,835 chainXenTro7,835 chainXenTro9,832 netGalGal6,823 netXenTro7,835 netXenTro9,832 nbci uniprot,822 nbsp chainGalGal6,674 chainNetGalGal6,677 chainNetXenTro7,689 chainNetXenTro9,686 chainXenTro7,686 chainXenTro9,683 netGalGal6,674 netXenTro7,686 netXenTro9,683 ncbi gap,28 gap,31 gap,57 gold,30 gold,33 gold,56 ncbiRefSeq,3 ncbiRefSeqGenomicDiff,5 ncbiRefSeqOther,3 ncbiRefSeqPredicted,3 refSeqComposite,1 refSeqComposite,6 refSeqComposite,13 refSeqComposite,28 refSeqComposite,73 refSeqComposite,80 refSeqComposite,105 refSeqComposite,318 refSeqComposite,374 refSeqComposite,546 refSeqComposite,642 refSeqComposite,649 refSeqComposite,693 refSeqComposite,1160 refSeqComposite,1191 refSeqComposite,1207 refSeqComposite,1728 refSeqComposite,1798 ucscToINSDC,39 ucscToRefSeq,22 ucscToRefSeq,33 uniprot,840 uniprot,856 uniprot,1024 uniprot,1046 uniprot,1049 uniprot,1079 uniprot,1204 uniprot,1274 uniprot,1280 uniprot,1289 uniprot,1299 windowmaskerSdust,29 windowmaskerSdust,43 xenoRefGene,29 xenoRefGene,299 xenoRefGene,368 ncbirefseq refSeqComposite,1411 refSeqComposite,1555 refSeqComposite,1699 ncbirefseqcurated refSeqComposite,1414 ncbirefseqdiffs.bb refSeqComposite,1494 ncbirefseqother.bb refSeqComposite,1492 refSeqComposite,1556 ncbirefseqpredicted refSeqComposite,1417 refSeqComposite,1619 ncbirefseqpredicted.gtf refSeqComposite,1620 ncbirefseqpsl refSeqComposite,1425 ndash refSeqComposite,200 refSeqComposite,211 refSeqComposite,341 refSeqComposite,380 refSeqComposite,435 refSeqComposite,459 refSeqComposite,482 refSeqComposite,519 refSeqComposite,552 refSeqComposite,897 refSeqComposite,931 refSeqComposite,964 refSeqComposite,1022 refSeqComposite,1048 near cpgIslandExt,31 cpgIslandExtUnmasked,34 cpgIslandSuper,31 refSeqComposite,1648 near-best transMapEnsemblV5,358 transMapEstV5,327 transMapRefSeqV5,327 transMapRnaV5,327 transMapV5,433 necessary chainGalGal6,807 chainNetGalGal6,810 chainNetXenTro7,822 chainNetXenTro9,819 chainXenTro7,819 chainXenTro9,816 netGalGal6,807 netXenTro7,819 netXenTro9,816 nematodes augustusGene,211 net chainGalGal6,34 chainGalGal6,262 chainGalGal6,265 chainGalGal6,382 chainGalGal6,761 chainNetGalGal6,3 chainNetGalGal6,11 chainNetGalGal6,37 chainNetGalGal6,265 chainNetGalGal6,268 chainNetGalGal6,385 chainNetGalGal6,764 chainNetGalGal6Viewchain,9 chainNetGalGal6Viewnet,1 chainNetGalGal6Viewnet,9 chainNetXenTro7,4 chainNetXenTro7,14 chainNetXenTro7,40 chainNetXenTro7,272 chainNetXenTro7,275 chainNetXenTro7,395 chainNetXenTro7,776 chainNetXenTro7Viewchain,11 chainNetXenTro7Viewnet,1 chainNetXenTro7Viewnet,11 chainNetXenTro9,4 chainNetXenTro9,13 chainNetXenTro9,39 chainNetXenTro9,270 chainNetXenTro9,273 chainNetXenTro9,392 chainNetXenTro9,773 chainNetXenTro9Viewchain,10 chainNetXenTro9Viewnet,1 chainNetXenTro9Viewnet,10 chainXenTro7,37 chainXenTro7,269 chainXenTro7,272 chainXenTro7,392 chainXenTro7,773 chainXenTro9,36 chainXenTro9,267 chainXenTro9,270 chainXenTro9,389 chainXenTro9,770 netGalGal6,2 netGalGal6,9 netGalGal6,34 netGalGal6,262 netGalGal6,265 netGalGal6,382 netGalGal6,761 netXenTro7,3 netXenTro7,12 netXenTro7,37 netXenTro7,269 netXenTro7,272 netXenTro7,392 netXenTro7,773 netXenTro9,3 netXenTro9,11 netXenTro9,36 netXenTro9,267 netXenTro9,270 netXenTro9,389 netXenTro9,770 transMapV5,140 netclass chainGalGal6,877 chainGalGal6,1000 chainNetGalGal6,880 chainNetGalGal6,1003 chainNetXenTro7,892 chainNetXenTro7,1015 chainNetXenTro9,889 chainNetXenTro9,1012 chainXenTro7,889 chainXenTro7,1012 chainXenTro9,886 chainXenTro9,1009 netGalGal6,877 netGalGal6,1000 netXenTro7,889 netXenTro7,1012 netXenTro9,886 netXenTro9,1009 netfilter transMapEnsemblV5,254 transMapEstV5,223 transMapRefSeqV5,223 transMapRnaV5,223 transMapV5,329 nets chainGalGal6,987 chainNetGalGal6,990 chainNetXenTro7,1002 chainNetXenTro9,999 chainXenTro7,999 chainXenTro9,996 netGalGal6,987 netXenTro7,999 netXenTro9,996 transMapEnsemblV5,200 transMapEnsemblV5,243 transMapEnsemblV5,249 transMapEnsemblV5,263 transMapEstV5,169 transMapEstV5,212 transMapEstV5,218 transMapEstV5,232 transMapRefSeqV5,169 transMapRefSeqV5,212 transMapRefSeqV5,218 transMapRefSeqV5,232 transMapRnaV5,169 transMapRnaV5,212 transMapRnaV5,218 transMapRnaV5,232 transMapV5,89 transMapV5,275 transMapV5,318 transMapV5,324 transMapV5,338 netsyntenic chainGalGal6,845 chainGalGal6,998 chainNetGalGal6,848 chainNetGalGal6,1001 chainNetXenTro7,860 chainNetXenTro7,1013 chainNetXenTro9,857 chainNetXenTro9,1010 chainXenTro7,857 chainXenTro7,1010 chainXenTro9,854 chainXenTro9,1007 netGalGal6,845 netGalGal6,998 netXenTro7,857 netXenTro7,1010 netXenTro9,854 netXenTro9,1007 new augustusGene,329 newer nestedRepeats,270 rmsk,106 newly cpgIslandExt,77 cpgIslandExtUnmasked,80 cpgIslandSuper,77 next chainGalGal6,348 chainGalGal6,377 chainNetGalGal6,351 chainNetGalGal6,380 chainNetXenTro7,361 chainNetXenTro7,390 chainNetXenTro9,358 chainNetXenTro9,387 chainXenTro7,358 chainXenTro7,387 chainXenTro9,355 chainXenTro9,384 netGalGal6,348 netGalGal6,377 netXenTro7,358 netXenTro7,387 netXenTro9,355 netXenTro9,384 refSeqComposite,167 refSeqComposite,755 nig augustusGene,270 nm refSeqComposite,225 refSeqComposite,492 nm_ ncbiRefSeq,9 ncbiRefSeqOther,8 nm_012309 refSeqComposite,1139 nm_012309.4 refSeqComposite,1137 no microsat,73 transMapEnsemblV5,223 transMapEstV5,192 transMapRefSeqV5,192 transMapRnaV5,192 transMapV5,298 uniprot,1031 uniprot,1078 uniprot,1262 uniprot,1324 nomask cpgIslandExt,498 cpgIslandExtUnmasked,501 cpgIslandSuper,498 non-alignable chainGalGal6,49 chainNetGalGal6,52 chainNetXenTro7,55 chainNetXenTro9,54 chainXenTro7,52 chainXenTro9,51 netGalGal6,49 netXenTro7,52 netXenTro9,51 non-coding augustusGene,75 refSeqComposite,1088 xenoRefGene,193 non-protein-coding refSeqComposite,23 xenoRefGene,18 xenoRefGene,201 non-redundant refSeqComposite,1804 xenoRefGene,374 non-tibetan xenoRefGene,3 nonsyn chainGalGal6,554 chainNetGalGal6,557 chainNetXenTro7,567 chainNetXenTro9,564 chainXenTro7,564 chainXenTro9,561 netGalGal6,554 netXenTro7,564 netXenTro9,561 normally cpgIslandExt,42 cpgIslandExtUnmasked,45 cpgIslandSuper,42 not chainGalGal6,812 chainNetGalGal6,815 chainNetXenTro7,827 chainNetXenTro9,824 chainXenTro7,824 chainXenTro9,821 cpgIslandExt,131 cpgIslandExt,186 cpgIslandExtUnmasked,134 cpgIslandExtUnmasked,189 cpgIslandSuper,131 cpgIslandSuper,186 ncbiRefSeqOther,7 netGalGal6,812 netXenTro7,824 netXenTro9,821 refSeqComposite,177 refSeqComposite,391 refSeqComposite,429 refSeqComposite,474 refSeqComposite,675 refSeqComposite,700 refSeqComposite,1060 refSeqComposite,1138 rmsk,113 rmsk,313 transMapEnsemblV5,62 uniprot,169 uniprot,627 uniprot,959 uniprot,1130 uniprot,1455 note nestedRepeats,264 refSeqComposite,176 refSeqComposite,1621 transMapEnsemblV5,499 transMapEstV5,468 transMapRefSeqV5,468 transMapRnaV5,468 transMapV5,574 uniprot,695 novel transMapEnsemblV5,740 transMapEstV5,709 transMapRefSeqV5,709 transMapRnaV5,709 transMapV5,815 novo augustusGene,304 transMapEnsemblV5,775 transMapEstV5,744 transMapRefSeqV5,744 transMapRnaV5,744 transMapV5,850 now uniprot,1680 np refSeqComposite,227 refSeqComposite,230 np_ ncbiRefSeq,13 ncbiRefSeqOther,12 nr refSeqComposite,226 refSeqComposite,494 nr_ ncbiRefSeq,11 ncbiRefSeqOther,9 ns chainGalGal6,892 chainNetGalGal6,895 chainNetXenTro7,907 chainNetXenTro9,904 chainXenTro7,904 chainXenTro9,901 netGalGal6,892 netXenTro7,904 netXenTro9,901 nuclear rmsk,155 rmsk,163 nucleic microsat,125 refSeqComposite,1779 refSeqComposite,1812 simpleRepeat,85 uniprot,1997 xenoRefGene,349 xenoRefGene,382 nucleotide cpgIslandExt,352 cpgIslandExtUnmasked,355 cpgIslandSuper,352 ucscToINSDC,6 ucscToINSDC,28 number augustusGene,153 cpgIslandExt,279 cpgIslandExt,286 cpgIslandExt,292 cpgIslandExt,337 cpgIslandExt,383 cpgIslandExt,387 cpgIslandExt,390 cpgIslandExtUnmasked,282 cpgIslandExtUnmasked,289 cpgIslandExtUnmasked,295 cpgIslandExtUnmasked,340 cpgIslandExtUnmasked,386 cpgIslandExtUnmasked,390 cpgIslandExtUnmasked,393 cpgIslandSuper,279 cpgIslandSuper,286 cpgIslandSuper,292 cpgIslandSuper,337 cpgIslandSuper,383 cpgIslandSuper,387 cpgIslandSuper,390 rmsk,233 transMapEnsemblV5,427 transMapEnsemblV5,550 transMapEstV5,396 transMapEstV5,519 transMapRefSeqV5,396 transMapRefSeqV5,519 transMapRnaV5,396 transMapRnaV5,519 transMapV5,502 transMapV5,625 o refSeqComposite,1761 xenoRefGene,331 obs cpgIslandExt,380 cpgIslandExtUnmasked,383 cpgIslandSuper,380 observed cpgIslandExt,278 cpgIslandExt,364 cpgIslandExtUnmasked,281 cpgIslandExtUnmasked,367 cpgIslandSuper,278 cpgIslandSuper,364 uniprot,1114 obtain transMapEnsemblV5,652 transMapEstV5,621 transMapRefSeqV5,621 transMapRnaV5,621 transMapV5,727 uniprot,1803 obtained augustusGene,126 cpgIslandExt,562 cpgIslandExt,573 cpgIslandExtUnmasked,565 cpgIslandExtUnmasked,576 cpgIslandSuper,562 cpgIslandSuper,573 refSeqComposite,1486 refSeqComposite,1506 transMapEnsemblV5,157 transMapEnsemblV5,612 transMapEstV5,126 transMapEstV5,581 transMapRefSeqV5,126 transMapRefSeqV5,581 transMapRnaV5,126 transMapRnaV5,581 transMapV5,232 transMapV5,687 uniprot,1506 uniprot,1695 occasional refSeqComposite,63 occur simpleRepeat,36 oct augustusGene,334 of augustusGene,72 augustusGene,84 augustusGene,92 augustusGene,94 augustusGene,154 augustusGene,195 augustusGene,236 chainGalGal6,17 chainGalGal6,64 chainGalGal6,182 chainGalGal6,202 chainGalGal6,255 chainGalGal6,277 chainGalGal6,360 chainGalGal6,370 chainGalGal6,488 chainGalGal6,508 chainGalGal6,643 chainGalGal6,648 chainGalGal6,666 chainGalGal6,686 chainGalGal6,886 chainGalGal6,961 chainGalGal6,983 chainGalGal6,1007 chainGalGal6,1021 chainNetGalGal6,20 chainNetGalGal6,67 chainNetGalGal6,185 chainNetGalGal6,205 chainNetGalGal6,258 chainNetGalGal6,280 chainNetGalGal6,363 chainNetGalGal6,373 chainNetGalGal6,491 chainNetGalGal6,511 chainNetGalGal6,646 chainNetGalGal6,651 chainNetGalGal6,669 chainNetGalGal6,689 chainNetGalGal6,889 chainNetGalGal6,964 chainNetGalGal6,986 chainNetGalGal6,1010 chainNetGalGal6,1024 chainNetXenTro7,23 chainNetXenTro7,70 chainNetXenTro7,192 chainNetXenTro7,212 chainNetXenTro7,265 chainNetXenTro7,288 chainNetXenTro7,373 chainNetXenTro7,383 chainNetXenTro7,501 chainNetXenTro7,521 chainNetXenTro7,658 chainNetXenTro7,663 chainNetXenTro7,681 chainNetXenTro7,701 chainNetXenTro7,901 chainNetXenTro7,976 chainNetXenTro7,998 chainNetXenTro7,1022 chainNetXenTro7,1036 chainNetXenTro9,22 chainNetXenTro9,69 chainNetXenTro9,190 chainNetXenTro9,210 chainNetXenTro9,263 chainNetXenTro9,286 chainNetXenTro9,370 chainNetXenTro9,380 chainNetXenTro9,498 chainNetXenTro9,518 chainNetXenTro9,655 chainNetXenTro9,660 chainNetXenTro9,678 chainNetXenTro9,698 chainNetXenTro9,898 chainNetXenTro9,973 chainNetXenTro9,995 chainNetXenTro9,1019 chainNetXenTro9,1033 chainXenTro7,20 chainXenTro7,67 chainXenTro7,189 chainXenTro7,209 chainXenTro7,262 chainXenTro7,285 chainXenTro7,370 chainXenTro7,380 chainXenTro7,498 chainXenTro7,518 chainXenTro7,655 chainXenTro7,660 chainXenTro7,678 chainXenTro7,698 chainXenTro7,898 chainXenTro7,973 chainXenTro7,995 chainXenTro7,1019 chainXenTro7,1033 chainXenTro9,19 chainXenTro9,66 chainXenTro9,187 chainXenTro9,207 chainXenTro9,260 chainXenTro9,283 chainXenTro9,367 chainXenTro9,377 chainXenTro9,495 chainXenTro9,515 chainXenTro9,652 chainXenTro9,657 chainXenTro9,675 chainXenTro9,695 chainXenTro9,895 chainXenTro9,970 chainXenTro9,992 chainXenTro9,1016 chainXenTro9,1030 cpgIslandExt,91 cpgIslandExt,108 cpgIslandExt,144 cpgIslandExt,171 cpgIslandExt,200 cpgIslandExt,221 cpgIslandExt,264 cpgIslandExt,277 cpgIslandExt,280 cpgIslandExt,290 cpgIslandExt,293 cpgIslandExt,312 cpgIslandExt,338 cpgIslandExt,350 cpgIslandExt,363 cpgIslandExt,384 cpgIslandExt,388 cpgIslandExt,391 cpgIslandExt,396 cpgIslandExt,400 cpgIslandExt,592 cpgIslandExtUnmasked,94 cpgIslandExtUnmasked,111 cpgIslandExtUnmasked,147 cpgIslandExtUnmasked,174 cpgIslandExtUnmasked,203 cpgIslandExtUnmasked,224 cpgIslandExtUnmasked,267 cpgIslandExtUnmasked,280 cpgIslandExtUnmasked,283 cpgIslandExtUnmasked,293 cpgIslandExtUnmasked,296 cpgIslandExtUnmasked,315 cpgIslandExtUnmasked,341 cpgIslandExtUnmasked,353 cpgIslandExtUnmasked,366 cpgIslandExtUnmasked,387 cpgIslandExtUnmasked,391 cpgIslandExtUnmasked,394 cpgIslandExtUnmasked,399 cpgIslandExtUnmasked,403 cpgIslandExtUnmasked,595 cpgIslandSuper,91 cpgIslandSuper,108 cpgIslandSuper,144 cpgIslandSuper,171 cpgIslandSuper,200 cpgIslandSuper,221 cpgIslandSuper,264 cpgIslandSuper,277 cpgIslandSuper,280 cpgIslandSuper,290 cpgIslandSuper,293 cpgIslandSuper,312 cpgIslandSuper,338 cpgIslandSuper,350 cpgIslandSuper,363 cpgIslandSuper,384 cpgIslandSuper,388 cpgIslandSuper,391 cpgIslandSuper,396 cpgIslandSuper,400 cpgIslandSuper,592 gap,41 gap,64 gap,83 gap,89 gap,123 gc5BaseBw,19 gc5BaseBw,46 gc5BaseBw,52 gc5BaseBw,67 gc5BaseBw,76 genscan,43 genscan,110 genscan,134 genscan,212 gold,43 gold,63 gold,89 gold,114 gold,144 microsat,27 microsat,55 microsat,64 microsat,81 ncbiRefSeqPsl,5 nestedRepeats,4 nestedRepeats,20 nestedRepeats,27 nestedRepeats,48 nestedRepeats,83 nestedRepeats,93 nestedRepeats,108 nestedRepeats,189 nestedRepeats,195 nestedRepeats,203 nestedRepeats,228 nestedRepeats,252 nestedRepeats,350 nestedRepeats,365 nestedRepeats,378 nestedRepeats,399 netGalGal6,17 netGalGal6,64 netGalGal6,182 netGalGal6,202 netGalGal6,255 netGalGal6,277 netGalGal6,360 netGalGal6,370 netGalGal6,488 netGalGal6,508 netGalGal6,643 netGalGal6,648 netGalGal6,666 netGalGal6,686 netGalGal6,886 netGalGal6,961 netGalGal6,983 netGalGal6,1007 netGalGal6,1021 netXenTro7,20 netXenTro7,67 netXenTro7,189 netXenTro7,209 netXenTro7,262 netXenTro7,285 netXenTro7,370 netXenTro7,380 netXenTro7,498 netXenTro7,518 netXenTro7,655 netXenTro7,660 netXenTro7,678 netXenTro7,698 netXenTro7,898 netXenTro7,973 netXenTro7,995 netXenTro7,1019 netXenTro7,1033 netXenTro9,19 netXenTro9,66 netXenTro9,187 netXenTro9,207 netXenTro9,260 netXenTro9,283 netXenTro9,367 netXenTro9,377 netXenTro9,495 netXenTro9,515 netXenTro9,652 netXenTro9,657 netXenTro9,675 netXenTro9,695 netXenTro9,895 netXenTro9,970 netXenTro9,992 netXenTro9,1016 netXenTro9,1030 refSeqComposite,162 refSeqComposite,195 refSeqComposite,213 refSeqComposite,260 refSeqComposite,321 refSeqComposite,343 refSeqComposite,437 refSeqComposite,489 refSeqComposite,521 refSeqComposite,528 refSeqComposite,554 refSeqComposite,612 refSeqComposite,632 refSeqComposite,710 refSeqComposite,738 refSeqComposite,787 refSeqComposite,796 refSeqComposite,876 refSeqComposite,891 refSeqComposite,943 refSeqComposite,989 refSeqComposite,1007 refSeqComposite,1055 refSeqComposite,1243 refSeqComposite,1275 refSeqComposite,1348 refSeqComposite,1429 refSeqComposite,1431 refSeqComposite,1501 refSeqComposite,1571 refSeqComposite,1651 refSeqComposite,1697 refSeqComposite,1701 refSeqComposite,1807 rmsk,39 rmsk,59 rmsk,84 rmsk,151 rmsk,206 rmsk,216 rmsk,234 rmsk,246 rmsk,264 rmsk,373 rmsk,388 rmsk,401 rmsk,422 simpleRepeat,40 transMapEnsemblV5,85 transMapEnsemblV5,140 transMapEnsemblV5,169 transMapEnsemblV5,209 transMapEnsemblV5,275 transMapEnsemblV5,282 transMapEnsemblV5,298 transMapEnsemblV5,310 transMapEnsemblV5,323 transMapEnsemblV5,341 transMapEnsemblV5,360 transMapEnsemblV5,378 transMapEnsemblV5,457 transMapEnsemblV5,508 transMapEnsemblV5,551 transMapEnsemblV5,739 transMapEnsemblV5,804 transMapEstV5,54 transMapEstV5,109 transMapEstV5,138 transMapEstV5,178 transMapEstV5,244 transMapEstV5,251 transMapEstV5,267 transMapEstV5,279 transMapEstV5,292 transMapEstV5,310 transMapEstV5,329 transMapEstV5,347 transMapEstV5,426 transMapEstV5,477 transMapEstV5,520 transMapEstV5,708 transMapEstV5,773 transMapRefSeqV5,54 transMapRefSeqV5,109 transMapRefSeqV5,138 transMapRefSeqV5,178 transMapRefSeqV5,244 transMapRefSeqV5,251 transMapRefSeqV5,267 transMapRefSeqV5,279 transMapRefSeqV5,292 transMapRefSeqV5,310 transMapRefSeqV5,329 transMapRefSeqV5,347 transMapRefSeqV5,426 transMapRefSeqV5,477 transMapRefSeqV5,520 transMapRefSeqV5,708 transMapRefSeqV5,773 transMapRnaV5,54 transMapRnaV5,109 transMapRnaV5,138 transMapRnaV5,178 transMapRnaV5,244 transMapRnaV5,251 transMapRnaV5,267 transMapRnaV5,279 transMapRnaV5,292 transMapRnaV5,310 transMapRnaV5,329 transMapRnaV5,347 transMapRnaV5,426 transMapRnaV5,477 transMapRnaV5,520 transMapRnaV5,708 transMapRnaV5,773 transMapV5,55 transMapV5,215 transMapV5,244 transMapV5,284 transMapV5,350 transMapV5,357 transMapV5,373 transMapV5,385 transMapV5,398 transMapV5,416 transMapV5,435 transMapV5,453 transMapV5,532 transMapV5,583 transMapV5,626 transMapV5,814 transMapV5,879 unipAliSwissprot,5 unipAliTrembl,5 unipInterest,4 uniprot,83 uniprot,269 uniprot,298 uniprot,310 uniprot,385 uniprot,407 uniprot,420 uniprot,452 uniprot,465 uniprot,542 uniprot,561 uniprot,652 uniprot,677 uniprot,877 uniprot,902 uniprot,980 uniprot,1111 uniprot,1125 uniprot,1159 uniprot,1166 uniprot,1181 uniprot,1288 uniprot,1298 uniprot,1306 uniprot,1315 uniprot,1347 uniprot,1360 uniprot,1363 uniprot,1397 uniprot,1436 uniprot,1457 uniprot,1590 uniprot,1594 uniprot,1639 uniprot,1646 uniprot,1656 uniprot,1666 uniprot,1684 uniprot,1687 uniprot,1710 uniprot,1951 xenoRefGene,63 xenoRefGene,82 xenoRefGene,96 xenoRefGene,121 xenoRefGene,233 xenoRefGene,265 xenoRefGene,377 off chainGalGal6,339 chainGalGal6,345 chainNetGalGal6,342 chainNetGalGal6,348 chainNetXenTro7,352 chainNetXenTro7,358 chainNetXenTro9,349 chainNetXenTro9,355 chainXenTro7,349 chainXenTro7,355 chainXenTro9,346 chainXenTro9,352 netGalGal6,339 netGalGal6,345 netXenTro7,349 netXenTro7,355 netXenTro9,346 netXenTro9,352 refSeqComposite,810 xenoRefGene,134 offers genscan,79 often chainGalGal6,213 chainGalGal6,225 chainNetGalGal6,216 chainNetGalGal6,228 chainNetXenTro7,223 chainNetXenTro7,235 chainNetXenTro9,221 chainNetXenTro9,233 chainXenTro7,220 chainXenTro7,232 chainXenTro9,218 chainXenTro9,230 netGalGal6,213 netGalGal6,225 netXenTro7,220 netXenTro7,232 netXenTro9,218 netXenTro9,230 older uniprot,1560 uniprot,1647 omim refSeqComposite,784 refSeqComposite,803 omitted nestedRepeats,165 on augustusGene,29 augustusGene,37 augustusGene,151 chainGalGal6,327 chainGalGal6,353 chainGalGal6,456 chainGalGal6,470 chainGalGal6,520 chainGalGal6,525 chainGalGal6,540 chainGalGal6,773 chainNetGalGal6,330 chainNetGalGal6,356 chainNetGalGal6,459 chainNetGalGal6,473 chainNetGalGal6,523 chainNetGalGal6,528 chainNetGalGal6,543 chainNetGalGal6,776 chainNetXenTro7,340 chainNetXenTro7,366 chainNetXenTro7,469 chainNetXenTro7,483 chainNetXenTro7,533 chainNetXenTro7,538 chainNetXenTro7,553 chainNetXenTro7,788 chainNetXenTro9,337 chainNetXenTro9,363 chainNetXenTro9,466 chainNetXenTro9,480 chainNetXenTro9,530 chainNetXenTro9,535 chainNetXenTro9,550 chainNetXenTro9,785 chainXenTro7,337 chainXenTro7,363 chainXenTro7,466 chainXenTro7,480 chainXenTro7,530 chainXenTro7,535 chainXenTro7,550 chainXenTro7,785 chainXenTro9,334 chainXenTro9,360 chainXenTro9,463 chainXenTro9,477 chainXenTro9,527 chainXenTro9,532 chainXenTro9,547 chainXenTro9,782 cpgIslandExt,287 cpgIslandExt,323 cpgIslandExt,544 cpgIslandExt,551 cpgIslandExtUnmasked,5 cpgIslandExtUnmasked,290 cpgIslandExtUnmasked,326 cpgIslandExtUnmasked,547 cpgIslandExtUnmasked,554 cpgIslandSuper,287 cpgIslandSuper,323 cpgIslandSuper,544 cpgIslandSuper,551 gap,86 genscan,27 genscan,52 nestedRepeats,141 nestedRepeats,176 nestedRepeats,277 netGalGal6,327 netGalGal6,353 netGalGal6,456 netGalGal6,470 netGalGal6,520 netGalGal6,525 netGalGal6,540 netGalGal6,773 netXenTro7,337 netXenTro7,363 netXenTro7,466 netXenTro7,480 netXenTro7,530 netXenTro7,535 netXenTro7,550 netXenTro7,785 netXenTro9,334 netXenTro9,360 netXenTro9,463 netXenTro9,477 netXenTro9,527 netXenTro9,532 netXenTro9,547 netXenTro9,782 refSeqComposite,132 refSeqComposite,182 refSeqComposite,239 refSeqComposite,253 refSeqComposite,361 refSeqComposite,517 refSeqComposite,570 refSeqComposite,976 refSeqComposite,1120 refSeqComposite,1601 refSeqComposite,1643 refSeqComposite,1681 refSeqComposite,1706 refSeqComposite,1775 rmsk,74 transMapEnsemblV5,570 transMapEnsemblV5,807 transMapEstV5,539 transMapEstV5,776 transMapRefSeqV5,539 transMapRefSeqV5,776 transMapRnaV5,539 transMapRnaV5,776 transMapV5,103 transMapV5,645 transMapV5,882 uniprot,19 uniprot,61 uniprot,129 uniprot,172 uniprot,232 uniprot,443 uniprot,482 uniprot,648 uniprot,728 uniprot,772 uniprot,809 uniprot,859 uniprot,1035 uniprot,1139 uniprot,1176 uniprot,1366 uniprot,1446 uniprot,1534 uniprot,1558 uniprot,1567 uniprot,1581 uniprot,1605 uniprot,1887 uniprot,2039 xenoRefGene,345 once uniprot,647 one augustusGene,169 chainGalGal6,190 chainGalGal6,361 chainGalGal6,507 chainGalGal6,800 chainGalGal6,896 chainNetGalGal6,193 chainNetGalGal6,364 chainNetGalGal6,510 chainNetGalGal6,803 chainNetGalGal6,899 chainNetXenTro7,200 chainNetXenTro7,374 chainNetXenTro7,520 chainNetXenTro7,815 chainNetXenTro7,911 chainNetXenTro9,198 chainNetXenTro9,371 chainNetXenTro9,517 chainNetXenTro9,812 chainNetXenTro9,908 chainXenTro7,197 chainXenTro7,371 chainXenTro7,517 chainXenTro7,812 chainXenTro7,908 chainXenTro9,195 chainXenTro9,368 chainXenTro9,514 chainXenTro9,809 chainXenTro9,905 cpgIslandExt,233 cpgIslandExtUnmasked,236 cpgIslandSuper,233 netGalGal6,190 netGalGal6,361 netGalGal6,507 netGalGal6,800 netGalGal6,896 netXenTro7,197 netXenTro7,371 netXenTro7,517 netXenTro7,812 netXenTro7,908 netXenTro9,195 netXenTro9,368 netXenTro9,514 netXenTro9,809 netXenTro9,905 transMapV5,78 uniprot,74 uniprot,77 uniprot,155 uniprot,981 uniprot,1098 uniprot,1638 ones transMapEnsemblV5,50 uniprot,1041 ongoing uniprot,1569 only chainGalGal6,357 chainNetGalGal6,360 chainNetXenTro7,370 chainNetXenTro9,367 chainXenTro7,367 chainXenTro9,364 cpgIslandExt,196 cpgIslandExtUnmasked,199 cpgIslandSuper,196 microsat,61 netGalGal6,357 netXenTro7,367 netXenTro9,364 refSeqComposite,158 refSeqComposite,218 refSeqComposite,235 refSeqComposite,247 refSeqComposite,516 refSeqComposite,568 refSeqComposite,1266 refSeqComposite,1538 transMapEnsemblV5,49 transMapEnsemblV5,653 transMapEstV5,622 transMapRefSeqV5,622 transMapRnaV5,622 transMapV5,728 uniprot,645 uniprot,975 uniprot,1178 uniprot,1302 uniprot,1804 xenoRefGene,210 xenoRefGene,256 oommen transMapEnsemblV5,731 transMapEstV5,700 transMapRefSeqV5,700 transMapRnaV5,700 transMapV5,806 open-3.0 nestedRepeats,331 rmsk,354 opin nestedRepeats,385 nestedRepeats,407 rmsk,408 rmsk,430 opposite chainGalGal6,552 chainNetGalGal6,555 chainNetXenTro7,565 chainNetXenTro9,562 chainXenTro7,562 chainXenTro9,559 netGalGal6,552 netXenTro7,562 netXenTro9,559 option augustusGene,167 augustusGene,187 genscan,94 refSeqComposite,777 refSeqComposite,842 transMapEnsemblV5,135 transMapEstV5,104 transMapRefSeqV5,104 transMapRnaV5,104 transMapV5,210 xenoRefGene,114 xenoRefGene,166 optional refSeqComposite,820 xenoRefGene,144 options gc5BaseBw,70 genscan,85 or chainGalGal6,30 chainGalGal6,129 chainGalGal6,152 chainGalGal6,185 chainGalGal6,491 chainGalGal6,868 chainGalGal6,897 chainNetGalGal6,33 chainNetGalGal6,132 chainNetGalGal6,155 chainNetGalGal6,188 chainNetGalGal6,494 chainNetGalGal6,871 chainNetGalGal6,900 chainNetXenTro7,36 chainNetXenTro7,138 chainNetXenTro7,162 chainNetXenTro7,195 chainNetXenTro7,504 chainNetXenTro7,883 chainNetXenTro7,912 chainNetXenTro9,35 chainNetXenTro9,136 chainNetXenTro9,160 chainNetXenTro9,193 chainNetXenTro9,501 chainNetXenTro9,880 chainNetXenTro9,909 chainXenTro7,33 chainXenTro7,135 chainXenTro7,159 chainXenTro7,192 chainXenTro7,501 chainXenTro7,880 chainXenTro7,909 chainXenTro9,32 chainXenTro9,133 chainXenTro9,157 chainXenTro9,190 chainXenTro9,498 chainXenTro9,877 chainXenTro9,906 cpgIslandExt,127 cpgIslandExt,266 cpgIslandExt,523 cpgIslandExtUnmasked,130 cpgIslandExtUnmasked,269 cpgIslandExtUnmasked,526 cpgIslandSuper,127 cpgIslandSuper,266 cpgIslandSuper,523 ncbiRefSeqOther,13 ncbiRefSeqPredicted,9 nestedRepeats,96 nestedRepeats,117 nestedRepeats,158 netGalGal6,30 netGalGal6,129 netGalGal6,152 netGalGal6,185 netGalGal6,491 netGalGal6,868 netGalGal6,897 netXenTro7,33 netXenTro7,135 netXenTro7,159 netXenTro7,192 netXenTro7,501 netXenTro7,880 netXenTro7,909 netXenTro9,32 netXenTro9,133 netXenTro9,157 netXenTro9,190 netXenTro9,498 netXenTro9,877 netXenTro9,906 refSeqComposite,86 refSeqComposite,122 refSeqComposite,228 refSeqComposite,280 refSeqComposite,355 refSeqComposite,401 refSeqComposite,410 refSeqComposite,416 refSeqComposite,425 refSeqComposite,623 refSeqComposite,644 refSeqComposite,692 refSeqComposite,783 refSeqComposite,793 refSeqComposite,808 refSeqComposite,952 refSeqComposite,974 refSeqComposite,1053 refSeqComposite,1315 refSeqComposite,1330 refSeqComposite,1497 refSeqComposite,1519 rmsk,251 rmsk,280 transMapEnsemblV5,19 transMapEnsemblV5,534 transMapEnsemblV5,562 transMapEnsemblV5,605 transMapEnsemblV5,625 transMapEstV5,503 transMapEstV5,531 transMapEstV5,574 transMapEstV5,594 transMapRefSeqV5,503 transMapRefSeqV5,531 transMapRefSeqV5,574 transMapRefSeqV5,594 transMapRnaV5,503 transMapRnaV5,531 transMapRnaV5,574 transMapRnaV5,594 transMapV5,47 transMapV5,609 transMapV5,637 transMapV5,680 transMapV5,700 uniprot,317 uniprot,389 uniprot,436 uniprot,829 uniprot,888 uniprot,982 uniprot,1038 uniprot,1205 uniprot,1266 uniprot,1401 uniprot,1449 uniprot,1722 uniprot,1776 uniprot,1835 uniprot,1879 xenoRefGene,132 order gap,80 gold,111 uniprot,872 organism chainGalGal6,336 chainGalGal6,366 chainNetGalGal6,339 chainNetGalGal6,369 chainNetXenTro7,349 chainNetXenTro7,379 chainNetXenTro9,346 chainNetXenTro9,376 chainXenTro7,346 chainXenTro7,376 chainXenTro9,343 chainXenTro9,373 netGalGal6,336 netGalGal6,366 netXenTro7,346 netXenTro7,376 netXenTro9,343 netXenTro9,373 organisms chainGalGal6,913 chainNetGalGal6,916 chainNetXenTro7,928 chainNetXenTro9,925 chainXenTro7,925 chainXenTro9,922 nestedRepeats,295 netGalGal6,913 netXenTro7,925 netXenTro9,922 rmsk,302 transMapEnsemblV5,160 transMapEnsemblV5,218 transMapEstV5,129 transMapEstV5,187 transMapRefSeqV5,129 transMapRefSeqV5,187 transMapRnaV5,129 transMapRnaV5,187 transMapV5,65 transMapV5,153 transMapV5,235 transMapV5,293 uniprot,998 xenoRefGene,21 organized refSeqComposite,1378 organizes chainGalGal6,621 chainNetGalGal6,624 chainNetXenTro7,635 chainNetXenTro9,632 chainXenTro7,632 chainXenTro9,629 netGalGal6,621 netXenTro7,632 netXenTro9,629 orientation chainGalGal6,553 chainNetGalGal6,556 chainNetXenTro7,566 chainNetXenTro9,563 chainXenTro7,563 chainXenTro9,560 cytoBandIdeo,6 gap,82 gold,113 netGalGal6,553 netXenTro7,563 netXenTro9,560 origin nestedRepeats,398 rmsk,421 original nestedRepeats,84 orthologous transMapEnsemblV5,87 transMapEstV5,56 transMapRefSeqV5,56 transMapRnaV5,56 transMapV5,57 orthologs chainGalGal6,290 chainNetGalGal6,293 chainNetXenTro7,301 chainNetXenTro9,299 chainXenTro7,298 chainXenTro9,296 netGalGal6,290 netXenTro7,298 netXenTro9,296 transMapV5,95 other augustusGene,208 chainGalGal6,24 chainGalGal6,418 chainGalGal6,511 chainNetGalGal6,27 chainNetGalGal6,421 chainNetGalGal6,514 chainNetXenTro7,30 chainNetXenTro7,431 chainNetXenTro7,524 chainNetXenTro9,29 chainNetXenTro9,428 chainNetXenTro9,521 chainXenTro7,27 chainXenTro7,428 chainXenTro7,521 chainXenTro9,26 chainXenTro9,425 chainXenTro9,518 cpgIslandExt,135 cpgIslandExtUnmasked,138 cpgIslandSuper,135 ncbiRefSeqOther,2 ncbiRefSeqOther,5 nestedRepeats,376 netGalGal6,24 netGalGal6,418 netGalGal6,511 netXenTro7,27 netXenTro7,428 netXenTro7,521 netXenTro9,26 netXenTro9,425 netXenTro9,518 refSeqComposite,275 refSeqComposite,379 refSeqComposite,382 refSeqComposite,1372 refSeqComposite,1398 rmsk,195 rmsk,399 transMapEnsemblV5,30 transMapEnsemblV5,46 transMapEnsemblV5,371 transMapEstV5,28 transMapEstV5,340 transMapRefSeqV5,28 transMapRefSeqV5,340 transMapRnaV5,28 transMapRnaV5,340 transMapV5,27 transMapV5,446 unipOther,1 unipOther,4 uniprot,90 uniprot,122 uniprot,205 uniprot,319 uniprot,393 uniprot,396 uniprot,862 uniprot,1200 xenoRefGene,1 xenoRefGene,22 others cpgIslandExt,247 cpgIslandExtUnmasked,250 cpgIslandSuper,247 nestedRepeats,214 uniprot,1312 uniprot,1344 otherwise cpgIslandExt,185 cpgIslandExtUnmasked,188 cpgIslandSuper,185 transMapEnsemblV5,248 transMapEstV5,217 transMapRefSeqV5,217 transMapRnaV5,217 transMapV5,323 ouml augustusGene,269 our augustusGene,43 cpgIslandExt,536 cpgIslandExt,545 cpgIslandExt,552 cpgIslandExtUnmasked,539 cpgIslandExtUnmasked,548 cpgIslandExtUnmasked,555 cpgIslandSuper,536 cpgIslandSuper,545 cpgIslandSuper,552 genscan,58 refSeqComposite,138 refSeqComposite,1326 refSeqComposite,1333 refSeqComposite,1349 refSeqComposite,1364 refSeqComposite,1488 refSeqComposite,1508 refSeqComposite,1629 refSeqComposite,1682 refSeqComposite,1689 refSeqComposite,1707 rmsk,124 rmsk,129 transMapEnsemblV5,559 transMapEnsemblV5,565 transMapEnsemblV5,575 transMapEnsemblV5,614 transMapEstV5,528 transMapEstV5,534 transMapEstV5,544 transMapEstV5,583 transMapRefSeqV5,528 transMapRefSeqV5,534 transMapRefSeqV5,544 transMapRefSeqV5,583 transMapRnaV5,528 transMapRnaV5,534 transMapRnaV5,544 transMapRnaV5,583 transMapV5,634 transMapV5,640 transMapV5,650 transMapV5,689 uniprot,891 uniprot,1697 uniprot,1765 uniprot,1829 uniprot,1836 uniprot,1870 uniprot,1874 out chainGalGal6,642 chainNetGalGal6,645 chainNetXenTro7,657 chainNetXenTro9,654 chainXenTro7,654 chainXenTro9,651 netGalGal6,642 netXenTro7,654 netXenTro9,651 output cpgIslandExt,499 cpgIslandExtUnmasked,502 cpgIslandSuper,499 nestedRepeats,26 nestedRepeats,110 windowmaskerSdust,63 windowmaskerSdust,72 outputs rmsk,35 outside refSeqComposite,690 uniprot,558 over chainGalGal6,198 chainGalGal6,657 chainNetGalGal6,201 chainNetGalGal6,660 chainNetXenTro7,208 chainNetXenTro7,672 chainNetXenTro9,206 chainNetXenTro9,669 chainXenTro7,205 chainXenTro7,669 chainXenTro9,203 chainXenTro9,666 cpgIslandExt,97 cpgIslandExtUnmasked,100 cpgIslandSuper,97 netGalGal6,198 netGalGal6,657 netXenTro7,205 netXenTro7,669 netXenTro9,203 netXenTro9,666 refSeqComposite,1035 uniprot,522 uniprot,536 overlapping chainGalGal6,114 chainGalGal6,178 chainNetGalGal6,117 chainNetGalGal6,181 chainNetXenTro7,123 chainNetXenTro7,188 chainNetXenTro9,121 chainNetXenTro9,186 chainXenTro7,120 chainXenTro7,185 chainXenTro9,118 chainXenTro9,183 netGalGal6,114 netGalGal6,178 netXenTro7,120 netXenTro7,185 netXenTro9,118 netXenTro9,183 own uniprot,724 p genscan,205 nestedRepeats,329 rmsk,352 pac chainGalGal6,1041 chainNetGalGal6,1044 chainNetXenTro7,1056 chainNetXenTro9,1053 chainXenTro7,1053 chainXenTro9,1050 netGalGal6,1041 netXenTro7,1053 netXenTro9,1050 pack chainGalGal6,235 chainNetGalGal6,238 chainNetXenTro7,245 chainNetXenTro9,243 chainXenTro7,242 chainXenTro9,240 nestedRepeats,116 netGalGal6,235 netXenTro7,242 netXenTro9,240 page cpgIslandExt,223 cpgIslandExt,547 cpgIslandExtUnmasked,226 cpgIslandExtUnmasked,550 cpgIslandSuper,223 cpgIslandSuper,547 genscan,78 genscan,123 refSeqComposite,114 refSeqComposite,742 refSeqComposite,867 refSeqComposite,1127 refSeqComposite,1646 rmsk,77 uniprot,236 uniprot,651 uniprot,1158 uniprot,1585 uniprot,2027 xenoRefGene,100 xenoRefGene,191 pages chainGalGal6,778 chainNetGalGal6,781 chainNetXenTro7,793 chainNetXenTro9,790 chainXenTro7,790 chainXenTro9,787 netGalGal6,778 netXenTro7,790 netXenTro9,787 pair gap,96 pairwise chainGalGal6,1019 chainGalGal6,1037 chainNetGalGal6,1022 chainNetGalGal6,1040 chainNetXenTro7,1034 chainNetXenTro7,1052 chainNetXenTro9,1031 chainNetXenTro9,1049 chainXenTro7,1031 chainXenTro7,1049 chainXenTro9,1028 chainXenTro9,1046 netGalGal6,1019 netGalGal6,1037 netXenTro7,1031 netXenTro7,1049 netXenTro9,1028 netXenTro9,1046 transMapEnsemblV5,339 transMapEstV5,308 transMapRefSeqV5,308 transMapRnaV5,308 transMapV5,84 transMapV5,414 paralogous transMapEnsemblV5,302 transMapEstV5,271 transMapRefSeqV5,271 transMapRnaV5,271 transMapV5,377 paralogs chainGalGal6,228 chainNetGalGal6,231 chainNetXenTro7,238 chainNetXenTro9,236 chainXenTro7,235 chainXenTro9,233 netGalGal6,228 netXenTro7,235 netXenTro9,233 transMapV5,161 parameters windowmaskerSdust,57 parent cpgIslandExt,83 cpgIslandExtUnmasked,86 cpgIslandSuper,83 parentheses gold,148 part chainGalGal6,276 chainNetGalGal6,279 chainNetXenTro7,287 chainNetXenTro9,285 chainXenTro7,284 chainXenTro9,282 netGalGal6,276 netXenTro7,284 netXenTro9,282 refSeqComposite,527 particular augustusGene,234 chainGalGal6,200 chainNetGalGal6,203 chainNetXenTro7,210 chainNetXenTro9,208 chainXenTro7,207 chainXenTro9,205 netGalGal6,200 netXenTro7,207 netXenTro9,205 refSeqComposite,297 uniprot,1019 particularly cpgIslandExt,21 cpgIslandExtUnmasked,24 cpgIslandSuper,21 parts chainGalGal6,39 chainGalGal6,50 chainNetGalGal6,42 chainNetGalGal6,53 chainNetXenTro7,45 chainNetXenTro7,56 chainNetXenTro9,44 chainNetXenTro9,55 chainXenTro7,42 chainXenTro7,53 chainXenTro9,41 chainXenTro9,52 netGalGal6,39 netGalGal6,50 netXenTro7,42 netXenTro7,53 netXenTro9,41 netXenTro9,52 past uniprot,1690 patch uniprot,1423 patches uniprot,1432 patterns augustusGene,56 pennsylvania chainGalGal6,924 chainGalGal6,1027 chainNetGalGal6,927 chainNetGalGal6,1030 chainNetXenTro7,939 chainNetXenTro7,1042 chainNetXenTro9,936 chainNetXenTro9,1039 chainXenTro7,936 chainXenTro7,1039 chainXenTro9,933 chainXenTro9,1036 netGalGal6,924 netGalGal6,1027 netXenTro7,936 netXenTro7,1039 netXenTro9,933 netXenTro9,1036 peptide unipLocSignal,2 uniprot,477 uniprot,565 peptides unipLocSignal,5 uniprot,239 uniprot,512 percent gc5BaseBw,2 gc5BaseBw,4 gc5BaseBw,14 percentage cpgIslandExt,345 cpgIslandExtUnmasked,348 cpgIslandSuper,345 gc5BaseBw,18 perfect microsat,31 performed cpgIslandExt,405 cpgIslandExtUnmasked,408 cpgIslandSuper,405 perhaps cpgIslandExt,137 cpgIslandExtUnmasked,140 cpgIslandSuper,137 period microsat,65 permitted rmsk,314 ph.d chainGalGal6,1024 chainNetGalGal6,1027 chainNetXenTro7,1039 chainNetXenTro9,1036 chainXenTro7,1036 chainXenTro9,1033 netGalGal6,1024 netXenTro7,1036 netXenTro9,1033 pharmaceuticals uniprot,1969 phenotype uniprot,432 phosphorylation uniprot,590 phylofit transMapEnsemblV5,230 transMapEstV5,199 transMapRefSeqV5,199 transMapRnaV5,199 transMapV5,305 pia uniprot,1971 pick uniprot,1089 pipeline refSeqComposite,1193 uniprot,1537 pipelines uniprot,1850 place chainGalGal6,797 chainNetGalGal6,800 chainNetXenTro7,812 chainNetXenTro9,809 chainXenTro7,809 chainXenTro9,806 netGalGal6,797 netXenTro7,809 netXenTro9,806 placed chainGalGal6,839 chainNetGalGal6,842 chainNetXenTro7,854 chainNetXenTro9,851 chainXenTro7,851 chainXenTro9,848 netGalGal6,839 netXenTro7,851 netXenTro9,848 placement refSeqComposite,968 places refSeqComposite,1256 xenoRefGene,246 please refSeqComposite,103 refSeqComposite,1113 refSeqComposite,1686 uniprot,685 uniprot,1439 uniprot,1826 plos transMapEnsemblV5,811 transMapEstV5,780 transMapRefSeqV5,780 transMapRnaV5,780 transMapV5,886 plus refSeqComposite,902 pmc chainGalGal6,1086 chainGalGal6,1117 chainNetGalGal6,1089 chainNetGalGal6,1120 chainNetXenTro7,1101 chainNetXenTro7,1132 chainNetXenTro9,1098 chainNetXenTro9,1129 chainXenTro7,1098 chainXenTro7,1129 chainXenTro9,1095 chainXenTro9,1126 microsat,136 netGalGal6,1086 netGalGal6,1117 netXenTro7,1098 netXenTro7,1129 netXenTro9,1095 netXenTro9,1126 refSeqComposite,1748 refSeqComposite,1790 refSeqComposite,1824 simpleRepeat,96 transMapEnsemblV5,755 transMapEnsemblV5,821 transMapEstV5,724 transMapEstV5,790 transMapRefSeqV5,724 transMapRefSeqV5,790 transMapRnaV5,724 transMapRnaV5,790 transMapV5,830 transMapV5,896 uniprot,2008 xenoRefGene,318 xenoRefGene,360 xenoRefGene,394 pmc148217 microsat,137 simpleRepeat,97 pmc187518 refSeqComposite,1749 xenoRefGene,319 pmc208784 chainGalGal6,1087 chainNetGalGal6,1090 chainNetXenTro7,1102 chainNetXenTro9,1099 chainXenTro7,1099 chainXenTro9,1096 netGalGal6,1087 netXenTro7,1099 netXenTro9,1096 pmc2099585 transMapEnsemblV5,756 transMapEstV5,725 transMapRefSeqV5,725 transMapRnaV5,725 transMapV5,831 pmc2134963 transMapEnsemblV5,822 transMapEstV5,791 transMapRefSeqV5,791 transMapRnaV5,791 transMapV5,897 pmc3245120 uniprot,2009 pmc3965018 refSeqComposite,1791 xenoRefGene,361 pmc430961 chainGalGal6,1118 chainNetGalGal6,1121 chainNetXenTro7,1133 chainNetXenTro9,1130 chainXenTro7,1130 chainXenTro9,1127 netGalGal6,1118 netXenTro7,1130 netXenTro9,1127 pmc539979 refSeqComposite,1825 xenoRefGene,395 pmid augustusGene,314 augustusGene,339 chainGalGal6,1046 chainGalGal6,1084 chainGalGal6,1115 chainNetGalGal6,1049 chainNetGalGal6,1087 chainNetGalGal6,1118 chainNetXenTro7,1061 chainNetXenTro7,1099 chainNetXenTro7,1130 chainNetXenTro9,1058 chainNetXenTro9,1096 chainNetXenTro9,1127 chainXenTro7,1058 chainXenTro7,1096 chainXenTro7,1127 chainXenTro9,1055 chainXenTro9,1093 chainXenTro9,1124 cpgIslandExt,622 cpgIslandExtUnmasked,625 cpgIslandSuper,622 genscan,229 microsat,134 nestedRepeats,360 nestedRepeats,393 nestedRepeats,415 netGalGal6,1046 netGalGal6,1084 netGalGal6,1115 netXenTro7,1058 netXenTro7,1096 netXenTro7,1127 netXenTro9,1055 netXenTro9,1093 netXenTro9,1124 refSeqComposite,1746 refSeqComposite,1788 refSeqComposite,1822 rmsk,383 rmsk,416 rmsk,438 simpleRepeat,94 transMapEnsemblV5,753 transMapEnsemblV5,785 transMapEnsemblV5,819 transMapEstV5,722 transMapEstV5,754 transMapEstV5,788 transMapRefSeqV5,722 transMapRefSeqV5,754 transMapRefSeqV5,788 transMapRnaV5,722 transMapRnaV5,754 transMapRnaV5,788 transMapV5,828 transMapV5,860 transMapV5,894 uniprot,2006 uniprot,2050 windowmaskerSdust,113 xenoRefGene,316 xenoRefGene,358 xenoRefGene,392 point rmsk,269 poly-a augustusGene,62 polymorphic microsat,41 simpleRepeat,46 polypeptide unipChain,6 uniprot,287 uniprot,289 population microsat,44 position chainGalGal6,713 chainNetGalGal6,716 chainNetXenTro7,728 chainNetXenTro9,725 chainXenTro7,725 chainXenTro9,722 netGalGal6,713 netXenTro7,725 netXenTro9,722 refSeqComposite,987 uniprot,610 positions uniprot,1495 possible chainGalGal6,412 chainNetGalGal6,415 chainNetXenTro7,425 chainNetXenTro9,422 chainXenTro7,422 chainXenTro9,419 netGalGal6,412 netXenTro7,422 netXenTro9,419 refSeqComposite,186 uniprot,601 possibly chainGalGal6,289 chainNetGalGal6,292 chainNetXenTro7,300 chainNetXenTro9,298 chainXenTro7,297 chainXenTro9,295 netGalGal6,289 netXenTro7,297 netXenTro9,295 simpleRepeat,18 post-alignment transMapEnsemblV5,305 transMapEstV5,274 transMapRefSeqV5,274 transMapRnaV5,274 transMapV5,380 post-processing uniprot,295 potential cpgIslandExt,175 cpgIslandExtUnmasked,178 cpgIslandSuper,175 pre-mrna genscan,185 precompiled refSeqComposite,1523 transMapEnsemblV5,629 transMapEstV5,598 transMapRefSeqV5,598 transMapRnaV5,598 transMapV5,704 uniprot,1780 predicted cpgIslandExt,228 cpgIslandExtUnmasked,231 cpgIslandSuper,228 ncbiRefSeq,8 ncbiRefSeqPredicted,2 ncbiRefSeqPredicted,6 refSeqComposite,204 refSeqComposite,340 refSeqComposite,359 refSeqComposite,404 refSeqComposite,593 refSeqComposite,619 refSeqComposite,695 refSeqComposite,715 refSeqComposite,1416 refSeqComposite,1676 uniprot,48 uniprot,193 xenoRefGene,70 prediction augustusGene,321 genscan,73 genscan,211 refSeqComposite,376 refSeqComposite,604 transMapEnsemblV5,84 transMapEstV5,53 transMapRefSeqV5,53 transMapRnaV5,53 transMapV5,54 xenoRefGene,55 predictions augustusGene,6 augustusGene,11 augustusGene,18 augustusGene,26 augustusGene,191 genscan,5 genscan,9 genscan,14 genscan,24 genscan,112 genscan,118 ncbiRefSeq,18 ncbiRefSeqGenomicDiff,15 ncbiRefSeqOther,18 ncbiRefSeqPredicted,14 ncbiRefSeqPsl,10 refSeqComposite,10 refSeqComposite,833 refSeqComposite,862 transMapEnsemblV5,13 transMapEstV5,11 transMapRefSeqV5,12 transMapRnaV5,12 transMapV5,10 unipAliSwissprot,21 unipAliTrembl,13 unipChain,11 unipConflict,9 unipDisulfBond,9 unipDomain,7 unipInterest,9 unipLocCytopl,8 unipLocExtra,8 unipLocSignal,9 unipLocTransMemb,8 unipModif,10 unipMut,9 unipOther,9 unipRepeat,7 unipStruct,11 uniprot,10 xenoRefGene,10 xenoRefGene,157 xenoRefGene,186 prepared gc5BaseBw,80 ucscToINSDC,49 ucscToRefSeq,43 uniprot,712 present cpgIslandExt,154 cpgIslandExtUnmasked,157 cpgIslandSuper,154 rmsk,44 presentation gc5BaseBw,75 pressure cpgIslandExt,123 cpgIslandExtUnmasked,126 cpgIslandSuper,123 previous refSeqComposite,1224 refSeqComposite,1340 refSeqComposite,1695 uniprot,1654 previously chainGalGal6,917 chainNetGalGal6,920 chainNetXenTro7,932 chainNetXenTro9,929 chainXenTro7,929 chainXenTro9,926 netGalGal6,917 netXenTro7,929 netXenTro9,926 refSeqComposite,504 primary unipStruct,4 uniprot,360 principal gap,121 pringle transMapEnsemblV5,795 transMapEstV5,764 transMapRefSeqV5,764 transMapRnaV5,764 transMapV5,870 printf cpgIslandExt,435 cpgIslandExtUnmasked,438 cpgIslandSuper,435 problem uniprot,1359 uniprot,1389 proc chainGalGal6,1071 chainNetGalGal6,1074 chainNetXenTro7,1086 chainNetXenTro9,1083 chainXenTro7,1083 chainXenTro9,1080 netGalGal6,1071 netXenTro7,1083 netXenTro9,1080 procedure uniprot,990 procedures gap,23 gold,25 process chainGalGal6,821 chainNetGalGal6,824 chainNetXenTro7,836 chainNetXenTro9,833 chainXenTro7,833 chainXenTro9,830 netGalGal6,821 netXenTro7,833 netXenTro9,830 refSeqComposite,651 uniprot,321 uniprot,879 uniprot,905 uniprot,1229 uniprot,1448 processed chainGalGal6,216 chainNetGalGal6,219 chainNetXenTro7,226 chainNetXenTro9,224 chainXenTro7,223 chainXenTro9,221 netGalGal6,216 netXenTro7,223 netXenTro9,221 processing refSeqComposite,1338 produced refSeqComposite,384 refSeqComposite,1715 transMapEnsemblV5,22 transMapEnsemblV5,680 transMapEnsemblV5,704 transMapEstV5,20 transMapEstV5,649 transMapEstV5,673 transMapRefSeqV5,20 transMapRefSeqV5,649 transMapRefSeqV5,673 transMapRnaV5,20 transMapRnaV5,649 transMapRnaV5,673 transMapV5,19 transMapV5,142 transMapV5,755 transMapV5,779 xenoRefGene,284 produces refSeqComposite,49 products unipChain,5 program augustusGene,21 augustusGene,257 chainGalGal6,612 chainGalGal6,653 chainGalGal6,791 chainGalGal6,844 chainGalGal6,876 chainGalGal6,952 chainGalGal6,955 chainNetGalGal6,615 chainNetGalGal6,656 chainNetGalGal6,794 chainNetGalGal6,847 chainNetGalGal6,879 chainNetGalGal6,955 chainNetGalGal6,958 chainNetXenTro7,626 chainNetXenTro7,668 chainNetXenTro7,806 chainNetXenTro7,859 chainNetXenTro7,891 chainNetXenTro7,967 chainNetXenTro7,970 chainNetXenTro9,623 chainNetXenTro9,665 chainNetXenTro9,803 chainNetXenTro9,856 chainNetXenTro9,888 chainNetXenTro9,964 chainNetXenTro9,967 chainXenTro7,623 chainXenTro7,665 chainXenTro7,803 chainXenTro7,856 chainXenTro7,888 chainXenTro7,964 chainXenTro7,967 chainXenTro9,620 chainXenTro9,662 chainXenTro9,800 chainXenTro9,853 chainXenTro9,885 chainXenTro9,961 chainXenTro9,964 cpgIslandExt,559 cpgIslandExt,569 cpgIslandExt,594 cpgIslandExtUnmasked,562 cpgIslandExtUnmasked,572 cpgIslandExtUnmasked,597 cpgIslandSuper,559 cpgIslandSuper,569 cpgIslandSuper,594 genscan,18 genscan,137 genscan,178 microsat,100 microsat,120 nestedRepeats,30 netGalGal6,612 netGalGal6,653 netGalGal6,791 netGalGal6,844 netGalGal6,876 netGalGal6,952 netGalGal6,955 netXenTro7,623 netXenTro7,665 netXenTro7,803 netXenTro7,856 netXenTro7,888 netXenTro7,964 netXenTro7,967 netXenTro9,620 netXenTro9,662 netXenTro9,800 netXenTro9,853 netXenTro9,885 netXenTro9,961 netXenTro9,964 rmsk,20 rmsk,34 simpleRepeat,62 simpleRepeat,80 transMapEnsemblV5,315 transMapEstV5,284 transMapRefSeqV5,284 transMapRnaV5,284 transMapV5,390 uniprot,1529 programmatically refSeqComposite,1324 programs chainGalGal6,1001 chainNetGalGal6,1004 chainNetXenTro7,1016 chainNetXenTro9,1013 chainXenTro7,1013 chainXenTro9,1010 netGalGal6,1001 netXenTro7,1013 netXenTro9,1010 uniprot,1877 project refSeqComposite,1162 refSeqComposite,1730 xenoRefGene,301 projected uniprot,800 projection transMapEnsemblV5,57 transMapEnsemblV5,322 transMapEstV5,291 transMapRefSeqV5,291 transMapRnaV5,291 transMapV5,397 projects transMapEnsemblV5,712 transMapEstV5,681 transMapRefSeqV5,681 transMapRnaV5,681 transMapV5,787 promoter cpgIslandExt,40 cpgIslandExtUnmasked,43 cpgIslandSuper,40 pronounced uniprot,1392 proofreading cpgIslandExt,93 cpgIslandExtUnmasked,96 cpgIslandSuper,93 properties refSeqComposite,722 prot.bed uniprot,1931 uniprot,1933 protein refSeqComposite,269 refSeqComposite,362 unipChain,4 unipStruct,3 uniprot,5 uniprot,15 uniprot,84 uniprot,95 uniprot,111 uniprot,113 uniprot,137 uniprot,153 uniprot,194 uniprot,196 uniprot,252 uniprot,256 uniprot,267 uniprot,278 uniprot,293 uniprot,324 uniprot,359 uniprot,635 uniprot,672 uniprot,742 uniprot,760 uniprot,780 uniprot,790 uniprot,906 uniprot,916 uniprot,954 uniprot,966 uniprot,970 uniprot,1020 uniprot,1037 uniprot,1072 uniprot,1099 uniprot,1218 uniprot,1241 uniprot,1244 uniprot,1333 uniprot,1607 uniprot,1635 uniprot,1854 uniprot,1888 uniprot,1989 uniprot,1994 uniprot,2041 protein-coding augustusGene,73 refSeqComposite,21 refSeqComposite,237 refSeqComposite,543 xenoRefGene,16 xenoRefGene,199 protein-genome uniprot,875 uniprot,1174 protein-protein uniprot,315 protein-to-genome uniprot,1703 proteins refSeqComposite,1811 unipAliSwissprot,7 unipAliTrembl,7 uniprot,243 uniprot,744 uniprot,925 uniprot,929 uniprot,1005 uniprot,1188 uniprot,1364 uniprot,1385 uniprot,1404 uniprot,1470 xenoRefGene,381 protocadherin refSeqComposite,417 provide uniprot,1860 provided refSeqComposite,38 refSeqComposite,69 refSeqComposite,206 refSeqComposite,445 uniprot,817 provides gap,33 gold,35 uniprot,489 providing augustusGene,254 genscan,175 nestedRepeats,312 rmsk,335 provisional refSeqComposite,621 refSeqComposite,670 xenoRefGene,72 pruitt refSeqComposite,1750 refSeqComposite,1792 xenoRefGene,320 xenoRefGene,362 pseudogenes chainGalGal6,217 chainGalGal6,231 chainNetGalGal6,220 chainNetGalGal6,234 chainNetXenTro7,227 chainNetXenTro7,241 chainNetXenTro9,225 chainNetXenTro9,239 chainXenTro7,224 chainXenTro7,238 chainXenTro9,222 chainXenTro9,236 netGalGal6,217 netGalGal6,231 netXenTro7,224 netXenTro7,238 netXenTro9,222 netXenTro9,236 refSeqComposite,409 uniprot,1184 psl refSeqComposite,455 refSeqComposite,1179 refSeqComposite,1421 transMapEnsemblV5,103 transMapEstV5,72 transMapRefSeqV5,72 transMapRnaV5,72 transMapV5,178 uniprot,1479 pslcdnafilter transMapEnsemblV5,354 transMapEstV5,323 transMapRefSeqV5,323 transMapRnaV5,323 transMapV5,429 pslmap transMapEnsemblV5,314 transMapEstV5,283 transMapRefSeqV5,283 transMapRnaV5,283 transMapV5,389 uniprot,889 uniprot,1497 uniprot,1528 uniprot,1880 uniprot,1900 pslreps uniprot,1482 uniprot,1502 public cpgIslandExt,537 cpgIslandExtUnmasked,540 cpgIslandSuper,537 refSeqComposite,1327 refSeqComposite,1630 transMapEnsemblV5,696 transMapEstV5,665 transMapRefSeqV5,665 transMapRnaV5,665 transMapV5,771 uniprot,709 publications refSeqComposite,254 refSeqComposite,424 uniprot,38 publicly nestedRepeats,275 pull-down refSeqComposite,849 xenoRefGene,173 purpose simpleRepeat,32 q uniprot,1904 uniprot,1914 q99697 uniprot,1926 qgap chainGalGal6,725 chainNetGalGal6,728 chainNetXenTro7,740 chainNetXenTro9,737 chainXenTro7,737 chainXenTro9,734 netGalGal6,725 netXenTro7,737 netXenTro9,734 queried cpgIslandExt,533 cpgIslandExtUnmasked,536 cpgIslandSuper,533 transMapEnsemblV5,563 transMapEstV5,532 transMapRefSeqV5,532 transMapRnaV5,532 transMapV5,638 query rmsk,47 rmsk,61 uniprot,1484 questions refSeqComposite,1694 uniprot,1834 quickly refSeqComposite,828 transMapEnsemblV5,123 transMapEstV5,92 transMapRefSeqV5,92 transMapRnaV5,92 transMapV5,198 xenoRefGene,152 quite simpleRepeat,45 quot chainGalGal6,26 chainGalGal6,28 chainGalGal6,33 chainGalGal6,35 chainGalGal6,103 chainGalGal6,105 chainGalGal6,234 chainGalGal6,236 chainGalGal6,238 chainGalGal6,240 chainGalGal6,344 chainGalGal6,346 chainGalGal6,687 chainGalGal6,689 chainNetGalGal6,29 chainNetGalGal6,31 chainNetGalGal6,36 chainNetGalGal6,38 chainNetGalGal6,106 chainNetGalGal6,108 chainNetGalGal6,237 chainNetGalGal6,239 chainNetGalGal6,241 chainNetGalGal6,243 chainNetGalGal6,347 chainNetGalGal6,349 chainNetGalGal6,690 chainNetGalGal6,692 chainNetXenTro7,32 chainNetXenTro7,34 chainNetXenTro7,39 chainNetXenTro7,41 chainNetXenTro7,112 chainNetXenTro7,114 chainNetXenTro7,244 chainNetXenTro7,246 chainNetXenTro7,248 chainNetXenTro7,250 chainNetXenTro7,357 chainNetXenTro7,359 chainNetXenTro7,702 chainNetXenTro7,704 chainNetXenTro9,31 chainNetXenTro9,33 chainNetXenTro9,38 chainNetXenTro9,40 chainNetXenTro9,110 chainNetXenTro9,112 chainNetXenTro9,242 chainNetXenTro9,244 chainNetXenTro9,246 chainNetXenTro9,248 chainNetXenTro9,354 chainNetXenTro9,356 chainNetXenTro9,699 chainNetXenTro9,701 chainXenTro7,29 chainXenTro7,31 chainXenTro7,36 chainXenTro7,38 chainXenTro7,109 chainXenTro7,111 chainXenTro7,241 chainXenTro7,243 chainXenTro7,245 chainXenTro7,247 chainXenTro7,354 chainXenTro7,356 chainXenTro7,699 chainXenTro7,701 chainXenTro9,28 chainXenTro9,30 chainXenTro9,35 chainXenTro9,37 chainXenTro9,107 chainXenTro9,109 chainXenTro9,239 chainXenTro9,241 chainXenTro9,243 chainXenTro9,245 chainXenTro9,351 chainXenTro9,353 chainXenTro9,696 chainXenTro9,698 gc5BaseBw,58 gc5BaseBw,62 netGalGal6,26 netGalGal6,28 netGalGal6,33 netGalGal6,35 netGalGal6,103 netGalGal6,105 netGalGal6,234 netGalGal6,236 netGalGal6,238 netGalGal6,240 netGalGal6,344 netGalGal6,346 netGalGal6,687 netGalGal6,689 netXenTro7,29 netXenTro7,31 netXenTro7,36 netXenTro7,38 netXenTro7,109 netXenTro7,111 netXenTro7,241 netXenTro7,243 netXenTro7,245 netXenTro7,247 netXenTro7,354 netXenTro7,356 netXenTro7,699 netXenTro7,701 netXenTro9,28 netXenTro9,30 netXenTro9,35 netXenTro9,37 netXenTro9,107 netXenTro9,109 netXenTro9,239 netXenTro9,241 netXenTro9,243 netXenTro9,245 netXenTro9,351 netXenTro9,353 netXenTro9,696 netXenTro9,698 refSeqComposite,508 refSeqComposite,511 refSeqComposite,1435 refSeqComposite,1437 rmsk,130 rmsk,133 rmsk,241 rmsk,242 rmsk,248 rmsk,250 rmsk,252 rmsk,254 rmsk,275 rmsk,276 uniprot,63 uniprot,66 uniprot,261 uniprot,263 uniprot,272 uniprot,274 uniprot,283 uniprot,285 uniprot,412 uniprot,416 uniprot,423 uniprot,426 uniprot,431 uniprot,435 uniprot,437 uniprot,441 uniprot,468 uniprot,470 uniprot,471 uniprot,474 uniprot,475 uniprot,478 uniprot,572 uniprot,575 windowmaskerSdust,82 windowmaskerSdust,84 r augustusGene,291 chainGalGal6,1051 chainGalGal6,1097 chainNetGalGal6,1054 chainNetGalGal6,1100 chainNetXenTro7,1066 chainNetXenTro7,1112 chainNetXenTro9,1063 chainNetXenTro9,1109 chainXenTro7,1063 chainXenTro7,1109 chainXenTro9,1060 chainXenTro9,1106 nestedRepeats,327 netGalGal6,1051 netGalGal6,1097 netXenTro7,1063 netXenTro7,1109 netXenTro9,1060 netXenTro9,1106 rmsk,350 transMapEnsemblV5,762 transMapEstV5,731 transMapRefSeqV5,731 transMapRnaV5,731 transMapV5,837 windowmaskerSdust,99 r.s chainGalGal6,1016 chainNetGalGal6,1019 chainNetXenTro7,1031 chainNetXenTro9,1028 chainXenTro7,1028 chainXenTro9,1025 netGalGal6,1016 netXenTro7,1028 netXenTro9,1025 random augustusGene,119 raney uniprot,1960 range gap,136 nestedRepeats,227 nestedRepeats,236 refSeqComposite,988 transMapEnsemblV5,658 transMapEstV5,627 transMapRefSeqV5,627 transMapRnaV5,627 transMapV5,733 uniprot,1809 ranked chainGalGal6,788 chainNetGalGal6,791 chainNetXenTro7,803 chainNetXenTro9,800 chainXenTro7,800 chainXenTro9,797 netGalGal6,788 netXenTro7,800 netXenTro9,797 rare cpgIslandExt,57 cpgIslandExt,118 cpgIslandExtUnmasked,60 cpgIslandExtUnmasked,121 cpgIslandSuper,57 cpgIslandSuper,118 ratio cpgIslandExt,273 cpgIslandExt,349 cpgIslandExt,362 cpgIslandExtUnmasked,276 cpgIslandExtUnmasked,352 cpgIslandExtUnmasked,365 cpgIslandSuper,273 cpgIslandSuper,349 cpgIslandSuper,362 raw refSeqComposite,1293 transMapEnsemblV5,521 transMapEstV5,490 transMapRefSeqV5,490 transMapRnaV5,490 transMapV5,596 uniprot,1708 rc chainGalGal6,1099 chainNetGalGal6,1102 chainNetXenTro7,1114 chainNetXenTro9,1111 chainXenTro7,1111 chainXenTro9,1108 netGalGal6,1099 netXenTro7,1111 netXenTro9,1108 rmsk,200 read gap,95 refSeqComposite,1462 realigning refSeqComposite,51 realignment refSeqComposite,59 refSeqComposite,488 rearrangement chainGalGal6,295 chainGalGal6,498 chainGalGal6,1064 chainNetGalGal6,298 chainNetGalGal6,501 chainNetGalGal6,1067 chainNetXenTro7,306 chainNetXenTro7,511 chainNetXenTro7,1079 chainNetXenTro9,304 chainNetXenTro9,508 chainNetXenTro9,1076 chainXenTro7,303 chainXenTro7,508 chainXenTro7,1076 chainXenTro9,301 chainXenTro9,505 chainXenTro9,1073 netGalGal6,295 netGalGal6,498 netGalGal6,1064 netXenTro7,303 netXenTro7,508 netXenTro7,1076 netXenTro9,301 netXenTro9,505 netXenTro9,1073 rearrangements nestedRepeats,99 reason cpgIslandExt,136 cpgIslandExtUnmasked,139 cpgIslandSuper,136 recently uniprot,1186 reciprocal transMapEnsemblV5,241 transMapEstV5,210 transMapRefSeqV5,210 transMapRnaV5,210 transMapV5,66 transMapV5,316 record refSeqComposite,616 refSeqComposite,637 refSeqComposite,673 refSeqComposite,698 refSeqComposite,713 uniprot,496 xenoRefGene,67 records refSeqComposite,128 refSeqComposite,662 refer genscan,144 refSeqComposite,1687 uniprot,1827 reference ncbiRefSeqGenomicDiff,10 refSeqComposite,30 refSeqComposite,111 refSeqComposite,466 refSeqComposite,880 refSeqComposite,1090 refSeqComposite,1777 refSeqComposite,1799 ucscToRefSeq,23 uniprot,1378 uniprot,1422 xenoRefGene,31 xenoRefGene,347 xenoRefGene,369 references augustusGene,285 chainGalGal6,1014 chainNetGalGal6,1017 chainNetXenTro7,1029 chainNetXenTro9,1026 chainXenTro7,1026 chainXenTro9,1023 cpgIslandExt,603 cpgIslandExtUnmasked,606 cpgIslandSuper,603 genscan,152 genscan,179 microsat,113 nestedRepeats,66 nestedRepeats,323 netGalGal6,1014 netXenTro7,1026 netXenTro9,1023 refSeqComposite,1731 rmsk,102 rmsk,346 simpleRepeat,73 transMapEnsemblV5,713 transMapEstV5,682 transMapRefSeqV5,682 transMapRnaV5,682 transMapV5,788 uniprot,1984 windowmaskerSdust,89 xenoRefGene,302 refgene refSeqComposite,1420 transMapEnsemblV5,595 transMapEstV5,564 transMapRefSeqV5,2 transMapRefSeqV5,564 transMapRnaV5,564 transMapV5,670 reflects rmsk,213 refseq ncbiRefSeq,1 ncbiRefSeq,4 ncbiRefSeqGenomicDiff,1 ncbiRefSeqGenomicDiff,6 ncbiRefSeqOther,1 ncbiRefSeqOther,4 ncbiRefSeqPredicted,1 ncbiRefSeqPredicted,4 ncbiRefSeqPsl,1 ncbiRefSeqPsl,3 refSeqComposite,2 refSeqComposite,3 refSeqComposite,14 refSeqComposite,33 refSeqComposite,40 refSeqComposite,45 refSeqComposite,53 refSeqComposite,84 refSeqComposite,87 refSeqComposite,113 refSeqComposite,127 refSeqComposite,189 refSeqComposite,196 refSeqComposite,198 refSeqComposite,208 refSeqComposite,209 refSeqComposite,214 refSeqComposite,314 refSeqComposite,335 refSeqComposite,339 refSeqComposite,344 refSeqComposite,378 refSeqComposite,387 refSeqComposite,399 refSeqComposite,403 refSeqComposite,433 refSeqComposite,438 refSeqComposite,448 refSeqComposite,457 refSeqComposite,470 refSeqComposite,481 refSeqComposite,509 refSeqComposite,513 refSeqComposite,522 refSeqComposite,530 refSeqComposite,547 refSeqComposite,549 refSeqComposite,555 refSeqComposite,582 refSeqComposite,588 refSeqComposite,590 refSeqComposite,592 refSeqComposite,596 refSeqComposite,615 refSeqComposite,629 refSeqComposite,636 refSeqComposite,661 refSeqComposite,672 refSeqComposite,697 refSeqComposite,712 refSeqComposite,869 refSeqComposite,885 refSeqComposite,1096 refSeqComposite,1116 refSeqComposite,1131 refSeqComposite,1145 refSeqComposite,1148 refSeqComposite,1161 refSeqComposite,1168 refSeqComposite,1199 refSeqComposite,1209 refSeqComposite,1214 refSeqComposite,1225 refSeqComposite,1228 refSeqComposite,1357 refSeqComposite,1371 refSeqComposite,1374 refSeqComposite,1409 refSeqComposite,1412 refSeqComposite,1415 refSeqComposite,1419 refSeqComposite,1423 refSeqComposite,1573 refSeqComposite,1670 refSeqComposite,1672 refSeqComposite,1675 refSeqComposite,1729 refSeqComposite,1772 refSeqComposite,1801 transMapEnsemblV5,170 transMapEnsemblV5,707 transMapEstV5,139 transMapEstV5,676 transMapRefSeqV5,4 transMapRefSeqV5,17 transMapRefSeqV5,139 transMapRefSeqV5,676 transMapRnaV5,139 transMapRnaV5,676 transMapV5,245 transMapV5,782 ucscToRefSeq,1 ucscToRefSeq,3 ucscToRefSeq,26 uniprot,823 uniprot,828 uniprot,841 uniprot,845 uniprot,857 uniprot,864 uniprot,1002 uniprot,1010 uniprot,1055 uniprot,1207 uniprot,1236 uniprot,1276 uniprot,1290 xenoRefGene,2 xenoRefGene,5 xenoRefGene,34 xenoRefGene,66 xenoRefGene,300 xenoRefGene,342 xenoRefGene,371 refseqdiffs refSeqComposite,1476 refseqother refSeqComposite,1474 regeneron uniprot,1968 region chainGalGal6,201 chainGalGal6,401 chainNetGalGal6,204 chainNetGalGal6,404 chainNetXenTro7,211 chainNetXenTro7,414 chainNetXenTro9,209 chainNetXenTro9,411 chainXenTro7,208 chainXenTro7,411 chainXenTro9,206 chainXenTro9,408 cpgIslandExt,129 cpgIslandExtUnmasked,132 cpgIslandSuper,129 netGalGal6,201 netGalGal6,401 netXenTro7,208 netXenTro7,411 netXenTro9,206 netXenTro9,408 refSeqComposite,991 refSeqComposite,1543 uniprot,312 regions augustusGene,76 chainGalGal6,16 chainGalGal6,136 chainGalGal6,288 chainNetGalGal6,19 chainNetGalGal6,139 chainNetGalGal6,291 chainNetXenTro7,22 chainNetXenTro7,145 chainNetXenTro7,299 chainNetXenTro9,21 chainNetXenTro9,143 chainNetXenTro9,297 chainXenTro7,19 chainXenTro7,142 chainXenTro7,296 chainXenTro9,18 chainXenTro9,140 chainXenTro9,294 cpgIslandExt,41 cpgIslandExt,150 cpgIslandExt,182 cpgIslandExtUnmasked,44 cpgIslandExtUnmasked,153 cpgIslandExtUnmasked,185 cpgIslandSuper,41 cpgIslandSuper,150 cpgIslandSuper,182 genscan,48 microsat,14 netGalGal6,16 netGalGal6,136 netGalGal6,288 netXenTro7,19 netXenTro7,142 netXenTro7,296 netXenTro9,18 netXenTro9,140 netXenTro9,294 refSeqComposite,1496 simpleRepeat,39 transMapEnsemblV5,303 transMapEnsemblV5,604 transMapEstV5,272 transMapEstV5,573 transMapRefSeqV5,272 transMapRefSeqV5,573 transMapRnaV5,272 transMapRnaV5,573 transMapV5,378 transMapV5,679 unipInterest,3 uniprot,240 uniprot,297 uniprot,300 uniprot,328 uniprot,348 uniprot,368 uniprot,384 regulation cpgIslandExt,13 cpgIslandExt,143 cpgIslandExtUnmasked,16 cpgIslandExtUnmasked,146 cpgIslandSuper,13 cpgIslandSuper,143 related augustusGene,242 transMapV5,75 uniprot,551 relationship chainGalGal6,854 chainNetGalGal6,857 chainNetXenTro7,869 chainNetXenTro9,866 chainXenTro7,866 chainXenTro9,863 netGalGal6,854 netXenTro7,866 netXenTro9,863 relative chainGalGal6,870 chainNetGalGal6,873 chainNetXenTro7,885 chainNetXenTro9,882 chainXenTro7,882 chainXenTro9,879 gap,79 gold,110 netGalGal6,870 netXenTro7,882 netXenTro9,879 relatively cpgIslandExt,117 cpgIslandExtUnmasked,120 cpgIslandSuper,117 release refSeqComposite,1118 uniprot,1589 releases uniprot,1561 uniprot,1686 relevant uniprot,681 remain uniprot,1189 remaining chainGalGal6,693 chainNetGalGal6,696 chainNetXenTro7,708 chainNetXenTro9,705 chainXenTro7,705 chainXenTro9,702 netGalGal6,693 netXenTro7,705 netXenTro9,702 removed chainGalGal6,583 chainNetGalGal6,586 chainNetXenTro7,597 chainNetXenTro9,594 chainXenTro7,594 chainXenTro9,591 cpgIslandExt,331 cpgIslandExtUnmasked,334 cpgIslandSuper,331 netGalGal6,583 netXenTro7,594 netXenTro9,591 rmsk,279 uniprot,597 uniprot,1150 removes transMapEnsemblV5,308 transMapEstV5,277 transMapRefSeqV5,277 transMapRnaV5,277 transMapV5,383 reorganizing uniprot,1987 repbase nestedRepeats,45 nestedRepeats,57 nestedRepeats,335 nestedRepeats,342 rmsk,81 rmsk,93 rmsk,114 rmsk,358 rmsk,365 repeat cpgIslandExt,181 cpgIslandExt,191 cpgIslandExtUnmasked,184 cpgIslandExtUnmasked,194 cpgIslandSuper,181 cpgIslandSuper,191 microsat,83 nestedRepeats,85 nestedRepeats,122 nestedRepeats,135 nestedRepeats,257 nestedRepeats,316 rmsk,168 rmsk,175 rmsk,227 rmsk,339 simpleRepeat,47 repeated uniprot,386 uniprot,390 repeating rmsk,2 repeatmasker chainGalGal6,951 chainNetGalGal6,954 chainNetXenTro7,966 chainNetXenTro9,963 chainXenTro7,963 chainXenTro9,960 nestedRepeats,9 nestedRepeats,29 nestedRepeats,73 nestedRepeats,77 nestedRepeats,109 nestedRepeats,254 nestedRepeats,285 nestedRepeats,330 netGalGal6,951 netXenTro7,963 netXenTro9,960 rmsk,1 rmsk,5 rmsk,19 rmsk,78 rmsk,292 rmsk,353 repeats chainGalGal6,943 chainNetGalGal6,946 chainNetXenTro7,958 chainNetXenTro9,955 chainXenTro7,955 chainXenTro9,952 microsat,6 microsat,9 microsat,35 microsat,58 microsat,63 microsat,86 microsat,93 microsat,106 microsat,117 nestedRepeats,6 nestedRepeats,13 nestedRepeats,22 nestedRepeats,37 nestedRepeats,49 nestedRepeats,95 nestedRepeats,366 nestedRepeats,374 nestedRepeats,401 netGalGal6,943 netXenTro7,955 netXenTro9,952 rmsk,8 rmsk,27 rmsk,41 rmsk,68 rmsk,85 rmsk,152 rmsk,179 rmsk,183 rmsk,185 rmsk,187 rmsk,196 rmsk,303 rmsk,310 rmsk,389 rmsk,397 rmsk,424 simpleRepeat,2 simpleRepeat,5 simpleRepeat,10 simpleRepeat,17 simpleRepeat,20 simpleRepeat,24 simpleRepeat,34 simpleRepeat,77 unipRepeat,1 unipRepeat,3 uniprot,383 uniprot,440 windowmaskerSdust,11 repeats.bed windowmaskerSdust,73 windowmaskerSdust,75 repetitive nestedRepeats,351 refSeqComposite,981 refSeqComposite,1009 rmsk,374 uniprot,1400 reporting refSeqComposite,1093 represent chainGalGal6,134 chainGalGal6,162 chainGalGal6,448 chainGalGal6,453 chainNetGalGal6,137 chainNetGalGal6,165 chainNetGalGal6,451 chainNetGalGal6,456 chainNetXenTro7,143 chainNetXenTro7,172 chainNetXenTro7,461 chainNetXenTro7,466 chainNetXenTro9,141 chainNetXenTro9,170 chainNetXenTro9,458 chainNetXenTro9,463 chainXenTro7,140 chainXenTro7,169 chainXenTro7,458 chainXenTro7,463 chainXenTro9,138 chainXenTro9,167 chainXenTro9,455 chainXenTro9,460 netGalGal6,134 netGalGal6,162 netGalGal6,448 netGalGal6,453 netXenTro7,140 netXenTro7,169 netXenTro7,458 netXenTro7,463 netXenTro9,138 netXenTro9,167 netXenTro9,455 netXenTro9,460 representative refSeqComposite,540 represented gap,70 rmsk,49 representing gap,113 reproducibility uniprot,1645 required refSeqComposite,910 refSeqComposite,924 requirements refSeqComposite,394 res chainGalGal6,1109 chainNetGalGal6,1112 chainNetXenTro7,1124 chainNetXenTro9,1121 chainXenTro7,1121 chainXenTro9,1118 microsat,127 netGalGal6,1109 netXenTro7,1121 netXenTro9,1118 refSeqComposite,1740 refSeqComposite,1781 refSeqComposite,1814 simpleRepeat,87 transMapEnsemblV5,747 transMapEstV5,716 transMapRefSeqV5,716 transMapRnaV5,716 transMapV5,822 uniprot,1999 xenoRefGene,310 xenoRefGene,351 xenoRefGene,384 research nestedRepeats,54 refSeqComposite,1104 rmsk,90 residues uniprot,344 resolve uniprot,1357 resolved uniprot,1284 resource uniprot,1995 uniprot,2033 rest cpgIslandExt,518 cpgIslandExtUnmasked,521 cpgIslandSuper,518 refSeqComposite,1311 restricted refSeqComposite,581 result chainGalGal6,175 chainNetGalGal6,178 chainNetXenTro7,185 chainNetXenTro9,183 chainXenTro7,182 chainXenTro9,180 cpgIslandExt,112 cpgIslandExtUnmasked,115 cpgIslandSuper,112 netGalGal6,175 netXenTro7,182 netXenTro9,180 refSeqComposite,61 transMapEnsemblV5,507 transMapEstV5,476 transMapRefSeqV5,476 transMapRnaV5,476 transMapV5,582 uniprot,798 uniprot,1065 uniprot,1170 resulting chainGalGal6,602 chainNetGalGal6,605 chainNetXenTro7,616 chainNetXenTro9,613 chainXenTro7,613 chainXenTro9,610 netGalGal6,602 netXenTro7,613 netXenTro9,610 refSeqComposite,285 transMapEnsemblV5,81 transMapEnsemblV5,337 transMapEnsemblV5,349 transMapEnsemblV5,494 transMapEstV5,50 transMapEstV5,306 transMapEstV5,318 transMapEstV5,463 transMapRefSeqV5,50 transMapRefSeqV5,306 transMapRefSeqV5,318 transMapRefSeqV5,463 transMapRnaV5,50 transMapRnaV5,306 transMapRnaV5,318 transMapRnaV5,463 transMapV5,51 transMapV5,412 transMapV5,424 transMapV5,569 uniprot,874 uniprot,1137 uniprot,1308 results refSeqComposite,1102 uniprot,1463 uniprot,1649 retained uniprot,795 retroposons rmsk,173 review refSeqComposite,613 refSeqComposite,633 refSeqComposite,650 refSeqComposite,681 refSeqComposite,706 xenoRefGene,64 reviewed refSeqComposite,624 refSeqComposite,634 refSeqComposite,640 xenoRefGene,74 reviews refSeqComposite,259 riestra uniprot,1972 right refSeqComposite,975 rightmost refSeqComposite,1017 rna refSeqComposite,29 refSeqComposite,1089 refSeqComposite,1149 refSeqComposite,1210 refSeqComposite,1252 refSeqComposite,1660 rmsk,186 rmsk,189 transMapEnsemblV5,598 transMapEstV5,567 transMapRefSeqV5,567 transMapRnaV5,2 transMapRnaV5,5 transMapRnaV5,567 transMapV5,673 xenoRefGene,30 xenoRefGene,242 xenoRefGene,288 rna-seq refSeqComposite,75 refSeqComposite,366 rnas ncbiRefSeqPsl,6 refSeqComposite,54 refSeqComposite,439 refSeqComposite,490 refSeqComposite,1229 xenoRefGene,219 robert chainGalGal6,991 chainNetGalGal6,994 chainNetXenTro7,1006 chainNetXenTro9,1003 chainXenTro7,1003 chainXenTro9,1000 nestedRepeats,307 netGalGal6,991 netXenTro7,1003 netXenTro9,1000 rmsk,330 role uniprot,309 rolling rmsk,201 ross chainGalGal6,940 chainNetGalGal6,943 chainNetXenTro7,955 chainNetXenTro9,952 chainXenTro7,952 chainXenTro9,949 netGalGal6,940 netXenTro7,952 netXenTro9,949 row nestedRepeats,179 rpts nestedRepeats,2 rrna rmsk,191 run chainGalGal6,656 chainNetGalGal6,659 chainNetXenTro7,671 chainNetXenTro9,668 chainXenTro7,668 chainXenTro9,665 netGalGal6,656 netXenTro7,668 netXenTro9,665 refSeqComposite,1610 windowmaskerSdust,53 s augustusGene,104 augustusGene,221 augustusGene,319 chainGalGal6,1059 chainGalGal6,1076 chainGalGal6,1089 chainNetGalGal6,1062 chainNetGalGal6,1079 chainNetGalGal6,1092 chainNetXenTro7,1074 chainNetXenTro7,1091 chainNetXenTro7,1104 chainNetXenTro9,1071 chainNetXenTro9,1088 chainNetXenTro9,1101 chainXenTro7,1071 chainXenTro7,1088 chainXenTro7,1101 chainXenTro9,1068 chainXenTro9,1085 chainXenTro9,1098 cpgIslandExt,436 cpgIslandExt,440 cpgIslandExt,442 cpgIslandExt,443 cpgIslandExt,445 cpgIslandExt,447 cpgIslandExt,453 cpgIslandExt,455 cpgIslandExtUnmasked,439 cpgIslandExtUnmasked,443 cpgIslandExtUnmasked,445 cpgIslandExtUnmasked,446 cpgIslandExtUnmasked,448 cpgIslandExtUnmasked,450 cpgIslandExtUnmasked,456 cpgIslandExtUnmasked,458 cpgIslandSuper,436 cpgIslandSuper,440 cpgIslandSuper,442 cpgIslandSuper,443 cpgIslandSuper,445 cpgIslandSuper,447 cpgIslandSuper,453 cpgIslandSuper,455 genscan,190 genscan,194 genscan,210 nestedRepeats,286 netGalGal6,1059 netGalGal6,1076 netGalGal6,1089 netXenTro7,1071 netXenTro7,1088 netXenTro7,1101 netXenTro9,1068 netXenTro9,1085 netXenTro9,1098 refSeqComposite,106 refSeqComposite,319 refSeqComposite,468 refSeqComposite,487 refSeqComposite,1123 refSeqComposite,1208 rmsk,18 rmsk,293 transMapEnsemblV5,732 transMapEstV5,701 transMapRefSeqV5,701 transMapRnaV5,701 transMapV5,807 uniprot,751 uniprot,774 saccharomyces augustusGene,223 safely refSeqComposite,1455 salzberg genscan,189 same chainGalGal6,527 chainGalGal6,542 chainNetGalGal6,530 chainNetGalGal6,545 chainNetXenTro7,540 chainNetXenTro7,555 chainNetXenTro9,537 chainNetXenTro9,552 chainXenTro7,537 chainXenTro7,552 chainXenTro9,534 chainXenTro9,549 nestedRepeats,143 netGalGal6,527 netGalGal6,542 netXenTro7,537 netXenTro7,552 netXenTro9,534 netXenTro9,549 refSeqComposite,1221 uniprot,608 uniprot,612 uniprot,641 uniprot,1173 sample augustusGene,133 sampling augustusGene,129 sanborn transMapEnsemblV5,789 transMapEstV5,758 transMapRefSeqV5,758 transMapRnaV5,758 transMapV5,864 santa chainGalGal6,964 chainGalGal6,1009 chainNetGalGal6,967 chainNetGalGal6,1012 chainNetXenTro7,979 chainNetXenTro7,1024 chainNetXenTro9,976 chainNetXenTro9,1021 chainXenTro7,976 chainXenTro7,1021 chainXenTro9,973 chainXenTro9,1018 netGalGal6,964 netGalGal6,1009 netXenTro7,976 netXenTro7,1021 netXenTro9,973 netXenTro9,1018 satellite rmsk,184 save cpgIslandExt,582 cpgIslandExtUnmasked,585 cpgIslandSuper,582 scaffold gap,125 gold,81 gold,119 scaffolds gap,128 sch windowmaskerSdust,94 scheib uniprot,2012 schwartz chainGalGal6,931 chainGalGal6,1088 chainNetGalGal6,934 chainNetGalGal6,1091 chainNetXenTro7,946 chainNetXenTro7,1103 chainNetXenTro9,943 chainNetXenTro9,1100 chainXenTro7,943 chainXenTro7,1100 chainXenTro9,940 chainXenTro9,1097 netGalGal6,931 netGalGal6,1088 netXenTro7,943 netXenTro7,1100 netXenTro9,940 netXenTro9,1097 sci chainGalGal6,1074 chainNetGalGal6,1077 chainNetXenTro7,1089 chainNetXenTro9,1086 chainXenTro7,1086 chainXenTro9,1083 netGalGal6,1074 netXenTro7,1086 netXenTro9,1083 science genscan,203 scientific refSeqComposite,282 uniprot,37 scientists refSeqComposite,1722 transMapEnsemblV5,700 transMapEstV5,669 transMapRefSeqV5,669 transMapRnaV5,669 transMapV5,775 xenoRefGene,293 score chainGalGal6,685 chainNetGalGal6,688 chainNetXenTro7,700 chainNetXenTro9,697 chainXenTro7,697 chainXenTro9,694 nestedRepeats,188 nestedRepeats,216 nestedRepeats,223 netGalGal6,685 netXenTro7,697 netXenTro9,694 uniprot,950 uniprot,1116 uniprot,1317 uniprot,1349 uniprot,1491 scores uniprot,1085 scoring chainGalGal6,78 chainGalGal6,88 chainGalGal6,664 chainGalGal6,681 chainGalGal6,1036 chainNetGalGal6,81 chainNetGalGal6,91 chainNetGalGal6,667 chainNetGalGal6,684 chainNetGalGal6,1039 chainNetXenTro7,86 chainNetXenTro7,96 chainNetXenTro7,679 chainNetXenTro7,696 chainNetXenTro7,1051 chainNetXenTro9,84 chainNetXenTro9,94 chainNetXenTro9,676 chainNetXenTro9,693 chainNetXenTro9,1048 chainXenTro7,83 chainXenTro7,93 chainXenTro7,676 chainXenTro7,693 chainXenTro7,1048 chainXenTro9,81 chainXenTro9,91 chainXenTro9,673 chainXenTro9,690 chainXenTro9,1045 cpgIslandExt,238 cpgIslandExt,251 cpgIslandExtUnmasked,241 cpgIslandExtUnmasked,254 cpgIslandSuper,238 cpgIslandSuper,251 netGalGal6,78 netGalGal6,88 netGalGal6,664 netGalGal6,681 netGalGal6,1036 netXenTro7,83 netXenTro7,93 netXenTro7,676 netXenTro7,693 netXenTro7,1048 netXenTro9,81 netXenTro9,91 netXenTro9,673 netXenTro9,690 netXenTro9,1045 scott chainGalGal6,930 chainNetGalGal6,933 chainNetXenTro7,945 chainNetXenTro9,942 chainXenTro7,942 chainXenTro9,939 netGalGal6,930 netXenTro7,942 netXenTro9,939 screens nestedRepeats,32 rmsk,22 script uniprot,1549 scrna rmsk,193 sdust windowmaskerSdust,2 windowmaskerSdust,8 windowmaskerSdust,68 search transMapEnsemblV5,801 transMapEstV5,770 transMapRefSeqV5,770 transMapRnaV5,770 transMapV5,876 searching cpgIslandExt,230 cpgIslandExtUnmasked,233 cpgIslandSuper,230 searls genscan,191 secondary unipStruct,5 uniprot,361 secreted uniprot,247 section genscan,153 nestedRepeats,67 refSeqComposite,92 refSeqComposite,1655 rmsk,103 uniprot,897 sections chainGalGal6,811 chainNetGalGal6,814 chainNetXenTro7,826 chainNetXenTro9,823 chainXenTro7,823 chainXenTro9,820 netGalGal6,811 netXenTro7,823 netXenTro9,820 see augustusGene,42 genscan,57 microsat,101 nestedRepeats,296 nestedRepeats,370 refSeqComposite,89 refSeqComposite,137 refSeqComposite,337 refSeqComposite,545 rmsk,319 rmsk,393 simpleRepeat,63 transMapEnsemblV5,231 transMapEnsemblV5,574 transMapEstV5,200 transMapEstV5,543 transMapRefSeqV5,200 transMapRefSeqV5,543 transMapRnaV5,200 transMapRnaV5,543 transMapV5,306 transMapV5,649 uniprot,188 uniprot,526 uniprot,768 uniprot,894 xenoRefGene,209 segment cpgIslandExt,254 cpgIslandExt,299 cpgIslandExtUnmasked,257 cpgIslandExtUnmasked,302 cpgIslandSuper,254 cpgIslandSuper,299 segments cpgIslandExt,252 cpgIslandExtUnmasked,255 cpgIslandSuper,252 select genscan,90 refSeqComposite,514 refSeqComposite,531 refSeqComposite,535 refSeqComposite,548 refSeqComposite,838 xenoRefGene,162 selected refSeqComposite,160 transMapEnsemblV5,214 transMapEnsemblV5,251 transMapEnsemblV5,262 transMapEnsemblV5,330 transMapEstV5,183 transMapEstV5,220 transMapEstV5,231 transMapEstV5,299 transMapRefSeqV5,183 transMapRefSeqV5,220 transMapRefSeqV5,231 transMapRefSeqV5,299 transMapRnaV5,183 transMapRnaV5,220 transMapRnaV5,231 transMapRnaV5,299 transMapV5,289 transMapV5,326 transMapV5,337 transMapV5,405 uniprot,986 selecting microsat,60 selective cpgIslandExt,122 cpgIslandExtUnmasked,125 cpgIslandSuper,122 semi-markov augustusGene,117 sensitivity transMapV5,148 sep chainGalGal6,1079 chainNetGalGal6,1082 chainNetXenTro7,7 chainNetXenTro7,73 chainNetXenTro7,318 chainNetXenTro7,1094 chainNetXenTro7Viewchain,4 chainNetXenTro7Viewnet,4 chainNetXenTro9,1091 chainXenTro7,6 chainXenTro7,70 chainXenTro7,315 chainXenTro7,1091 chainXenTro9,1088 nestedRepeats,356 netGalGal6,1079 netXenTro7,6 netXenTro7,70 netXenTro7,315 netXenTro7,1091 netXenTro9,1088 rmsk,379 seq unipConflict,1 sequence augustusGene,32 augustusGene,70 chainGalGal6,169 chainGalGal6,298 chainGalGal6,1039 chainNetGalGal6,172 chainNetGalGal6,301 chainNetGalGal6,1042 chainNetXenTro7,179 chainNetXenTro7,310 chainNetXenTro7,1054 chainNetXenTro9,177 chainNetXenTro9,308 chainNetXenTro9,1051 chainXenTro7,176 chainXenTro7,307 chainXenTro7,1051 chainXenTro9,174 chainXenTro9,305 chainXenTro9,1048 cpgIslandExt,232 cpgIslandExt,303 cpgIslandExt,325 cpgIslandExt,329 cpgIslandExt,397 cpgIslandExt,410 cpgIslandExtUnmasked,7 cpgIslandExtUnmasked,235 cpgIslandExtUnmasked,306 cpgIslandExtUnmasked,328 cpgIslandExtUnmasked,332 cpgIslandExtUnmasked,400 cpgIslandExtUnmasked,413 cpgIslandSuper,232 cpgIslandSuper,303 cpgIslandSuper,325 cpgIslandSuper,329 cpgIslandSuper,397 cpgIslandSuper,410 gap,55 gold,54 netGalGal6,169 netGalGal6,298 netGalGal6,1039 netXenTro7,176 netXenTro7,307 netXenTro7,1051 netXenTro9,174 netXenTro9,305 netXenTro9,1048 refSeqComposite,655 refSeqComposite,666 refSeqComposite,882 refSeqComposite,982 refSeqComposite,1010 refSeqComposite,1037 refSeqComposite,1049 refSeqComposite,1082 refSeqComposite,1086 refSeqComposite,1091 refSeqComposite,1287 refSeqComposite,1800 refSeqComposite,1805 rmsk,48 rmsk,62 transMapEnsemblV5,129 transMapEnsemblV5,690 transMapEnsemblV5,697 transMapEstV5,98 transMapEstV5,659 transMapEstV5,666 transMapRefSeqV5,98 transMapRefSeqV5,659 transMapRefSeqV5,666 transMapRnaV5,98 transMapRnaV5,659 transMapRnaV5,666 transMapV5,204 transMapV5,765 transMapV5,772 ucscToINSDC,7 ucscToINSDC,29 ucscToRefSeq,24 unipConflict,4 uniprot,356 uniprot,372 uniprot,381 uniprot,387 uniprot,636 uniprot,967 uniprot,971 uniprot,1134 uniprot,1219 uniprot,1242 uniprot,1379 uniprot,2035 windowmaskerSdust,17 xenoRefGene,277 xenoRefGene,289 xenoRefGene,370 xenoRefGene,375 sequence-to-gene refSeqComposite,684 sequenced windowmaskerSdust,104 sequences gold,13 microsat,26 microsat,124 nestedRepeats,34 nestedRepeats,42 refSeqComposite,31 refSeqComposite,112 refSeqComposite,270 refSeqComposite,286 refSeqComposite,887 refSeqComposite,1097 refSeqComposite,1661 refSeqComposite,1778 rmsk,24 rmsk,32 simpleRepeat,84 uniprot,16 uniprot,85 uniprot,112 uniprot,114 uniprot,131 uniprot,138 uniprot,166 uniprot,195 uniprot,197 uniprot,377 uniprot,673 uniprot,781 uniprot,1103 uniprot,1374 uniprot,1424 uniprot,1608 uniprot,1611 uniprot,1889 xenoRefGene,32 xenoRefGene,348 sequencing chainGalGal6,893 chainNetGalGal6,896 chainNetXenTro7,908 chainNetXenTro9,905 chainXenTro7,905 chainXenTro9,902 cytoBandIdeo,9 gap,6 gc5BaseBw,10 gold,7 netGalGal6,893 netXenTro7,905 netXenTro9,902 ucscToINSDC,12 ucscToRefSeq,7 server refSeqComposite,1329 refSeqComposite,1335 refSeqComposite,1351 refSeqComposite,1490 refSeqComposite,1605 refSeqComposite,1632 refSeqComposite,1684 refSeqComposite,1710 transMapEnsemblV5,561 transMapEstV5,530 transMapRefSeqV5,530 transMapRnaV5,530 transMapV5,636 uniprot,1699 uniprot,1745 servers cpgIslandExt,539 cpgIslandExtUnmasked,542 cpgIslandSuper,539 set refSeqComposite,161 refSeqComposite,1500 refSeqComposite,1637 refSeqComposite,1700 transMapEnsemblV5,281 transMapEstV5,250 transMapRefSeqV5,250 transMapRnaV5,250 transMapV5,356 uniprot,838 uniprot,858 uniprot,1287 uniprot,1597 sets augustusGene,158 refSeqComposite,155 setting refSeqComposite,1041 refSeqComposite,1068 settings cpgIslandExt,213 cpgIslandExtUnmasked,216 cpgIslandSuper,213 refSeqComposite,746 several transMapEnsemblV5,138 transMapEstV5,107 transMapRefSeqV5,107 transMapRnaV5,107 transMapV5,213 shade nestedRepeats,194 shaded nestedRepeats,182 shades nestedRepeats,202 shading nestedRepeats,240 refSeqComposite,608 rmsk,208 rmsk,239 xenoRefGene,59 shift refSeqComposite,962 shifted refSeqComposite,971 refSeqComposite,1018 short refSeqComposite,929 rmsk,153 uniprot,460 uniprot,978 shortgap refSeqComposite,965 shotgun gold,152 show refSeqComposite,157 refSeqComposite,791 refSeqComposite,906 refSeqComposite,920 uniprot,80 uniprot,227 uniprot,538 xenoRefGene,125 showing refSeqComposite,960 shown chainGalGal6,41 chainGalGal6,54 chainNetGalGal6,44 chainNetGalGal6,57 chainNetXenTro7,47 chainNetXenTro7,60 chainNetXenTro9,46 chainNetXenTro9,59 chainXenTro7,44 chainXenTro7,57 chainXenTro9,43 chainXenTro9,56 gold,102 microsat,48 netGalGal6,41 netGalGal6,54 netXenTro7,44 netXenTro7,57 netXenTro9,43 netXenTro9,56 uniprot,504 uniprot,628 uniprot,646 uniprot,1580 uniprot,1631 shows augustusGene,15 augustusGene,108 chainGalGal6,15 chainGalGal6,62 chainGalGal6,267 chainNetGalGal6,18 chainNetGalGal6,65 chainNetGalGal6,270 chainNetXenTro7,21 chainNetXenTro7,68 chainNetXenTro7,277 chainNetXenTro9,20 chainNetXenTro9,67 chainNetXenTro9,275 chainXenTro7,18 chainXenTro7,65 chainXenTro7,274 chainXenTro9,17 chainXenTro9,64 chainXenTro9,272 gap,10 gc5BaseBw,16 genscan,13 gold,11 nestedRepeats,17 nestedRepeats,81 netGalGal6,15 netGalGal6,62 netGalGal6,267 netXenTro7,18 netXenTro7,65 netXenTro7,274 netXenTro9,17 netXenTro9,64 netXenTro9,272 refSeqComposite,18 refSeqComposite,1004 refSeqComposite,1015 uniprot,14 uniprot,484 xenoRefGene,14 side gap,88 siepel transMapEnsemblV5,714 transMapEstV5,683 transMapRefSeqV5,683 transMapRnaV5,683 transMapV5,789 signal augustusGene,48 augustusGene,63 unipLocSignal,1 unipLocSignal,4 uniprot,238 uniprot,476 uniprot,511 uniprot,564 signals genscan,34 genscan,187 significantly cpgIslandExt,156 cpgIslandExtUnmasked,159 cpgIslandSuper,156 signifies rmsk,258 similar nestedRepeats,199 uniprot,1403 simple microsat,57 microsat,85 rmsk,178 simpleRepeat,1 simpleRepeat,3 simpleRepeat,15 simultaneously chainGalGal6,101 chainNetGalGal6,104 chainNetXenTro7,110 chainNetXenTro9,108 chainXenTro7,107 chainXenTro9,105 netGalGal6,101 netXenTro7,107 netXenTro9,105 since chainGalGal6,576 chainNetGalGal6,579 chainNetXenTro7,589 chainNetXenTro9,586 chainXenTro7,586 chainXenTro9,583 netGalGal6,576 netXenTro7,586 netXenTro9,583 uniprot,1383 sine rmsk,157 single chainGalGal6,128 chainGalGal6,137 chainGalGal6,626 chainGalGal6,631 chainNetGalGal6,131 chainNetGalGal6,140 chainNetGalGal6,629 chainNetGalGal6,634 chainNetXenTro7,137 chainNetXenTro7,146 chainNetXenTro7,640 chainNetXenTro7,646 chainNetXenTro9,135 chainNetXenTro9,144 chainNetXenTro9,637 chainNetXenTro9,643 chainXenTro7,134 chainXenTro7,143 chainXenTro7,637 chainXenTro7,643 chainXenTro9,132 chainXenTro9,141 chainXenTro9,634 chainXenTro9,640 nestedRepeats,178 netGalGal6,128 netGalGal6,137 netGalGal6,626 netGalGal6,631 netXenTro7,134 netXenTro7,143 netXenTro7,637 netXenTro7,643 netXenTro9,132 netXenTro9,141 netXenTro9,634 netXenTro9,640 refSeqComposite,534 refSeqComposite,1251 transMapEnsemblV5,480 transMapEstV5,449 transMapRefSeqV5,449 transMapRnaV5,449 transMapV5,555 uniprot,141 xenoRefGene,241 single-lined chainGalGal6,210 chainNetGalGal6,213 chainNetXenTro7,220 chainNetXenTro9,218 chainXenTro7,217 chainXenTro9,215 netGalGal6,210 netXenTro7,217 netXenTro9,215 site genscan,157 windowmaskerSdust,45 sites augustusGene,54 augustusGene,59 cpgIslandExt,34 cpgIslandExtUnmasked,37 cpgIslandSuper,34 refSeqComposite,272 uniprot,342 uniprot,354 uniprot,578 uniprot,585 size gap,135 skip refSeqComposite,1034 skipped refSeqComposite,1047 sm refSeqComposite,1755 xenoRefGene,325 small refSeqComposite,937 smallsize chainGalGal6,711 chainNetGalGal6,714 chainNetXenTro7,726 chainNetXenTro9,723 chainXenTro7,723 chainXenTro9,720 netGalGal6,711 netXenTro7,723 netXenTro9,720 smit chainGalGal6,948 chainGalGal6,1092 chainNetGalGal6,951 chainNetGalGal6,1095 chainNetXenTro7,963 chainNetXenTro7,1107 chainNetXenTro9,960 chainNetXenTro9,1104 chainXenTro7,960 chainXenTro7,1104 chainXenTro9,957 chainXenTro9,1101 nestedRepeats,306 nestedRepeats,324 nestedRepeats,371 nestedRepeats,395 netGalGal6,948 netGalGal6,1092 netXenTro7,960 netXenTro7,1104 netXenTro9,957 netXenTro9,1101 rmsk,17 rmsk,329 rmsk,347 rmsk,394 rmsk,418 snrna rmsk,192 so chainGalGal6,440 chainNetGalGal6,443 chainNetXenTro7,453 chainNetXenTro9,450 chainXenTro7,450 chainXenTro9,447 netGalGal6,440 netXenTro7,450 netXenTro9,447 refSeqComposite,302 refSeqComposite,1616 uniprot,1135 uniprot,1430 society refSeqComposite,1079 soft-masked rmsk,305 software nestedRepeats,255 refSeqComposite,377 some cpgIslandExt,134 cpgIslandExtUnmasked,137 cpgIslandSuper,134 nestedRepeats,207 refSeqComposite,660 refSeqComposite,708 rmsk,105 rmsk,268 transMapEnsemblV5,299 transMapEnsemblV5,309 transMapEstV5,268 transMapEstV5,278 transMapRefSeqV5,268 transMapRefSeqV5,278 transMapRnaV5,268 transMapRnaV5,278 transMapV5,374 transMapV5,384 uniprot,318 sometimes simpleRepeat,50 uniprot,983 sort cpgIslandExt,483 cpgIslandExtUnmasked,486 cpgIslandSuper,483 sorted chainGalGal6,780 chainNetGalGal6,783 chainNetXenTro7,795 chainNetXenTro9,792 chainXenTro7,792 chainXenTro9,789 netGalGal6,780 netXenTro7,792 netXenTro9,789 uniprot,556 source cpgIslandExt,555 cpgIslandExtUnmasked,558 cpgIslandSuper,555 refSeqComposite,1517 transMapEnsemblV5,153 transMapEnsemblV5,325 transMapEnsemblV5,343 transMapEnsemblV5,407 transMapEnsemblV5,432 transMapEnsemblV5,623 transMapEnsemblV5,637 transMapEstV5,122 transMapEstV5,294 transMapEstV5,312 transMapEstV5,376 transMapEstV5,401 transMapEstV5,592 transMapEstV5,606 transMapRefSeqV5,122 transMapRefSeqV5,294 transMapRefSeqV5,312 transMapRefSeqV5,376 transMapRefSeqV5,401 transMapRefSeqV5,592 transMapRefSeqV5,606 transMapRnaV5,122 transMapRnaV5,294 transMapRnaV5,312 transMapRnaV5,376 transMapRnaV5,401 transMapRnaV5,592 transMapRnaV5,606 transMapV5,228 transMapV5,400 transMapV5,418 transMapV5,482 transMapV5,507 transMapV5,698 transMapV5,712 uniprot,820 uniprot,1545 uniprot,1774 uniprot,1788 windowmaskerSdust,33 sources transMapEnsemblV5,48 transMapEnsemblV5,66 space uniprot,1990 spaces gold,100 span chainGalGal6,399 chainNetGalGal6,402 chainNetXenTro7,412 chainNetXenTro9,409 chainXenTro7,409 chainXenTro9,406 netGalGal6,399 netXenTro7,409 netXenTro9,406 refSeqComposite,1006 specialized simpleRepeat,29 species augustusGene,166 augustusGene,173 augustusGene,181 augustusGene,186 augustusGene,200 augustusGene,229 augustusGene,244 chainGalGal6,118 chainGalGal6,172 chainGalGal6,191 chainGalGal6,899 chainNetGalGal6,121 chainNetGalGal6,175 chainNetGalGal6,194 chainNetGalGal6,902 chainNetXenTro7,127 chainNetXenTro7,182 chainNetXenTro7,201 chainNetXenTro7,914 chainNetXenTro9,125 chainNetXenTro9,180 chainNetXenTro9,199 chainNetXenTro9,911 chainXenTro7,124 chainXenTro7,179 chainXenTro7,198 chainXenTro7,911 chainXenTro9,122 chainXenTro9,177 chainXenTro9,196 chainXenTro9,908 netGalGal6,118 netGalGal6,172 netGalGal6,191 netGalGal6,899 netXenTro7,124 netXenTro7,179 netXenTro7,198 netXenTro7,911 netXenTro9,122 netXenTro9,177 netXenTro9,196 netXenTro9,908 transMapEnsemblV5,32 transMapEnsemblV5,271 transMapEstV5,30 transMapEstV5,240 transMapRefSeqV5,30 transMapRefSeqV5,240 transMapRnaV5,30 transMapRnaV5,240 transMapV5,29 transMapV5,79 transMapV5,115 transMapV5,346 species-specific augustusGene,156 specific gap,34 gold,36 simpleRepeat,53 specification gap,60 gold,59 specify refSeqComposite,1114 speed refSeqComposite,1443 splice augustusGene,53 genscan,156 refSeqComposite,271 uniprot,144 spliced transMapEnsemblV5,176 transMapEstV5,17 transMapEstV5,145 transMapRefSeqV5,145 transMapRnaV5,145 transMapV5,251 splicing augustusGene,123 genscan,33 genscan,186 split chainGalGal6,581 chainNetGalGal6,584 chainNetXenTro7,595 chainNetXenTro9,592 chainXenTro7,592 chainXenTro9,589 netGalGal6,581 netXenTro7,592 netXenTro9,589 spontaneous cpgIslandExt,109 cpgIslandExtUnmasked,112 cpgIslandSuper,109 squish nestedRepeats,159 src cpgIslandExt,564 cpgIslandExtUnmasked,567 cpgIslandSuper,564 srcuniq transMapEnsemblV5,424 transMapEstV5,393 transMapRefSeqV5,393 transMapRnaV5,393 transMapV5,499 srprna rmsk,194 staff refSeqComposite,643 refSeqComposite,694 uniprot,42 uniprot,1965 stage uniprot,1228 stages cpgIslandExt,90 cpgIslandExtUnmasked,93 cpgIslandSuper,90 stanke augustusGene,103 augustusGene,251 augustusGene,284 augustusGene,286 augustusGene,316 transMapEnsemblV5,757 transMapEstV5,726 transMapRefSeqV5,726 transMapRnaV5,726 transMapV5,832 start augustusGene,58 cpgIslandExt,33 cpgIslandExtUnmasked,36 cpgIslandSuper,33 refSeqComposite,1559 transMapEnsemblV5,671 transMapEstV5,640 transMapRefSeqV5,640 transMapRnaV5,640 transMapV5,746 uniprot,125 uniprot,209 uniprot,1821 state chainGalGal6,925 chainGalGal6,1028 chainNetGalGal6,928 chainNetGalGal6,1031 chainNetXenTro7,940 chainNetXenTro7,1043 chainNetXenTro9,937 chainNetXenTro9,1040 chainXenTro7,937 chainXenTro7,1040 chainXenTro9,934 chainXenTro9,1037 netGalGal6,925 netGalGal6,1028 netXenTro7,937 netXenTro7,1040 netXenTro9,934 netXenTro9,1037 statistical augustusGene,47 stdin cpgIslandExt,415 cpgIslandExt,420 cpgIslandExtUnmasked,418 cpgIslandExtUnmasked,423 cpgIslandSuper,415 cpgIslandSuper,420 stdout cpgIslandExt,413 cpgIslandExt,417 cpgIslandExtUnmasked,416 cpgIslandExtUnmasked,420 cpgIslandSuper,413 cpgIslandSuper,417 refSeqComposite,1563 transMapEnsemblV5,675 transMapEstV5,644 transMapRefSeqV5,644 transMapRnaV5,644 transMapV5,750 uniprot,1825 stefanie augustusGene,267 step transMapEnsemblV5,307 transMapEstV5,276 transMapRefSeqV5,276 transMapRnaV5,276 transMapV5,382 uniprot,901 uniprot,1155 uniprot,1330 stevens transMapEnsemblV5,723 transMapEstV5,692 transMapRefSeqV5,692 transMapRnaV5,692 transMapV5,798 storage chainGalGal6,982 chainNetGalGal6,985 chainNetXenTro7,997 chainNetXenTro9,994 chainXenTro7,994 chainXenTro9,991 netGalGal6,982 netXenTro7,994 netXenTro9,991 stored refSeqComposite,1479 transMapEnsemblV5,544 transMapEstV5,513 transMapRefSeqV5,513 transMapRnaV5,513 transMapV5,619 uniprot,1733 strand chainGalGal6,250 chainNetGalGal6,253 chainNetXenTro7,260 chainNetXenTro9,258 chainXenTro7,257 chainXenTro9,255 cpgIslandExt,80 cpgIslandExt,84 cpgIslandExtUnmasked,83 cpgIslandExtUnmasked,87 cpgIslandSuper,80 cpgIslandSuper,84 nestedRepeats,144 nestedRepeats,155 netGalGal6,250 netXenTro7,257 netXenTro9,255 strands uniprot,365 strategy uniprot,1120 uniprot,1193 stringency transMapV5,120 structure augustusGene,113 unipStruct,1 unipStruct,6 uniprot,362 uniprot,2037 structures augustusGene,164 genscan,215 studying chainGalGal6,293 chainNetGalGal6,296 chainNetXenTro7,304 chainNetXenTro9,302 chainXenTro7,301 chainXenTro9,299 netGalGal6,293 netXenTro7,301 netXenTro9,299 subcellular uniprot,553 subject refSeqComposite,678 refSeqComposite,703 submit refSeqComposite,118 submitted transMapEnsemblV5,692 transMapEstV5,661 transMapRefSeqV5,661 transMapRnaV5,661 transMapV5,767 submodel augustusGene,331 subsections chainGalGal6,646 chainNetGalGal6,649 chainNetXenTro7,661 chainNetXenTro9,658 chainXenTro7,658 chainXenTro9,655 netGalGal6,646 netXenTro7,658 netXenTro9,655 subsequent transMapEnsemblV5,442 transMapEstV5,411 transMapRefSeqV5,411 transMapRnaV5,411 transMapV5,517 subset microsat,54 ncbiRefSeqPredicted,7 refSeqComposite,212 refSeqComposite,342 refSeqComposite,515 refSeqComposite,520 refSeqComposite,551 refSeqComposite,553 refSeqComposite,583 refSeqComposite,795 transMapEnsemblV5,208 transMapEstV5,177 transMapRefSeqV5,177 transMapRnaV5,177 transMapV5,283 substantial chainGalGal6,168 chainNetGalGal6,171 chainNetXenTro7,178 chainNetXenTro9,176 chainXenTro7,175 chainXenTro9,173 netGalGal6,168 netXenTro7,175 netXenTro9,173 subtrack refSeqComposite,750 refSeqComposite,762 uniprot,411 subtracks chainGalGal6,29 chainGalGal6,36 chainNetGalGal6,32 chainNetGalGal6,39 chainNetXenTro7,35 chainNetXenTro7,42 chainNetXenTro9,34 chainNetXenTro9,41 chainXenTro7,32 chainXenTro7,39 chainXenTro9,31 chainXenTro9,38 netGalGal6,29 netGalGal6,36 netXenTro7,32 netXenTro7,39 netXenTro9,31 netXenTro9,38 refSeqComposite,35 refSeqComposite,163 refSeqComposite,187 refSeqComposite,1399 uniprot,59 uniprot,72 uniprot,520 uniprot,548 subtracts refSeqComposite,179 such chainGalGal6,860 chainNetGalGal6,863 chainNetXenTro7,875 chainNetXenTro9,872 chainXenTro7,872 chainXenTro9,869 cpgIslandExt,65 cpgIslandExtUnmasked,68 cpgIslandSuper,65 netGalGal6,860 netXenTro7,872 netXenTro9,869 refSeqComposite,413 uniprot,306 suffix transMapEnsemblV5,401 transMapEstV5,370 transMapRefSeqV5,370 transMapRnaV5,370 transMapV5,476 uniprot,1255 suggestions refSeqComposite,117 suitable uniprot,1868 suppl augustusGene,336 supported gap,93 sure refSeqComposite,1100 uniprot,1407 swiss-prot uniprot,2025 swissprot unipAliSwissprot,1 unipAliSwissprot,6 uniprot,3 uniprot,24 uniprot,31 uniprot,76 uniprot,109 uniprot,116 uniprot,127 uniprot,414 uniprot,454 uniprot,495 uniprot,623 uniprot,703 uniprot,1373 symp chainGalGal6,1042 chainNetGalGal6,1045 chainNetXenTro7,1057 chainNetXenTro9,1054 chainXenTro7,1054 chainXenTro9,1051 netGalGal6,1042 netXenTro7,1054 netXenTro9,1051 syn chainGalGal6,523 chainNetGalGal6,526 chainNetXenTro7,536 chainNetXenTro9,533 chainXenTro7,533 chainXenTro9,530 netGalGal6,523 netXenTro7,533 netXenTro9,530 transMapEnsemblV5,255 transMapEstV5,224 transMapRefSeqV5,224 transMapRnaV5,224 transMapV5,330 syntenic chainGalGal6,287 chainGalGal6,867 chainNetGalGal6,290 chainNetGalGal6,870 chainNetXenTro7,298 chainNetXenTro7,882 chainNetXenTro9,296 chainNetXenTro9,879 chainXenTro7,295 chainXenTro7,879 chainXenTro9,293 chainXenTro9,876 netGalGal6,287 netGalGal6,867 netXenTro7,295 netXenTro7,879 netXenTro9,293 netXenTro9,876 transMapEnsemblV5,237 transMapEnsemblV5,517 transMapEstV5,206 transMapEstV5,486 transMapRefSeqV5,206 transMapRefSeqV5,486 transMapRnaV5,206 transMapRnaV5,486 transMapV5,312 transMapV5,592 syntenically augustusGene,297 transMapEnsemblV5,76 transMapEnsemblV5,768 transMapEstV5,45 transMapEstV5,737 transMapRefSeqV5,45 transMapRefSeqV5,737 transMapRnaV5,45 transMapRnaV5,737 transMapV5,44 transMapV5,843 synteny chainGalGal6,32 chainNetGalGal6,35 chainNetXenTro7,38 chainNetXenTro9,37 chainXenTro7,35 chainXenTro9,34 netGalGal6,32 netXenTro7,35 netXenTro9,34 transMapEnsemblV5,276 transMapEstV5,245 transMapRefSeqV5,245 transMapRnaV5,245 transMapV5,351 synteny-filtered transMapV5,83 synthesized cpgIslandExt,78 cpgIslandExtUnmasked,81 cpgIslandSuper,78 system chainGalGal6,79 chainNetGalGal6,82 chainNetXenTro7,87 chainNetXenTro9,85 chainXenTro7,84 chainXenTro9,82 netGalGal6,79 netXenTro7,84 netXenTro9,82 refSeqComposite,1468 refSeqComposite,1527 transMapEnsemblV5,633 transMapEstV5,602 transMapRefSeqV5,602 transMapRnaV5,602 transMapV5,708 uniprot,1353 uniprot,1784 systems chainGalGal6,89 chainNetGalGal6,92 chainNetXenTro7,97 chainNetXenTro9,95 chainXenTro7,94 chainXenTro9,92 netGalGal6,89 netXenTro7,94 netXenTro9,92 t cpgIslandExt,437 cpgIslandExt,439 cpgIslandExt,441 cpgIslandExt,444 cpgIslandExt,446 cpgIslandExt,448 cpgIslandExt,450 cpgIslandExt,452 cpgIslandExt,454 cpgIslandExtUnmasked,440 cpgIslandExtUnmasked,442 cpgIslandExtUnmasked,444 cpgIslandExtUnmasked,447 cpgIslandExtUnmasked,449 cpgIslandExtUnmasked,451 cpgIslandExtUnmasked,453 cpgIslandExtUnmasked,455 cpgIslandExtUnmasked,457 cpgIslandSuper,437 cpgIslandSuper,439 cpgIslandSuper,441 cpgIslandSuper,444 cpgIslandSuper,446 cpgIslandSuper,448 cpgIslandSuper,450 cpgIslandSuper,452 cpgIslandSuper,454 refSeqComposite,1795 xenoRefGene,365 t-100-25-9091 chainGalGal6,679 chainNetGalGal6,682 netGalGal6,679 t-123-31-11491 chainNetXenTro7,694 chainNetXenTro9,691 chainXenTro7,691 chainXenTro9,688 netXenTro7,691 netXenTro9,688 table augustusGene,225 cpgIslandExt,521 cpgIslandExtUnmasked,524 cpgIslandSuper,521 refSeqComposite,1180 refSeqComposite,1313 refSeqComposite,1358 refSeqComposite,1575 transMapEnsemblV5,532 transMapEstV5,501 transMapRefSeqV5,501 transMapRnaV5,501 transMapV5,607 uniprot,1720 windowmaskerSdust,85 tables cpgIslandExt,511 cpgIslandExt,529 cpgIslandExtUnmasked,514 cpgIslandExtUnmasked,532 cpgIslandSuper,511 cpgIslandSuper,529 refSeqComposite,82 refSeqComposite,1319 refSeqComposite,1404 refSeqComposite,1433 uniprot,1301 tablesize chainGalGal6,709 chainNetGalGal6,712 chainNetXenTro7,724 chainNetXenTro9,721 chainXenTro7,721 chainXenTro9,718 netGalGal6,709 netXenTro7,721 netXenTro9,718 taken refSeqComposite,25 xenoRefGene,26 tandem microsat,92 microsat,105 microsat,116 simpleRepeat,4 simpleRepeat,16 simpleRepeat,23 simpleRepeat,76 transMapEnsemblV5,509 transMapEstV5,478 transMapRefSeqV5,478 transMapRnaV5,478 transMapV5,584 targeted transMapEnsemblV5,737 transMapEstV5,706 transMapRefSeqV5,706 transMapRnaV5,706 transMapV5,812 targeting refSeqComposite,584 tatusova refSeqComposite,1794 xenoRefGene,364 tblastn uniprot,1476 temperature augustusGene,141 ten rmsk,148 tend cpgIslandExt,68 cpgIslandExt,102 cpgIslandExtUnmasked,71 cpgIslandExtUnmasked,105 cpgIslandSuper,68 cpgIslandSuper,102 microsat,37 terminal rmsk,167 terminology refSeqComposite,1075 text uniprot,1763 tgap chainGalGal6,737 chainNetGalGal6,740 chainNetXenTro7,752 chainNetXenTro9,749 chainXenTro7,749 chainXenTro9,746 netGalGal6,737 netXenTro7,749 netXenTro9,746 th transMapEnsemblV5,796 transMapEstV5,765 transMapRefSeqV5,765 transMapRnaV5,765 transMapV5,871 than chainGalGal6,84 chainGalGal6,512 chainNetGalGal6,87 chainNetGalGal6,515 chainNetXenTro7,92 chainNetXenTro7,525 chainNetXenTro9,90 chainNetXenTro9,522 chainXenTro7,89 chainXenTro7,522 chainXenTro9,87 chainXenTro9,519 cpgIslandExt,159 cpgIslandExt,270 cpgIslandExt,275 cpgIslandExtUnmasked,162 cpgIslandExtUnmasked,273 cpgIslandExtUnmasked,278 cpgIslandSuper,159 cpgIslandSuper,270 cpgIslandSuper,275 nestedRepeats,213 nestedRepeats,271 netGalGal6,84 netGalGal6,512 netXenTro7,89 netXenTro7,522 netXenTro9,87 netXenTro9,519 refSeqComposite,1245 transMapEnsemblV5,225 transMapEnsemblV5,376 transMapEstV5,194 transMapEstV5,345 transMapRefSeqV5,194 transMapRefSeqV5,345 transMapRnaV5,194 transMapRnaV5,345 transMapV5,108 transMapV5,149 transMapV5,300 transMapV5,451 xenoRefGene,23 xenoRefGene,235 thanks augustusGene,248 genscan,170 nestedRepeats,303 rmsk,326 uniprot,1974 that chainGalGal6,20 chainGalGal6,45 chainGalGal6,80 chainGalGal6,141 chainGalGal6,166 chainGalGal6,371 chainGalGal6,398 chainGalGal6,420 chainGalGal6,572 chainGalGal6,830 chainGalGal6,841 chainNetGalGal6,23 chainNetGalGal6,48 chainNetGalGal6,83 chainNetGalGal6,144 chainNetGalGal6,169 chainNetGalGal6,374 chainNetGalGal6,401 chainNetGalGal6,423 chainNetGalGal6,575 chainNetGalGal6,833 chainNetGalGal6,844 chainNetXenTro7,26 chainNetXenTro7,51 chainNetXenTro7,88 chainNetXenTro7,150 chainNetXenTro7,176 chainNetXenTro7,384 chainNetXenTro7,411 chainNetXenTro7,433 chainNetXenTro7,585 chainNetXenTro7,845 chainNetXenTro7,856 chainNetXenTro9,25 chainNetXenTro9,50 chainNetXenTro9,86 chainNetXenTro9,148 chainNetXenTro9,174 chainNetXenTro9,381 chainNetXenTro9,408 chainNetXenTro9,430 chainNetXenTro9,582 chainNetXenTro9,842 chainNetXenTro9,853 chainXenTro7,23 chainXenTro7,48 chainXenTro7,85 chainXenTro7,147 chainXenTro7,173 chainXenTro7,381 chainXenTro7,408 chainXenTro7,430 chainXenTro7,582 chainXenTro7,842 chainXenTro7,853 chainXenTro9,22 chainXenTro9,47 chainXenTro9,83 chainXenTro9,145 chainXenTro9,171 chainXenTro9,378 chainXenTro9,405 chainXenTro9,427 chainXenTro9,579 chainXenTro9,839 chainXenTro9,850 cpgIslandExt,114 cpgIslandExt,178 cpgIslandExtUnmasked,117 cpgIslandExtUnmasked,181 cpgIslandSuper,114 cpgIslandSuper,178 genscan,141 gold,75 gold,145 microsat,15 nestedRepeats,265 nestedRepeats,273 netGalGal6,20 netGalGal6,45 netGalGal6,80 netGalGal6,141 netGalGal6,166 netGalGal6,371 netGalGal6,398 netGalGal6,420 netGalGal6,572 netGalGal6,830 netGalGal6,841 netXenTro7,23 netXenTro7,48 netXenTro7,85 netXenTro7,147 netXenTro7,173 netXenTro7,381 netXenTro7,408 netXenTro7,430 netXenTro7,582 netXenTro7,842 netXenTro7,853 netXenTro9,22 netXenTro9,47 netXenTro9,83 netXenTro9,145 netXenTro9,171 netXenTro9,378 netXenTro9,405 netXenTro9,427 netXenTro9,579 netXenTro9,839 netXenTro9,850 refSeqComposite,151 refSeqComposite,171 refSeqComposite,216 refSeqComposite,346 refSeqComposite,389 refSeqComposite,824 refSeqComposite,934 refSeqComposite,1025 refSeqComposite,1033 refSeqComposite,1058 refSeqComposite,1101 refSeqComposite,1622 rmsk,42 rmsk,259 transMapEnsemblV5,118 transMapEnsemblV5,194 transMapEnsemblV5,500 transMapEstV5,87 transMapEstV5,163 transMapEstV5,469 transMapRefSeqV5,87 transMapRefSeqV5,163 transMapRefSeqV5,469 transMapRnaV5,87 transMapRnaV5,163 transMapRnaV5,469 transMapV5,193 transMapV5,269 transMapV5,575 uniprot,167 uniprot,301 uniprot,696 uniprot,734 uniprot,745 uniprot,999 uniprot,1012 uniprot,1169 uniprot,1408 uniprot,1602 uniprot,1624 uniprot,1738 uniprot,1866 xenoRefGene,148 the augustusGene,20 augustusGene,25 augustusGene,30 augustusGene,38 augustusGene,61 augustusGene,69 augustusGene,81 augustusGene,109 augustusGene,143 augustusGene,165 augustusGene,172 augustusGene,177 augustusGene,185 augustusGene,240 augustusGene,250 augustusGene,255 augustusGene,258 augustusGene,261 augustusGene,272 augustusGene,275 chainGalGal6,18 chainGalGal6,37 chainGalGal6,59 chainGalGal6,71 chainGalGal6,119 chainGalGal6,132 chainGalGal6,149 chainGalGal6,156 chainGalGal6,203 chainGalGal6,207 chainGalGal6,233 chainGalGal6,243 chainGalGal6,248 chainGalGal6,256 chainGalGal6,264 chainGalGal6,268 chainGalGal6,278 chainGalGal6,296 chainGalGal6,305 chainGalGal6,319 chainGalGal6,334 chainGalGal6,340 chainGalGal6,343 chainGalGal6,358 chainGalGal6,364 chainGalGal6,368 chainGalGal6,388 chainGalGal6,394 chainGalGal6,408 chainGalGal6,426 chainGalGal6,443 chainGalGal6,446 chainGalGal6,451 chainGalGal6,464 chainGalGal6,477 chainGalGal6,479 chainGalGal6,486 chainGalGal6,489 chainGalGal6,496 chainGalGal6,502 chainGalGal6,515 chainGalGal6,526 chainGalGal6,530 chainGalGal6,533 chainGalGal6,541 chainGalGal6,545 chainGalGal6,551 chainGalGal6,562 chainGalGal6,565 chainGalGal6,577 chainGalGal6,585 chainGalGal6,587 chainGalGal6,595 chainGalGal6,601 chainGalGal6,610 chainGalGal6,613 chainGalGal6,644 chainGalGal6,649 chainGalGal6,658 chainGalGal6,662 chainGalGal6,669 chainGalGal6,692 chainGalGal6,700 chainGalGal6,770 chainGalGal6,774 chainGalGal6,782 chainGalGal6,786 chainGalGal6,790 chainGalGal6,798 chainGalGal6,843 chainGalGal6,853 chainGalGal6,872 chainGalGal6,875 chainGalGal6,887 chainGalGal6,911 chainGalGal6,953 chainGalGal6,959 chainGalGal6,977 chainGalGal6,984 chainGalGal6,996 chainGalGal6,1005 chainGalGal6,1026 chainGalGal6,1066 chainNetGalGal6,21 chainNetGalGal6,40 chainNetGalGal6,62 chainNetGalGal6,74 chainNetGalGal6,122 chainNetGalGal6,135 chainNetGalGal6,152 chainNetGalGal6,159 chainNetGalGal6,206 chainNetGalGal6,210 chainNetGalGal6,236 chainNetGalGal6,246 chainNetGalGal6,251 chainNetGalGal6,259 chainNetGalGal6,267 chainNetGalGal6,271 chainNetGalGal6,281 chainNetGalGal6,299 chainNetGalGal6,308 chainNetGalGal6,322 chainNetGalGal6,337 chainNetGalGal6,343 chainNetGalGal6,346 chainNetGalGal6,361 chainNetGalGal6,367 chainNetGalGal6,371 chainNetGalGal6,391 chainNetGalGal6,397 chainNetGalGal6,411 chainNetGalGal6,429 chainNetGalGal6,446 chainNetGalGal6,449 chainNetGalGal6,454 chainNetGalGal6,467 chainNetGalGal6,480 chainNetGalGal6,482 chainNetGalGal6,489 chainNetGalGal6,492 chainNetGalGal6,499 chainNetGalGal6,505 chainNetGalGal6,518 chainNetGalGal6,529 chainNetGalGal6,533 chainNetGalGal6,536 chainNetGalGal6,544 chainNetGalGal6,548 chainNetGalGal6,554 chainNetGalGal6,565 chainNetGalGal6,568 chainNetGalGal6,580 chainNetGalGal6,588 chainNetGalGal6,590 chainNetGalGal6,598 chainNetGalGal6,604 chainNetGalGal6,613 chainNetGalGal6,616 chainNetGalGal6,647 chainNetGalGal6,652 chainNetGalGal6,661 chainNetGalGal6,665 chainNetGalGal6,672 chainNetGalGal6,695 chainNetGalGal6,703 chainNetGalGal6,773 chainNetGalGal6,777 chainNetGalGal6,785 chainNetGalGal6,789 chainNetGalGal6,793 chainNetGalGal6,801 chainNetGalGal6,846 chainNetGalGal6,856 chainNetGalGal6,875 chainNetGalGal6,878 chainNetGalGal6,890 chainNetGalGal6,914 chainNetGalGal6,956 chainNetGalGal6,962 chainNetGalGal6,980 chainNetGalGal6,987 chainNetGalGal6,999 chainNetGalGal6,1008 chainNetGalGal6,1029 chainNetGalGal6,1069 chainNetXenTro7,24 chainNetXenTro7,43 chainNetXenTro7,65 chainNetXenTro7,79 chainNetXenTro7,128 chainNetXenTro7,141 chainNetXenTro7,158 chainNetXenTro7,166 chainNetXenTro7,213 chainNetXenTro7,217 chainNetXenTro7,243 chainNetXenTro7,253 chainNetXenTro7,258 chainNetXenTro7,266 chainNetXenTro7,274 chainNetXenTro7,278 chainNetXenTro7,289 chainNetXenTro7,307 chainNetXenTro7,317 chainNetXenTro7,332 chainNetXenTro7,347 chainNetXenTro7,353 chainNetXenTro7,356 chainNetXenTro7,371 chainNetXenTro7,377 chainNetXenTro7,381 chainNetXenTro7,401 chainNetXenTro7,407 chainNetXenTro7,421 chainNetXenTro7,439 chainNetXenTro7,456 chainNetXenTro7,459 chainNetXenTro7,464 chainNetXenTro7,477 chainNetXenTro7,490 chainNetXenTro7,492 chainNetXenTro7,499 chainNetXenTro7,502 chainNetXenTro7,509 chainNetXenTro7,515 chainNetXenTro7,528 chainNetXenTro7,539 chainNetXenTro7,543 chainNetXenTro7,546 chainNetXenTro7,554 chainNetXenTro7,558 chainNetXenTro7,564 chainNetXenTro7,575 chainNetXenTro7,578 chainNetXenTro7,590 chainNetXenTro7,599 chainNetXenTro7,601 chainNetXenTro7,609 chainNetXenTro7,615 chainNetXenTro7,624 chainNetXenTro7,627 chainNetXenTro7,659 chainNetXenTro7,664 chainNetXenTro7,673 chainNetXenTro7,677 chainNetXenTro7,684 chainNetXenTro7,707 chainNetXenTro7,715 chainNetXenTro7,785 chainNetXenTro7,789 chainNetXenTro7,797 chainNetXenTro7,801 chainNetXenTro7,805 chainNetXenTro7,813 chainNetXenTro7,858 chainNetXenTro7,868 chainNetXenTro7,887 chainNetXenTro7,890 chainNetXenTro7,902 chainNetXenTro7,926 chainNetXenTro7,968 chainNetXenTro7,974 chainNetXenTro7,992 chainNetXenTro7,999 chainNetXenTro7,1011 chainNetXenTro7,1020 chainNetXenTro7,1041 chainNetXenTro7,1081 chainNetXenTro9,23 chainNetXenTro9,42 chainNetXenTro9,64 chainNetXenTro9,77 chainNetXenTro9,126 chainNetXenTro9,139 chainNetXenTro9,156 chainNetXenTro9,164 chainNetXenTro9,211 chainNetXenTro9,215 chainNetXenTro9,241 chainNetXenTro9,251 chainNetXenTro9,256 chainNetXenTro9,264 chainNetXenTro9,272 chainNetXenTro9,276 chainNetXenTro9,287 chainNetXenTro9,305 chainNetXenTro9,315 chainNetXenTro9,329 chainNetXenTro9,344 chainNetXenTro9,350 chainNetXenTro9,353 chainNetXenTro9,368 chainNetXenTro9,374 chainNetXenTro9,378 chainNetXenTro9,398 chainNetXenTro9,404 chainNetXenTro9,418 chainNetXenTro9,436 chainNetXenTro9,453 chainNetXenTro9,456 chainNetXenTro9,461 chainNetXenTro9,474 chainNetXenTro9,487 chainNetXenTro9,489 chainNetXenTro9,496 chainNetXenTro9,499 chainNetXenTro9,506 chainNetXenTro9,512 chainNetXenTro9,525 chainNetXenTro9,536 chainNetXenTro9,540 chainNetXenTro9,543 chainNetXenTro9,551 chainNetXenTro9,555 chainNetXenTro9,561 chainNetXenTro9,572 chainNetXenTro9,575 chainNetXenTro9,587 chainNetXenTro9,596 chainNetXenTro9,598 chainNetXenTro9,606 chainNetXenTro9,612 chainNetXenTro9,621 chainNetXenTro9,624 chainNetXenTro9,656 chainNetXenTro9,661 chainNetXenTro9,670 chainNetXenTro9,674 chainNetXenTro9,681 chainNetXenTro9,704 chainNetXenTro9,712 chainNetXenTro9,782 chainNetXenTro9,786 chainNetXenTro9,794 chainNetXenTro9,798 chainNetXenTro9,802 chainNetXenTro9,810 chainNetXenTro9,855 chainNetXenTro9,865 chainNetXenTro9,884 chainNetXenTro9,887 chainNetXenTro9,899 chainNetXenTro9,923 chainNetXenTro9,965 chainNetXenTro9,971 chainNetXenTro9,989 chainNetXenTro9,996 chainNetXenTro9,1008 chainNetXenTro9,1017 chainNetXenTro9,1038 chainNetXenTro9,1078 chainXenTro7,21 chainXenTro7,40 chainXenTro7,62 chainXenTro7,76 chainXenTro7,125 chainXenTro7,138 chainXenTro7,155 chainXenTro7,163 chainXenTro7,210 chainXenTro7,214 chainXenTro7,240 chainXenTro7,250 chainXenTro7,255 chainXenTro7,263 chainXenTro7,271 chainXenTro7,275 chainXenTro7,286 chainXenTro7,304 chainXenTro7,314 chainXenTro7,329 chainXenTro7,344 chainXenTro7,350 chainXenTro7,353 chainXenTro7,368 chainXenTro7,374 chainXenTro7,378 chainXenTro7,398 chainXenTro7,404 chainXenTro7,418 chainXenTro7,436 chainXenTro7,453 chainXenTro7,456 chainXenTro7,461 chainXenTro7,474 chainXenTro7,487 chainXenTro7,489 chainXenTro7,496 chainXenTro7,499 chainXenTro7,506 chainXenTro7,512 chainXenTro7,525 chainXenTro7,536 chainXenTro7,540 chainXenTro7,543 chainXenTro7,551 chainXenTro7,555 chainXenTro7,561 chainXenTro7,572 chainXenTro7,575 chainXenTro7,587 chainXenTro7,596 chainXenTro7,598 chainXenTro7,606 chainXenTro7,612 chainXenTro7,621 chainXenTro7,624 chainXenTro7,656 chainXenTro7,661 chainXenTro7,670 chainXenTro7,674 chainXenTro7,681 chainXenTro7,704 chainXenTro7,712 chainXenTro7,782 chainXenTro7,786 chainXenTro7,794 chainXenTro7,798 chainXenTro7,802 chainXenTro7,810 chainXenTro7,855 chainXenTro7,865 chainXenTro7,884 chainXenTro7,887 chainXenTro7,899 chainXenTro7,923 chainXenTro7,965 chainXenTro7,971 chainXenTro7,989 chainXenTro7,996 chainXenTro7,1008 chainXenTro7,1017 chainXenTro7,1038 chainXenTro7,1078 chainXenTro9,20 chainXenTro9,39 chainXenTro9,61 chainXenTro9,74 chainXenTro9,123 chainXenTro9,136 chainXenTro9,153 chainXenTro9,161 chainXenTro9,208 chainXenTro9,212 chainXenTro9,238 chainXenTro9,248 chainXenTro9,253 chainXenTro9,261 chainXenTro9,269 chainXenTro9,273 chainXenTro9,284 chainXenTro9,302 chainXenTro9,312 chainXenTro9,326 chainXenTro9,341 chainXenTro9,347 chainXenTro9,350 chainXenTro9,365 chainXenTro9,371 chainXenTro9,375 chainXenTro9,395 chainXenTro9,401 chainXenTro9,415 chainXenTro9,433 chainXenTro9,450 chainXenTro9,453 chainXenTro9,458 chainXenTro9,471 chainXenTro9,484 chainXenTro9,486 chainXenTro9,493 chainXenTro9,496 chainXenTro9,503 chainXenTro9,509 chainXenTro9,522 chainXenTro9,533 chainXenTro9,537 chainXenTro9,540 chainXenTro9,548 chainXenTro9,552 chainXenTro9,558 chainXenTro9,569 chainXenTro9,572 chainXenTro9,584 chainXenTro9,593 chainXenTro9,595 chainXenTro9,603 chainXenTro9,609 chainXenTro9,618 chainXenTro9,621 chainXenTro9,653 chainXenTro9,658 chainXenTro9,667 chainXenTro9,671 chainXenTro9,678 chainXenTro9,701 chainXenTro9,709 chainXenTro9,779 chainXenTro9,783 chainXenTro9,791 chainXenTro9,795 chainXenTro9,799 chainXenTro9,807 chainXenTro9,852 chainXenTro9,862 chainXenTro9,881 chainXenTro9,884 chainXenTro9,896 chainXenTro9,920 chainXenTro9,962 chainXenTro9,968 chainXenTro9,986 chainXenTro9,993 chainXenTro9,1005 chainXenTro9,1014 chainXenTro9,1035 chainXenTro9,1075 cpgIslandExt,62 cpgIslandExt,76 cpgIslandExt,82 cpgIslandExt,88 cpgIslandExt,111 cpgIslandExt,142 cpgIslandExt,163 cpgIslandExt,168 cpgIslandExt,172 cpgIslandExt,190 cpgIslandExt,197 cpgIslandExt,201 cpgIslandExt,207 cpgIslandExt,211 cpgIslandExt,215 cpgIslandExt,219 cpgIslandExt,231 cpgIslandExt,259 cpgIslandExt,284 cpgIslandExt,288 cpgIslandExt,291 cpgIslandExt,298 cpgIslandExt,300 cpgIslandExt,310 cpgIslandExt,313 cpgIslandExt,317 cpgIslandExt,324 cpgIslandExt,332 cpgIslandExt,336 cpgIslandExt,342 cpgIslandExt,344 cpgIslandExt,348 cpgIslandExt,355 cpgIslandExt,359 cpgIslandExt,361 cpgIslandExt,372 cpgIslandExt,398 cpgIslandExt,401 cpgIslandExt,407 cpgIslandExt,490 cpgIslandExt,501 cpgIslandExt,517 cpgIslandExt,520 cpgIslandExt,524 cpgIslandExt,528 cpgIslandExt,554 cpgIslandExt,557 cpgIslandExt,567 cpgIslandExtUnmasked,65 cpgIslandExtUnmasked,79 cpgIslandExtUnmasked,85 cpgIslandExtUnmasked,91 cpgIslandExtUnmasked,114 cpgIslandExtUnmasked,145 cpgIslandExtUnmasked,166 cpgIslandExtUnmasked,171 cpgIslandExtUnmasked,175 cpgIslandExtUnmasked,193 cpgIslandExtUnmasked,200 cpgIslandExtUnmasked,204 cpgIslandExtUnmasked,210 cpgIslandExtUnmasked,214 cpgIslandExtUnmasked,218 cpgIslandExtUnmasked,222 cpgIslandExtUnmasked,234 cpgIslandExtUnmasked,262 cpgIslandExtUnmasked,287 cpgIslandExtUnmasked,291 cpgIslandExtUnmasked,294 cpgIslandExtUnmasked,301 cpgIslandExtUnmasked,303 cpgIslandExtUnmasked,313 cpgIslandExtUnmasked,316 cpgIslandExtUnmasked,320 cpgIslandExtUnmasked,327 cpgIslandExtUnmasked,335 cpgIslandExtUnmasked,339 cpgIslandExtUnmasked,345 cpgIslandExtUnmasked,347 cpgIslandExtUnmasked,351 cpgIslandExtUnmasked,358 cpgIslandExtUnmasked,362 cpgIslandExtUnmasked,364 cpgIslandExtUnmasked,375 cpgIslandExtUnmasked,401 cpgIslandExtUnmasked,404 cpgIslandExtUnmasked,410 cpgIslandExtUnmasked,493 cpgIslandExtUnmasked,504 cpgIslandExtUnmasked,520 cpgIslandExtUnmasked,523 cpgIslandExtUnmasked,527 cpgIslandExtUnmasked,531 cpgIslandExtUnmasked,557 cpgIslandExtUnmasked,560 cpgIslandExtUnmasked,570 cpgIslandSuper,62 cpgIslandSuper,76 cpgIslandSuper,82 cpgIslandSuper,88 cpgIslandSuper,111 cpgIslandSuper,142 cpgIslandSuper,163 cpgIslandSuper,168 cpgIslandSuper,172 cpgIslandSuper,190 cpgIslandSuper,197 cpgIslandSuper,201 cpgIslandSuper,207 cpgIslandSuper,211 cpgIslandSuper,215 cpgIslandSuper,219 cpgIslandSuper,231 cpgIslandSuper,259 cpgIslandSuper,284 cpgIslandSuper,288 cpgIslandSuper,291 cpgIslandSuper,298 cpgIslandSuper,300 cpgIslandSuper,310 cpgIslandSuper,313 cpgIslandSuper,317 cpgIslandSuper,324 cpgIslandSuper,332 cpgIslandSuper,336 cpgIslandSuper,342 cpgIslandSuper,344 cpgIslandSuper,348 cpgIslandSuper,355 cpgIslandSuper,359 cpgIslandSuper,361 cpgIslandSuper,372 cpgIslandSuper,398 cpgIslandSuper,401 cpgIslandSuper,407 cpgIslandSuper,490 cpgIslandSuper,501 cpgIslandSuper,517 cpgIslandSuper,520 cpgIslandSuper,524 cpgIslandSuper,528 cpgIslandSuper,554 cpgIslandSuper,557 cpgIslandSuper,567 gap,11 gap,14 gap,27 gap,39 gap,42 gap,49 gap,54 gap,56 gap,62 gap,65 gap,78 gap,84 gap,90 gap,110 gap,114 gap,119 gc5BaseBw,12 gc5BaseBw,17 gc5BaseBw,53 gc5BaseBw,57 gc5BaseBw,68 gc5BaseBw,72 genscan,16 genscan,23 genscan,38 genscan,53 genscan,68 genscan,75 genscan,80 genscan,91 genscan,115 genscan,135 genscan,139 genscan,151 genscan,155 genscan,176 gold,12 gold,16 gold,29 gold,41 gold,48 gold,53 gold,55 gold,61 gold,64 gold,73 gold,78 gold,87 gold,104 gold,109 gold,115 gold,129 gold,134 microsat,43 microsat,46 microsat,56 microsat,82 microsat,84 microsat,91 ncbiRefSeqGenomicDiff,9 nestedRepeats,25 nestedRepeats,28 nestedRepeats,44 nestedRepeats,51 nestedRepeats,65 nestedRepeats,69 nestedRepeats,76 nestedRepeats,100 nestedRepeats,105 nestedRepeats,134 nestedRepeats,142 nestedRepeats,149 nestedRepeats,154 nestedRepeats,185 nestedRepeats,193 nestedRepeats,201 nestedRepeats,215 nestedRepeats,220 nestedRepeats,235 nestedRepeats,242 nestedRepeats,248 nestedRepeats,253 nestedRepeats,278 nestedRepeats,284 nestedRepeats,297 nestedRepeats,313 nestedRepeats,397 nestedRepeats,403 netGalGal6,18 netGalGal6,37 netGalGal6,59 netGalGal6,71 netGalGal6,119 netGalGal6,132 netGalGal6,149 netGalGal6,156 netGalGal6,203 netGalGal6,207 netGalGal6,233 netGalGal6,243 netGalGal6,248 netGalGal6,256 netGalGal6,264 netGalGal6,268 netGalGal6,278 netGalGal6,296 netGalGal6,305 netGalGal6,319 netGalGal6,334 netGalGal6,340 netGalGal6,343 netGalGal6,358 netGalGal6,364 netGalGal6,368 netGalGal6,388 netGalGal6,394 netGalGal6,408 netGalGal6,426 netGalGal6,443 netGalGal6,446 netGalGal6,451 netGalGal6,464 netGalGal6,477 netGalGal6,479 netGalGal6,486 netGalGal6,489 netGalGal6,496 netGalGal6,502 netGalGal6,515 netGalGal6,526 netGalGal6,530 netGalGal6,533 netGalGal6,541 netGalGal6,545 netGalGal6,551 netGalGal6,562 netGalGal6,565 netGalGal6,577 netGalGal6,585 netGalGal6,587 netGalGal6,595 netGalGal6,601 netGalGal6,610 netGalGal6,613 netGalGal6,644 netGalGal6,649 netGalGal6,658 netGalGal6,662 netGalGal6,669 netGalGal6,692 netGalGal6,700 netGalGal6,770 netGalGal6,774 netGalGal6,782 netGalGal6,786 netGalGal6,790 netGalGal6,798 netGalGal6,843 netGalGal6,853 netGalGal6,872 netGalGal6,875 netGalGal6,887 netGalGal6,911 netGalGal6,953 netGalGal6,959 netGalGal6,977 netGalGal6,984 netGalGal6,996 netGalGal6,1005 netGalGal6,1026 netGalGal6,1066 netXenTro7,21 netXenTro7,40 netXenTro7,62 netXenTro7,76 netXenTro7,125 netXenTro7,138 netXenTro7,155 netXenTro7,163 netXenTro7,210 netXenTro7,214 netXenTro7,240 netXenTro7,250 netXenTro7,255 netXenTro7,263 netXenTro7,271 netXenTro7,275 netXenTro7,286 netXenTro7,304 netXenTro7,314 netXenTro7,329 netXenTro7,344 netXenTro7,350 netXenTro7,353 netXenTro7,368 netXenTro7,374 netXenTro7,378 netXenTro7,398 netXenTro7,404 netXenTro7,418 netXenTro7,436 netXenTro7,453 netXenTro7,456 netXenTro7,461 netXenTro7,474 netXenTro7,487 netXenTro7,489 netXenTro7,496 netXenTro7,499 netXenTro7,506 netXenTro7,512 netXenTro7,525 netXenTro7,536 netXenTro7,540 netXenTro7,543 netXenTro7,551 netXenTro7,555 netXenTro7,561 netXenTro7,572 netXenTro7,575 netXenTro7,587 netXenTro7,596 netXenTro7,598 netXenTro7,606 netXenTro7,612 netXenTro7,621 netXenTro7,624 netXenTro7,656 netXenTro7,661 netXenTro7,670 netXenTro7,674 netXenTro7,681 netXenTro7,704 netXenTro7,712 netXenTro7,782 netXenTro7,786 netXenTro7,794 netXenTro7,798 netXenTro7,802 netXenTro7,810 netXenTro7,855 netXenTro7,865 netXenTro7,884 netXenTro7,887 netXenTro7,899 netXenTro7,923 netXenTro7,965 netXenTro7,971 netXenTro7,989 netXenTro7,996 netXenTro7,1008 netXenTro7,1017 netXenTro7,1038 netXenTro7,1078 netXenTro9,20 netXenTro9,39 netXenTro9,61 netXenTro9,74 netXenTro9,123 netXenTro9,136 netXenTro9,153 netXenTro9,161 netXenTro9,208 netXenTro9,212 netXenTro9,238 netXenTro9,248 netXenTro9,253 netXenTro9,261 netXenTro9,269 netXenTro9,273 netXenTro9,284 netXenTro9,302 netXenTro9,312 netXenTro9,326 netXenTro9,341 netXenTro9,347 netXenTro9,350 netXenTro9,365 netXenTro9,371 netXenTro9,375 netXenTro9,395 netXenTro9,401 netXenTro9,415 netXenTro9,433 netXenTro9,450 netXenTro9,453 netXenTro9,458 netXenTro9,471 netXenTro9,484 netXenTro9,486 netXenTro9,493 netXenTro9,496 netXenTro9,503 netXenTro9,509 netXenTro9,522 netXenTro9,533 netXenTro9,537 netXenTro9,540 netXenTro9,548 netXenTro9,552 netXenTro9,558 netXenTro9,569 netXenTro9,572 netXenTro9,584 netXenTro9,593 netXenTro9,595 netXenTro9,603 netXenTro9,609 netXenTro9,618 netXenTro9,621 netXenTro9,653 netXenTro9,658 netXenTro9,667 netXenTro9,671 netXenTro9,678 netXenTro9,701 netXenTro9,709 netXenTro9,779 netXenTro9,783 netXenTro9,791 netXenTro9,795 netXenTro9,799 netXenTro9,807 netXenTro9,852 netXenTro9,862 netXenTro9,881 netXenTro9,884 netXenTro9,896 netXenTro9,920 netXenTro9,962 netXenTro9,968 netXenTro9,986 netXenTro9,993 netXenTro9,1005 netXenTro9,1014 netXenTro9,1035 netXenTro9,1075 refSeqComposite,12 refSeqComposite,27 refSeqComposite,43 refSeqComposite,52 refSeqComposite,56 refSeqComposite,66 refSeqComposite,90 refSeqComposite,98 refSeqComposite,133 refSeqComposite,165 refSeqComposite,169 refSeqComposite,185 refSeqComposite,240 refSeqComposite,281 refSeqComposite,284 refSeqComposite,290 refSeqComposite,307 refSeqComposite,313 refSeqComposite,325 refSeqComposite,333 refSeqComposite,369 refSeqComposite,373 refSeqComposite,386 refSeqComposite,393 refSeqComposite,398 refSeqComposite,402 refSeqComposite,441 refSeqComposite,447 refSeqComposite,451 refSeqComposite,463 refSeqComposite,497 refSeqComposite,507 refSeqComposite,529 refSeqComposite,560 refSeqComposite,571 refSeqComposite,579 refSeqComposite,587 refSeqComposite,599 refSeqComposite,606 refSeqComposite,610 refSeqComposite,614 refSeqComposite,635 refSeqComposite,648 refSeqComposite,658 refSeqComposite,671 refSeqComposite,682 refSeqComposite,696 refSeqComposite,711 refSeqComposite,716 refSeqComposite,732 refSeqComposite,736 refSeqComposite,739 refSeqComposite,745 refSeqComposite,752 refSeqComposite,757 refSeqComposite,761 refSeqComposite,774 refSeqComposite,780 refSeqComposite,788 refSeqComposite,800 refSeqComposite,811 refSeqComposite,839 refSeqComposite,844 refSeqComposite,859 refSeqComposite,868 refSeqComposite,879 refSeqComposite,884 refSeqComposite,888 refSeqComposite,907 refSeqComposite,913 refSeqComposite,921 refSeqComposite,927 refSeqComposite,977 refSeqComposite,1001 refSeqComposite,1005 refSeqComposite,1008 refSeqComposite,1012 refSeqComposite,1016 refSeqComposite,1051 refSeqComposite,1063 refSeqComposite,1110 refSeqComposite,1115 refSeqComposite,1121 refSeqComposite,1130 refSeqComposite,1144 refSeqComposite,1159 refSeqComposite,1176 refSeqComposite,1185 refSeqComposite,1190 refSeqComposite,1198 refSeqComposite,1212 refSeqComposite,1220 refSeqComposite,1233 refSeqComposite,1257 refSeqComposite,1260 refSeqComposite,1276 refSeqComposite,1285 refSeqComposite,1292 refSeqComposite,1310 refSeqComposite,1318 refSeqComposite,1339 refSeqComposite,1346 refSeqComposite,1367 refSeqComposite,1370 refSeqComposite,1387 refSeqComposite,1397 refSeqComposite,1426 refSeqComposite,1449 refSeqComposite,1465 refSeqComposite,1470 refSeqComposite,1473 refSeqComposite,1498 refSeqComposite,1516 refSeqComposite,1529 refSeqComposite,1547 refSeqComposite,1572 refSeqComposite,1577 refSeqComposite,1581 refSeqComposite,1593 refSeqComposite,1598 refSeqComposite,1602 refSeqComposite,1606 refSeqComposite,1612 refSeqComposite,1644 refSeqComposite,1649 refSeqComposite,1652 refSeqComposite,1659 refSeqComposite,1669 refSeqComposite,1698 refSeqComposite,1727 refSeqComposite,1735 rmsk,33 rmsk,40 rmsk,46 rmsk,60 rmsk,66 rmsk,75 rmsk,80 rmsk,87 rmsk,101 rmsk,118 rmsk,204 rmsk,210 rmsk,214 rmsk,229 rmsk,231 rmsk,236 rmsk,238 rmsk,244 rmsk,247 rmsk,260 rmsk,265 rmsk,271 rmsk,274 rmsk,281 rmsk,291 rmsk,320 rmsk,336 rmsk,420 rmsk,426 simpleRepeat,60 transMapEnsemblV5,24 transMapEnsemblV5,34 transMapEnsemblV5,71 transMapEnsemblV5,86 transMapEnsemblV5,99 transMapEnsemblV5,120 transMapEnsemblV5,127 transMapEnsemblV5,162 transMapEnsemblV5,179 transMapEnsemblV5,202 transMapEnsemblV5,210 transMapEnsemblV5,253 transMapEnsemblV5,257 transMapEnsemblV5,261 transMapEnsemblV5,273 transMapEnsemblV5,279 transMapEnsemblV5,296 transMapEnsemblV5,304 transMapEnsemblV5,311 transMapEnsemblV5,313 transMapEnsemblV5,324 transMapEnsemblV5,329 transMapEnsemblV5,333 transMapEnsemblV5,342 transMapEnsemblV5,346 transMapEnsemblV5,348 transMapEnsemblV5,379 transMapEnsemblV5,406 transMapEnsemblV5,416 transMapEnsemblV5,419 transMapEnsemblV5,441 transMapEnsemblV5,450 transMapEnsemblV5,463 transMapEnsemblV5,473 transMapEnsemblV5,485 transMapEnsemblV5,506 transMapEnsemblV5,520 transMapEnsemblV5,531 transMapEnsemblV5,535 transMapEnsemblV5,541 transMapEnsemblV5,580 transMapEnsemblV5,588 transMapEnsemblV5,606 transMapEnsemblV5,622 transMapEnsemblV5,645 transMapEnsemblV5,694 transMapEnsemblV5,706 transMapEnsemblV5,808 transMapEstV5,22 transMapEstV5,32 transMapEstV5,40 transMapEstV5,55 transMapEstV5,68 transMapEstV5,89 transMapEstV5,96 transMapEstV5,131 transMapEstV5,148 transMapEstV5,171 transMapEstV5,179 transMapEstV5,222 transMapEstV5,226 transMapEstV5,230 transMapEstV5,242 transMapEstV5,248 transMapEstV5,265 transMapEstV5,273 transMapEstV5,280 transMapEstV5,282 transMapEstV5,293 transMapEstV5,298 transMapEstV5,302 transMapEstV5,311 transMapEstV5,315 transMapEstV5,317 transMapEstV5,348 transMapEstV5,375 transMapEstV5,385 transMapEstV5,388 transMapEstV5,410 transMapEstV5,419 transMapEstV5,432 transMapEstV5,442 transMapEstV5,454 transMapEstV5,475 transMapEstV5,489 transMapEstV5,500 transMapEstV5,504 transMapEstV5,510 transMapEstV5,549 transMapEstV5,557 transMapEstV5,575 transMapEstV5,591 transMapEstV5,614 transMapEstV5,663 transMapEstV5,675 transMapEstV5,777 transMapRefSeqV5,22 transMapRefSeqV5,32 transMapRefSeqV5,40 transMapRefSeqV5,55 transMapRefSeqV5,68 transMapRefSeqV5,89 transMapRefSeqV5,96 transMapRefSeqV5,131 transMapRefSeqV5,148 transMapRefSeqV5,171 transMapRefSeqV5,179 transMapRefSeqV5,222 transMapRefSeqV5,226 transMapRefSeqV5,230 transMapRefSeqV5,242 transMapRefSeqV5,248 transMapRefSeqV5,265 transMapRefSeqV5,273 transMapRefSeqV5,280 transMapRefSeqV5,282 transMapRefSeqV5,293 transMapRefSeqV5,298 transMapRefSeqV5,302 transMapRefSeqV5,311 transMapRefSeqV5,315 transMapRefSeqV5,317 transMapRefSeqV5,348 transMapRefSeqV5,375 transMapRefSeqV5,385 transMapRefSeqV5,388 transMapRefSeqV5,410 transMapRefSeqV5,419 transMapRefSeqV5,432 transMapRefSeqV5,442 transMapRefSeqV5,454 transMapRefSeqV5,475 transMapRefSeqV5,489 transMapRefSeqV5,500 transMapRefSeqV5,504 transMapRefSeqV5,510 transMapRefSeqV5,549 transMapRefSeqV5,557 transMapRefSeqV5,575 transMapRefSeqV5,591 transMapRefSeqV5,614 transMapRefSeqV5,663 transMapRefSeqV5,675 transMapRefSeqV5,777 transMapRnaV5,22 transMapRnaV5,32 transMapRnaV5,40 transMapRnaV5,55 transMapRnaV5,68 transMapRnaV5,89 transMapRnaV5,96 transMapRnaV5,131 transMapRnaV5,148 transMapRnaV5,171 transMapRnaV5,179 transMapRnaV5,222 transMapRnaV5,226 transMapRnaV5,230 transMapRnaV5,242 transMapRnaV5,248 transMapRnaV5,265 transMapRnaV5,273 transMapRnaV5,280 transMapRnaV5,282 transMapRnaV5,293 transMapRnaV5,298 transMapRnaV5,302 transMapRnaV5,311 transMapRnaV5,315 transMapRnaV5,317 transMapRnaV5,348 transMapRnaV5,375 transMapRnaV5,385 transMapRnaV5,388 transMapRnaV5,410 transMapRnaV5,419 transMapRnaV5,432 transMapRnaV5,442 transMapRnaV5,454 transMapRnaV5,475 transMapRnaV5,489 transMapRnaV5,500 transMapRnaV5,504 transMapRnaV5,510 transMapRnaV5,549 transMapRnaV5,557 transMapRnaV5,575 transMapRnaV5,591 transMapRnaV5,614 transMapRnaV5,663 transMapRnaV5,675 transMapRnaV5,777 transMapV5,21 transMapV5,31 transMapV5,39 transMapV5,56 transMapV5,92 transMapV5,99 transMapV5,104 transMapV5,122 transMapV5,127 transMapV5,133 transMapV5,137 transMapV5,174 transMapV5,195 transMapV5,202 transMapV5,237 transMapV5,254 transMapV5,277 transMapV5,285 transMapV5,328 transMapV5,332 transMapV5,336 transMapV5,348 transMapV5,354 transMapV5,371 transMapV5,379 transMapV5,386 transMapV5,388 transMapV5,399 transMapV5,404 transMapV5,408 transMapV5,417 transMapV5,421 transMapV5,423 transMapV5,454 transMapV5,481 transMapV5,491 transMapV5,494 transMapV5,516 transMapV5,525 transMapV5,538 transMapV5,548 transMapV5,560 transMapV5,581 transMapV5,595 transMapV5,606 transMapV5,610 transMapV5,616 transMapV5,655 transMapV5,663 transMapV5,681 transMapV5,697 transMapV5,720 transMapV5,769 transMapV5,781 transMapV5,883 ucscToINSDC,26 ucscToINSDC,33 ucscToINSDC,38 ucscToINSDC,43 ucscToRefSeq,21 ucscToRefSeq,27 ucscToRefSeq,32 ucscToRefSeq,37 uniprot,22 uniprot,40 uniprot,53 uniprot,69 uniprot,81 uniprot,87 uniprot,94 uniprot,102 uniprot,119 uniprot,184 uniprot,202 uniprot,215 uniprot,233 uniprot,259 uniprot,270 uniprot,281 uniprot,308 uniprot,379 uniprot,410 uniprot,421 uniprot,428 uniprot,444 uniprot,463 uniprot,485 uniprot,493 uniprot,510 uniprot,527 uniprot,534 uniprot,539 uniprot,543 uniprot,547 uniprot,562 uniprot,571 uniprot,607 uniprot,640 uniprot,649 uniprot,668 uniprot,698 uniprot,748 uniprot,785 uniprot,789 uniprot,791 uniprot,797 uniprot,802 uniprot,810 uniprot,812 uniprot,819 uniprot,832 uniprot,836 uniprot,855 uniprot,873 uniprot,883 uniprot,903 uniprot,913 uniprot,923 uniprot,927 uniprot,935 uniprot,944 uniprot,947 uniprot,953 uniprot,961 uniprot,969 uniprot,1009 uniprot,1036 uniprot,1039 uniprot,1054 uniprot,1090 uniprot,1112 uniprot,1126 uniprot,1136 uniprot,1140 uniprot,1156 uniprot,1172 uniprot,1212 uniprot,1221 uniprot,1243 uniprot,1253 uniprot,1267 uniprot,1273 uniprot,1278 uniprot,1294 uniprot,1303 uniprot,1307 uniprot,1321 uniprot,1332 uniprot,1339 uniprot,1358 uniprot,1372 uniprot,1376 uniprot,1384 uniprot,1388 uniprot,1409 uniprot,1414 uniprot,1428 uniprot,1431 uniprot,1462 uniprot,1508 uniprot,1512 uniprot,1519 uniprot,1522 uniprot,1527 uniprot,1535 uniprot,1547 uniprot,1574 uniprot,1582 uniprot,1588 uniprot,1592 uniprot,1595 uniprot,1606 uniprot,1609 uniprot,1612 uniprot,1618 uniprot,1621 uniprot,1628 uniprot,1640 uniprot,1664 uniprot,1667 uniprot,1678 uniprot,1681 uniprot,1701 uniprot,1707 uniprot,1711 uniprot,1719 uniprot,1723 uniprot,1729 uniprot,1743 uniprot,1746 uniprot,1753 uniprot,1773 uniprot,1796 uniprot,1857 uniprot,1861 uniprot,1893 uniprot,1963 uniprot,1988 uniprot,1992 uniprot,2024 uniprot,2029 windowmaskerSdust,22 windowmaskerSdust,28 windowmaskerSdust,32 windowmaskerSdust,36 windowmaskerSdust,42 windowmaskerSdust,55 windowmaskerSdust,74 windowmaskerSdust,81 xenoRefGene,28 xenoRefGene,35 xenoRefGene,50 xenoRefGene,57 xenoRefGene,61 xenoRefGene,65 xenoRefGene,76 xenoRefGene,91 xenoRefGene,94 xenoRefGene,97 xenoRefGene,111 xenoRefGene,117 xenoRefGene,122 xenoRefGene,127 xenoRefGene,135 xenoRefGene,163 xenoRefGene,168 xenoRefGene,183 xenoRefGene,198 xenoRefGene,211 xenoRefGene,218 xenoRefGene,223 xenoRefGene,247 xenoRefGene,250 xenoRefGene,266 xenoRefGene,275 xenoRefGene,298 their nestedRepeats,190 uniprot,62 uniprot,723 uniprot,1101 them chainGalGal6,805 chainNetGalGal6,808 chainNetXenTro7,820 chainNetXenTro9,817 chainXenTro7,817 chainXenTro9,814 cpgIslandExt,126 cpgIslandExtUnmasked,129 cpgIslandSuper,126 netGalGal6,805 netXenTro7,817 netXenTro9,814 rmsk,318 uniprot,20 uniprot,173 uniprot,483 then chainGalGal6,655 chainGalGal6,794 chainGalGal6,879 chainNetGalGal6,658 chainNetGalGal6,797 chainNetGalGal6,882 chainNetXenTro7,670 chainNetXenTro7,809 chainNetXenTro7,894 chainNetXenTro9,667 chainNetXenTro9,806 chainNetXenTro9,891 chainXenTro7,667 chainXenTro7,806 chainXenTro7,891 chainXenTro9,664 chainXenTro9,803 chainXenTro9,888 cpgIslandExt,256 cpgIslandExtUnmasked,259 cpgIslandSuper,256 nestedRepeats,232 netGalGal6,655 netGalGal6,794 netGalGal6,879 netXenTro7,667 netXenTro7,806 netXenTro7,891 netXenTro9,664 netXenTro9,803 netXenTro9,888 transMapV5,130 uniprot,1083 uniprot,1516 there cpgIslandExt,120 cpgIslandExtUnmasked,123 cpgIslandSuper,120 transMapEnsemblV5,453 transMapEstV5,422 transMapRefSeqV5,422 transMapRnaV5,422 transMapV5,528 uniprot,705 uniprot,1092 therefore gold,123 refSeqComposite,1635 uniprot,968 uniprot,1145 these augustusGene,95 augustusGene,190 chainGalGal6,52 chainGalGal6,102 chainGalGal6,413 chainGalGal6,667 chainNetGalGal6,55 chainNetGalGal6,105 chainNetGalGal6,416 chainNetGalGal6,670 chainNetXenTro7,58 chainNetXenTro7,111 chainNetXenTro7,426 chainNetXenTro7,682 chainNetXenTro9,57 chainNetXenTro9,109 chainNetXenTro9,423 chainNetXenTro9,679 chainXenTro7,55 chainXenTro7,108 chainXenTro7,423 chainXenTro7,679 chainXenTro9,54 chainXenTro9,106 chainXenTro9,420 chainXenTro9,676 microsat,24 nestedRepeats,262 nestedRepeats,266 netGalGal6,52 netGalGal6,102 netGalGal6,413 netGalGal6,667 netXenTro7,55 netXenTro7,108 netXenTro7,423 netXenTro7,679 netXenTro9,54 netXenTro9,106 netXenTro9,420 netXenTro9,676 refSeqComposite,322 refSeqComposite,332 refSeqComposite,797 refSeqComposite,1296 refSeqComposite,1432 rmsk,235 simpleRepeat,33 transMapEnsemblV5,460 transMapEnsemblV5,469 transMapEnsemblV5,524 transMapEnsemblV5,585 transMapEstV5,429 transMapEstV5,438 transMapEstV5,493 transMapEstV5,554 transMapRefSeqV5,429 transMapRefSeqV5,438 transMapRefSeqV5,493 transMapRefSeqV5,554 transMapRnaV5,429 transMapRnaV5,438 transMapRnaV5,493 transMapRnaV5,554 transMapV5,12 transMapV5,535 transMapV5,544 transMapV5,599 transMapV5,660 uniprot,99 uniprot,130 uniprot,1160 thesis chainGalGal6,1025 chainNetGalGal6,1028 chainNetXenTro7,1040 chainNetXenTro9,1037 chainXenTro7,1037 chainXenTro9,1034 netGalGal6,1025 netXenTro7,1037 netXenTro9,1034 they chainGalGal6,330 chainNetGalGal6,333 chainNetXenTro7,343 chainNetXenTro9,340 chainXenTro7,340 chainXenTro9,337 netGalGal6,330 netXenTro7,340 netXenTro9,337 refSeqComposite,248 refSeqComposite,292 refSeqComposite,357 refSeqComposite,419 uniprot,179 thibaud-nissen refSeqComposite,1756 xenoRefGene,326 thick chainGalGal6,43 chainNetGalGal6,46 chainNetXenTro7,49 chainNetXenTro9,48 chainXenTro7,46 chainXenTro9,45 netGalGal6,43 netXenTro7,46 netXenTro9,45 refSeqComposite,997 refSeqComposite,1013 thin refSeqComposite,995 refSeqComposite,1002 this augustusGene,13 augustusGene,106 augustusGene,224 chainGalGal6,13 chainGalGal6,173 chainGalGal6,301 chainGalGal6,400 chainGalGal6,698 chainGalGal6,820 chainNetGalGal6,16 chainNetGalGal6,176 chainNetGalGal6,304 chainNetGalGal6,403 chainNetGalGal6,701 chainNetGalGal6,823 chainNetXenTro7,19 chainNetXenTro7,183 chainNetXenTro7,313 chainNetXenTro7,413 chainNetXenTro7,713 chainNetXenTro7,835 chainNetXenTro9,18 chainNetXenTro9,181 chainNetXenTro9,311 chainNetXenTro9,410 chainNetXenTro9,710 chainNetXenTro9,832 chainXenTro7,16 chainXenTro7,180 chainXenTro7,310 chainXenTro7,410 chainXenTro7,710 chainXenTro7,832 chainXenTro9,15 chainXenTro9,178 chainXenTro9,308 chainXenTro9,407 chainXenTro9,707 chainXenTro9,829 cpgIslandExt,72 cpgIslandExt,222 cpgIslandExt,585 cpgIslandExtUnmasked,75 cpgIslandExtUnmasked,225 cpgIslandExtUnmasked,588 cpgIslandSuper,72 cpgIslandSuper,222 cpgIslandSuper,585 gap,8 gap,37 gap,45 gap,75 gap,116 gc5BaseBw,38 gc5BaseBw,77 genscan,11 genscan,65 genscan,128 gold,9 gold,39 gold,44 gold,70 gold,140 microsat,11 microsat,50 microsat,99 nestedRepeats,15 nestedRepeats,79 nestedRepeats,321 netGalGal6,13 netGalGal6,173 netGalGal6,301 netGalGal6,400 netGalGal6,698 netGalGal6,820 netXenTro7,16 netXenTro7,180 netXenTro7,310 netXenTro7,410 netXenTro7,710 netXenTro7,832 netXenTro9,15 netXenTro9,178 netXenTro9,308 netXenTro9,407 netXenTro9,707 netXenTro9,829 refSeqComposite,58 refSeqComposite,145 refSeqComposite,501 refSeqComposite,565 refSeqComposite,726 refSeqComposite,816 refSeqComposite,855 refSeqComposite,1390 refSeqComposite,1438 refSeqComposite,1626 refSeqComposite,1712 rmsk,10 rmsk,51 rmsk,143 rmsk,344 simpleRepeat,12 simpleRepeat,31 transMapEnsemblV5,15 transMapEnsemblV5,96 transMapEnsemblV5,106 transMapEnsemblV5,134 transMapEnsemblV5,288 transMapEnsemblV5,677 transMapEstV5,13 transMapEstV5,65 transMapEstV5,75 transMapEstV5,103 transMapEstV5,257 transMapEstV5,646 transMapRefSeqV5,14 transMapRefSeqV5,65 transMapRefSeqV5,75 transMapRefSeqV5,103 transMapRefSeqV5,257 transMapRefSeqV5,646 transMapRnaV5,14 transMapRnaV5,65 transMapRnaV5,75 transMapRnaV5,103 transMapRnaV5,257 transMapRnaV5,646 transMapV5,171 transMapV5,181 transMapV5,209 transMapV5,363 transMapV5,752 ucscToINSDC,14 ucscToINSDC,46 ucscToRefSeq,9 ucscToRefSeq,40 uniprot,12 uniprot,134 uniprot,149 uniprot,218 uniprot,220 uniprot,653 uniprot,663 uniprot,871 uniprot,878 uniprot,1018 uniprot,1058 uniprot,1063 uniprot,1248 uniprot,1259 uniprot,1352 uniprot,1447 uniprot,1530 uniprot,1553 uniprot,1562 uniprot,1657 uniprot,1674 uniprot,1688 uniprot,1939 windowmaskerSdust,13 windowmaskerSdust,49 windowmaskerSdust,87 xenoRefGene,12 xenoRefGene,38 xenoRefGene,47 xenoRefGene,85 xenoRefGene,140 xenoRefGene,179 xenoRefGene,215 xenoRefGene,281 those microsat,62 nestedRepeats,272 refSeqComposite,219 refSeqComposite,348 refSeqComposite,1239 uniprot,729 xenoRefGene,229 thousands chainGalGal6,254 chainNetGalGal6,257 chainNetXenTro7,264 chainNetXenTro9,262 chainXenTro7,261 chainXenTro9,259 netGalGal6,254 netXenTro7,261 netXenTro9,259 three uniprot,1227 three-step uniprot,989 through gap,109 nestedRepeats,97 refSeqComposite,731 refSeqComposite,1325 refSeqComposite,1363 rmsk,309 transMapEnsemblV5,530 transMapEstV5,499 transMapRefSeqV5,499 transMapRnaV5,499 transMapV5,605 uniprot,98 uniprot,133 uniprot,633 uniprot,804 uniprot,1521 xenoRefGene,90 tibetan chainGalGal6,72 chainGalGal6,99 chainGalGal6,157 chainGalGal6,204 chainGalGal6,271 chainGalGal6,279 chainGalGal6,579 chainGalGal6,632 chainNetGalGal6,75 chainNetGalGal6,102 chainNetGalGal6,160 chainNetGalGal6,207 chainNetGalGal6,274 chainNetGalGal6,282 chainNetGalGal6,582 chainNetGalGal6,635 chainNetXenTro7,80 chainNetXenTro7,108 chainNetXenTro7,167 chainNetXenTro7,214 chainNetXenTro7,282 chainNetXenTro7,290 chainNetXenTro7,593 chainNetXenTro7,647 chainNetXenTro9,78 chainNetXenTro9,106 chainNetXenTro9,165 chainNetXenTro9,212 chainNetXenTro9,280 chainNetXenTro9,288 chainNetXenTro9,590 chainNetXenTro9,644 chainXenTro7,77 chainXenTro7,105 chainXenTro7,164 chainXenTro7,211 chainXenTro7,279 chainXenTro7,287 chainXenTro7,590 chainXenTro7,644 chainXenTro9,75 chainXenTro9,103 chainXenTro9,162 chainXenTro9,209 chainXenTro9,277 chainXenTro9,285 chainXenTro9,587 chainXenTro9,641 gap,17 gold,19 netGalGal6,72 netGalGal6,99 netGalGal6,157 netGalGal6,204 netGalGal6,271 netGalGal6,279 netGalGal6,579 netGalGal6,632 netXenTro7,77 netXenTro7,105 netXenTro7,164 netXenTro7,211 netXenTro7,279 netXenTro7,287 netXenTro7,590 netXenTro7,644 netXenTro9,75 netXenTro9,103 netXenTro9,162 netXenTro9,209 netXenTro9,277 netXenTro9,285 netXenTro9,587 netXenTro9,641 refSeqComposite,19 refSeqComposite,442 refSeqComposite,464 refSeqComposite,498 refSeqComposite,1234 transMapEnsemblV5,90 transMapEnsemblV5,203 transMapEnsemblV5,334 transMapEstV5,59 transMapEstV5,172 transMapEstV5,303 transMapRefSeqV5,59 transMapRefSeqV5,172 transMapRefSeqV5,303 transMapRnaV5,59 transMapRnaV5,172 transMapRnaV5,303 transMapV5,60 transMapV5,278 transMapV5,409 xenoRefGene,24 xenoRefGene,224 time chainGalGal6,803 chainNetGalGal6,806 chainNetXenTro7,818 chainNetXenTro9,815 chainXenTro7,815 chainXenTro9,812 cpgIslandExt,99 cpgIslandExt,237 cpgIslandExtUnmasked,102 cpgIslandExtUnmasked,240 cpgIslandSuper,99 cpgIslandSuper,237 netGalGal6,803 netXenTro7,815 netXenTro9,812 to augustusGene,115 augustusGene,170 augustusGene,249 augustusGene,301 chainGalGal6,23 chainGalGal6,70 chainGalGal6,145 chainGalGal6,215 chainGalGal6,227 chainGalGal6,321 chainGalGal6,332 chainGalGal6,337 chainGalGal6,349 chainGalGal6,355 chainGalGal6,378 chainGalGal6,459 chainGalGal6,473 chainGalGal6,557 chainGalGal6,660 chainGalGal6,796 chainGalGal6,808 chainGalGal6,848 chainGalGal6,871 chainGalGal6,881 chainNetGalGal6,26 chainNetGalGal6,73 chainNetGalGal6,148 chainNetGalGal6,218 chainNetGalGal6,230 chainNetGalGal6,324 chainNetGalGal6,335 chainNetGalGal6,340 chainNetGalGal6,352 chainNetGalGal6,358 chainNetGalGal6,381 chainNetGalGal6,462 chainNetGalGal6,476 chainNetGalGal6,560 chainNetGalGal6,663 chainNetGalGal6,799 chainNetGalGal6,811 chainNetGalGal6,851 chainNetGalGal6,874 chainNetGalGal6,884 chainNetXenTro7,29 chainNetXenTro7,78 chainNetXenTro7,154 chainNetXenTro7,225 chainNetXenTro7,237 chainNetXenTro7,334 chainNetXenTro7,345 chainNetXenTro7,350 chainNetXenTro7,362 chainNetXenTro7,368 chainNetXenTro7,391 chainNetXenTro7,472 chainNetXenTro7,486 chainNetXenTro7,570 chainNetXenTro7,675 chainNetXenTro7,811 chainNetXenTro7,823 chainNetXenTro7,863 chainNetXenTro7,886 chainNetXenTro7,896 chainNetXenTro9,28 chainNetXenTro9,76 chainNetXenTro9,152 chainNetXenTro9,223 chainNetXenTro9,235 chainNetXenTro9,331 chainNetXenTro9,342 chainNetXenTro9,347 chainNetXenTro9,359 chainNetXenTro9,365 chainNetXenTro9,388 chainNetXenTro9,469 chainNetXenTro9,483 chainNetXenTro9,567 chainNetXenTro9,672 chainNetXenTro9,808 chainNetXenTro9,820 chainNetXenTro9,860 chainNetXenTro9,883 chainNetXenTro9,893 chainXenTro7,26 chainXenTro7,75 chainXenTro7,151 chainXenTro7,222 chainXenTro7,234 chainXenTro7,331 chainXenTro7,342 chainXenTro7,347 chainXenTro7,359 chainXenTro7,365 chainXenTro7,388 chainXenTro7,469 chainXenTro7,483 chainXenTro7,567 chainXenTro7,672 chainXenTro7,808 chainXenTro7,820 chainXenTro7,860 chainXenTro7,883 chainXenTro7,893 chainXenTro9,25 chainXenTro9,73 chainXenTro9,149 chainXenTro9,220 chainXenTro9,232 chainXenTro9,328 chainXenTro9,339 chainXenTro9,344 chainXenTro9,356 chainXenTro9,362 chainXenTro9,385 chainXenTro9,466 chainXenTro9,480 chainXenTro9,564 chainXenTro9,669 chainXenTro9,805 chainXenTro9,817 chainXenTro9,857 chainXenTro9,880 chainXenTro9,890 cpgIslandExt,69 cpgIslandExt,103 cpgIslandExt,124 cpgIslandExt,139 cpgIslandExt,205 cpgIslandExt,283 cpgIslandExt,358 cpgIslandExt,365 cpgIslandExt,371 cpgIslandExtUnmasked,72 cpgIslandExtUnmasked,106 cpgIslandExtUnmasked,127 cpgIslandExtUnmasked,142 cpgIslandExtUnmasked,208 cpgIslandExtUnmasked,286 cpgIslandExtUnmasked,361 cpgIslandExtUnmasked,368 cpgIslandExtUnmasked,374 cpgIslandSuper,69 cpgIslandSuper,103 cpgIslandSuper,124 cpgIslandSuper,139 cpgIslandSuper,205 cpgIslandSuper,283 cpgIslandSuper,358 cpgIslandSuper,365 cpgIslandSuper,371 gc5BaseBw,48 genscan,95 genscan,105 genscan,114 genscan,145 genscan,171 gold,132 microsat,18 microsat,38 microsat,121 nestedRepeats,148 nestedRepeats,152 nestedRepeats,174 nestedRepeats,184 nestedRepeats,200 nestedRepeats,225 nestedRepeats,234 nestedRepeats,260 nestedRepeats,304 nestedRepeats,319 netGalGal6,23 netGalGal6,70 netGalGal6,145 netGalGal6,215 netGalGal6,227 netGalGal6,321 netGalGal6,332 netGalGal6,337 netGalGal6,349 netGalGal6,355 netGalGal6,378 netGalGal6,459 netGalGal6,473 netGalGal6,557 netGalGal6,660 netGalGal6,796 netGalGal6,808 netGalGal6,848 netGalGal6,871 netGalGal6,881 netXenTro7,26 netXenTro7,75 netXenTro7,151 netXenTro7,222 netXenTro7,234 netXenTro7,331 netXenTro7,342 netXenTro7,347 netXenTro7,359 netXenTro7,365 netXenTro7,388 netXenTro7,469 netXenTro7,483 netXenTro7,567 netXenTro7,672 netXenTro7,808 netXenTro7,820 netXenTro7,860 netXenTro7,883 netXenTro7,893 netXenTro9,25 netXenTro9,73 netXenTro9,149 netXenTro9,220 netXenTro9,232 netXenTro9,328 netXenTro9,339 netXenTro9,344 netXenTro9,356 netXenTro9,362 netXenTro9,385 netXenTro9,466 netXenTro9,480 netXenTro9,564 netXenTro9,669 netXenTro9,805 netXenTro9,817 netXenTro9,857 netXenTro9,880 netXenTro9,890 refSeqComposite,55 refSeqComposite,115 refSeqComposite,156 refSeqComposite,168 refSeqComposite,174 refSeqComposite,306 refSeqComposite,309 refSeqComposite,324 refSeqComposite,368 refSeqComposite,440 refSeqComposite,496 refSeqComposite,679 refSeqComposite,704 refSeqComposite,743 refSeqComposite,756 refSeqComposite,778 refSeqComposite,827 refSeqComposite,834 refSeqComposite,858 refSeqComposite,905 refSeqComposite,911 refSeqComposite,919 refSeqComposite,925 refSeqComposite,938 refSeqComposite,980 refSeqComposite,1029 refSeqComposite,1062 refSeqComposite,1098 refSeqComposite,1109 refSeqComposite,1175 refSeqComposite,1442 refSeqComposite,1536 refSeqComposite,1589 refSeqComposite,1688 rmsk,147 rmsk,315 rmsk,327 rmsk,342 simpleRepeat,81 transMapEnsemblV5,112 transMapEnsemblV5,122 transMapEnsemblV5,178 transMapEnsemblV5,201 transMapEnsemblV5,260 transMapEnsemblV5,293 transMapEnsemblV5,301 transMapEnsemblV5,318 transMapEnsemblV5,332 transMapEnsemblV5,345 transMapEnsemblV5,384 transMapEnsemblV5,429 transMapEnsemblV5,439 transMapEnsemblV5,472 transMapEnsemblV5,478 transMapEnsemblV5,491 transMapEnsemblV5,651 transMapEnsemblV5,693 transMapEnsemblV5,772 transMapEstV5,81 transMapEstV5,91 transMapEstV5,147 transMapEstV5,170 transMapEstV5,229 transMapEstV5,262 transMapEstV5,270 transMapEstV5,287 transMapEstV5,301 transMapEstV5,314 transMapEstV5,353 transMapEstV5,398 transMapEstV5,408 transMapEstV5,441 transMapEstV5,447 transMapEstV5,460 transMapEstV5,620 transMapEstV5,662 transMapEstV5,741 transMapRefSeqV5,81 transMapRefSeqV5,91 transMapRefSeqV5,147 transMapRefSeqV5,170 transMapRefSeqV5,229 transMapRefSeqV5,262 transMapRefSeqV5,270 transMapRefSeqV5,287 transMapRefSeqV5,301 transMapRefSeqV5,314 transMapRefSeqV5,353 transMapRefSeqV5,398 transMapRefSeqV5,408 transMapRefSeqV5,441 transMapRefSeqV5,447 transMapRefSeqV5,460 transMapRefSeqV5,620 transMapRefSeqV5,662 transMapRefSeqV5,741 transMapRnaV5,81 transMapRnaV5,91 transMapRnaV5,147 transMapRnaV5,170 transMapRnaV5,229 transMapRnaV5,262 transMapRnaV5,270 transMapRnaV5,287 transMapRnaV5,301 transMapRnaV5,314 transMapRnaV5,353 transMapRnaV5,398 transMapRnaV5,408 transMapRnaV5,441 transMapRnaV5,447 transMapRnaV5,460 transMapRnaV5,620 transMapRnaV5,662 transMapRnaV5,741 transMapV5,80 transMapV5,90 transMapV5,121 transMapV5,132 transMapV5,155 transMapV5,187 transMapV5,197 transMapV5,253 transMapV5,276 transMapV5,335 transMapV5,368 transMapV5,376 transMapV5,393 transMapV5,407 transMapV5,420 transMapV5,459 transMapV5,504 transMapV5,514 transMapV5,547 transMapV5,553 transMapV5,566 transMapV5,726 transMapV5,768 transMapV5,847 ucscToINSDC,22 ucscToRefSeq,17 unipAliSwissprot,8 unipAliTrembl,8 uniprot,27 uniprot,86 uniprot,101 uniprot,118 uniprot,201 uniprot,214 uniprot,226 uniprot,245 uniprot,492 uniprot,525 uniprot,552 uniprot,559 uniprot,658 uniprot,682 uniprot,764 uniprot,784 uniprot,801 uniprot,849 uniprot,917 uniprot,920 uniprot,955 uniprot,974 uniprot,1008 uniprot,1088 uniprot,1196 uniprot,1215 uniprot,1220 uniprot,1247 uniprot,1285 uniprot,1336 uniprot,1356 uniprot,1369 uniprot,1405 uniprot,1413 uniprot,1460 uniprot,1473 uniprot,1478 uniprot,1493 uniprot,1518 uniprot,1551 uniprot,1676 uniprot,1761 uniprot,1802 uniprot,1828 uniprot,1846 uniprot,1851 uniprot,1856 uniprot,1884 uniprot,1890 uniprot,1975 windowmaskerSdust,47 xenoRefGene,115 xenoRefGene,151 xenoRefGene,158 xenoRefGene,182 xenoRefGene,208 together chainGalGal6,125 chainNetGalGal6,128 chainNetXenTro7,134 chainNetXenTro9,132 chainXenTro7,131 chainXenTro9,129 netGalGal6,125 netXenTro7,131 netXenTro9,129 tolerate chainGalGal6,93 chainNetGalGal6,96 chainNetXenTro7,101 chainNetXenTro9,99 chainXenTro7,98 chainXenTro9,96 netGalGal6,93 netXenTro7,98 netXenTro9,96 tolerated uniprot,1257 too refSeqComposite,936 tool refSeqComposite,1509 refSeqComposite,1738 transMapEnsemblV5,615 transMapEnsemblV5,646 transMapEstV5,584 transMapEstV5,615 transMapRefSeqV5,584 transMapRefSeqV5,615 transMapRnaV5,584 transMapRnaV5,615 transMapV5,690 transMapV5,721 uniprot,1766 uniprot,1797 windowmaskerSdust,24 xenoRefGene,308 toolkit windowmaskerSdust,31 windowmaskerSdust,38 tools nestedRepeats,314 rmsk,337 uniprot,1873 top chainGalGal6,514 chainNetGalGal6,517 chainNetXenTro7,527 chainNetXenTro9,524 chainXenTro7,524 chainXenTro9,521 cpgIslandExt,220 cpgIslandExtUnmasked,223 cpgIslandSuper,220 netGalGal6,514 netXenTro7,524 netXenTro9,521 refSeqComposite,737 uniprot,1304 uniprot,1340 uniprot,1489 xenoRefGene,95 top-level chainGalGal6,389 chainGalGal6,409 chainNetGalGal6,392 chainNetGalGal6,412 chainNetXenTro7,402 chainNetXenTro7,422 chainNetXenTro9,399 chainNetXenTro9,419 chainXenTro7,399 chainXenTro7,419 chainXenTro9,396 chainXenTro9,416 netGalGal6,389 netGalGal6,409 netXenTro7,399 netXenTro7,419 netXenTro9,396 netXenTro9,416 top-scoring uniprot,792 topological uniprot,330 track augustusGene,14 augustusGene,107 chainGalGal6,14 chainGalGal6,58 chainGalGal6,61 chainGalGal6,121 chainGalGal6,263 chainGalGal6,266 chainGalGal6,316 chainGalGal6,351 chainGalGal6,383 chainGalGal6,570 chainGalGal6,699 chainGalGal6,762 chainNetGalGal6,17 chainNetGalGal6,61 chainNetGalGal6,64 chainNetGalGal6,124 chainNetGalGal6,266 chainNetGalGal6,269 chainNetGalGal6,319 chainNetGalGal6,354 chainNetGalGal6,386 chainNetGalGal6,573 chainNetGalGal6,702 chainNetGalGal6,765 chainNetXenTro7,20 chainNetXenTro7,64 chainNetXenTro7,67 chainNetXenTro7,130 chainNetXenTro7,273 chainNetXenTro7,276 chainNetXenTro7,329 chainNetXenTro7,364 chainNetXenTro7,396 chainNetXenTro7,583 chainNetXenTro7,714 chainNetXenTro7,777 chainNetXenTro9,19 chainNetXenTro9,63 chainNetXenTro9,66 chainNetXenTro9,128 chainNetXenTro9,271 chainNetXenTro9,274 chainNetXenTro9,326 chainNetXenTro9,361 chainNetXenTro9,393 chainNetXenTro9,580 chainNetXenTro9,711 chainNetXenTro9,774 chainXenTro7,17 chainXenTro7,61 chainXenTro7,64 chainXenTro7,127 chainXenTro7,270 chainXenTro7,273 chainXenTro7,326 chainXenTro7,361 chainXenTro7,393 chainXenTro7,580 chainXenTro7,711 chainXenTro7,774 chainXenTro9,16 chainXenTro9,60 chainXenTro9,63 chainXenTro9,125 chainXenTro9,268 chainXenTro9,271 chainXenTro9,323 chainXenTro9,358 chainXenTro9,390 chainXenTro9,577 chainXenTro9,708 chainXenTro9,771 cpgIslandExt,173 cpgIslandExt,202 cpgIslandExt,216 cpgIslandExt,314 cpgIslandExt,318 cpgIslandExt,402 cpgIslandExt,492 cpgIslandExt,586 cpgIslandExtUnmasked,176 cpgIslandExtUnmasked,205 cpgIslandExtUnmasked,219 cpgIslandExtUnmasked,317 cpgIslandExtUnmasked,321 cpgIslandExtUnmasked,405 cpgIslandExtUnmasked,495 cpgIslandExtUnmasked,589 cpgIslandSuper,173 cpgIslandSuper,202 cpgIslandSuper,216 cpgIslandSuper,314 cpgIslandSuper,318 cpgIslandSuper,402 cpgIslandSuper,492 cpgIslandSuper,586 gap,9 gap,76 gc5BaseBw,15 gc5BaseBw,39 genscan,12 genscan,66 genscan,76 genscan,87 gold,10 gold,71 gold,141 microsat,12 microsat,51 microsat,59 microsat,87 nestedRepeats,16 nestedRepeats,78 nestedRepeats,80 nestedRepeats,322 netGalGal6,14 netGalGal6,58 netGalGal6,61 netGalGal6,121 netGalGal6,263 netGalGal6,266 netGalGal6,316 netGalGal6,351 netGalGal6,383 netGalGal6,570 netGalGal6,699 netGalGal6,762 netXenTro7,17 netXenTro7,61 netXenTro7,64 netXenTro7,127 netXenTro7,270 netXenTro7,273 netXenTro7,326 netXenTro7,361 netXenTro7,393 netXenTro7,580 netXenTro7,711 netXenTro7,774 netXenTro9,16 netXenTro9,60 netXenTro9,63 netXenTro9,125 netXenTro9,268 netXenTro9,271 netXenTro9,323 netXenTro9,358 netXenTro9,390 netXenTro9,577 netXenTro9,708 netXenTro9,771 refSeqComposite,17 refSeqComposite,46 refSeqComposite,146 refSeqComposite,150 refSeqComposite,312 refSeqComposite,316 refSeqComposite,329 refSeqComposite,336 refSeqComposite,473 refSeqComposite,502 refSeqComposite,512 refSeqComposite,566 refSeqComposite,727 refSeqComposite,740 refSeqComposite,758 refSeqComposite,817 refSeqComposite,846 refSeqComposite,871 refSeqComposite,1201 refSeqComposite,1216 refSeqComposite,1341 refSeqComposite,1713 rmsk,11 rmsk,52 rmsk,144 rmsk,345 simpleRepeat,13 transMapEnsemblV5,16 transMapEnsemblV5,97 transMapEnsemblV5,107 transMapEnsemblV5,233 transMapEnsemblV5,572 transMapEnsemblV5,576 transMapEnsemblV5,678 transMapEstV5,14 transMapEstV5,66 transMapEstV5,76 transMapEstV5,202 transMapEstV5,541 transMapEstV5,545 transMapEstV5,647 transMapRefSeqV5,15 transMapRefSeqV5,66 transMapRefSeqV5,76 transMapRefSeqV5,202 transMapRefSeqV5,541 transMapRefSeqV5,545 transMapRefSeqV5,647 transMapRnaV5,15 transMapRnaV5,66 transMapRnaV5,76 transMapRnaV5,202 transMapRnaV5,541 transMapRnaV5,545 transMapRnaV5,647 transMapV5,102 transMapV5,172 transMapV5,182 transMapV5,308 transMapV5,647 transMapV5,651 transMapV5,753 ucscToINSDC,15 ucscToINSDC,47 ucscToRefSeq,10 ucscToRefSeq,41 uniprot,13 uniprot,104 uniprot,150 uniprot,219 uniprot,221 uniprot,234 uniprot,422 uniprot,429 uniprot,576 uniprot,654 uniprot,710 uniprot,1004 uniprot,1208 uniprot,1277 uniprot,1554 uniprot,1563 uniprot,1583 uniprot,1658 uniprot,1671 uniprot,1689 uniprot,1713 uniprot,1754 uniprot,1940 windowmaskerSdust,14 windowmaskerSdust,50 windowmaskerSdust,88 xenoRefGene,13 xenoRefGene,39 xenoRefGene,48 xenoRefGene,86 xenoRefGene,98 xenoRefGene,141 xenoRefGene,170 xenoRefGene,282 tracks augustusGene,41 chainGalGal6,776 chainNetGalGal6,779 chainNetXenTro7,791 chainNetXenTro9,788 chainXenTro7,788 chainXenTro9,785 genscan,56 genscan,74 netGalGal6,776 netXenTro7,788 netXenTro9,785 refSeqComposite,100 refSeqComposite,136 refSeqComposite,170 refSeqComposite,405 refSeqComposite,456 refSeqComposite,597 refSeqComposite,605 refSeqComposite,1141 refSeqComposite,1151 refSeqComposite,1227 refSeqComposite,1297 refSeqComposite,1376 refSeqComposite,1477 refSeqComposite,1584 refSeqComposite,1677 refSeqComposite,1702 transMapEnsemblV5,105 transMapEnsemblV5,525 transMapEnsemblV5,586 transMapEstV5,74 transMapEstV5,494 transMapEstV5,555 transMapRefSeqV5,74 transMapRefSeqV5,494 transMapRefSeqV5,555 transMapRnaV5,74 transMapRnaV5,494 transMapRnaV5,555 transMapV5,13 transMapV5,180 transMapV5,600 transMapV5,661 uniprot,91 uniprot,123 uniprot,206 uniprot,409 uniprot,1643 xenoRefGene,56 traditional chainGalGal6,85 chainNetGalGal6,88 chainNetXenTro7,93 chainNetXenTro9,91 chainXenTro7,90 chainXenTro9,88 netGalGal6,85 netXenTro7,90 netXenTro9,88 trained augustusGene,150 training augustusGene,162 augustusGene,176 augustusGene,180 augustusGene,199 augustusGene,228 augustusGene,243 augustusGene,259 augustusGene,273 transcribed refSeqComposite,431 transcript refSeqComposite,536 refSeqComposite,886 refSeqComposite,914 refSeqComposite,922 refSeqComposite,993 refSeqComposite,1036 refSeqComposite,1057 refSeqComposite,1122 refSeqComposite,1132 transMapEnsemblV5,154 transMapEnsemblV5,326 transMapEnsemblV5,380 transMapEstV5,123 transMapEstV5,295 transMapEstV5,349 transMapRefSeqV5,123 transMapRefSeqV5,295 transMapRefSeqV5,349 transMapRnaV5,123 transMapRnaV5,295 transMapRnaV5,349 transMapV5,229 transMapV5,401 transMapV5,455 uniprot,837 uniprot,908 uniprot,918 uniprot,945 uniprot,963 uniprot,1003 uniprot,1076 uniprot,1223 uniprot,1237 uniprot,1249 uniprot,1263 uniprot,1268 uniprot,1291 uniprot,1325 uniprot,1596 uniprot,1610 uniprot,1623 transcript-genome uniprot,813 uniprot,1619 transcript-to-genome uniprot,806 transcription cpgIslandExt,32 cpgIslandExtUnmasked,35 cpgIslandSuper,32 transcriptional genscan,28 transcripts augustusGene,124 ncbiRefSeqGenomicDiff,7 refSeqComposite,256 refSeqComposite,323 refSeqComposite,472 refSeqComposite,524 refSeqComposite,557 refSeqComposite,1809 transMapEnsemblV5,344 transMapEstV5,313 transMapRefSeqV5,313 transMapRnaV5,313 transMapV5,419 uniprot,786 uniprot,833 uniprot,928 uniprot,936 uniprot,957 uniprot,985 uniprot,992 uniprot,1011 uniprot,1022 uniprot,1032 uniprot,1056 uniprot,1069 uniprot,1091 uniprot,1096 uniprot,1108 uniprot,1127 uniprot,1168 uniprot,1338 uniprot,1474 xenoRefGene,379 translated transMapV5,156 translation augustusGene,57 translational genscan,29 transmap transMapEnsemblV5,1 transMapEnsemblV5,3 transMapEnsemblV5,25 transMapEnsemblV5,443 transMapEnsemblV5,502 transMapEnsemblV5,591 transMapEnsemblV5,594 transMapEnsemblV5,597 transMapEnsemblV5,600 transMapEnsemblV5,666 transMapEstV5,1 transMapEstV5,3 transMapEstV5,23 transMapEstV5,412 transMapEstV5,471 transMapEstV5,560 transMapEstV5,563 transMapEstV5,566 transMapEstV5,569 transMapEstV5,635 transMapRefSeqV5,1 transMapRefSeqV5,3 transMapRefSeqV5,23 transMapRefSeqV5,412 transMapRefSeqV5,471 transMapRefSeqV5,560 transMapRefSeqV5,563 transMapRefSeqV5,566 transMapRefSeqV5,569 transMapRefSeqV5,635 transMapRnaV5,1 transMapRnaV5,3 transMapRnaV5,23 transMapRnaV5,412 transMapRnaV5,471 transMapRnaV5,560 transMapRnaV5,563 transMapRnaV5,566 transMapRnaV5,569 transMapRnaV5,635 transMapV5,1 transMapV5,3 transMapV5,22 transMapV5,71 transMapV5,101 transMapV5,158 transMapV5,518 transMapV5,577 transMapV5,666 transMapV5,669 transMapV5,672 transMapV5,675 transMapV5,741 transmembrane unipLocTransMemb,1 unipLocTransMemb,3 uniprot,265 uniprot,273 uniprot,515 uniprot,567 transposable nestedRepeats,379 rmsk,402 transposons chainGalGal6,571 chainGalGal6,596 chainGalGal6,906 chainNetGalGal6,574 chainNetGalGal6,599 chainNetGalGal6,909 chainNetXenTro7,584 chainNetXenTro7,610 chainNetXenTro7,921 chainNetXenTro9,581 chainNetXenTro9,607 chainNetXenTro9,918 chainXenTro7,581 chainXenTro7,607 chainXenTro7,918 chainXenTro9,578 chainXenTro9,604 chainXenTro9,915 netGalGal6,571 netGalGal6,596 netGalGal6,906 netXenTro7,581 netXenTro7,607 netXenTro7,918 netXenTro9,578 netXenTro9,604 netXenTro9,915 trembl unipAliTrembl,1 unipAliTrembl,6 uniprot,4 uniprot,44 uniprot,79 uniprot,185 uniprot,192 uniprot,199 uniprot,211 uniprot,500 uniprot,604 uniprot,661 trends nestedRepeats,353 rmsk,376 trf simpleRepeat,7 simpleRepeat,26 simpleRepeat,61 simpleRepeat,67 tri-nucleotide microsat,5 microsat,34 tried uniprot,869 trimming chainGalGal6,804 chainNetGalGal6,807 chainNetXenTro7,819 chainNetXenTro9,816 chainXenTro7,816 chainXenTro9,813 netGalGal6,804 netXenTro7,816 netXenTro9,813 trna rmsk,190 tropicalis chainNetXenTro7,2 chainNetXenTro7,6 chainNetXenTro7,72 chainNetXenTro7,106 chainNetXenTro7,160 chainNetXenTro7,281 chainNetXenTro7,309 chainNetXenTro7,592 chainNetXenTro7,642 chainNetXenTro7Viewchain,3 chainNetXenTro7Viewnet,3 chainNetXenTro9,2 chainNetXenTro9,6 chainNetXenTro9,71 chainNetXenTro9,104 chainNetXenTro9,158 chainNetXenTro9,279 chainNetXenTro9,307 chainNetXenTro9,589 chainNetXenTro9,639 chainNetXenTro9Viewchain,3 chainNetXenTro9Viewnet,3 chainXenTro7,2 chainXenTro7,5 chainXenTro7,69 chainXenTro7,103 chainXenTro7,157 chainXenTro7,278 chainXenTro7,306 chainXenTro7,589 chainXenTro7,639 chainXenTro9,2 chainXenTro9,5 chainXenTro9,68 chainXenTro9,101 chainXenTro9,155 chainXenTro9,276 chainXenTro9,304 chainXenTro9,586 chainXenTro9,636 netXenTro7,2 netXenTro7,5 netXenTro7,69 netXenTro7,103 netXenTro7,157 netXenTro7,278 netXenTro7,306 netXenTro7,589 netXenTro7,639 netXenTro9,2 netXenTro9,5 netXenTro9,68 netXenTro9,101 netXenTro9,155 netXenTro9,276 netXenTro9,304 netXenTro9,586 netXenTro9,636 true augustusGene,132 windowmaskerSdust,60 windowmaskerSdust,69 ts cpgIslandExt,106 cpgIslandExtUnmasked,109 cpgIslandSuper,106 turn chainGalGal6,338 chainNetGalGal6,341 chainNetXenTro7,351 chainNetXenTro9,348 chainXenTro7,348 chainXenTro9,345 cpgIslandExt,104 cpgIslandExtUnmasked,107 cpgIslandSuper,104 netGalGal6,338 netXenTro7,348 netXenTro9,345 refSeqComposite,809 xenoRefGene,133 turns uniprot,370 twice cpgIslandExt,354 cpgIslandExtUnmasked,357 cpgIslandSuper,354 two chainGalGal6,912 chainNetGalGal6,915 chainNetXenTro7,927 chainNetXenTro9,924 chainXenTro7,924 chainXenTro9,921 netGalGal6,912 netXenTro7,924 netXenTro9,921 transMapEnsemblV5,455 transMapEnsemblV5,492 transMapEstV5,424 transMapEstV5,461 transMapRefSeqV5,424 transMapRefSeqV5,461 transMapRnaV5,424 transMapRnaV5,461 transMapV5,530 transMapV5,567 uniprot,71 uniprot,630 uniprot,1641 twobittofa cpgIslandExt,411 cpgIslandExt,497 cpgIslandExt,502 cpgIslandExtUnmasked,414 cpgIslandExtUnmasked,500 cpgIslandExtUnmasked,505 cpgIslandSuper,411 cpgIslandSuper,497 cpgIslandSuper,502 type gold,146 uniprot,65 uniprot,271 uniprot,464 uniprot,614 types augustusGene,89 chainGalGal6,510 chainNetGalGal6,513 chainNetXenTro7,523 chainNetXenTro9,520 chainXenTro7,520 chainXenTro9,517 gap,122 gold,137 netGalGal6,510 netXenTro7,520 netXenTro9,517 refSeqComposite,875 refSeqComposite,890 transMapEnsemblV5,139 transMapEstV5,108 transMapRefSeqV5,108 transMapRnaV5,108 transMapV5,214 uniprot,676 typical cpgIslandExt,161 cpgIslandExtUnmasked,164 cpgIslandSuper,161 refSeqComposite,430 typically cpgIslandExt,29 cpgIslandExtUnmasked,32 cpgIslandSuper,29 gc5BaseBw,33 u chainGalGal6,1075 chainNetGalGal6,1078 chainNetXenTro7,1090 chainNetXenTro9,1087 chainXenTro7,1087 chainXenTro9,1084 netGalGal6,1075 netXenTro7,1087 netXenTro9,1084 ucsc nestedRepeats,245 refSeqComposite,44 refSeqComposite,48 refSeqComposite,71 refSeqComposite,193 refSeqComposite,334 refSeqComposite,480 refSeqComposite,486 refSeqComposite,595 refSeqComposite,1155 refSeqComposite,1205 refSeqComposite,1213 refSeqComposite,1418 refSeqComposite,1603 refSeqComposite,1717 transMapEnsemblV5,35 transMapEnsemblV5,163 transMapEnsemblV5,184 transMapEnsemblV5,685 transMapEstV5,33 transMapEstV5,132 transMapEstV5,153 transMapEstV5,654 transMapRefSeqV5,33 transMapRefSeqV5,132 transMapRefSeqV5,153 transMapRefSeqV5,654 transMapRnaV5,33 transMapRnaV5,132 transMapRnaV5,153 transMapRnaV5,654 transMapV5,32 transMapV5,238 transMapV5,259 transMapV5,760 ucscToINSDC,17 ucscToRefSeq,12 unipAliSwissprot,3 unipAliTrembl,3 uniprot,107 uniprot,190 uniprot,773 uniprot,826 uniprot,827 uniprot,844 uniprot,1206 uniprot,1275 uniprot,1668 uniprot,1947 xenoRefGene,286 unambiguously refSeqComposite,1112 uncheck refSeqComposite,164 undergone refSeqComposite,618 xenoRefGene,69 underlies genscan,142 underlying uniprot,1682 xenoRefGene,37 underneath chainGalGal6,840 chainNetGalGal6,843 chainNetXenTro7,855 chainNetXenTro9,852 chainXenTro7,852 chainXenTro9,849 netGalGal6,840 netXenTro7,852 netXenTro9,849 unexpected uniprot,766 ungapped chainGalGal6,449 chainNetGalGal6,452 chainNetXenTro7,462 chainNetXenTro9,459 chainXenTro7,459 chainXenTro9,456 netGalGal6,449 netXenTro7,459 netXenTro9,456 uniprot unipChain,2 unipConflict,3 unipDisulfBond,3 unipDomain,2 unipInterest,2 unipLocCytopl,2 unipLocExtra,2 unipLocSignal,3 unipLocTransMemb,2 unipModif,3 unipMut,2 unipOther,3 unipRepeat,2 unipStruct,2 uniprot,1 uniprot,2 uniprot,23 uniprot,30 uniprot,41 uniprot,43 uniprot,68 uniprot,152 uniprot,237 uniprot,253 uniprot,264 uniprot,275 uniprot,286 uniprot,296 uniprot,322 uniprot,332 uniprot,337 uniprot,349 uniprot,358 uniprot,371 uniprot,380 uniprot,382 uniprot,392 uniprot,413 uniprot,424 uniprot,453 uniprot,494 uniprot,529 uniprot,544 uniprot,573 uniprot,669 uniprot,714 uniprot,721 uniprot,738 uniprot,750 uniprot,779 uniprot,924 uniprot,996 uniprot,1016 uniprot,1029 uniprot,1231 uniprot,1437 uniprot,1503 uniprot,1509 uniprot,1513 uniprot,1591 uniprot,1669 uniprot,1702 uniprot,1817 uniprot,1845 uniprot,1910 uniprot,1964 uniprot,1976 uniprot,1985 uniprot,1996 uniprot-annotated uniprot,1279 unipstruct.bb uniprot,1818 uniptogenome.over.chain.gz uniprot,1896 uniprot,1912 uniprot,1934 uniptogenomelift.psl.gz uniprot,1899 unique transMapEnsemblV5,386 transMapEnsemblV5,397 transMapEnsemblV5,434 transMapEnsemblV5,445 transMapEstV5,355 transMapEstV5,366 transMapEstV5,403 transMapEstV5,414 transMapRefSeqV5,355 transMapRefSeqV5,366 transMapRefSeqV5,403 transMapRefSeqV5,414 transMapRnaV5,355 transMapRnaV5,366 transMapRnaV5,403 transMapRnaV5,414 transMapV5,461 transMapV5,472 transMapV5,509 transMapV5,520 uniprot,1600 universal uniprot,1993 university chainGalGal6,926 chainGalGal6,960 chainGalGal6,1006 chainGalGal6,1029 chainNetGalGal6,929 chainNetGalGal6,963 chainNetGalGal6,1009 chainNetGalGal6,1032 chainNetXenTro7,941 chainNetXenTro7,975 chainNetXenTro7,1021 chainNetXenTro7,1044 chainNetXenTro9,938 chainNetXenTro9,972 chainNetXenTro9,1018 chainNetXenTro9,1041 chainXenTro7,938 chainXenTro7,972 chainXenTro7,1018 chainXenTro7,1041 chainXenTro9,935 chainXenTro9,969 chainXenTro9,1015 chainXenTro9,1038 netGalGal6,926 netGalGal6,960 netGalGal6,1006 netGalGal6,1029 netXenTro7,938 netXenTro7,972 netXenTro7,1018 netXenTro7,1041 netXenTro9,935 netXenTro9,969 netXenTro9,1015 netXenTro9,1038 unknown rmsk,203 unless cpgIslandExt,119 cpgIslandExtUnmasked,122 cpgIslandSuper,119 nestedRepeats,206 unmasked cpgIslandExt,169 cpgIslandExt,208 cpgIslandExt,315 cpgIslandExt,491 cpgIslandExtUnmasked,1 cpgIslandExtUnmasked,172 cpgIslandExtUnmasked,211 cpgIslandExtUnmasked,318 cpgIslandExtUnmasked,494 cpgIslandSuper,169 cpgIslandSuper,208 cpgIslandSuper,315 cpgIslandSuper,491 unprocessed chainGalGal6,230 chainNetGalGal6,233 chainNetXenTro7,240 chainNetXenTro9,238 chainXenTro7,237 chainXenTro9,235 netGalGal6,230 netXenTro7,237 netXenTro9,235 unpublished cpgIslandExt,602 cpgIslandExtUnmasked,605 cpgIslandSuper,602 unsequenced chainGalGal6,187 chainNetGalGal6,190 chainNetXenTro7,197 chainNetXenTro9,195 chainXenTro7,194 chainXenTro9,192 netGalGal6,187 netXenTro7,194 netXenTro9,192 unsure rmsk,263 untranscribed refSeqComposite,408 up gold,77 refSeqComposite,1444 refSeqComposite,1638 rmsk,146 update nestedRepeats,46 nestedRepeats,58 nestedRepeats,336 nestedRepeats,343 refSeqComposite,1774 rmsk,82 rmsk,94 rmsk,359 rmsk,366 xenoRefGene,344 updated uniprot,1566 xenoRefGene,41 us uniprot,687 uniprot,1441 use gold,88 refSeqComposite,36 refSeqComposite,1546 uniprot,991 uniprot,1021 uniprot,1073 uniprot,1225 used augustusGene,146 augustusGene,174 augustusGene,183 augustusGene,231 augustusGene,246 chainGalGal6,299 chainGalGal6,673 chainGalGal6,704 chainGalGal6,795 chainGalGal6,847 chainGalGal6,880 chainNetGalGal6,302 chainNetGalGal6,676 chainNetGalGal6,707 chainNetGalGal6,798 chainNetGalGal6,850 chainNetGalGal6,883 chainNetXenTro7,311 chainNetXenTro7,688 chainNetXenTro7,719 chainNetXenTro7,810 chainNetXenTro7,862 chainNetXenTro7,895 chainNetXenTro9,309 chainNetXenTro9,685 chainNetXenTro9,716 chainNetXenTro9,807 chainNetXenTro9,859 chainNetXenTro9,892 chainXenTro7,308 chainXenTro7,685 chainXenTro7,716 chainXenTro7,807 chainXenTro7,859 chainXenTro7,892 chainXenTro9,306 chainXenTro9,682 chainXenTro9,713 chainXenTro9,804 chainXenTro9,856 chainXenTro9,889 cpgIslandExt,308 cpgIslandExtUnmasked,311 cpgIslandSuper,308 genscan,159 gold,14 nestedRepeats,247 nestedRepeats,292 nestedRepeats,318 netGalGal6,299 netGalGal6,673 netGalGal6,704 netGalGal6,795 netGalGal6,847 netGalGal6,880 netXenTro7,308 netXenTro7,685 netXenTro7,716 netXenTro7,807 netXenTro7,859 netXenTro7,892 netXenTro9,306 netXenTro9,682 netXenTro9,713 netXenTro9,804 netXenTro9,856 netXenTro9,889 refSeqComposite,234 refSeqComposite,244 refSeqComposite,1000 rmsk,299 rmsk,341 transMapEnsemblV5,56 transMapEnsemblV5,64 transMapEnsemblV5,187 transMapEnsemblV5,240 transMapEnsemblV5,245 transMapEnsemblV5,265 transMapEnsemblV5,285 transMapEnsemblV5,317 transMapEnsemblV5,650 transMapEstV5,156 transMapEstV5,209 transMapEstV5,214 transMapEstV5,234 transMapEstV5,254 transMapEstV5,286 transMapEstV5,619 transMapRefSeqV5,156 transMapRefSeqV5,209 transMapRefSeqV5,214 transMapRefSeqV5,234 transMapRefSeqV5,254 transMapRefSeqV5,286 transMapRefSeqV5,619 transMapRnaV5,156 transMapRnaV5,209 transMapRnaV5,214 transMapRnaV5,234 transMapRnaV5,254 transMapRnaV5,286 transMapRnaV5,619 transMapV5,70 transMapV5,262 transMapV5,315 transMapV5,320 transMapV5,340 transMapV5,360 transMapV5,392 transMapV5,725 uniprot,1062 uniprot,1087 uniprot,1118 uniprot,1198 uniprot,1210 uniprot,1319 uniprot,1351 uniprot,1550 uniprot,1626 uniprot,1801 uniprot,1883 useful chainGalGal6,284 chainGalGal6,483 chainNetGalGal6,287 chainNetGalGal6,486 chainNetXenTro7,295 chainNetXenTro7,496 chainNetXenTro9,293 chainNetXenTro9,493 chainXenTro7,292 chainXenTro7,493 chainXenTro9,290 chainXenTro9,490 microsat,20 netGalGal6,284 netGalGal6,483 netXenTro7,292 netXenTro7,493 netXenTro9,290 netXenTro9,490 user transMapEnsemblV5,121 transMapEstV5,90 transMapRefSeqV5,90 transMapRnaV5,90 transMapV5,196 users refSeqComposite,826 uniprot,406 uniprot,684 xenoRefGene,150 uses rmsk,79 using augustusGene,294 chainGalGal6,75 chainGalGal6,609 chainGalGal6,769 chainNetGalGal6,78 chainNetGalGal6,612 chainNetGalGal6,772 chainNetXenTro7,83 chainNetXenTro7,623 chainNetXenTro7,784 chainNetXenTro9,81 chainNetXenTro9,620 chainNetXenTro9,781 chainXenTro7,80 chainXenTro7,620 chainXenTro7,781 chainXenTro9,78 chainXenTro9,617 chainXenTro9,778 cpgIslandExt,516 cpgIslandExt,589 cpgIslandExtUnmasked,519 cpgIslandExtUnmasked,592 cpgIslandSuper,516 cpgIslandSuper,589 microsat,90 nestedRepeats,43 nestedRepeats,104 nestedRepeats,283 netGalGal6,75 netGalGal6,609 netGalGal6,769 netXenTro7,80 netXenTro7,620 netXenTro7,781 netXenTro9,78 netXenTro9,617 netXenTro9,778 refSeqComposite,79 refSeqComposite,1156 refSeqComposite,1206 refSeqComposite,1219 refSeqComposite,1237 refSeqComposite,1309 refSeqComposite,1507 refSeqComposite,1592 refSeqComposite,1623 rmsk,15 rmsk,290 transMapEnsemblV5,75 transMapEnsemblV5,564 transMapEnsemblV5,613 transMapEnsemblV5,765 transMapEstV5,44 transMapEstV5,533 transMapEstV5,582 transMapEstV5,734 transMapRefSeqV5,44 transMapRefSeqV5,533 transMapRefSeqV5,582 transMapRefSeqV5,734 transMapRnaV5,44 transMapRnaV5,533 transMapRnaV5,582 transMapRnaV5,734 transMapV5,43 transMapV5,82 transMapV5,125 transMapV5,136 transMapV5,143 transMapV5,639 transMapV5,688 transMapV5,840 uniprot,217 uniprot,722 uniprot,1526 xenoRefGene,227 ustat windowmaskerSdust,66 usually nestedRepeats,192 transMapEnsemblV5,505 transMapEstV5,474 transMapRefSeqV5,474 transMapRnaV5,474 transMapV5,580 utilities refSeqComposite,1530 refSeqComposite,1599 utility refSeqComposite,1595 refSeqComposite,1607 utils cpgIslandExt,565 cpgIslandExtUnmasked,568 cpgIslandSuper,565 utr transMapV5,165 v3.1 augustusGene,7 v4 transMapEnsemblV5,667 transMapEstV5,636 transMapRefSeqV5,636 transMapRnaV5,636 v5 transMapV5,2 transMapV5,742 validate refSeqComposite,829 xenoRefGene,153 validation genscan,107 variant uniprot,2026 variants refSeqComposite,951 uniprot,357 uniprot,415 uniprot,425 uniprot,533 uniprot,943 uniprot,2042 variation microsat,7 nestedRepeats,11 refSeqComposite,1078 rmsk,6 simpleRepeat,8 uniprot,438 windowmaskerSdust,9 variety gc5BaseBw,45 various uniprot,50 vb chainGalGal6,1033 chainNetGalGal6,1036 chainNetXenTro7,1048 chainNetXenTro9,1045 chainXenTro7,1045 chainXenTro9,1042 netGalGal6,1033 netXenTro7,1045 netXenTro9,1042 version augustusGene,23 augustusGene,263 cpgIslandExt,170 cpgIslandExt,193 cpgIslandExt,199 cpgIslandExt,209 cpgIslandExtUnmasked,173 cpgIslandExtUnmasked,196 cpgIslandExtUnmasked,202 cpgIslandExtUnmasked,212 cpgIslandSuper,170 cpgIslandSuper,193 cpgIslandSuper,199 cpgIslandSuper,209 refSeqComposite,1135 refSeqComposite,1570 rmsk,58 transMapEnsemblV5,8 transMapEstV5,6 transMapRefSeqV5,7 transMapRnaV5,7 transMapV5,5 uniprot,1254 uniprot,1297 uniprot,1576 uniprot,1593 versions augustusGene,279 nestedRepeats,251 nestedRepeats,267 refSeqComposite,1342 refSeqComposite,1696 uniprot,1655 vertebrate cpgIslandExt,59 cpgIslandExt,611 cpgIslandExtUnmasked,62 cpgIslandExtUnmasked,614 cpgIslandSuper,59 cpgIslandSuper,611 transMapEnsemblV5,31 transMapEnsemblV5,159 transMapEnsemblV5,192 transMapEstV5,29 transMapEstV5,128 transMapEstV5,161 transMapRefSeqV5,29 transMapRefSeqV5,128 transMapRefSeqV5,161 transMapRnaV5,29 transMapRnaV5,128 transMapRnaV5,161 transMapV5,28 transMapV5,114 transMapV5,234 transMapV5,267 vertebrates augustusGene,209 cpgIslandExt,25 cpgIslandExtUnmasked,28 cpgIslandSuper,25 very uniprot,977 uniprot,1185 uniprot,1399 uniprot,1402 via transMapEnsemblV5,328 transMapEstV5,297 transMapRefSeqV5,297 transMapRnaV5,297 transMapV5,403 uniprot,1293 view chainGalGal6,460 chainNetGalGal6,463 chainNetXenTro7,473 chainNetXenTro9,470 chainXenTro7,470 chainXenTro9,467 cpgIslandExt,206 cpgIslandExtUnmasked,209 cpgIslandSuper,206 netGalGal6,460 netXenTro7,470 netXenTro9,467 viewed gold,80 visibility cpgIslandExt,212 cpgIslandExtUnmasked,215 cpgIslandSuper,212 visible cpgIslandExt,188 cpgIslandExtUnmasked,191 cpgIslandSuper,188 uniprot,147 visit refSeqComposite,104 w chainGalGal6,1035 chainGalGal6,1055 chainGalGal6,1103 chainNetGalGal6,1038 chainNetGalGal6,1058 chainNetGalGal6,1106 chainNetXenTro7,1050 chainNetXenTro7,1070 chainNetXenTro7,1118 chainNetXenTro9,1047 chainNetXenTro9,1067 chainNetXenTro9,1115 chainXenTro7,1047 chainXenTro7,1067 chainXenTro7,1115 chainXenTro9,1044 chainXenTro9,1064 chainXenTro9,1112 gold,149 netGalGal6,1035 netGalGal6,1055 netGalGal6,1103 netXenTro7,1047 netXenTro7,1067 netXenTro7,1115 netXenTro9,1044 netXenTro9,1064 netXenTro9,1112 waack augustusGene,318 want uniprot,690 was augustusGene,230 augustusGene,245 augustusGene,264 augustusGene,280 chainGalGal6,654 chainGalGal6,672 chainGalGal6,793 chainGalGal6,838 chainGalGal6,846 chainGalGal6,866 chainGalGal6,878 chainGalGal6,903 chainGalGal6,921 chainGalGal6,956 chainNetGalGal6,657 chainNetGalGal6,675 chainNetGalGal6,796 chainNetGalGal6,841 chainNetGalGal6,849 chainNetGalGal6,869 chainNetGalGal6,881 chainNetGalGal6,906 chainNetGalGal6,924 chainNetGalGal6,959 chainNetXenTro7,669 chainNetXenTro7,687 chainNetXenTro7,808 chainNetXenTro7,853 chainNetXenTro7,861 chainNetXenTro7,881 chainNetXenTro7,893 chainNetXenTro7,918 chainNetXenTro7,936 chainNetXenTro7,971 chainNetXenTro9,666 chainNetXenTro9,684 chainNetXenTro9,805 chainNetXenTro9,850 chainNetXenTro9,858 chainNetXenTro9,878 chainNetXenTro9,890 chainNetXenTro9,915 chainNetXenTro9,933 chainNetXenTro9,968 chainXenTro7,666 chainXenTro7,684 chainXenTro7,805 chainXenTro7,850 chainXenTro7,858 chainXenTro7,878 chainXenTro7,890 chainXenTro7,915 chainXenTro7,933 chainXenTro7,968 chainXenTro9,663 chainXenTro9,681 chainXenTro9,802 chainXenTro9,847 chainXenTro9,855 chainXenTro9,875 chainXenTro9,887 chainXenTro9,912 chainXenTro9,930 chainXenTro9,965 cpgIslandExt,255 cpgIslandExt,307 cpgIslandExt,587 cpgIslandExtUnmasked,258 cpgIslandExtUnmasked,310 cpgIslandExtUnmasked,590 cpgIslandSuper,255 cpgIslandSuper,307 cpgIslandSuper,587 microsat,108 netGalGal6,654 netGalGal6,672 netGalGal6,793 netGalGal6,838 netGalGal6,846 netGalGal6,866 netGalGal6,878 netGalGal6,903 netGalGal6,921 netGalGal6,956 netXenTro7,666 netXenTro7,684 netXenTro7,805 netXenTro7,850 netXenTro7,858 netXenTro7,878 netXenTro7,890 netXenTro7,915 netXenTro7,933 netXenTro7,968 netXenTro9,663 netXenTro9,681 netXenTro9,802 netXenTro9,847 netXenTro9,855 netXenTro9,875 netXenTro9,887 netXenTro9,912 netXenTro9,930 netXenTro9,965 refSeqComposite,503 refSeqComposite,1264 refSeqComposite,1714 rmsk,12 rmsk,262 simpleRepeat,68 transMapEnsemblV5,222 transMapEnsemblV5,239 transMapEnsemblV5,284 transMapEnsemblV5,316 transMapEnsemblV5,679 transMapEstV5,191 transMapEstV5,208 transMapEstV5,253 transMapEstV5,285 transMapEstV5,648 transMapRefSeqV5,191 transMapRefSeqV5,208 transMapRefSeqV5,253 transMapRefSeqV5,285 transMapRefSeqV5,648 transMapRnaV5,191 transMapRnaV5,208 transMapRnaV5,253 transMapRnaV5,285 transMapRnaV5,648 transMapV5,297 transMapV5,314 transMapV5,359 transMapV5,391 transMapV5,754 ucscToINSDC,48 ucscToRefSeq,42 uniprot,799 uniprot,815 uniprot,1354 uniprot,1625 uniprot,1941 windowmaskerSdust,52 windowmaskerSdust,78 xenoRefGene,254 xenoRefGene,283 way transMapEnsemblV5,590 transMapEstV5,559 transMapRefSeqV5,559 transMapRnaV5,559 transMapV5,665 uniprot,1459 ways gc5BaseBw,47 refSeqComposite,1303 we refSeqComposite,77 rmsk,122 uniprot,1224 uniprot,1453 uniprot,1859 webb chainGalGal6,935 chainGalGal6,972 chainNetGalGal6,938 chainNetGalGal6,975 chainNetXenTro7,950 chainNetXenTro7,987 chainNetXenTro9,947 chainNetXenTro9,984 chainXenTro7,947 chainXenTro7,984 chainXenTro9,944 chainXenTro9,981 netGalGal6,935 netGalGal6,972 netXenTro7,947 netXenTro7,984 netXenTro9,944 netXenTro9,981 weekly xenoRefGene,42 well augustusGene,78 cpgIslandExt,549 cpgIslandExtUnmasked,552 cpgIslandSuper,549 genscan,36 rmsk,54 were augustusGene,50 augustusGene,66 augustusGene,125 augustusGene,149 augustusGene,182 chainGalGal6,582 chainGalGal6,590 chainGalGal6,597 chainGalGal6,604 chainGalGal6,616 chainGalGal6,690 chainGalGal6,764 chainGalGal6,944 chainGalGal6,988 chainGalGal6,1002 chainNetGalGal6,585 chainNetGalGal6,593 chainNetGalGal6,600 chainNetGalGal6,607 chainNetGalGal6,619 chainNetGalGal6,693 chainNetGalGal6,767 chainNetGalGal6,947 chainNetGalGal6,991 chainNetGalGal6,1005 chainNetXenTro7,596 chainNetXenTro7,604 chainNetXenTro7,611 chainNetXenTro7,618 chainNetXenTro7,630 chainNetXenTro7,705 chainNetXenTro7,779 chainNetXenTro7,959 chainNetXenTro7,1003 chainNetXenTro7,1017 chainNetXenTro9,593 chainNetXenTro9,601 chainNetXenTro9,608 chainNetXenTro9,615 chainNetXenTro9,627 chainNetXenTro9,702 chainNetXenTro9,776 chainNetXenTro9,956 chainNetXenTro9,1000 chainNetXenTro9,1014 chainXenTro7,593 chainXenTro7,601 chainXenTro7,608 chainXenTro7,615 chainXenTro7,627 chainXenTro7,702 chainXenTro7,776 chainXenTro7,956 chainXenTro7,1000 chainXenTro7,1014 chainXenTro9,590 chainXenTro9,598 chainXenTro9,605 chainXenTro9,612 chainXenTro9,624 chainXenTro9,699 chainXenTro9,773 chainXenTro9,953 chainXenTro9,997 chainXenTro9,1011 cpgIslandExt,227 cpgIslandExtUnmasked,230 cpgIslandSuper,227 gc5BaseBw,79 netGalGal6,582 netGalGal6,590 netGalGal6,597 netGalGal6,604 netGalGal6,616 netGalGal6,690 netGalGal6,764 netGalGal6,944 netGalGal6,988 netGalGal6,1002 netXenTro7,593 netXenTro7,601 netXenTro7,608 netXenTro7,615 netXenTro7,627 netXenTro7,702 netXenTro7,776 netXenTro7,956 netXenTro7,1000 netXenTro7,1014 netXenTro9,590 netXenTro9,598 netXenTro9,605 netXenTro9,612 netXenTro9,624 netXenTro9,699 netXenTro9,773 netXenTro9,953 netXenTro9,997 netXenTro9,1011 refSeqComposite,101 refSeqComposite,249 refSeqComposite,358 refSeqComposite,420 refSeqComposite,1152 refSeqComposite,1165 refSeqComposite,1230 refSeqComposite,1247 refSeqComposite,1288 transMapEnsemblV5,156 transMapEnsemblV5,186 transMapEnsemblV5,213 transMapEnsemblV5,244 transMapEnsemblV5,250 transMapEnsemblV5,264 transMapEnsemblV5,351 transMapEnsemblV5,382 transMapEnsemblV5,395 transMapEstV5,125 transMapEstV5,155 transMapEstV5,182 transMapEstV5,213 transMapEstV5,219 transMapEstV5,233 transMapEstV5,320 transMapEstV5,351 transMapEstV5,364 transMapRefSeqV5,125 transMapRefSeqV5,155 transMapRefSeqV5,182 transMapRefSeqV5,213 transMapRefSeqV5,219 transMapRefSeqV5,233 transMapRefSeqV5,320 transMapRefSeqV5,351 transMapRefSeqV5,364 transMapRnaV5,125 transMapRnaV5,155 transMapRnaV5,182 transMapRnaV5,213 transMapRnaV5,219 transMapRnaV5,233 transMapRnaV5,320 transMapRnaV5,351 transMapRnaV5,364 transMapV5,116 transMapV5,129 transMapV5,231 transMapV5,261 transMapV5,288 transMapV5,319 transMapV5,325 transMapV5,339 transMapV5,426 transMapV5,457 transMapV5,470 ucscToINSDC,35 ucscToRefSeq,29 uniprot,782 uniprot,794 uniprot,930 uniprot,937 uniprot,1386 uniprot,1471 uniprot,1505 uniprot,1515 xenoRefGene,220 xenoRefGene,237 xenoRefGene,278 wget uniprot,1903 uniprot,1913 when augustusGene,188 augustusGene,238 chainGalGal6,411 chainNetGalGal6,414 chainNetXenTro7,424 chainNetXenTro9,421 chainXenTro7,421 chainXenTro9,418 netGalGal6,411 netXenTro7,421 netXenTro9,418 refSeqComposite,1092 refSeqComposite,1249 transMapEnsemblV5,468 transMapEstV5,437 transMapRefSeqV5,437 transMapRnaV5,437 transMapV5,543 uniprot,951 uniprot,1202 uniprot,1632 xenoRefGene,239 where chainGalGal6,194 chainNetGalGal6,197 chainNetXenTro7,204 chainNetXenTro9,202 chainXenTro7,201 chainXenTro9,199 cpgIslandExt,151 cpgIslandExt,393 cpgIslandExtUnmasked,154 cpgIslandExtUnmasked,396 cpgIslandSuper,151 cpgIslandSuper,393 gold,95 netGalGal6,194 netXenTro7,201 netXenTro9,199 transMapEnsemblV5,272 transMapEnsemblV5,374 transMapEnsemblV5,423 transMapEnsemblV5,511 transMapEstV5,241 transMapEstV5,343 transMapEstV5,392 transMapEstV5,480 transMapRefSeqV5,241 transMapRefSeqV5,343 transMapRefSeqV5,392 transMapRefSeqV5,480 transMapRnaV5,241 transMapRnaV5,343 transMapRnaV5,392 transMapRnaV5,480 transMapV5,347 transMapV5,449 transMapV5,498 transMapV5,586 uniprot,1192 whether chainGalGal6,862 chainNetGalGal6,865 chainNetXenTro7,877 chainNetXenTro9,874 chainXenTro7,874 chainXenTro9,871 netGalGal6,862 netXenTro7,874 netXenTro9,871 which augustusGene,159 augustusGene,227 chainGalGal6,328 chainGalGal6,620 chainGalGal6,827 chainNetGalGal6,331 chainNetGalGal6,623 chainNetGalGal6,830 chainNetXenTro7,341 chainNetXenTro7,634 chainNetXenTro7,842 chainNetXenTro9,338 chainNetXenTro9,631 chainNetXenTro9,839 chainXenTro7,338 chainXenTro7,631 chainXenTro7,839 chainXenTro9,335 chainXenTro9,628 chainXenTro9,836 cpgIslandExt,85 cpgIslandExtUnmasked,88 cpgIslandSuper,85 nestedRepeats,31 nestedRepeats,87 netGalGal6,328 netGalGal6,620 netGalGal6,827 netXenTro7,338 netXenTro7,631 netXenTro7,839 netXenTro9,335 netXenTro9,628 netXenTro9,836 refSeqComposite,47 refSeqComposite,262 refSeqComposite,1483 refSeqComposite,1511 rmsk,21 rmsk,64 rmsk,158 rmsk,171 rmsk,197 simpleRepeat,27 transMapEnsemblV5,617 transMapEstV5,586 transMapRefSeqV5,586 transMapRnaV5,586 transMapV5,145 transMapV5,692 uniprot,158 uniprot,1380 uniprot,1768 while chainGalGal6,218 chainNetGalGal6,221 chainNetXenTro7,228 chainNetXenTro9,226 chainXenTro7,225 chainXenTro9,223 netGalGal6,218 netXenTro7,225 netXenTro9,223 white gap,105 whole chainGalGal6,468 chainNetGalGal6,471 chainNetXenTro7,481 chainNetXenTro9,478 chainXenTro7,478 chainXenTro9,475 cpgIslandExt,167 cpgIslandExtUnmasked,170 cpgIslandSuper,167 gold,150 netGalGal6,468 netXenTro7,478 netXenTro9,475 refSeqComposite,1499 transMapEnsemblV5,607 transMapEstV5,576 transMapRefSeqV5,576 transMapRnaV5,576 transMapV5,682 whose refSeqComposite,221 refSeqComposite,350 refSeqComposite,967 transMapEnsemblV5,219 transMapEstV5,188 transMapRefSeqV5,188 transMapRnaV5,188 transMapV5,294 width cpgIslandExt,430 cpgIslandExt,467 cpgIslandExt,470 cpgIslandExt,478 cpgIslandExtUnmasked,433 cpgIslandExtUnmasked,470 cpgIslandExtUnmasked,473 cpgIslandExtUnmasked,481 cpgIslandSuper,430 cpgIslandSuper,467 cpgIslandSuper,470 cpgIslandSuper,478 will rmsk,277 rmsk,283 transMapEnsemblV5,61 uniprot,537 uniprot,665 uniprot,754 uniprot,1142 uniprot,1162 window-based windowmaskerSdust,101 windowmasker windowmaskerSdust,7 windowmaskerSdust,21 windowmaskerSdust,23 windowmaskerSdust,51 windowmaskerSdust,58 windowmaskerSdust,65 windowmaskerSdust,100 windowmaskersdust windowmaskerSdust,83 windows gc5BaseBw,7 gc5BaseBw,28 wish refSeqComposite,173 xenoRefGene,207 with augustusGene,127 augustusGene,322 chainGalGal6,42 chainGalGal6,209 chainGalGal6,220 chainGalGal6,592 chainGalGal6,705 chainGalGal6,781 chainGalGal6,905 chainGalGal6,937 chainGalGal6,969 chainGalGal6,1106 chainNetGalGal6,45 chainNetGalGal6,212 chainNetGalGal6,223 chainNetGalGal6,595 chainNetGalGal6,708 chainNetGalGal6,784 chainNetGalGal6,908 chainNetGalGal6,940 chainNetGalGal6,972 chainNetGalGal6,1109 chainNetXenTro7,48 chainNetXenTro7,219 chainNetXenTro7,230 chainNetXenTro7,606 chainNetXenTro7,720 chainNetXenTro7,796 chainNetXenTro7,920 chainNetXenTro7,952 chainNetXenTro7,984 chainNetXenTro7,1121 chainNetXenTro9,47 chainNetXenTro9,217 chainNetXenTro9,228 chainNetXenTro9,603 chainNetXenTro9,717 chainNetXenTro9,793 chainNetXenTro9,917 chainNetXenTro9,949 chainNetXenTro9,981 chainNetXenTro9,1118 chainXenTro7,45 chainXenTro7,216 chainXenTro7,227 chainXenTro7,603 chainXenTro7,717 chainXenTro7,793 chainXenTro7,917 chainXenTro7,949 chainXenTro7,981 chainXenTro7,1118 chainXenTro9,44 chainXenTro9,214 chainXenTro9,225 chainXenTro9,600 chainXenTro9,714 chainXenTro9,790 chainXenTro9,914 chainXenTro9,946 chainXenTro9,978 chainXenTro9,1115 cpgIslandExt,19 cpgIslandExt,39 cpgIslandExt,141 cpgIslandExt,540 cpgIslandExtUnmasked,22 cpgIslandExtUnmasked,42 cpgIslandExtUnmasked,144 cpgIslandExtUnmasked,543 cpgIslandSuper,19 cpgIslandSuper,39 cpgIslandSuper,141 cpgIslandSuper,540 gap,53 gc5BaseBw,35 gold,52 gold,142 microsat,69 microsat,76 nestedRepeats,133 netGalGal6,42 netGalGal6,209 netGalGal6,220 netGalGal6,592 netGalGal6,705 netGalGal6,781 netGalGal6,905 netGalGal6,937 netGalGal6,969 netGalGal6,1106 netXenTro7,45 netXenTro7,216 netXenTro7,227 netXenTro7,603 netXenTro7,717 netXenTro7,793 netXenTro7,917 netXenTro7,949 netXenTro7,981 netXenTro7,1118 netXenTro9,44 netXenTro9,214 netXenTro9,225 netXenTro9,600 netXenTro9,714 netXenTro9,790 netXenTro9,914 netXenTro9,946 netXenTro9,978 netXenTro9,1115 refSeqComposite,224 refSeqComposite,353 refSeqComposite,491 refSeqComposite,954 refSeqComposite,983 refSeqComposite,1042 refSeqComposite,1069 refSeqComposite,1095 refSeqComposite,1134 refSeqComposite,1240 refSeqComposite,1284 refSeqComposite,1402 rmsk,111 rmsk,225 simpleRepeat,52 transMapEnsemblV5,51 transMapEnsemblV5,183 transMapEnsemblV5,252 transMapEnsemblV5,353 transMapEnsemblV5,355 transMapEnsemblV5,584 transMapEstV5,152 transMapEstV5,221 transMapEstV5,322 transMapEstV5,324 transMapEstV5,553 transMapRefSeqV5,152 transMapRefSeqV5,221 transMapRefSeqV5,322 transMapRefSeqV5,324 transMapRefSeqV5,553 transMapRnaV5,152 transMapRnaV5,221 transMapRnaV5,322 transMapRnaV5,324 transMapRnaV5,553 transMapV5,258 transMapV5,327 transMapV5,428 transMapV5,430 transMapV5,659 uniprot,183 uniprot,258 uniprot,280 uniprot,458 uniprot,639 uniprot,716 uniprot,788 uniprot,946 uniprot,1475 uniprot,1481 uniprot,1496 uniprot,1501 uniprot,1718 uniprot,1948 windowmaskerSdust,54 xenoRefGene,230 xenoRefGene,274 within gold,117 refSeqComposite,725 refSeqComposite,1273 simpleRepeat,37 transMapEnsemblV5,655 transMapEstV5,624 transMapRefSeqV5,624 transMapRnaV5,624 transMapV5,730 uniprot,1109 uniprot,1313 uniprot,1345 uniprot,1488 uniprot,1806 xenoRefGene,84 xenoRefGene,263 without uniprot,139 wj chainGalGal6,1049 chainGalGal6,1091 chainNetGalGal6,1052 chainNetGalGal6,1094 chainNetXenTro7,1064 chainNetXenTro7,1106 chainNetXenTro9,1061 chainNetXenTro9,1103 chainXenTro7,1061 chainXenTro7,1103 chainXenTro9,1058 chainXenTro9,1100 netGalGal6,1049 netGalGal6,1091 netXenTro7,1061 netXenTro7,1103 netXenTro9,1058 netXenTro9,1100 refSeqComposite,1733 xenoRefGene,304 wm windowmaskerSdust,1 wm_counts windowmaskerSdust,64 windowmaskerSdust,67 words uniprot,1201 worldwide refSeqComposite,1723 transMapEnsemblV5,701 transMapEstV5,670 transMapRefSeqV5,670 transMapRnaV5,670 transMapV5,776 xenoRefGene,294 would cpgIslandExt,184 cpgIslandExtUnmasked,187 cpgIslandSuper,184 wrench refSeqComposite,753 written genscan,19 microsat,109 simpleRepeat,69 www.repeatmasker.org nestedRepeats,333 rmsk,356 x chainNetXenTro7,1 chainNetXenTro7,5 chainNetXenTro7,71 chainNetXenTro7,105 chainNetXenTro7,159 chainNetXenTro7,280 chainNetXenTro7,308 chainNetXenTro7,591 chainNetXenTro7,641 chainNetXenTro7Viewchain,2 chainNetXenTro7Viewnet,2 chainNetXenTro9,1 chainNetXenTro9,5 chainNetXenTro9,70 chainNetXenTro9,103 chainNetXenTro9,157 chainNetXenTro9,278 chainNetXenTro9,306 chainNetXenTro9,588 chainNetXenTro9,638 chainNetXenTro9Viewchain,2 chainNetXenTro9Viewnet,2 chainXenTro7,1 chainXenTro7,4 chainXenTro7,68 chainXenTro7,102 chainXenTro7,156 chainXenTro7,277 chainXenTro7,305 chainXenTro7,588 chainXenTro7,638 chainXenTro9,1 chainXenTro9,4 chainXenTro9,67 chainXenTro9,100 chainXenTro9,154 chainXenTro9,275 chainXenTro9,303 chainXenTro9,585 chainXenTro9,635 netXenTro7,1 netXenTro7,4 netXenTro7,68 netXenTro7,102 netXenTro7,156 netXenTro7,277 netXenTro7,305 netXenTro7,588 netXenTro7,638 netXenTro9,1 netXenTro9,4 netXenTro9,67 netXenTro9,100 netXenTro9,154 netXenTro9,275 netXenTro9,303 netXenTro9,585 netXenTro9,635 uniprot,1923 xenopus_tropicalis_v9.1 chainNetXenTro9,9 chainNetXenTro9,74 chainNetXenTro9,318 chainNetXenTro9Viewchain,6 chainNetXenTro9Viewnet,6 chainXenTro9,8 chainXenTro9,71 chainXenTro9,315 netXenTro9,8 netXenTro9,71 netXenTro9,315 xentro7 chainNetXenTro7,11 chainNetXenTro7,77 chainNetXenTro7,322 chainNetXenTro7Viewchain,8 chainNetXenTro7Viewnet,8 chainXenTro7,10 chainXenTro7,74 chainXenTro7,319 netXenTro7,10 netXenTro7,74 netXenTro7,319 xentro9 chainNetXenTro9,10 chainNetXenTro9,75 chainNetXenTro9,319 chainNetXenTro9Viewchain,7 chainNetXenTro9Viewnet,7 chainXenTro9,9 chainXenTro9,72 chainXenTro9,316 netXenTro9,9 netXenTro9,72 netXenTro9,316 xm refSeqComposite,354 xm_ ncbiRefSeq,10 ncbiRefSeqOther,10 ncbiRefSeqPredicted,8 xml uniprot,1510 xr refSeqComposite,356 xr_ ncbiRefSeq,12 ncbiRefSeqOther,11 ncbiRefSeqPredicted,10 yap chainGalGal6,1032 chainNetGalGal6,1035 chainNetXenTro7,1047 chainNetXenTro9,1044 chainXenTro7,1044 chainXenTro9,1041 netGalGal6,1032 netXenTro7,1044 netXenTro9,1041 years uniprot,933 yet refSeqComposite,676 refSeqComposite,701 yip uniprot,2010 yl uniprot,2011 you refSeqComposite,172 refSeqComposite,1352 refSeqComposite,1460 refSeqComposite,1544 refSeqComposite,1564 refSeqComposite,1634 rmsk,115 uniprot,655 uniprot,689 uniprot,1443 xenoRefGene,206 younger nestedRepeats,94 your refSeqComposite,1526 refSeqComposite,1639 transMapEnsemblV5,632 transMapEstV5,601 transMapRefSeqV5,601 transMapRnaV5,601 transMapV5,707 uniprot,1783 yp refSeqComposite,229 refSeqComposite,232 refSeqComposite,242 yp_ ncbiRefSeq,14 ncbiRefSeqOther,14 z chainGalGal6,1095 chainNetGalGal6,1098 chainNetXenTro7,1110 chainNetXenTro9,1107 chainXenTro7,1107 chainXenTro9,1104 netGalGal6,1095 netXenTro7,1107 netXenTro9,1104 zebrafish augustusGene,202 augustusGene,278 zhang chainGalGal6,933 chainGalGal6,1094 chainNetGalGal6,936 chainNetGalGal6,1097 chainNetXenTro7,948 chainNetXenTro7,1109 chainNetXenTro9,945 chainNetXenTro9,1106 chainXenTro7,945 chainXenTro7,1106 chainXenTro9,942 chainXenTro9,1103 netGalGal6,933 netGalGal6,1094 netXenTro7,945 netXenTro7,1106 netXenTro9,942 netXenTro9,1103 zheng chainGalGal6,932 chainNetGalGal6,935 chainNetXenTro7,947 chainNetXenTro9,944 chainXenTro7,944 chainXenTro9,941 netGalGal6,932 netXenTro7,944 netXenTro9,941 zhu transMapEnsemblV5,787 transMapEstV5,756 transMapRefSeqV5,756 transMapRnaV5,756 transMapV5,862 zinc uniprot,326 zoomed-in genscan,103